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文檔簡(jiǎn)介
1、基因表達(dá)量實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)步驟1 材料(試劑和耗材)1.1 樣本(小鼠組織)-2個(gè)1.2 引物(life technology公司合成)1.3 BestarTMqPCR RT Kit(德國(guó)DBI貨號(hào):DBI-2220)1.4 Bestar® SybrGreenqPCRmastermix(德國(guó)DBI貨號(hào):DBI-2043)1.5 96孔板(美國(guó)life technology)2 材料(儀器)2.1 ABI7500熒光定量PCR儀(life technology公司)2.2 TGL-16M低溫冷凍離心機(jī)(湘儀)2.3 SW-CJ-1D單人凈化工作臺(tái)(瀘凈凈化)2.4 HR40- A
2、2生物安全柜(Haier)3 實(shí)驗(yàn)步驟3.1 RNA的抽提RNA 的提取按life technology公司提供的Triozol RNA提取試劑盒的使用說(shuō)明進(jìn)行。程序如下:(1)將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1ml TRIzol;(2)加入0.2mL氯仿,蓋緊離心管管蓋,上下顛倒混勻60s(請(qǐng)勿渦漩激烈振蕩),室溫靜置3min,12,000g,4離心 15min,置于冰上;(3)溶液分為三層,RNA溶解在水相中,小心吸取 500l水相至另一個(gè)新的RNasefree的EP管中;(4)加入500l異丙醇,-20度放置1h,12,000g,4離心10min,離心后管底出現(xiàn)RNA沉淀,
3、棄上清;(5)加入1ml 75乙醇,用手輕輕顛倒,12,000g離心5min,去上清;(6)超凈工作臺(tái)上吹干樣品10min,加入適量DEPC水溶解RNA。加入40l DEPC水溶解沉淀。3.2 RNA質(zhì)量檢測(cè)紫外分光光度計(jì)測(cè)定RNA濃度:3.3去基因組DNA和cDNA的合成將RNA加入到gDNA吸附柱,室溫10,000g離心1min,收集濾液即為去除基因組DNA的RNA。把RNA在65°C條件下熱變性5分鐘后,立即置于冰上冷卻。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng):5×RT BufferRT Enzyme MixPrimer MixRNARNase-free WaterToal反應(yīng)條件:37
4、6;C, 15min98°C, 5min4°C,hold反應(yīng)結(jié)束后,-20°C保存。 2L 0.5L 0.5L 6L 1L 10L3.4cDNA的實(shí)時(shí)熒光定量PCR 3.4.1實(shí)驗(yàn)步驟每個(gè)樣本分別設(shè)置3個(gè)目的基因和3個(gè)內(nèi)參基因的平行實(shí)驗(yàn)。PCR反應(yīng)體系為20L,根據(jù)表1.配置。反應(yīng)條件為:95°C2min 95°C10s60°C34s(采集熒光信號(hào)) 72°C 30s循環(huán)結(jié)束后從60升高到98獲取熔解曲線。45個(gè)循環(huán)3.4.2實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析方法本實(shí)驗(yàn)采用2-Ct法進(jìn)行分析,計(jì)算公式為:F=2對(duì)照組目的基因?qū)φ战M管家基因待測(cè)組目的基因待測(cè)組管家基因-( - ) -( - )平均Ct值平均Ct值平均Ct值平均Ct值F為相對(duì)表達(dá)量,根據(jù)此次試驗(yàn)的設(shè)計(jì),對(duì)照組中的目的基因表達(dá)量為1。4結(jié)果4.1 擴(kuò)增曲線4.2 熔解曲線4.3實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)見(jiàn)EXCEL表格。備注:Ct
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