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1、如何包裝你的實(shí)驗(yàn)結(jié)果不少研究生們可能都有這樣的體會(huì):千辛萬(wàn)苦得來(lái)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,不知道該如何展現(xiàn)給別人?的確如此,有些研究工作做得非常出色,可能由于呈現(xiàn)方式的問(wèn)題,不能發(fā)表高水平的文章(尤其是SCI文章)。仔細(xì)分析C-N-S系列的大牛文章,不難發(fā)現(xiàn),這些高水平論文的圖表質(zhì)量也高人一籌。因此,合理的“包裝”自己的實(shí)驗(yàn)結(jié)果非常重要。一、共聚焦圖片1. 拍照時(shí)要保留大中小三個(gè)倍數(shù)的圖,且圖片分辨率不能太低(我們用1024*1024),能大則大,我們是因?yàn)闄C(jī)器限制。用的時(shí)候要進(jìn)行裁減,比如文章上放的是200倍和400倍的圖,實(shí)際上200倍的圖來(lái)自拍照時(shí)100倍的圖,400倍的圖來(lái)自拍照時(shí)200倍的圖。這樣
2、有利于準(zhǔn)確地形成系列圖片。2. 圖片對(duì)比度、中間色之類(lèi)可以(或者是必須)在保證趨勢(shì)的基礎(chǔ)上進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。3. 熒光圖片不提倡定量,定量要配合western。4. 應(yīng)該是tif格式。5. 拍照時(shí)一般不要把對(duì)比度調(diào)節(jié)的太大,盡量保存細(xì)節(jié)。拍的太強(qiáng)了后期是不好調(diào)弱的,或者背底太暗了也會(huì)丟失細(xì)節(jié)的。這些后期都可以通過(guò)軟件調(diào)節(jié)。6. 低倍-高倍的順序。反之會(huì)形成暗區(qū),特別是在高倍加zoom放大層掃之后特別明顯。這是教訓(xùn),不能看見(jiàn)高倍下面比較好的結(jié)果,就欣喜若狂,先高倍后低倍。7. 一定要保留你的oib格式,不能因?yàn)槭】臻g,只存留tif格式。有些雜志會(huì)要求偽色,比如,紅色的用粉色顯示,要是有oib格式就很
3、好調(diào)整,重新出圖就是。沒(méi)有oib,用tif也可以用其他軟件轉(zhuǎn)換,但總覺(jué)得最后的顏色不是很對(duì),因?yàn)楹茈y把握粉色的色值。8. 層掃的圖片疊加或出2D的tif圖,建議不要用“輸出所見(jiàn)”這個(gè)選項(xiàng),這樣出來(lái)的1024-1024的會(huì)變成512-512,這時(shí)候還是選擇一般tif,1024-1024,后期再用其他軟件合成會(huì)比較好。9. 結(jié)果好,拍照好,才是最基本的,一定要杜絕對(duì)結(jié)果的修改。對(duì)于形態(tài)學(xué)的圖片來(lái)說(shuō),用軟件修改后的用一些二進(jìn)制的軟件打開(kāi)后可以明顯看出修改過(guò)程。這是同學(xué)告訴我的,自己沒(méi)試過(guò),因?yàn)闆](méi)這樣修過(guò)。二、幻燈片實(shí)驗(yàn)室就非常強(qiáng)調(diào)你的匯報(bào)能力?;脽羝辽偈且獰o(wú)懈可擊。可能你的工作很漂亮,但是你做了一
