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文檔簡(jiǎn)介
1、1第三章、核酸(nucleic acid)2本章內(nèi)容提要:n第一節(jié)、核酸的發(fā)現(xiàn)與研究簡(jiǎn)史n第二節(jié)、核酸的種類、分布及功能n第三節(jié)、核酸的組成、結(jié)構(gòu)n第四節(jié)、核酸的理化性質(zhì)n第五節(jié)、核酸的研究方法3第一節(jié)、核酸的發(fā)現(xiàn)與研究簡(jiǎn)史n1868年,瑞士的外科醫(yī)生Friedrich Miescher從膿細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了DNA。n1944 年, O. Avery 通過(guò)肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)證明DNA是遺傳物質(zhì)n1953年, Watson-Crick提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型,為分子生物學(xué)的發(fā)展史奠定了基礎(chǔ)。n2000年,人類基因組計(jì)劃(HGP)基本完成:返回4肺炎雙球菌轉(zhuǎn)化試驗(yàn)研究對(duì)象:肺炎雙球菌SIII型菌株:有莢
2、膜,菌落表面光滑,有致病性RII型菌株:無(wú)莢膜,菌落表面粗糙,無(wú)致病性56Watson-Crick的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型7人類基因組計(jì)劃(HGP):n1986年,著名生物學(xué)家H.Dulbecco在Science雜志率先提出;完成人類基因組DNA全序列測(cè)定;是生物學(xué)有史以來(lái)最巨大和意義深遠(yuǎn)的一項(xiàng)科學(xué)工程;將有益于人類健康、醫(yī)療、制藥、人口、環(huán)境等方面,對(duì)生命科學(xué)也有極大貢獻(xiàn)。n人類細(xì)胞有23對(duì)染色體,單倍體基因組大約有3109堿基對(duì)8第二節(jié)、核酸的種類、分布及功能一、核酸的種類n脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)和核糖核酸(ribonucleic acid, RN
3、A)兩大類。9nDNA:含有D-2-脫氧核糖和胸腺嘧啶;通常為雙鏈結(jié)構(gòu),使DNA分子穩(wěn)定;是主要的遺傳物質(zhì),通過(guò)復(fù)制而將遺傳信息由親代傳給子代。nRNA:含有D-核糖和尿嘧啶;通常為單鏈結(jié)構(gòu)(某些病毒為雙鏈RNA);與遺傳信息的表達(dá)有關(guān)。10、DNA的種類n1、線型雙鏈DNA:真核生物染色體DNA、某些病毒DNA 。n2、環(huán)狀雙鏈DNA:原核生物染色體DNA、質(zhì)粒DNA、真核生物細(xì)胞器DNA、某些病毒DNA 。n3、線型單鏈DNA:某些病毒DNA,如:小鼠微小病毒n4、環(huán)狀單鏈DNA:某些病毒DNA,如:絲桿噬菌體fd11n質(zhì)粒(plasmid):細(xì)菌中的染色體外的遺傳成分;為環(huán)狀雙鏈DNA分
4、子;為重組DNA技術(shù)中的有用工具。12、RNA的種類1、信使RNA ( mRNA)n占細(xì)胞總RNA的3%5%左右,含量最少;代謝活躍。在蛋白質(zhì)的生物合成中起模板作用。2、轉(zhuǎn)移RNA (tRNA) n占細(xì)胞總RNA的15%左右;細(xì)胞中最小的一種RNA分子。在蛋白質(zhì)的生物合成中起攜帶氨基酸和解譯的作用。133、核糖體RNA (ribosome RNA ,rRNA) n占細(xì)胞中總RNA80%左右,含量最大 。在蛋白質(zhì)合成中起催化作用,催化肽鍵的形成(可以說(shuō),核糖體是一種核酶,蛋白質(zhì)只是維持rRNA構(gòu)象)。原核細(xì)胞中rRNA有三種,分別是:16SrRNA(小亞基),23SrRNA、5SrRNA(大亞基
