《微生物分類》ppt課件

1、界、門、綱、目、科、屬、種界、門、綱、目、科、屬、種 種是最根本的分類單位種是最根本的分類單位 每一分類單位之后可有亞門、亞綱、亞目、亞科每一分類單位之后可有亞門、亞綱、亞目、亞科.一、通用分類單元一、通用分類單元以啤酒酵母為例，它在分類學(xué)上的位置是：以啤酒酵母為例，它在分類學(xué)上的位置是： 界界(Kindom)：真菌界：真菌界 門門(Phyllum)：真菌門：真菌門 綱綱(Class)：子囊菌綱：子囊菌綱 目目(Order)：內(nèi)孢霉目：內(nèi)孢霉目 科科(Family)：內(nèi)孢霉科：內(nèi)孢霉科 屬屬(Genus)：酵母屬：酵母屬 種種(Species)：啤酒酵母：啤酒酵母1 種種species：是一個(gè)

2、根本分類單位；是一大群表型：是一個(gè)根本分類單位；是一大群表型特征高度類似、親緣關(guān)系極其接近，與同屬內(nèi)其他特征高度類似、親緣關(guān)系極其接近，與同屬內(nèi)其他種有明顯差別的菌株的總稱。種有明顯差別的菌株的總稱。 根據(jù)根據(jù)16SrRNA序列分析，同源性序列分析，同源性97%的兩個(gè)原的兩個(gè)原核微生物很能夠是同一個(gè)種。核微生物很能夠是同一個(gè)種。 典型菌株、方式種。典型菌株、方式種。2 菌株菌株strain: 表示任何由一個(gè)獨(dú)立分別的單細(xì)胞表示任何由一個(gè)獨(dú)立分別的單細(xì)胞繁衍而成的純種群體及其一切后代來源于共同祖繁衍而成的純種群體及其一切后代來源于共同祖先并堅(jiān)持祖先特性的一組純種后代菌群。因此，先并堅(jiān)持祖先特性的

3、一組純種后代菌群。因此，一種微生物的不同來源的純培育物均可稱為該菌種一種微生物的不同來源的純培育物均可稱為該菌種的一個(gè)菌株。菌株強(qiáng)調(diào)的是遺傳型純的譜系。的一個(gè)菌株。菌株強(qiáng)調(diào)的是遺傳型純的譜系。 例如：例如：Escherichia coli B 和和Escherichia coli K123 亞種亞種(subspecies： 當(dāng)某一個(gè)種內(nèi)的不同菌株存在少數(shù)明顯而穩(wěn)定的變異特征或當(dāng)某一個(gè)種內(nèi)的不同菌株存在少數(shù)明顯而穩(wěn)定的變異特征或遺傳外形，而又缺乏以區(qū)分成新種時(shí)，可以將這些菌株細(xì)分成遺傳外形，而又缺乏以區(qū)分成新種時(shí)，可以將這些菌株細(xì)分成兩個(gè)或更多的小的分類單元兩個(gè)或更多的小的分類單元亞種。亞種。

4、變種是亞種的同義詞，因變種是亞種的同義詞，因“變種一詞易引起詞義上的混淆，變種一詞易引起詞義上的混淆，從從1976年后，不再運(yùn)用變種一詞。通常把實(shí)驗(yàn)室中所獲得的變年后，不再運(yùn)用變種一詞。通常把實(shí)驗(yàn)室中所獲得的變異型菌株，稱之為變種。如：異型菌株，稱之為變種。如：E.coli k12野生型是不需求特野生型是不需求特殊殊aa的，而實(shí)驗(yàn)室變異后，可從的，而實(shí)驗(yàn)室變異后，可從k12獲得某獲得某aa的缺陷型，此即稱的缺陷型，此即稱為為E.coli k12的變種。的變種。4 型型(form): 常指亞種以下的細(xì)分。當(dāng)同種或同亞種內(nèi)不同菌株之間的性常指亞種以下的細(xì)分。當(dāng)同種或同亞種內(nèi)不同菌株之間的性狀差別缺

