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文檔簡(jiǎn)介

1、Western blotting protocolBy Wei-Zhang Wang-070610A. 溶液和試劑注意:溶液的配制最好用Milli-Q或同等純度的水!所有下面所用容器使用前都必須洗干凈,并用雙蒸水潤(rùn)洗,最后晾干。A1. 抑制劑:蛋白酶抑制(35mg/ml PMSF):用無(wú)水乙醇稀釋為35mg/ml,室溫下避光保存,可使用34個(gè)月。(MW:172.4g)絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶抑制劑(5M 氟化鈉(NaF):取2.1克氟化鈉置于10ml Milli-Q水中,然后vortex劇烈震蕩使其充分溶解,最后分裝成10l/管,置于-20保存(解凍后必須1小時(shí)內(nèi)使用)。酪氨酸磷酸酶抑制劑(1M

2、釩酸鈉(Sodium Orthovanadate)):稱(chēng)一定量的釩酸鈉置于水中,用鹽酸調(diào)pH至10.0,加熱沸騰至完全溶解且溶液為無(wú)色,待溶液冷卻至室溫后再調(diào)pH至10.0,加熱至溶液變無(wú)色,冷卻后再調(diào)pH至10.0,如此反復(fù)操作至室溫下pH穩(wěn)定在10.0即可,最后定容至濃度為1M。此配制方法是參考網(wǎng)上的WB protocol,實(shí)際是否如此配制尚未實(shí)踐過(guò)!A2. 1PBS(pH7.4)A3. 1SDS裂解液(20ml): Stock 終濃度 Tris-HCL(pH6.8 at 25) 1M Tris(pH6.8) 1.25ml 62.5mM SDS 0.4g 2(w/v) Glycerol(甘

3、油) 2ml 10% DTT(二硫蘇糖醇) 1M 1ml 50mM Bromophenol blue(溴酚藍(lán)) 0.01%(w/v)A4. 轉(zhuǎn)移緩沖液:74.5g甘氨酸,15gTris堿加水定容至1000ml,成5stock,4保存。使用前稀釋成1:取200ml 5stock轉(zhuǎn)膜緩沖液,然后加入600mlddH2O,最后加入200ml無(wú)水甲醇至1L,4預(yù)冷2h以上。A5. Tris-甘氨酸電泳buffer(pH8.3):Tris base 15.1g 和94g甘氨酸,溶解在900ml水中,然后加入5g SDS,再加水至1000ml,成5X。A6. 配膠所用溶液: 1)30的凝膠儲(chǔ)備液:Acyl

4、 29g+Bis 1 g溶于100ml水,用濾紙過(guò)濾至棕色瓶中,4避光保存。每次使用前先放置室溫15-30min。 2)1.5 mol/L Tris-HCL, pH8.8:18.16g Tris base 溶解在80ml水中,用濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值至8.8,待溶液回復(fù)到室溫再用6M的鹽酸調(diào)pH至8.8,最后加水至100ml,室溫保存。 3)1.0 mol/L Tris-HCL, pH6.8:12.12g Tris base 溶解在80ml水中,用濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值至6.8,待溶液回復(fù)到室溫再用6M的鹽酸調(diào)pH至6.8,最后加水至100ml,室溫保存。 4)10%SDS:稱(chēng)10克SDS溶于100ml水

5、中,儲(chǔ)存于室溫。 TEMED(四甲基乙二胺):4避光保存。 5)10APS(過(guò)硫酸銨):配制10ml,分裝100-200uL至0.5ml離心管中,-20保存。解凍后4保存,不超過(guò)1周。A7. 10Tris Buffered Saline(TBS): 24.2g Tris堿,80gNaCl,定容至1L,HCL調(diào)pH至7.6。A8. 洗膜液:1TBS中含0.1Tween-20(0.1TBS/T);或者是1PBS中含0.1 Tween-20(0.1PBS/T) 奶粉封閉液(30ml):30ml洗膜液(0.1TBS/T)加入1.5g脫脂奶粉,室溫下攪拌半小時(shí)以上。終濃度為1TBS含0.1Tween-2

