應(yīng)化生態(tài)生物化學(xué)復(fù)習(xí)_第1頁
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文檔簡介

1、生物化學(xué)復(fù)習(xí)1. 解釋氨基酸的兩性解離性質(zhì)。如何判斷溶液中氨基酸帶什么電荷? 兩性解離-在水溶液中或在晶體狀態(tài)時都以兩性離子的形式存在,是兩性電解質(zhì),也叫偶極離子或兩性離子。不同pH中可解離為正離子、偶極離子或負離子 pHpI,負電2. 組成蛋白質(zhì)的氨基酸如何分類?這樣的分類有何意義? 根據(jù)R基的化學(xué)結(jié)構(gòu):脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、雜環(huán)氨基酸、雜環(huán)亞氨基酸 方便研究氨基酸的代謝途徑 根據(jù)R基的極性: 非極性R型氨基酸-丙氨酸Ala、纈氨酸Val、亮氨酸Leu、異亮氨酸Ile、脯氨酸Pro、甲硫氨酸Met、丙苯氨酸Phe、色氨酸Trp 不帶電荷的極性R基氨基酸-甘氨酸Gly、絲氨酸Ser、蘇氨

2、酸Thr、天冬酰胺Asn、谷氨酰胺Gln、絡(luò)氨酸Tyr和半胱氨酸Cys 極性帶負電的R基氨基酸-天冬氨酸Asp和谷氨酸Glu 極性帶正電的R基氨基酸-組氨酸His、精氨酸Arg、賴氨酸Lys 方便研究氨基酸的分離方法、考慮其在形成蛋白質(zhì)分子空間結(jié)構(gòu)中的作用3. 肽與肽鍵如何定義?一個氨基酸的-羧基與另一個氨基酸的-氨基脫水縮合形成的共價鍵稱為肽鍵,由此形成的化合物稱為肽。4. 肽的主鏈骨架和肽單位結(jié)構(gòu)有何特點?5. 如何描述蛋白質(zhì)構(gòu)象與構(gòu)型?蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)通常稱作蛋白質(zhì)的構(gòu)象或高級結(jié)構(gòu),是指蛋白質(zhì)分子中所有原子在三維空間的分布和肽鏈的走向蛋白質(zhì)的功能通常取決于它的特定構(gòu)象,主要取決于一級結(jié)構(gòu)

3、,一級結(jié)構(gòu)主要取決于遺傳構(gòu)型(configuration) 一個有機分子中各個原子特有的固定的空間排列.這種排列不經(jīng)過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的.構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化.構(gòu)象(conformation ) 指一個分子中,不改變共價鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子放置所產(chǎn)生的空間排布.一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時,不要求共價鍵的斷裂和重新形成.構(gòu)象改變不會改變分子的光學(xué)活性. 6. 如何看待蛋白質(zhì)構(gòu)象與遺傳的關(guān)系?蛋白質(zhì)的功能通常取決于它的特定構(gòu)象,主要取決于一級結(jié)構(gòu),一級結(jié)構(gòu)主要取決于遺傳7. 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)形成的作用力有何不同?二級結(jié)構(gòu)-由氫鍵維持;三級結(jié)構(gòu)-主要由疏

4、水作用維持8. 蛋白質(zhì)一、二、三和四級結(jié)構(gòu)如何定義?1. 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):指多肽鏈中的氨基酸序列(及二硫鍵的位置)2. 蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):指多肽主鏈有一定周期性的,由氫鍵維持的局部空間結(jié)構(gòu) 包括螺旋、折疊、轉(zhuǎn)角、凸起和無規(guī)則卷曲3. 三級結(jié)構(gòu):球形蛋白的多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)、超二級結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)域等結(jié)構(gòu)層次的基礎(chǔ)上,組裝而成的完整的結(jié)構(gòu)單元-主要由疏水作用力維持4. 四級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)由兩個或兩個以上相互關(guān)聯(lián)的具有三級結(jié)構(gòu)的亞單元組成,其中每一個亞單元稱為亞基,亞基間通過非共價鍵聚合而形成特定的構(gòu)象。蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)是指分子中亞基的種類、數(shù)量以及相互關(guān)系。9. 什么叫鹽析、分段鹽析、透析?它們有何作用