5、) ;高等真核細(xì)胞中rRNA有四種,分別是: 18SrRNA (小亞基), 28SrRNA、5.8SrRNA、5SrRNA (大亞基) 。14二、核酸的分布n1、DNA的分布n核( 98 %) ;漿( 2 %)n原核細(xì)胞:核區(qū);細(xì)胞質(zhì)n真核細(xì)胞:細(xì)胞核;線粒體、葉綠體等細(xì)胞器n2、RNA的分布n核(%) 90n3、病毒或只含DNA,或只含RNA。15三、核酸的生物功能1、是主要的遺傳物質(zhì)2、RNA功能的多樣性n控制蛋白質(zhì)合成;n作用于RNA轉(zhuǎn)錄后加工與修飾;n基因表達(dá)與細(xì)胞功能的調(diào)控;n催化作用;n遺傳信息的加工與進(jìn)化;n在RNA病毒中是遺傳信息的一級(jí)載體返回16第三節(jié)、核酸的組成、結(jié)構(gòu)171
6、8一、核苷酸n包括核糖核苷酸( RNA的結(jié)構(gòu)單位)和脫氧核糖核苷酸( DNA的結(jié)構(gòu)單位)n細(xì)胞內(nèi)還有各種游離的核苷酸和核苷酸衍生物,它們有重要的生理功能。n如:FAD、CoA、NAD+、NADP+、腺苷鈷胺素19(一)堿基(base)1、嘧啶堿(pyrimidine base)n嘧啶的衍生物。n核酸中常見(jiàn)的嘧啶:胞嘧啶(cytosine,C) 、尿嘧啶(uracil,U) ( RNA )、胸腺嘧啶(thymine,T) ( DNA )。n胸腺嘧啶在tRNA中也有少量存在。2、嘌呤堿(purine base)n嘌呤的衍生物。n核酸中常見(jiàn)的嘌呤:鳥(niǎo)嘌呤(guanine,G)、腺嘌呤(adenine
7、,A)202-氧,4-氨基嘧啶5-甲基尿嘧啶2,4-二氧嘧啶6-氨基嘌呤2-氨基,6-氧嘌呤21n核酸中五種堿基中的酮基和氨基,均位于堿基環(huán)中氮原子的鄰位,可以發(fā)生酮式一烯醇式或氨基、亞氨基之間的結(jié)構(gòu)互變,書(shū)寫(xiě)時(shí)用任何一種皆可。n這種互變異構(gòu)在基因的突變和生物的進(jìn)化中具有重要作用 。223、稀有堿基(minorbase)(1)稀有堿基:又稱修飾堿基(modified base),稀有的微量堿基衍生物。(2)稀有堿基種類極多,大多數(shù)都是甲基化(m)堿基。n修飾基團(tuán)在堿基上的寫(xiě)在堿基符號(hào)左邊,修飾基團(tuán)在核糖上的寫(xiě)在堿基符號(hào)右邊,修飾基團(tuán)的位置寫(xiě)在右上角,數(shù)目寫(xiě)在右下角。(3)稀有堿基在各種類型核酸
8、中的分布不均一,在tRNA中含量較高(可高達(dá)10%)2324(二)核苷n1.核苷:由戊糖與堿基以糖苷鍵連接而成,是一種糖苷。n2.通常是戊糖的C1與嘧啶堿的N1或嘌呤堿的N9相連接。糖苷鍵為CN鍵,為N-糖苷鍵(核酸中均為-糖苷鍵)。n3.包括核糖核苷和脫氧核糖核苷。25n4.糖環(huán)中的碳原子標(biāo)號(hào)右上角加撇,而堿基中原子的標(biāo)號(hào)不加撇。n5、稀有核苷包括修飾核苷和異構(gòu)化核苷。n核糖也能被修飾,主要是甲基化;n稀有核苷主要在RNA中;n假尿苷:核糖的C1與尿嘧啶的C5相連。26(三)核苷酸1.核糖核苷的糖環(huán)上有3個(gè)自由羥基,能形成3種不同的核苷酸;n脫氧核糖核苷的糖環(huán)上有2個(gè)自由羥基,只能形成2種不
9、同的核苷酸;n生物體內(nèi)游離存在的核苷酸多是5-核苷酸。n用堿水解RNA時(shí),可得到2-核糖核苷酸與3-核糖核苷酸的混合物。272.多磷酸核苷酸n種類: 5-二磷酸核苷( 5- NDP)、 5 -三磷酸核苷( 5- NTP)n功能:核酸合成的前體;重要的輔酶和能量載體。2829303、環(huán)化核苷酸n重要的有:cAMP、cGMP。n功能:細(xì)胞功能的調(diào)節(jié)因子和信號(hào)分子。31cAMP的產(chǎn)生32二、核酸的共價(jià)結(jié)構(gòu)n核酸的共價(jià)結(jié)構(gòu):即核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu),指核酸的核苷酸序列。(一)核酸中核苷酸的連接方式n3,5磷酸二酯鍵n書(shū)寫(xiě)順序:5 333n核酸共價(jià)結(jié)構(gòu)的表示方法:n豎線式表達(dá)法:用豎線代表戊糖,字母代表堿基;P