5、乏以分為新的亞種時(shí)，可以細(xì)分為不同的型。狀差別缺乏以分為新的亞種時(shí)，可以細(xì)分為不同的型。 例如：按抗原特征的差別分為不同的血清型。例如：按抗原特征的差別分為不同的血清型。 一生物的界級(jí)分類學(xué)說一生物的界級(jí)分類學(xué)說 動(dòng)物界 植物界 林奈動(dòng)物界 植物界 原生生 物界 Haeckel植物界 動(dòng)物界 原始生 物界 菌界 Copeland植物界 動(dòng)物界 原核生物界 原生生物界 真菌界 Whittaker五界上 加上病 毒界 王大耜 細(xì)菌域 古生菌域 真核生物域 美國(guó) Woese二、微生物在自然界的位置二、微生物在自然界的位置77病毒界病毒界動(dòng)物界動(dòng)物界植物界植物界真菌界真菌界原核生物界原核生物界原生生物

6、界原生生物界微藻類微藻類原生動(dòng)物原生動(dòng)物 細(xì)菌細(xì)菌古細(xì)菌古細(xì)菌放線菌放線菌衣原體衣原體支原體支原體立克次氏體立克次氏體螺旋體螺旋體藍(lán)細(xì)菌藍(lán)細(xì)菌病毒病毒亞病毒亞病毒朊病毒朊病毒生物的界級(jí)分類學(xué)說：是在認(rèn)識(shí)開展過程中存在的對(duì)生物的界級(jí)分類學(xué)說：是在認(rèn)識(shí)開展過程中存在的對(duì)生物分類的不同階段的不同觀念。如：二界系統(tǒng)、三生物分類的不同階段的不同觀念。如：二界系統(tǒng)、三界系統(tǒng)、四界系統(tǒng)、五界系統(tǒng)、六界系統(tǒng)和三原界系界系統(tǒng)、四界系統(tǒng)、五界系統(tǒng)、六界系統(tǒng)和三原界系統(tǒng)統(tǒng)三原界系統(tǒng)是三原界系統(tǒng)是1978年年 由由R.H.Whittaker和和L.Margulis提出的。提出的。一切生物存在一個(gè)共同祖先，由它分三條進(jìn)

7、化道路，一切生物存在一個(gè)共同祖先，由它分三條進(jìn)化道路，就構(gòu)成了三個(gè)原界：古細(xì)菌原界就構(gòu)成了三個(gè)原界：古細(xì)菌原界Archaebacter、真、真細(xì)菌原界、真核生物原界細(xì)菌原界、真核生物原界提出了內(nèi)共生學(xué)說提出了內(nèi)共生學(xué)說三原界系統(tǒng)表示圖三原界系統(tǒng)表示圖原核生物分類系統(tǒng)綱要原核生物分類系統(tǒng)綱要伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)手冊(cè)真菌界分類系統(tǒng)很多，各國(guó)采用不同的系統(tǒng)，真菌界分類系統(tǒng)很多，各國(guó)采用不同的系統(tǒng)，比較混亂。近年來為較多人接受的是比較混亂。近年來為較多人接受的是Ainsworth的的綱要。綱要。簡(jiǎn)介 美國(guó)的編寫者集國(guó)際學(xué)術(shù)界的權(quán)威學(xué) 者，為各國(guó)微生物分類學(xué)界公認(rèn)的一本經(jīng)典佳作。 第一版

8、1923年出版，后不斷再版至今，先后修訂出版了11個(gè)版本，1974年出版了第八版，1994年已出至第九版，由于G+Cmol%測(cè)定、核酸雜交和16SrRNA寡核苷酸序列測(cè)定等新技術(shù)和新目的的引入，使原核生物分類從以往以表型、適用性鑒定目的為主的舊體系向鑒定遺傳型的系統(tǒng)進(jìn)化分類新體系逐漸轉(zhuǎn)變，現(xiàn)書名已改為，Bergey Mamual of Systematic Bacteriology，簡(jiǎn)稱 20世紀(jì)初德國(guó)Lehmann和Neumann的 前蘇聯(lián)克拉西爾尼可夫的 法國(guó)A.R.Prevot的 基于基于16SrRNA的微生物微生物系統(tǒng)發(fā)育分析的微生物微生物系統(tǒng)發(fā)育分析 16SrRNA的序列高度保守，可準(zhǔn)確指示細(xì)菌之間的親緣的序列高度保守，可準(zhǔn)確指示細(xì)菌之間的親緣關(guān)系，關(guān)系， 16SrRNA的大小為的大小為1500bp左右，所含