6、0(0.1TBS/T),5脫脂奶粉(w/v)。BSA封閉液(15ml):15ml洗膜液(0.1TBS/T)加入0.45g BSA,顛倒混勻。終濃度1TBS含0.1Tween-20,3BSA(w/v)。(牛血清白蛋白BSA)以上封閉液可用1PBS/T代替1TBS/T。注意:一般情況下,BSA用于多克隆抗體的封閉,脫脂奶粉用于單克隆抗體的封閉!建議第一次使用的抗體可同時(shí)用這兩種方法進(jìn)行封閉,以確定哪種方法的封閉效果最好。假如兩種方法的效果無(wú)明顯差別,必須用脫脂奶粉進(jìn)行封閉(脫脂奶粉比BSA便宜很多?。9. 一抗稀釋液(8ml):8ml洗膜液(0.1TBS/T)加入0.08g BSA(終濃度1%

7、BSA),混勻后加入抗體。常用的抗體加入10%的疊氮鈉(1:1000稀釋?zhuān)K濃度為0.01%,抑菌作用)4保存,不常用的抗體-20保存。A10. 二抗稀釋液(10ml):用10ml 0.1TBS/T配制(1:500010000)。注意:CST推薦使用NC膜,此protocol對(duì)NC膜進(jìn)行了優(yōu)化!同時(shí)PVDF(聚偏氟乙烯)(使用前用純甲醇泡膜半小時(shí))也可以使用。B 試驗(yàn)步驟B1. 準(zhǔn)備樣品使用前1ml 1SDS裂解液加入2.5l PMSF(苯甲基磺酰氟),1l 氟化鈉和1l釩酸鈉。終濃度為1mM PMSF、5mM 氟化鈉和1mM 釩酸鈉。注:氟化鈉和釩酸鈉是磷酸酶抑制劑,因此,如果檢測(cè)磷酸化蛋白

8、,則必須在1SDS裂解液加入這兩種抑制劑。1) 按實(shí)驗(yàn)需要準(zhǔn)備好細(xì)胞:懸浮細(xì)胞:400g離心5min收集細(xì)胞,1PBS洗3次,前2次用10/50ml離心管收集并洗細(xì)胞,最后1次轉(zhuǎn)移至1.5ml管中,并計(jì)算細(xì)胞數(shù)。按比例加入1SDS裂解液,一般為4 x 106細(xì)胞加入至少100l裂解液,用heating block 95煮5-10分鐘,期間振蕩一次,至用10uL槍吸取不感覺(jué)有粘稠則可。貼壁細(xì)胞:去掉培養(yǎng)基,1PBS洗3次(去掉培養(yǎng)基中的血清),每個(gè)孔(12孔板)加入適量的1SDS裂解液。以Hep3B為例(檢測(cè)磷酸化蛋白),一般為2x 105細(xì)胞(70的confluence)加入75l裂解液(其它

9、細(xì)胞可根據(jù)細(xì)胞大小及密度調(diào)整裂解液的量),迅速用細(xì)胞刮刮下細(xì)胞并轉(zhuǎn)移至1.5ml管中,用heating block 95煮5-10分鐘,期間振蕩一次,至用10uL槍吸取不感覺(jué)有粘稠則可。其他細(xì)胞所加裂解液的量請(qǐng)參考附錄3。2) 12,000g,4離心8min,收集上清。3) 直接上樣跑膠或者分裝-80C長(zhǎng)期保存。B2 SDS-PAGE 聚丙烯酰胺凝膠電泳1)制備分離膠(5ml/gel)注:不同的分離膠配方可參見(jiàn)附錄2或者分子克隆p1716表A8-9。分離范圍:丙稀酰胺濃度線(xiàn)性分離范圍kDa15 10-431212-631020-807.536-945.057-2122)小心注入分離膠,留2 c

10、m左右的空間(制膠架綠色邊框下緣)給濃縮膠,頂層覆蓋去離子水或水飽和正丁醇。靜置約30分鐘。3) 制備濃縮膠(2ml/gel)4)將濃縮膠注入分離膠上端,注意避免氣泡。5)插入梳子,待濃縮膠凝固(膠與梳子之間有明顯的分界,加上分離膠的凝固時(shí)間要大于2h),用雙蒸水將孔洗凈,去除凝膠碎片,然后用濾紙吸干水。6)將膠放入電泳槽,上下槽均加入1電泳緩沖液(反復(fù)使用不要超過(guò)3次)。7)上樣:取3ul prestained marker加入適量1SDS裂解液(使得總體積與sample孔一樣),load到膠最右側(cè)的孔中。Sample上樣量一般為1025l,先用heating block 95煮5-10分鐘