4、個(gè)很粗糙的幻燈,而且講的也很粗糙,這樣,別人對(duì)你的評(píng)價(jià)就會(huì)打折扣。我一般喜歡用prism作圖,非常漂亮,而從來(lái)不用excel作圖。而幻燈,思路要很明確,背景要介紹清楚。然后大家一定要控制時(shí)間,給你十五分鐘,最好是留有10s的空余,但是一定不能多,也不能講到十分鐘就結(jié)束了。三、圖片目前雜志投稿沒(méi)有一個(gè)統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)比較麻煩,比如照片的DPI不同雜志要求就不一樣,有的雜志甚至單獨(dú)要求Merge圖片的DPI,還有的連統(tǒng)計(jì)圖的線粗細(xì)磅數(shù)也要求不一樣。這就造成一稿被拒,還要重新治理很多照片和統(tǒng)計(jì)圖,非常麻煩。1. 首先對(duì)文章中圖片的邏輯關(guān)系要十分清楚,針對(duì)results部分排好序,而且開(kāi)始的時(shí)候要多準(zhǔn)備一點(diǎn)
5、圖片,挑出幾張拍攝效果好的,在投稿的時(shí)候,除了你認(rèn)為最好的那張圖以外,還可以放幾張備選圖到附件中。2. 圖片的排列一定要有邏輯性,不管是從大體形態(tài)到分子機(jī)制,還是從分子機(jī)制再到形態(tài)學(xué),不管按照什么方式敘述,都要按照一定的邏輯順序。3. 圖片要盡量的精美,而且要每組圖片要保留幾個(gè)備用的圖片,以免要求修改時(shí),找不到合適的圖片。4. 要注重細(xì)節(jié),放在PPT上排列時(shí),要注意上下左右的圖片盡量對(duì)齊,包括用來(lái)放在柱形圖上的小星號(hào),一定要對(duì)齊,放好。5. 代表趨勢(shì)變化的圖,一定要能看出趨勢(shì)。不明顯的圖就不要放在上面了。6. 如果是大體照片,比如關(guān)節(jié)炎腫脹的照片,要放一個(gè)尺在背景中,這樣即使照片焦距不一樣,有
6、了尺的刻度在照片里,就很能說(shuō)明問(wèn)題(尺的刻度隨照片大小改變而改變)。7. 在excell中作的柱狀圖或線圖,我一般都是用字體14號(hào),字形加粗,線條粗細(xì)在1.75到2.0。8. 當(dāng)然大家想要得到精美圖片掌握photoshop等作圖軟件是少不掉。9. 幾幅圖如何排版,最好看看級(jí)別高的雜志,他們是如何排版的。10. 每次都感嘆老外的綜述性文章的圖片,看的很直觀,這次我也發(fā)表了一篇綜述性文章,找一個(gè)做動(dòng)漫的高手,將我個(gè)人的想法在photoshop上畫(huà)了一個(gè)精美的圖片,故有時(shí)可以請(qǐng)專(zhuān)業(yè)人士幫忙。圖1:高手做的圖11. 對(duì)于病理的圖片,照相時(shí)要加標(biāo)尺,一般用Tif保存,盡可能保存分辨率高的圖片(以后再壓縮
7、都行)。我一般都是100倍的照1張,200倍的照4張,400倍的照4張。12. 圖片要在PPT或paper中呈現(xiàn)的時(shí)候,最好加一個(gè)邊框,圖片之間不要距離太寬,這樣要好看些。13. 組合圖片時(shí),一般用photoshop.注意細(xì)節(jié),上下左右要對(duì)齊。每個(gè)圖片的背景要調(diào)整一致。14. 做統(tǒng)計(jì)圖時(shí),用origin,Prism,sigmaPlot。這樣做出來(lái)的圖確實(shí)要好看,而且容易調(diào)整間距,字體等。當(dāng)然用EXCEL也能做出好看的圖,但是需要仔細(xì)修改,比如要去除網(wǎng)格線。15. 所有的圖片最好符合黃金分割原理,長(zhǎng)寬比例控制在1.6左右。圖中重點(diǎn)強(qiáng)調(diào)的內(nèi)容一定要加粗,或者用很醒目的符號(hào)??傊钅芪搜矍虻牡胤?/p>
