PLFA法和DGGE法分析堆肥細(xì)菌群落變化_圖文

1、 第 30 卷第 6 期 農(nóng) 業(yè) 環(huán) 境 科 學(xué) 學(xué) 報(bào) 1247 是溫度開(kāi)始下降， 基本維持在中溫 （2040 ） ， 部分 o、 q 所代表的細(xì)菌， 嗜熱細(xì)菌死亡， 如條帶 l、 部分嗜 i、 n 所代表的細(xì)菌?？?溫細(xì)菌又開(kāi)始生長(zhǎng)， 如條帶 h、 以說(shuō)堆肥過(guò)程是微生物群落結(jié)構(gòu)與堆肥溫度相互制 約的過(guò)程， 溫度無(wú)疑是堆肥過(guò)程的最佳控制參數(shù)。 與傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法相比， 非培養(yǎng)生物技術(shù)更 能準(zhǔn)確全面地反映堆肥微生物群落結(jié)構(gòu)組成。 在本次 研究中以組合 PLFA 法和 DGGE 法分析堆肥微生物 群落結(jié)構(gòu)的變化， 雖然兩類方法顯示的信息并不完全 一致， 但也因此說(shuō)明了不同方法顯示的信息并不是絕

2、 對(duì)的， 采用各類方法組合研究微生物的信息變化是很 有必要的。 4 Howelera M, Ghiorseb W C, Walker Larry P. A quantitative analysis of DNA extraction and purification from compostJ. Journal of Microbio logical Methods, 2003, 54 37-45. （1 ） ： 5 喻 曼 , 許育新 , 曾光明 , 等 . RFLP 法研究接種對(duì)農(nóng)業(yè)廢物堆肥微 396-399. （2 ） ： 生物多樣性的影響J. 農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào), 2010, 29 Y

3、U Man, XU Yu-xin, ZENG Guang-ming, et al. Effect of inoculation on during agriculture waste composting analyzed by RFLP methodJ. Jour nal of Agro-Environment Science , 2010, 29 396-399. （2 ） ： 6 Ishii K, Fukui M, Takii S, et al. Microbial succession during a compost ing process as evaluated by denat

4、uring gradient gel electrophoresis anal ysisJ. Journal of Applied Microbiology , 2000, 89 768-777. （5 ） ： 7 Fang J, Barcelona M J, Alvarez P J. A direct comparison between fatty acid and intact phospholipid profiling for microbial identification J. Organic Geochemistry, 2000, 31 881-887. （9 ） ： 8 Yu

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6、on methods for obtaining PCR -amplifiable DNA from compost for microbial community analysisJ. Journal of Microbio logical Methods, 2002, 49 255-264. （3 ） ： 10 劉有勝, 楊朝暉, 曾光明, 等 . PCR-DGGE 技術(shù)對(duì)城市餐廚垃圾堆 1-6. 肥中細(xì)菌種群結(jié)構(gòu)分析J. 環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào), 2007, 27 （5 ） ： LIU Y S, YANG Z H, ZENG G M, et al. Application of PCR-DGGE

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10、t facial bacterial communities as revealed by 16S ribosomal DNAJ. FEMS Microbiology Ecology , 2003, 43： 225-235. 16 Strom P F. Identification of thermophilic bacteria in solid waste com postingJ. Applied and Environmental Microbiology, 1985, 50 906（4 ） ： 913. 17 Tiedje J M, Asuming B S, Nüsslei

11、n K, et al. Opening the black box of soil microbial diversityJ. Applied Soil Ecology, 1999, 13 109-112. （1 ） ： 4 結(jié)論 （1 ） 單體 PLFA 數(shù)據(jù)顯示樣品之間的群落結(jié)構(gòu)有 明顯差異，隨著堆肥進(jìn)程的進(jìn)行，群落在不斷演替， PLFA 數(shù)據(jù)可以表征較完整的微生物群落結(jié)構(gòu)變化并 較為明確地表征微生物生物量的變化， 但是 PLFA 法 不能給出具體的物種變化信息。 DGGE 方法主成分分析數(shù)據(jù)顯示本次研究堆 （2 ） 肥過(guò)程中的樣點(diǎn)和 DGGE 條帶數(shù)據(jù)都有 3 大主要類 別， 同時(shí)指示堆

12、肥過(guò)程中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)至少經(jīng)歷了 3 個(gè)階段的演替， 即嗜溫細(xì)菌群落 、 高溫細(xì)菌群落和腐 熟期細(xì)菌群落。 堆肥過(guò)程是微生物群落結(jié)構(gòu)與堆肥溫 度相互制約的過(guò)程。 （3 ） 雖然兩類方法顯示的信息并不完全一致， 但 也因此說(shuō)明了不同方法顯示的信息并不是絕對(duì)的， 采 用各類方法組合研究堆肥微生物的信息變化是很有 必要的。 參考文獻(xiàn)： 1 Steger K, Jarvis A, Sven S, et al. Comparison of signature lipid methods to determine microbial community structure in compostJ. Journal of Microbiological Methods, 2003, 55 371-382. （2 ） ： 2 Klamer M, B覽覽th E. Microbial community dynamics during composting of straw material studied using phospholipid fatty acid analysis J. FEMS Microbiology Ecology , 1998,