10、代表磷酸基團(tuán)n文字表示法:P在堿基左側(cè),表示P在C5位置上, P在堿基右側(cè),表示P與C3相連,書(shū)寫(xiě)順序5 3。5pCpApG334(二)DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)nDNA的一級(jí)結(jié)構(gòu):構(gòu)成DNA的脫氧核苷酸按照一定的排列順序,通過(guò)3,5磷酸二酯鍵相連形成的線形結(jié)構(gòu)。也稱為堿基的排列順序。35(三)RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)1、tRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)n3端皆為CpCpAOH。362、mRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)(1)原核細(xì)胞:多順?lè)醋樱╟istron),即一條mRNA鏈上有多個(gè)編碼區(qū),5端和3端各有一段非翻譯區(qū)(untranslated region,UTR)n順?lè)醋樱夯蚬δ艿膯挝唬痪幋a一條多肽鏈的一段染色體;一種結(jié)構(gòu)基因。37
11、(2)真核生物的mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)單順?lè)醋印?5端有帽子結(jié)構(gòu):由甲基化鳥(niǎo)苷經(jīng)焦磷酸與mRNA的的5末端核苷酸相連,形成5,5-三磷酸連接。(圖)n三種類型:m7G5PPP5Np; m7G5PPP5NmpNp; m7G5PPP5NmpNmpNp三種。n作用:抗5核酸外切酶的降解作用;在蛋白質(zhì)合成過(guò)程中,有助于核糖體對(duì)mRNA的識(shí)別與結(jié)合,使翻譯得以正確起始。 3端有poly(A):3端大約20250的聚腺苷酸,可能與mRNA從細(xì)胞核到細(xì)胞質(zhì)的運(yùn)輸有關(guān)。38甲基鳥(niǎo)苷5,5-三磷酸 5-帽子:m7G 5 -ppp5-Nm( Nm )p-3940三、DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)(一) Chargaff規(guī)則n關(guān)于D
12、NA堿基組成的規(guī)律,包括:n1.A=T;n2.G=C;n3.含氨基的堿基(A+C)=含酮基的堿基(G+T)n4.A+G=C+Tn暗示了A與T, G與C相互配對(duì)的可能性。nDNA堿基組成具有生物種的特異性。41(二)DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)1、雙螺旋結(jié)構(gòu)模型-Watson-Crick,1953:n兩條平行多脫氧核苷鏈以相反方向圍繞同一軸盤(pán)繞;兩條鏈都是右手螺旋(圖)。n兩條鏈配對(duì)偏向一側(cè),形成一條大溝和一條小溝(圖) 。n堿基在螺旋內(nèi),其平面與中心軸垂直;磷酸與核糖在外,由3,5-磷酸二酯鍵連接,糖環(huán)平面與中心軸平行(圖)。n螺旋平均直徑為2nm,堿基對(duì)的堆積距離為0.34nm,每10個(gè)核苷酸形成螺旋的
13、一轉(zhuǎn)(圖)。n兩條鏈由堿基對(duì)之間的氫鍵相連,在空間上可能的堿基對(duì)只有A與T(兩個(gè)氫鍵)以及G與C(三個(gè)氫鍵)(圖) 。42434445462、其他nDNA能以多種不同的構(gòu)象存在。n1.B-DNA:Watson-Crick雙螺旋,比較接近細(xì)胞正常狀態(tài)下DNA存在的構(gòu)象。n2. A-DNA:比較粗短,堿基傾角大一些,大溝深度明顯超過(guò)小溝。n3. Z-DNA:細(xì)長(zhǎng),大溝平坦,磷酸和糖骨架呈Z字型;左手DNA螺旋。(圖)nDNA的變構(gòu)效應(yīng)可能與基因表達(dá)的調(diào)節(jié)有關(guān)。4748493、特殊的DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)(1) 回文結(jié)構(gòu)n回文結(jié)構(gòu)也稱反向重復(fù)(inverted repeats)50(2) 發(fā)夾形和十字形51