8、就是你文章最重要的部分。16. 圖片的英文字體最好用Arial。四、圖表1. 完整性。圖表應(yīng)包含摘要中所有的重要結(jié)果,并且信息量要比摘要更豐富,這樣才顯得豐滿。但也要注意別把所有結(jié)果都堆砌上去,這樣反而會(huì)干擾文章的邏輯主線。2. 邏輯性。實(shí)驗(yàn)結(jié)果不同部分的圖表必須互相聯(lián)系,形成一個(gè)連貫的邏輯鏈條,以支撐文章的結(jié)論。如果只看圖表不看正文也能自然地得出結(jié)論的話,那說(shuō)明其邏輯主線是非常清晰的。3. 精煉的文字說(shuō)明。配以文字說(shuō)明,使得圖表易讀易懂,但一定要簡(jiǎn)潔精煉,否則還不如去看結(jié)果的文字部分呢。4. 把握一些細(xì)節(jié)問(wèn)題。比如圖與圖之間的間距以及字體的大小、位置應(yīng)保持一致,圖片中指示箭頭與背景的對(duì)比要明
9、顯.等等。圖表及文字說(shuō)明的排布要力求整齊劃一,給審稿人一個(gè)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)挠∠?。五、論?. 條理清晰:編號(hào)要有條理,可以所有的都不編號(hào),也可以編成1,1.1,。等等,但一定要前后一致。2. 豐富多樣:我認(rèn)為一篇論文中應(yīng)該有圖有表,有的數(shù)據(jù)既可以以表格形式表示,也可以用Excel畫(huà)出圖,那么就應(yīng)該看看文章中缺什么,比如圖比較多,那就畫(huà)個(gè)表,等等。3. 對(duì)于文章的格式,有一些具體的要求:字體 (Font):Times New Roman,字體大小 (Font size):12 (即小四),行距 (Spacing):雙行 (double space),紙張:8.5-by-11-inch (相當(dāng)于A4),紙張
10、邊距 (Page margins):各留 1 inch。4. 書(shū)寫(xiě)要求:右邊不對(duì)齊 (do not justify the lines at the right margin),每段第一個(gè)單詞嵌入1 inch (Tab鍵,或五個(gè)空格)。5. 對(duì)于圖,首先要寫(xiě)好Figure legends,“readers do NOT need to look at the text to find out what the figure means ”,所以Figure legends要敘述清楚。6. 繪圖工具:Photoshop or powerpoint7. 圖片大?。簅ne-column or two
11、-column8. 字體選擇:Helvetica or Arial9. 如果數(shù)據(jù)比較多的時(shí)候盡量放到表里面,減少結(jié)果部分文字的篇幅,我有一篇文章審稿人就要求我把文字部分的數(shù)據(jù)放到表中。10. 圖中盡量多做標(biāo)注,最好做到不看legend也能看懂圖的內(nèi)容。11. 圖的數(shù)量不宜太多,不重要的圖不必顯示。12. 示意圖宜簡(jiǎn)單明了,無(wú)關(guān)的東西不需要六、如何做免疫組化的圖免疫組化做完后就要進(jìn)行目的蛋白表達(dá)水平的評(píng)估,就是讀片的過(guò)程,期間可以留意哪些染色具有代表性,可以作為文章中的圖,用顯微鏡拍好后,接下來(lái)就是如何將這些代表性的圖(如weak,moderate, stong staining)合成一張圖。1
12、.將不同的圖同時(shí)用Photoshop打開(kāi),同時(shí)新建一張背景圖。2.考慮到美觀,可以采用圓形選擇工具,比如直徑為2cm,在每張圖上進(jìn)行選擇,將選好的區(qū)域拉到新建的背景圖上。3.注意各個(gè)圖之間要對(duì)齊,可以采用參考線進(jìn)行對(duì)齊或?qū)⒉煌瑘D層進(jìn)行鏈接,然后再對(duì)齊。4.根據(jù)不同雜志的具體要求,設(shè)置圖的大小及分辨率(DPI)。七、作圖軟件老板曾經(jīng)給我說(shuō)過(guò),一定要十分注意自己放到文章里的圖片,好的圖片更容易讓編輯對(duì)你的文章產(chǎn)生好感;而且,不完善的圖片一旦發(fā)表,它是永遠(yuǎn)不能被撤下來(lái)的。過(guò)一段時(shí)間,你自己看著就很難受。我以前習(xí)慣于用excel作圖,老板已經(jīng)不允許了,現(xiàn)在全部換成graphpad prism 5 和c
