微生物第5章分類與鑒定ppt課件

1、微生物鑒定與分類o 一、生物的系統(tǒng)發(fā)育和進化o1、對生物分類的兩種原則：o傳統(tǒng)：根據(jù)表形特征的相似程度分類。o 重在應(yīng)用，不以反應(yīng)生物之間的進化關(guān)系為目的o現(xiàn)代：通過比較不同物種間基因序列的相關(guān)性來類， o 目的是探尋各物種間的進化關(guān)系，建立反映生o 物發(fā)育相關(guān)性的分類系統(tǒng)。2、傳統(tǒng)的分類體系o1753年：瑞典人林奈Carrolus Linneaus）o 兩界分類系統(tǒng)：生物 動物o 植物o1969年： 惠特克 （R.H. Whittaker）：o o 原核生物界：細菌、藍細菌o 原生生物界：原生動物、單細胞藻類o五界系統(tǒng) 真菌界：真菌、酵母菌o 植物界o 動物界3、反映生物系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性的進化

2、計時器o 生物A A、B間的o 生物B 進化關(guān)系o理想的生物進化計時器應(yīng)具備的條件：見書o原核生物核糖體70S） ：o 大亞基50S）：蛋白質(zhì) + 23SrRNA + 5SrRNAo 小亞基30S）：蛋白質(zhì) + 16SrRNAo真核生物核糖體80S） ：o 大亞基60S）：蛋白質(zhì) + 28SrRNA + 55.8 SrRNAo 小亞基40S）：蛋白質(zhì) + 18SrRNAo o 比較兩者核苷酸 or 氨基酸序列差異進化計時器） o 20世紀(jì)70年代，沃斯Carl Woese根據(jù)生物核糖體中 18SrRNA 和 16SrRNA 的堿基序列將生物劃分為3個 “域domain)“ 或稱 “原界”：o

3、古細菌原界Archaea）： 甲烷菌，嗜鹽菌，嗜熱菌等o 真細菌原界Bacteria）： 除古細菌外的其它原核生物o 真核生物原界(Eukarya)：原生生物、真菌、動物、植物4、三域分類學(xué)說生物的三原界系統(tǒng)發(fā)育樹二、微生物的分類單元和命名： 1、種以上的微生物分類單元： 界Kingdom）、門Phylum）、 綱Class）、目Order）、 科Family）、屬Genus）、 種Species） 2、對于微生物來說，種的概念： 表型特征和包括16SrRNA在內(nèi)的基因序列特征高度相似的菌株群，而且這個菌株群和其它類群有明顯差異。 3、種以下的分類概念： 菌株strain）、模式菌株types

4、train） 亞種subspecies） 型form）：生物型、血清型、噬菌體型 4菌種學(xué)名 （1按命名的，國際公認，通用的正式菌種名字。采用林奈的雙名法：學(xué)名：屬名+種名加詞 （字母均為斜體） 屬名：拉丁文或希臘文，名詞，單數(shù)，第一個字 母大寫，描述微生物的一般的、主要的特性。 種名加詞：拉丁文或希臘文，形容詞，字母小寫， 描述該菌種具體、次要特征。例：金黃色葡萄球菌：Staphylococcus aurous結(jié)核分枝桿菌：Mycobacterium tuberculosis o 如果泛指某一屬的微生物，或某菌種，知其屬但種名未定，可用“sp” “spp作加詞：o Bacillus sp:

5、一個尚未定名的芽孢桿菌o Bacillus spp: 泛指芽孢桿菌屬的菌種 o（2種以下分類： o亞種subspecies, subsp指某一明顯而穩(wěn)定的特征與模式種不同的種，例：蠟狀芽孢桿菌的蕈狀亞種：o Bacillus cereus subsp. Mycoideso變種Variety, Var）:現(xiàn)不正式使用，枯草芽孢桿菌黑色變種：o Bacillus subtilis var. niger o 菌株菌株strainstrain）: : 由一個獨立的單細胞繁殖形成由一個獨立的單細胞繁殖形成的微生物純種群體，使用較廣泛。某菌種的菌株名的微生物純種群體，使用較廣泛。某菌種的菌株名稱加在菌種學(xué)