11、,期間振蕩一次,然后快速離心再上樣跑膠;在沒(méi)有l(wèi)oad sample的孔中加入等體積的1SDS裂解液。8) 電泳:開(kāi)始為恒流10-15mA每塊膠,當(dāng)跑過(guò)濃縮膠后,將電流加大到25mA每塊膠,電泳時(shí)間根據(jù)目標(biāo)蛋白的大小及marker的位置確定,一般為目標(biāo)蛋白跑到分離膠的三分之二的位置即可。B3 膜轉(zhuǎn)移不同大小蛋白的轉(zhuǎn)膜條件:蛋白x(kDa)轉(zhuǎn)膜液轉(zhuǎn)膜條件x2014.9g甘氨酸(0.2M),3.0gTris堿(25mM),200ml甲醇(20%,pH8.5),用水定容至1L。250mA恒流轉(zhuǎn)3 hrs20x120配方同上250mA恒流4 hrs120x20014.9g甘氨酸(0.2M),3.0gT

12、ris堿(25mM),200ml甲醇(20%,pH8.5),0.05%SDS,用水定容至1L。250mA恒流轉(zhuǎn)6 hrs200x配方同上500mA恒流轉(zhuǎn)4 hrsB1. NC膜(表達(dá)豐度高或大于25kDa的蛋白用0.45um孔徑的NC膜,小于25kDa且表達(dá)豐度低的蛋白用0.22um孔徑的NC膜,0.22um孔徑的NC膜比0.45um孔徑的NC膜貴很多)用鉛筆在膜正面的最上方寫(xiě)上待檢測(cè)蛋白名稱(chēng)、日期;然后先把膜置于雙蒸水面自然浸潤(rùn)10分鐘(利用虹吸的作用排掉膜的空氣,注意不要把膜直接浸入水中)后,再連同2張3mm濾紙和海綿完全浸入轉(zhuǎn)移緩沖液中15分鐘。B2. 在膠的最右側(cè)上方切角做記號(hào)后,完全

13、浸入轉(zhuǎn)移緩沖液中15分鐘。B3.制備“夾心餅”:依次按如下順序:纖維墊-濾紙-NC膜凝膠濾紙-纖維墊。轉(zhuǎn)膜后marker必 須在膜正面的最右側(cè)。 注意:每加一種物品都要對(duì)齊,并用10ml離心管排氣泡,確保沒(méi)有氣泡。B4. 轉(zhuǎn)膜:轉(zhuǎn)膜時(shí)間根據(jù)1)確定。NC膜一邊接正極(紅色),凝膠一邊接負(fù)極(黑色)。接電源前再三確認(rèn)。C 膜封閉和抗體孵育注意:下面所用溶液的量適用于5cm8cm(40cm2)的膜,用于不同面積的膜可根據(jù)比例自行調(diào)整!C1. 轉(zhuǎn)膜以后,用15ml的1TBS室溫洗膜10分鐘;C2. 30ml奶粉封閉液或者15ml的BSA封閉液室溫孵育2h或者4平緩搖動(dòng)(20-30rpm)過(guò)夜;C3.

14、 15ml的0.1TBS/T洗膜3次,每次搖5分鐘(60rpm);C4. 加入8ml一抗稀釋緩沖液(抗體根據(jù)說(shuō)明稀釋?zhuān)?,室? hrs或者4平緩搖動(dòng)過(guò)夜(對(duì)于磷酸化抗體一般情況下都要4過(guò)夜,因?yàn)榱姿峄鞍锥鄶?shù)豐度較低),回收一抗,按1:1000加入疊氮鈉(可抑制細(xì)菌生長(zhǎng))4保存(不常用的抗體可-20長(zhǎng)期保存),可重復(fù)使用!C5. 15ml的0.1TBS/T洗膜3次,每次搖5分鐘(60rpm);C6. 加入二抗(10ml TBST配制,一般為1:5000-10000稀釋?zhuān)?,室溫平緩?0-30rpm)搖動(dòng)1h;C7. 15ml的0.1TBS/T洗膜3次,每次搖5分鐘(60rpm)。最后用TBS浸