14、(3) H-DNA-三鏈螺旋524、維持DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的作用力n氫鍵n雖然它只是一種作用較弱的次級(jí)鍵,但當(dāng)DNA分子中氫鍵數(shù)量眾多,仍可產(chǎn)生足夠的能量來(lái)維持DNA分子結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性。n堿基堆積力n堿基堆積力實(shí)質(zhì)是疏水相互作用和范德華力。它對(duì)維持DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)起主要作用。53(三) DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)n1、DNA三級(jí)結(jié)構(gòu): DNA分子(雙螺旋)通過(guò)扭曲和折疊所形成的特定構(gòu)象。n2.超螺旋(superhelix) :環(huán)狀雙鏈DNA或兩端固定的線形雙鏈DNA進(jìn)一步纏繞時(shí)形成的結(jié)構(gòu); DNA三級(jí)結(jié)構(gòu)的一種形式;具有更致密的結(jié)構(gòu)。54n負(fù)超螺旋(negative superhelix) :向DNA雙螺旋的相
15、反方向纏繞而成的超螺旋,又稱松弛纏繞;天然的超螺旋DNA均為負(fù)超螺旋;可使其二級(jí)結(jié)構(gòu)處于松散狀態(tài),使分子內(nèi)部張力減少,利于DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和基因重組。n正超螺旋(positive superhelix) :向DNA雙螺旋的相同方向纏繞而成的超螺旋,又稱緊密纏繞;使分子內(nèi)部張力加大,旋得更緊。55(四)DNA與蛋白質(zhì)復(fù)合物的結(jié)構(gòu)n生物體內(nèi)的核酸通常都與蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合物,以核蛋白的形式存在。如:病毒、真核生物的染色體。56真核生物染色體的結(jié)構(gòu)n基本單位核小體(nucleosome):由DNA和組蛋白核心構(gòu)成;n組蛋白:H2A、H2B、H3、H4、 H1n核心由H2A、H2B、H3、H4各兩個(gè)組
16、成八聚體;nDNA以左手螺旋在組蛋白核心上盤(pán)繞1.8圈,共146bp,n核小體之間有連接DNA和組蛋白H1連接呈串珠狀結(jié)構(gòu)。(圖)5758四、RNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)nRNA通常是單鏈線形分子,但可自身回折形成局部雙螺旋(二級(jí)結(jié)構(gòu)),進(jìn)而折疊(三級(jí)結(jié)構(gòu))。除tRNA外,幾乎所有RNA都與蛋白質(zhì)形成核蛋白復(fù)合物(四級(jí)結(jié)構(gòu))nRNA二級(jí)結(jié)構(gòu):?jiǎn)捂淩NA自行盤(pán)繞形成局部雙螺旋的多“莖”多“環(huán)”結(jié)構(gòu)。螺旋部分稱為“莖”或“臂”;非螺旋部分稱為“環(huán)”;在螺旋區(qū),A與U配對(duì),G與C配對(duì)。(圖)5960(一)tRNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)1、tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)(1)形狀:三葉草形。(2)組成:4臂4環(huán)組成n4臂:氨基酸接受臂、
17、反密碼臂、二氫尿嘧啶臂、TC臂。n4環(huán):反密碼環(huán)(次黃嘌呤I核苷酸常出現(xiàn)于反密碼子中)、二氫尿嘧啶環(huán)、TC環(huán)和額外環(huán)(大小不同, tRNA分類的重要指標(biāo))(圖)6162n(1)氨基酸臂:由7對(duì)堿基組成,富含鳥(niǎo)嘌呤,末端為CCA,接受活化的氨基酸。n(2)二氫尿嘧啶環(huán):由812個(gè)核苷酸組成,具有兩個(gè)二氫尿嘧啶,故得名。n(3)反密碼環(huán):由7個(gè)核苷酸組成。環(huán)中部為反密碼子,由3個(gè)堿基組成。次黃嘌呤核苷酸(I)常出現(xiàn)于反密碼環(huán)中。n(4)額外環(huán):有318個(gè)核苷酸組成。不同的tRNA有不同大小的額外環(huán),故可作為tRNA分類指標(biāo)。n(5)TC環(huán):由7個(gè)核苷酸組成。幾乎所有tRNA在此環(huán)中都含有TC。63