13、anvas 11了,剛開(kāi)始的時(shí)候,用著這兩個(gè)英文軟件也不是很順手,用久了,果然發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)軟件作出的圖片和圖表的確質(zhì)量要好很多,而且,再次改起來(lái)也很方便。graphpad prism 5還可以直接做統(tǒng)計(jì)分析。至于圖片的初級(jí)處理工作,一般都是在image j和photoshop里做的。image j是個(gè)功能很強(qiáng)大的軟件,可以在網(wǎng)上免費(fèi)下載自己需要的插件,完成自己特定的要求?;ハ嘟涣?,共同進(jìn)步。確實(shí)如此,作圖軟件也是影響圖片質(zhì)量和作圖效率的一個(gè)關(guān)鍵因素。作圖軟件(或者統(tǒng)計(jì)軟件)往往因各人的習(xí)慣和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的特點(diǎn)而異。就我個(gè)人而言,我的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)大都是電生理和形態(tài)學(xué)方面的東西,我覺(jué)得比較合適的軟件是:電生
14、理:Igor 4.0; miniAnalysis; Plusfit;形態(tài)學(xué):photoshop;IPP統(tǒng)計(jì)軟件:spss,excel(一些簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)分析還是很實(shí)用的)的確如此,寫(xiě)文章過(guò)程中需要的主要軟件工具。關(guān)于實(shí)驗(yàn)方面的,不同專(zhuān)業(yè)要求不一樣。在這兒我想說(shuō)的是,從原始數(shù)據(jù)到文章成稿的過(guò)程中,你可能用到的軟件工具:文字的(e.g. Word )、圖形的(e.g. Origin, sigmaPlot,photoshop)、數(shù)據(jù)分析統(tǒng)計(jì)的(e.g. Excel, SPSS or SAS)、數(shù)據(jù)模擬 的(e.g. MathCad, Matlab)、文獻(xiàn)管理的(e.g. Endnote)及其專(zhuān)業(yè)軟件。在
15、這過(guò)程中,圖片的處理尤為重要!您想讓自己的圖片在文章中看起來(lái)更清晰,為您的文章增添更多吸引人的地方除掉軟件以外你的 Tables, Figure captions, and Figures, 還應(yīng)具有科學(xué)性、新穎性和邏輯性,有時(shí)候可觀賞性很重要。在英文綜述性文章中,用示意圖能很好將復(fù)雜問(wèn)題簡(jiǎn)單化!需要一定的作圖功底能力。個(gè)人覺(jué)得大家在作圖時(shí),不要太迷信用專(zhuān)業(yè)的作圖軟件,現(xiàn)有的常規(guī)軟件word、ppt,只要你用心轉(zhuǎn)研,一樣可以做出精美的示意圖。我之前在一次會(huì)議的時(shí)候看到一個(gè)高手做的示意圖,很是漂亮,下來(lái)一問(wèn),居然是用ppt做的,回來(lái)一試,果不其然,自己也能做出很漂亮的彩圖,這次直接在國(guó)基中派上用