5、? 鹽析是根據(jù)溶解度不同分離蛋白質(zhì),透析則根據(jù)分子大小分離。 向某些蛋白質(zhì)溶液中加入某些無機鹽溶液后,可以降低蛋白質(zhì)的溶解度,使蛋白質(zhì)凝聚而從溶液中析出,這種作用叫作鹽析,是物理變化,可復(fù)原。改變鹽的濃度與溶液的PH值,便可將混合液中的蛋白質(zhì)逐個鹽析分開,這種分離蛋白質(zhì)的操作稱為分段鹽析透析(dialysis)是通過小分子經(jīng)過半透膜擴散到水(或緩沖液)的原理,將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。 10. 什么是蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)單元和功能單元? 結(jié)構(gòu)單元-超二級結(jié)構(gòu); 功能單元-結(jié)構(gòu)域11. 牛胰島素分子和肌紅蛋白分子結(jié)構(gòu)有何特點? 胰島素-相對分子質(zhì)量為5734,由A、B兩條肽鏈組成,

6、A、B鏈之間通過兩對二硫鍵相連,另外A鏈內(nèi)部6位和11位上的半胱氨酸通過二硫鍵形成鏈內(nèi)小環(huán)。 肌紅蛋白-一條肽鏈構(gòu)成,單結(jié)構(gòu)域蛋白質(zhì),整條肽鏈盤繞成一個致密的外圓中空的不對稱結(jié)構(gòu)。分子量17800.氨基酸殘基幾乎全分布在分子表面,與水結(jié)合,使肌紅蛋白有良好的可溶性。12. 蛋白質(zhì)的變性與復(fù)性是什么?為何蛋白質(zhì)具有生物活性?蛋白質(zhì)的變性:分子內(nèi)部原有的高度規(guī)律性結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,但一級結(jié)構(gòu)未被破壞蛋白質(zhì)的變性作用,如不過于劇烈,在一定條件下可恢復(fù)活性,稱為蛋白質(zhì)的復(fù)性。對一條多肽鏈構(gòu)成的蛋白質(zhì),具有三級結(jié)構(gòu)才具有生物學(xué)活性。對多亞基蛋白質(zhì)而言,單獨的亞基沒有生物學(xué)活性,只有完整的四級結(jié)構(gòu)寡聚體才有生

7、物學(xué)活性。大多數(shù)酶是蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)完整時具有催化活性。13. 胰蛋白酶屬于那一類酶,為什么?其對肽鍵作用有何特點? 屬于水解酶,有水分子參加反應(yīng)。 胰蛋白酶專一地水解賴氨酸或精氨酸羧基參與形成的肽鍵 (胰凝乳蛋白酶專一地水解芳基氨基酸或帶有較大極性側(cè)臉氨基羧酸基參與形成的肽鍵)14. 酶起作用時為什么具有專一性?酶對底物的選擇性具有專一性,只催化一種或一類反應(yīng)。(結(jié)構(gòu)專一性與立體異構(gòu)專一性)15. 寫出米氏方程。米氏方程表達了什么?Km對說明酶促反應(yīng)有何意義? Km可表示酶與底物的親和力。 Km大,親和力小,反之亦然。 米氏常數(shù)為酶促反應(yīng)速度達到最大速度一半時的底物濃度。 Km的重要意義:

8、 1)鑒別酶 2)通過Km判斷酶的專一性與天然底物 在同一酶不同底物的反應(yīng)中,Km最小的為親和力最好,為天然底物。 3)若知Km,可計算某一底物濃度時其反應(yīng)速度相當(dāng)于最大反應(yīng)速度的百分率,利于在實踐中可掌握酶促反應(yīng)的情況(如是否還需要加底物等)。16. 酶活力和酶的比活力各指的是什么?酶純度用什么表示? 酶活力單位數(shù)是指一定條件下,單位時間內(nèi)將一定量的底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物需要的酶量。 酶的比活力規(guī)定為每毫克酶蛋白所具有的酶活力單位數(shù)。 比活力是酶樣品純度的指標(biāo),含同種酶的不同酶樣品,比活力越高純度越大。17. 酶催化反應(yīng)有何特征?簡述酶催化作用的主要機制。 特征:專一性,高效性,條件溫和,受到調(diào)控。