18、2、tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)n倒“L”形,所有的tRNA折疊后形成大小相似及三維構(gòu)象相似的三級(jí)結(jié)構(gòu)。 64(二)rRNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)大腸桿菌16SrRNA和5SrRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)返回65第四節(jié)、核酸的理化性質(zhì)一、核酸的水解(一)核酸的酸解n糖苷鍵和磷酸酯鍵都能被酸水解;66 n糖苷鍵比磷酸酯鍵更易被酸水解;n嘌呤堿的糖苷鍵比嘧啶堿的糖苷鍵對(duì)酸更不穩(wěn)定;n對(duì)酸最不穩(wěn)定的是嘌呤與脫氧核糖之間的糖苷鍵。如:nDNA在pH1.6于37對(duì)水透析,可完全除去嘌呤堿,得到無(wú)嘌呤酸(apurinic acid)。67(二)堿水解n1、RNA的磷酸酯鍵易被堿水解,產(chǎn)生核苷酸。n原因: RNA的核糖上有2-OH羥基,在堿
19、作用下形成磷酸三酯;磷酸三酯極不穩(wěn)定,隨即水解,產(chǎn)生核苷2,3-環(huán)磷酸酯;環(huán)磷酸酯繼續(xù)水解,產(chǎn)生2-核苷酸和3-核苷酸。(圖)n2、 DNA的磷酸酯鍵不易被堿水解, DNA一般對(duì)堿穩(wěn)定。6869(三)酶水解1、水解核酸的酶(1)磷酸二酯酶:非特異性水解磷酸二酯鍵的酶。n催化寡核苷酸及多核苷酸中雙重酯化的磷酸分子進(jìn)行水解的酶類。如:3,5-cAMP磷酸二酯酶。(2)核酸酶(nuclease):專一水解核酸的磷酸二酯酶。702、核酸酶的分類(1)按照對(duì)底物作用的方式n核酸內(nèi)切酶(endonuclease)和核酸外切酶(exonuclease)(2)按照磷酸二酯鍵斷裂的方式n在3-羥基與磷酸基之間斷
20、裂n在5-羥基與磷酸基之間斷裂71(3)按照底物專一性n核糖核酸酶(RNase)和脫氧核糖核酸酶(DNase)723、限制性內(nèi)切酶n限制性內(nèi)切酶(restriction endonuclease):簡(jiǎn)稱限制酶(restriction enzyme);存在于原核生物中;催化對(duì)外源DNA的降解;識(shí)別DNA中特異的堿基序列,將DNA分子剪切為數(shù)量不多的片段(限制性片段);為基因工程最重要的工具酶。73n限制性內(nèi)切酶的特征 具有嚴(yán)格的堿基專一性,有專一的識(shí)別順序、切點(diǎn) 粘性未端,平整末端74舉例: 75二、核酸的酸堿性質(zhì)n核酸的磷酸基具有酸性,堿基具有堿性,因此,核酸具有兩性電離的性質(zhì),為兩性電解質(zhì)。
21、n核酸中磷酸基的酸性大于堿基的堿性,其等電點(diǎn)偏酸性。DNA的pI約為45,RNA的pI約為2.02.5,在pH78電泳時(shí)泳向正極。76三、核酸的紫外吸收(一)核酸的紫外吸收特性n嘌呤堿和嘧啶堿具有共軛雙鍵,使堿基、核苷、核苷酸和核酸在240290nm的紫外波段有一強(qiáng)烈的吸收峰,最大吸收值在260nm附近。77(二)核酸的紫外吸收特性的應(yīng)用1. 作為定量測(cè)定核酸的方法。2. 鑒定核酸樣品的純度。A260/A280比值:純DNA=1.8;純RNA=2.0;樣品中含有雜蛋白, A260/A280比值明顯降低。3.可判斷核酸是否發(fā)生變性或降解。增色效應(yīng)(hyperchromic effect):當(dāng)核酸
22、變性或降解時(shí),其紫外線吸收強(qiáng)度顯著增高減色效應(yīng)(hypochromic effect):變性的核酸在一定條件下恢復(fù)原有性質(zhì)時(shí),其紫外線吸收強(qiáng)度又可回復(fù)到原有水平。n雙螺旋結(jié)構(gòu)使堿基對(duì)的電子云發(fā)生重疊,減少了對(duì)紫外光的吸收。78四、核酸的變性、復(fù)性和雜交(一)核酸的變性(denaturation)1、核酸的變性:核酸雙鏈螺旋區(qū)的氫鍵斷裂,變成單鏈,不涉及共價(jià)鍵的斷裂。n與核酸的降解區(qū)別開(kāi)。2、引起核酸變性的因素n加熱、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)試劑(尿素、甲醛、甲醇、乙醇、甲酰胺等)或射線等一切可以破壞核酸分子氫鍵的處理,都可使核酸變性。3、變性DNA的特征n紫外吸收增強(qiáng);粘度降低;浮力密度升高;比旋下降