16、場(chǎng)。希望大家能夠好好發(fā)掘現(xiàn)有的軟件和素材,小塊頭也有大智慧,呵呵!八、采集原始結(jié)果的原則和方法稿件中的圖片大體可以分為三類(lèi):1)來(lái)自數(shù)碼相機(jī),如顯微鏡下或大體照片等;2)來(lái)自采樣軟件,如powerlab的動(dòng)作電位圖、血壓圖等;3)來(lái)自統(tǒng)計(jì)作圖軟件,如Excel的柱狀圖等。操作的三大原則:1)原始圖像要保留,修改后的圖像務(wù)必另存而不要覆蓋原始圖像;2)盡量減少保存次數(shù),以免損失圖像質(zhì)量,可以多處修改,一一完畢后再做存盤(pán);3)所有操作不得使圖像失真,任何影響圖像真實(shí)性的修改都是不允許的。任何修改工作都是在原始圖像的基礎(chǔ)上進(jìn)行,所以如果原始圖像質(zhì)量不佳,那必將事倍功半。下面對(duì)有利于原始圖像質(zhì)量的細(xì)節(jié)
17、略做介紹。不同來(lái)源的圖像,其注意點(diǎn)也不一樣,因此分開(kāi)討論。1)來(lái)自照相的 獲得的數(shù)碼文件多是在顯微鏡視野下采集的,因此聚焦和暴光是必須要考慮的。顯微鏡下景深極淺,意味著聚焦清晰不能依賴(lài)于小光圈,而應(yīng)靠精細(xì)調(diào)節(jié)顯微鏡。注意應(yīng)使照相通道和目鏡觀察通道相一致,即目鏡下最清晰時(shí)拍照也最清晰。拍照時(shí)相機(jī)應(yīng)選擇最大光圈,廣角端。不要使用望遠(yuǎn)變焦,它使得視野變小且放大倍數(shù)難以計(jì)算。聚焦不清的另一主要問(wèn)題在于相機(jī)的抖動(dòng)。雖然一般相機(jī)都固定在顯微鏡上,但按快門(mén)時(shí)的手震有時(shí)仍不可忽視,這時(shí)一個(gè)簡(jiǎn)單的辦法是利用相機(jī)的自拍功能,按下快門(mén)之后經(jīng)倒數(shù)計(jì)時(shí)后正式拍攝。暴光時(shí)間的選擇在一般的明視野下可由相機(jī)的自動(dòng)暴光決定;而
18、暗視野下有時(shí)需要高達(dá)幾分鐘的暴光時(shí)間,這是一般數(shù)碼相機(jī)達(dá)不到的,只能通過(guò)專(zhuān)業(yè)的CCD系統(tǒng)并用軟件幫助采集圖像。一些軟件可以用來(lái)修改暴光不足的照片,但暴光過(guò)度往往使圖像細(xì)節(jié)丟失。顯微鏡下拍攝時(shí)閃光燈不起作用,將它關(guān)閉。通過(guò)白平衡,一般不會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重的偏色。另外,由于鏡頭的原因,邊角處難免會(huì)有失真,因此,請(qǐng)保證目標(biāo)在視野正中,鏡頭成像最佳范圍內(nèi),而無(wú)須鋪滿整個(gè)視野,現(xiàn)在的數(shù)碼相機(jī)的像素值已經(jīng)足夠高了。2)來(lái)自采樣軟件的 采樣軟件所采得的原始圖形一般儲(chǔ)存在特定格式的文件中,通過(guò)該軟件或配套的分析軟件打開(kāi)。有的采樣或分析軟件可以將圖形直接輸出到Word或Photoshop中,但有的則不能。這時(shí)最簡(jiǎn)單的辦法就是通過(guò)抓屏或抓圖軟件來(lái)獲取。通過(guò)采樣軟件獲取的圖形輸出后僅做些切割、拼合的工作,不應(yīng)該做更多其它的修改。圖形在采樣軟件中可以通過(guò)改變x軸和y軸的縮放比改變形狀,因此一組圖片應(yīng)該選擇統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),并且標(biāo)注x, y軸的標(biāo)尺。圖形的精細(xì)程度和采樣頻率相關(guān),采樣頻率越高,圖片
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