15、泡;注:每次應(yīng)從雜交盒的同一角倒出液體,然后加入洗膜液潤(rùn)洗一次,馬上倒掉,再加入洗膜液搖5min。每次加入液體應(yīng)沿壁,而不能對(duì)著膜。D顯影,定影D1. 顯色步驟:先鋪吸水紙,在吸水紙上再鋪上保鮮膜;分別將水、顯影液(顏色變黑則不能用)和定影液倒入各自的盤(pán)中。2.5ml ECL-A 和2.5ml ECL-B混合,避光。將ECL混合液、膜等拿入暗房。關(guān)好門(mén),反鎖,拉回布。ECL混合液倒入小盒中,膜用止血鉗夾住一角提起,用吸水紙吸取膜邊緣多余的液體后放入ECL混合液中,室溫手搖5min(使得ECL均勻的鋪過(guò)膜)。5min后用吸水紙將膜邊緣多余的液體吸取,然后把膜置于保鮮膜上,膜面朝下包好,然后膜面朝

16、上置于夾子中,將剪好的X-film(注意手只能拿X-film的邊緣,且手/手套必須保持潔凈和干燥。X-film大小與待檢測(cè)區(qū)域大小相當(dāng)即可,并在marker一側(cè)的上方剪角)放于膜上, (注意:取膠片時(shí)要把燈光調(diào)到最小,且不要對(duì)著燈光,應(yīng)背著燈光。),根據(jù)條帶的亮度來(lái)調(diào)整曝光時(shí)間,一般可先曝光2min,觀(guān)察條帶的強(qiáng)度,再確定最佳的曝光時(shí)間。ECL工作液在室溫下避光保存至少2h以上,盡量集中安排實(shí)驗(yàn)。D2. 顯影,定影:取出X-film置于顯影液中一定時(shí)間后(視目的條帶強(qiáng)度與背景而定),水洗一次再置于定影液中定影5min以上,最后泡水。當(dāng)檢測(cè)條帶較弱時(shí),可通過(guò)延長(zhǎng)曝光和顯影時(shí)間來(lái)增強(qiáng)信號(hào)。E 一抗

17、和二抗的strippingE1. 一抗的stripping buffer:For 100ml20ml SDS 10%12.5ml Tris HCl(pH 6.8 0.5M)67.5ml 超純水0.8ml -mercaptoethanol(通風(fēng)櫥中加入)操作步驟(下面所有步驟必須蓋上蓋子):1. 將30ml stripping buffer在50水浴中預(yù)熱10min;2. 把待strip的膜放入預(yù)熱的buffer中;3. 50水浴30min,每10min手搖一次;4. 30min后,用0.1TBS/T洗膜3次,每次10min以上,直至沒(méi)有了2-ME的氣味為止(因?yàn)?ME對(duì)一抗是有害的?。?;5.

18、重新封閉膜。E2. 二抗的stripping buffer:For 100ml20ml 5M NaCl,加入80ml 超純水,使NaCl終濃度為1M。操作步驟:1. 將stripping buffer在37水浴中預(yù)熱10min;2. 把待strip的膜放入預(yù)熱的buffer中;3. 37水浴30min,每10min手搖一次;4. 30min后,用0.1TBS/T洗膜3次,每次10min;5. 重新封閉膜。注:當(dāng)待檢測(cè)的蛋白不止一種,且一抗種屬來(lái)源不同時(shí),strip二抗即可。附錄1:顯影液和定影液配方顯影液體系A(chǔ)液B液C液自來(lái)水25L5L204ml182ml1L200ml8.2ml7.3ml785ml500ml100ml4.1ml3.65ml393ml30L5L204ml182ml1L167ml6.8ml6.1ml820ml500ml83.5ml3.4ml3.1ml410ml定影液體系A(chǔ)液B液自來(lái)水25L5L460ml1L200ml18.4ml782ml500m

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