23、;生物功能減小或消失等。794、DNA的熱變性nDNA熱變性是在一個(gè)很窄的溫度范圍內(nèi)發(fā)生的。nDNA的融解溫度(Tm):或稱熔點(diǎn),在核酸加熱變性過(guò)程中,核酸分子內(nèi)50%的雙螺旋結(jié)構(gòu)被破壞時(shí)的溫度,又稱為核酸的解鏈溫度。(即在260nm下光吸收達(dá)到最大光吸收一半是的溫度)nDNA的Tm值一般在8295之間。80n與Tm值有關(guān)的因素n GC所占總堿基數(shù)的百分比成正相關(guān)n經(jīng)驗(yàn)公式: Tm=69.30.41(G+C)%n或(G+C)%=( Tm-69.3)2.44n離子強(qiáng)度n溶液的離子強(qiáng)度較低時(shí),Tm值較低,融點(diǎn)范圍也較寬。因此,DNA制劑不應(yīng)保存在離子強(qiáng)度過(guò)低的溶液中。 n均一性n均質(zhì)DNA:熱變性
24、溫度范圍較??;n異質(zhì)DNA:熱變性溫度范圍較寬。815. RNA的變性n轉(zhuǎn)變不如DNA明顯,隨著溫度的升高, RNA 中雙鏈部分的堿基堆積會(huì)逐漸減少,吸光值逐漸地、不規(guī)則地增大; nTm值較低。82(二)核酸的復(fù)性1、DNA的復(fù)性:變性因素解除后,因變性而分開(kāi)的DNA兩條單鏈即可再聚合成原來(lái)的雙螺旋,其原有的性質(zhì),可得到部分恢復(fù)。832、DNA的復(fù)性主要制約因素(1)降溫速度n復(fù)性時(shí)溫度下降必須是一緩慢過(guò)程,若在超過(guò)Tm的溫度下迅速冷卻至低溫,復(fù)性幾乎是不可能的。n退火(annealing):熱變性DNA一般經(jīng)緩慢冷卻后即可復(fù)性,此過(guò)程稱之為。(2)DNA濃度濃度較高時(shí),易于復(fù)性。(3)DNA
25、片段的大小DNA片段越大,復(fù)性越慢。(4)基因組大小具有很多重復(fù)序列的DNA,復(fù)性較快。84(三)核酸的雜交n1.核酸的雜交(hybridization):不同來(lái)源的核酸變性后,合并在一處進(jìn)行復(fù)性;這時(shí),只要這些核酸分子的核苷酸序列含有可以形成堿基互補(bǔ)配對(duì)的片段,復(fù)性也會(huì)發(fā)生于不同來(lái)源的核酸鏈之間,即形成所謂的雜化雙鏈。n雜交可以發(fā)生于DNA與DNA之間,也可以發(fā)生于RNA與RNA之間和DNA與RNA之間。返回85第五節(jié)、核酸的研究方法一、核酸的分離、提純(一) DNA的分離n目前最重要的方法有3個(gè):n1. 鹽抽提,用苯酚或氯仿除去蛋白質(zhì)。n預(yù)處理:細(xì)胞破碎n鹽的作用:核蛋白(DNP)溶于濃鹽
26、溶液(如1M氯化鈉),但不溶于生理鹽溶液(如0.14M氯化鈉)n苯酚或氯仿的作用:為蛋白質(zhì)變性劑,除去蛋白質(zhì)。862.用廣譜蛋白酶在SDS存在下保溫消化細(xì)胞懸液,再用苯酚或氯仿除去蛋白質(zhì),用RNase除去少量RNA。3.氯化銫密度梯度離心法。n使用超速離心機(jī)。n氯化銫密度梯度:氯化銫在水介質(zhì)中有極高溶解度;將8.0M的氯化銫溶液裝入離心杯中,開(kāi)動(dòng)離心機(jī),形成線形氯化銫密度梯度,自杯底的1.80g/cm3到頂部的1.55 g/cm3。n當(dāng)DNA樣品的沉降速度與擴(kuò)散速度達(dá)到平衡狀態(tài)時(shí), DNA形成一穩(wěn)定的區(qū)帶,漂浮于氯化銫密度梯度中的一定位置。n用注射針頭從離心管側(cè)面一定部位刺入,收集這一區(qū)帶的DNA。87(二) RNA的分離nRNA比DNA更不穩(wěn)定,而且RNase又無(wú)處不在,因此RNA的分離更難。1、防止RNase降解的方法(1)器皿要高溫、高壓處理或用DEPC除去RNase;nDEPC:焦碳酸
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