9、 作用機制:酶分子的活性部位結(jié)合底物形成酶-底物復(fù)合物,在酶的幫助下(包括共價作用與非共價作用),底物進入特定的過渡態(tài),由于形成此類過渡態(tài)所需的活化能遠小于非酶促反應(yīng)所需的活化能,因此反應(yīng)能順利進行,形成產(chǎn)物并釋放出游離的酶,使其能參與其余底物的反應(yīng)。與該分子機理有關(guān)的因素包括鄰近效應(yīng)與定向效應(yīng)、促進底物過渡態(tài)形成的非共價作用、酸堿催化、共價催化、金屬離子催化等。這些因素有機的配合在一起發(fā)揮作用。18. 競爭性抑制發(fā)生的主要原理是什么? 底物與抑制劑結(jié)構(gòu)類似。底物與抑制劑競爭酶的活性中心。底物和抑制劑都能與酶的活性中心結(jié)合,這是競爭性抑制的實質(zhì)。19. 水解酶催化的反應(yīng)有何特點? 利用水催化分

10、子共價鍵斷裂(水解反應(yīng),必然有水分子參與)20. 酶及其輔助因子是指什么? 簡述它們之間的關(guān)系。 大多數(shù)酶是蛋白質(zhì),可分為單純蛋白與綴合蛋白。綴合蛋白質(zhì)又叫做全酶,由脫輔酶與輔因子兩部分組成。蛋白質(zhì)部分為脫輔酶,非蛋白質(zhì)部分為輔因子。21. 酶活性中心在結(jié)構(gòu)上有何特點? 體積小、具有立體三維結(jié)構(gòu)、含特定的催化基團、具有柔性、位于酶分子表面的裂隙中。22. 什么是DNA分子的二級結(jié)構(gòu)?有何特點?基因、基因組是什么? 二級結(jié)構(gòu): DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)。特點:堿基配對,兩條鏈反向平行纏繞構(gòu)成右手螺旋 基因-DNA上顯示功能的最小單位(片段)為一個基因 基因組-含有單體的全套遺傳物質(zhì)23. RNA如何分類

11、?主要作用是什么? rRNA-與蛋白質(zhì)結(jié)合組成核糖體 mRNA-用于蛋白質(zhì)的合成 tRNA-攜帶氨基酸到核糖體24. DNA、RNA水解的產(chǎn)物是什么? 脫氧核糖核苷酸、 核糖核苷酸25. 增色效應(yīng)和熔解溫度是什么? 由于核酸變性而使其在260nm的吸光值增大的現(xiàn)象,為增色效應(yīng)。 熔解溫度(Tm):加熱變性使DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半時(紫外吸收增加量達最大量一半時)的溫度。26. ATP、NADH、FADH2、乙酰輔酶A是什么物質(zhì)?在生物能量代謝中有何作用? ATP 高能腺苷三磷酸,是能量的載體和生物細胞內(nèi)能量代謝的偶聯(lián)劑。 NADH和FADH2是輔酶1FAD和FAD的還原態(tài),是高勢能化合物,有

12、傳遞電子和能量的作用。 乙酰輔酶A是?;妮d體,是乙?;c輔酶A的結(jié)合。有巰基高能鍵,是活化了的乙?;?,可提供C源,是代謝中起樞紐作用的物質(zhì)。27. 什么是生物氧化?其有何特點? 生物氧化是細胞內(nèi)的代謝過程,有機物在生物體內(nèi)氧的作用下,生成CO2和水并放出能量變化。 特點:1)37,近乎中性溶液,一系列酶催化2)能量逐步釋放 3)CO2的生成是有機物脫羧產(chǎn)生的,有-脫羧與脫羧。4)水的生成-代謝產(chǎn)物脫下的氫與氧結(jié)合生成5)場所-真核生物 線粒體;不含線粒體的原核生物 細胞膜28. 什么叫氧化磷酸化和底物水平磷酸化?生物體內(nèi)合成ATP的途徑是什么? 氧化磷酸化:在生物氧化的電子傳遞過程中的偶聯(lián)磷