6、名之后，可任意取名，例：稱加在菌種學(xué)名之后，可任意取名，例：o華癸中生根瘤菌華癸中生根瘤菌 7653R 7653R菌株：菌株： o Mesorhizobium huakuii 7653R Mesorhizobium huakuii 7653Ro費氏中華根瘤菌費氏中華根瘤菌 USDA205 USDA205株：株：o Sinorhizobium fredii USDA205 Sinorhizobium fredii USDA205o同一菌種學(xué)名在一篇文章中首次出現(xiàn)時應(yīng)寫全稱，同一菌種學(xué)名在一篇文章中首次出現(xiàn)時應(yīng)寫全稱，第二次出現(xiàn)，屬名可只寫第一個字母第二次出現(xiàn)，屬名可只寫第一個字母, ,字母右下加

7、圓字母右下加圓點，以示縮寫：點，以示縮寫：o Escherichia coli E . coli Escherichia coli E . coli 三、原核生物的鑒定和分類方法 o傳統(tǒng)分類依據(jù)：表型特征o現(xiàn)代分類依據(jù)：以遺傳型特征為依據(jù)的分子分類o（一傳統(tǒng)分類方法o高等動物：外部形態(tài)、內(nèi)部解剖結(jié)構(gòu)o種子植物：生殖器官特征：花、果實o微 生 物：微生物形體小，類型多，變異大，微生物分 o 類、鑒定的依據(jù)遠較其他生物復(fù)雜：o個體形態(tài)：細胞形狀、大小、特殊結(jié)構(gòu)如芽孢、鞭毛、o 莢膜）、革蘭氏染色反 應(yīng) 等o群體形態(tài)：在固體瓊脂上的菌落形態(tài)、斜面菌苔特征、o 液體培養(yǎng)特征o生理生化反應(yīng)：o 產(chǎn)能方式

8、、與氧氣關(guān)系、碳源氮源利用、糖發(fā)酵、o 乙酰甲基甲醇試驗V.P）、吲哚試驗、明膠液化、o 淀粉水解、產(chǎn)氨試驗 等o血清學(xué)試驗o噬菌體分型Different Shapes1、細菌的個體與群體形態(tài) （1細菌的個體形態(tài) o （2） 細菌的排列方式：o母細胞 子細胞 立即分開 分散個體o 不立即分開 形成各種排列方式o o不同排列方式多見于球菌，是球菌的分類依據(jù)之一：o 單球菌、雙球菌、鏈球菌、四聯(lián)球菌、o 八疊球菌、葡萄球菌o桿菌多為單生E.coli或排成鏈狀(B.t)，o 對分類意義不大 （3） 細菌的群體形態(tài)o細菌在自然環(huán)境或培養(yǎng)基上大量繁殖后，形成肉眼可見的群體。o在固體培養(yǎng)基上由單個細胞生長

9、繁殖形成的群體稱為菌落colony）；o o細菌在固體瓊脂平板上形成的菌落特征可作為分類鑒定的依據(jù)，如：菌落大小、形狀顏色、光澤、隆起狀況等。o 細菌在斜面、半固體、液體等培養(yǎng)條件下也有不同生長特征，可作為分類鑒定的依據(jù)。2、常用分類方法二分法數(shù)值分類法Numerical taxonomy見書3、 分子分類法：G + C 百分比的測定核酸雜交16 SrRNA 堿基測序4、細菌鑒定的自動分析技術(shù)API系統(tǒng)Biolog系統(tǒng)oAPIAPI細菌鑒定系統(tǒng)細菌鑒定系統(tǒng)o適用于腸道厭氧細菌的Enterotube鑒定系統(tǒng) 四、原核生物的分類系統(tǒng) 美國微生物學(xué)會組織編寫的鑒定細菌的兩部工具書1伯杰氏鑒定細菌學(xué)手冊 （Bergeys Manual of Determinative Bacteriology）該書根據(jù)細菌形態(tài)和生理特征進行分類，其分類體系被世界各國普遍接受 1923年第 1 版 1994年第 9 版：以細菌形態(tài)和生理類型為依據(jù)，結(jié) 合系統(tǒng)發(fā)育知識，將細菌分為 35 個群，4個大類： 1. 具 Cell wall的 G - 真細菌 2. 具 Cell wall的 G + 真細菌 3. 無 Cell wall真細菌 4. 古細菌2伯杰氏系統(tǒng)細菌