13、酸化作用。 此作用是將生物氧化所產(chǎn)生的自由能用來使ADP變成ATP的過程。 底物水平磷酸化是氧化磷酸化的一種,是指在被氧化的底物上發(fā)生磷酸化作用。即底物被氧化的過程中,形成某些高能磷酸化合物,這些高能磷酸化合物通過酶的作用使ADP生成ATP。通常所說的氧化磷酸化是指電子傳遞體系磷酸化。ATP來源:光合作用,氧化磷酸化(電子傳遞體系磷酸化),底物水平磷酸化。29. 何為電子傳遞鏈和化學(xué)滲透假說? 電子傳遞鏈(呼吸鏈):在真核細胞的線粒體內(nèi)膜或原核細胞的質(zhì)膜上,一系列電子和質(zhì)子傳遞體,按一定順序排列構(gòu)成的傳遞電子的多酶體系。它們的輔酶或輔基起到傳遞氫或電子的作用?;瘜W(xué)滲透假說要點:電子傳遞過程在線

14、粒體內(nèi)膜上進行,同時把H+泵至內(nèi)膜外。內(nèi)膜內(nèi)外H+的濃度差是合成ATP的能量來源。由于膜內(nèi)外H+濃度差,二個H+從高濃度的膜外返回膜內(nèi)時,通過ATP合酶使一個Pi與一個ADP合成一個ATP。30. 糖酵解、酒精發(fā)酵、乳酸發(fā)酵是什么?生物機體中將葡萄糖轉(zhuǎn)變成丙酮酸并同時生成ATP的一系列反應(yīng),為糖酵解。酒精發(fā)酵-由葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)橐掖嫉倪^程乳酸發(fā)酵-由葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)槿樗岬倪^程。31. 三羧酸循環(huán)如何定義?循環(huán)步驟如何?循環(huán)一周產(chǎn)生的能量如何計算?乙酰輔酶A的乙?;糠质窃谟醒鯒l件下通過一種循環(huán)被徹底氧化為CO2和水的。循環(huán)始于草酰乙酸和乙酰輔酶a縮合生成的含有三個羧基的檸檬酸,因此稱三羧酸循環(huán)或檸檬酸

15、循環(huán)。TCA循環(huán)是物質(zhì)代謝的樞紐a.能量代謝的中心。由于TCA循環(huán),可獲得大量能量。b.物質(zhì)代謝的中心。各大物質(zhì)的代謝可通過TCA循環(huán)相互連接。能量計算:乙酰輔酶A完全消耗完:形成三個NADH、一個FADH2、一個GTP(ATP),即產(chǎn)生ATP的數(shù)目為32.511.5110。從丙酮酸開始:多了一個NADH,故為12.5個ATP。從葡萄糖開始(包括糖酵解):形成二個丙酮酸共得25個,糖酵解中2個ATP與二個NADH(5個ATP),故總數(shù)為32個ATP。32. 戊糖磷酸途徑與脂肪酸的合成有何關(guān)系? 葡萄糖的降解代謝不是走糖酵解過程,而是走直接氧化,經(jīng)戊糖磷酸最后完全降解產(chǎn)生CO2、NADPH的過程

16、叫戊糖磷酸途徑。 產(chǎn)生大量的NADPH,為細胞的各種合成反應(yīng)提供還原劑(力),比如參與脂肪酸和固醇類物質(zhì)的合成。33. 何為限速步驟和限速酶?由激酶催化的一般為不可逆過程,這些酶稱為限速酶,不可逆過程也稱為限速步驟。三個限速步驟:已糖(葡萄糖)激酶 果糖磷酸激酶 丙酮酸激酶34. 人體內(nèi)如何進行多糖的合成與分解?多糖的合成:活化的葡萄糖在糖原合酶的作用下,轉(zhuǎn)移到多糖引物上。 UDPG + 引物 UDP + 引物-G 糖原合酶(UDPG轉(zhuǎn)葡糖苷酶) 分解: 1)-淀粉酶和-淀粉酶的作用 只能作用于-1,4糖苷鍵, -淀粉酶任意內(nèi)切, -淀粉酶從淀粉鏈的非還原端開始切。它們水解的產(chǎn)物一般是麥芽糖(

17、雙糖)。進一步在麥芽糖酶作用下成為葡萄糖。 2)磷酸解 在磷酸化酶的作用下,多糖的非還原性末端葡萄糖與多糖主鏈斷裂形成葡萄糖-1-磷酸。 葡萄糖-1-磷酸在變位酶作用下成為葡萄糖-6-磷酸,進入糖酵解?;蛘?,葡萄糖-6-磷酸在葡萄糖-6-磷酸酶水解下生成葡萄糖和磷酸。 3)由脫支酶與磷酸化酶共同作用降解 脫支酶的作用包含轉(zhuǎn)移葡萄糖殘基和水解-1,6糖苷鍵(P227)。 35. 為什么說三羧酸循環(huán)是物質(zhì)代謝的樞紐?a.能量代謝的中心。由于TCA循環(huán),可獲得大量能量。b.物質(zhì)代謝的中心。各大物質(zhì)的代謝可通過TCA循環(huán)相互連接。36. 何為-氧化?其產(chǎn)物是什么? -氧化降解:脂肪酸在一系列酶的作用下

18、于、碳原子之間斷裂形成乙酰輔酶A和少二個碳原子的脂酰輔酶A(脂肪酸)的過程,其重復(fù)進行,最后使脂肪酸降解為二碳化合物,叫脂肪酸的-氧化降解。(產(chǎn)物為乙酰輔酶A)37. ACP是什么?脂肪酸的從頭合成途徑是指什么? ACP:?;d體蛋白脂肪酸從頭合成途徑:以乙酰輔酶A為原料,在?;d體蛋白(ACP)及一系列酶(脂肪酸合酶等)的作用下合成16碳飽和脂肪酸的過程。38. 人的消化液如何對蛋白質(zhì)進行降解? 細胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解:溶酶體降解 依賴ATP,在細胞溶膠中以泛素(Ub)標(biāo)記的選擇性蛋白質(zhì)的降解 外源蛋白的酶促降解:以人的消化液對蛋白質(zhì)的降解為例、食物蛋白經(jīng)口腔加溫,進入胃后,胃粘膜分泌胃泌素,刺激

19、胃腺的胃壁細胞分泌鹽酸和主細胞分泌無活性的胃蛋白酶原。激活成為胃蛋白酶,將食物蛋白水解為大小不等的肽片段。進入小腸,經(jīng)催化產(chǎn)生胰蛋白酶,將肽片段水解為更短的肽,最終被催化降解為氨基酸。39. 聯(lián)合脫氨有哪些內(nèi)容? 氧化脫氨和轉(zhuǎn)氨作用一起進行。 第1個內(nèi)容:轉(zhuǎn)氨酶和L-谷氨酸脫氫酶聯(lián)合脫氨 第2個內(nèi)容:嘌呤核苷酸循環(huán)40. 氨基酸脫氨后的碳架有何去路? 1. 合成新的氨基酸。 2. 氧化成CO2和水,產(chǎn)生能量。41. 氨基酸脫羧酶有何特點? 脫羧酶專一性強,輔酶是磷酸吡哆醛(維生素B6)。42. 什么是轉(zhuǎn)氨作用和一碳單位? 轉(zhuǎn)氨基作用:在轉(zhuǎn)氨酶作用下氨基酸把氨基轉(zhuǎn)移到酮酸上。 一碳單位:某些氨基

20、酸在分解代謝過程中產(chǎn)生的含有一個碳原子的基團43. 生糖氨基酸和生酮氨基酸有何區(qū)別? 生糖氨基酸:在體內(nèi)可以轉(zhuǎn)變?yōu)樘?,按糖代謝途徑進行代謝 生酮氨基酸:在體內(nèi)能轉(zhuǎn)變?yōu)橥w,按脂肪酸代謝途徑進行代謝44. 在體內(nèi)氨基酸是如何合成的? 碳架由糖代謝、氨基酸降解后的碳架(酮酸等)來提供。氨基主要來自轉(zhuǎn)氨作用。1)-酮戊二酸衍生類:以-酮戊二酸為起始物,可合成Glu,Gln,Pro,Arg(稱為谷氨酸族)。2)草酰乙酸衍生類:以草酰乙酸為起始物,可合成Asp,Asn,Met,Thr,Lys,Ile(稱為天冬氨酸族)。3)丙酮酸衍生類:以丙酮酸為起始物,可合成Ala,Val,Leu(丙氨酸族)。4)甘油酸-3-磷酸衍生類:以甘油酸-3-磷酸為起始物,可合成Ser,Gly,Cys(絲氨酸族)。5)赤蘚糖-4-磷酸衍生類:以赤蘚糖-4-磷酸、磷酸烯醇式丙酮酸為起始物,可合成芳香族氨基酸

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