酶切位點(diǎn)保護(hù)堿基_第1頁
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文檔簡介

1、。PCR設(shè)計(jì)引物時(shí)酶切位點(diǎn)的保護(hù)酶寡核苷酸序列切割率 %2 hr20 hrAcc IGGTCGACC00CGGTCGACCG00CCGGTCGACCGG00Afl IIICACATGTG00CCACATGTGG>90>90CCCACATGTGGG>90>90Asc IGGCGCGCC>90>90AGGCGCGCCT>90>90TTGGCGCGCCAA>90>90Ava ICCCCGGGG50>90CCCCCGGGGG>90>90TCCCCCGGGGGA>90>90BamH ICGGATCCG1025CGG

2、GATCCCG>90>90CGCGGATCCGCG>90>90Bgl IICAGATCTG00GAAGATCTTC75>90GGAAGATCTTCC25>90BssH IIGGCGCGCC00AGGCGCGCCT00TTGGCGCGCCAA50>90BstE IIGGGT(A/T)ACCC010BstX IAACTGCAGAACCAATGCATTGG00AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA2550CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT25>90Cla ICATCGATG00GATCGATC00CCATCGATGG>

3、90>90CCCATCGATGGG5050EcoR IGGAATTCC>90>90CGGAATTCCG>90>90CCGGAATTCCGG>90>90。1Hae IIIHind IIIKpn IMlu INco INde INhe INot INsi IPac IPme I。GGGGCCCC>90>90AGCGGCCGCT>90>90TTGCGGCCGCAA>90>90CAAGCTTG00CCAAGCTTGG00CCCAAGCTTGGG1075GGGTACCC00GGGGTACCCC>90>90CGGGG

4、TACCCCG>90>90GACGCGTC00CGACGCGTCG2550CCCATGGG00CATGCCATGGCATG5075CCATATGG00CCCATATGGG00CGCCATATGGCG00GGGTTTCATATGAAACCC00GGAATTCCATATGGAATTCC75>90GGGAATTCCATATGGAATTCCC75>90GGCTAGCC00CGGCTAGCCG1025CTAGCTAGCTAG1050TTGCGGCCGCAA00ATTTGCGGCCGCTTTA1010AAATATGCGGCCGCTATAAA1010ATAAGAATGCGGCCGCT

5、AAACTAT2590AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA25>90TGCATGCATGCA10>90CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT>90>90TTAATTAA00GTTAATTAAC025CCTTAATTAAGG0>90GTTTAAAC00GGTTTAAACC025GGGTTTAAACCC050AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG75>90。2Pst IPvu ISac ISac IISal ISca ISma ISpe ISph IStu IXba IXho I。GCTGCAGC00TGCACTGCAGTGC

6、A1010AACTGCAGAACCAATGCATTGG>90>90AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA>90>90CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT00CCGATCGG00ATCGATCGAT1025TCGCGATCGCGA010CGAGCTCG1010GCCGCGGC00TCCCCGCGGGGA50>90GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC00GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG1050ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA1075GAGTACTC1025AAAA

7、GTACTTTT7575CCCGGG010CCCCGGGG010CCCCCGGGGG1050TCCCCCGGGGGA>90>90GACTAGTC10>90GGACTAGTCC10>90CGGACTAGTCCG050CTAGACTAGTCTAG050GGCATGCC00CATGCATGCATG025ACATGCATGCATGT1050AAGGCCTT>90>90GAAGGCCTTC>90>90AAAAGGCCTTTT>90>90CTCTAGAG00GCTCTAGAGC>90>90TGCTCTAGAGCA75>90CTAGTCTAGACTAG75>90CCTCGAGG00CCCTCGAGGG1025CCGCTCGAGCGG1075。3。Xma ICCCCGGGG00CCCCCGGGGG2575CCCCCCGGGGGG50>90TCCCCCCGGGGGGA>90>90注釋：1如果要加在序列的5端，就在酶切位點(diǎn)識(shí)別堿基序列（紅色）的5端加上相應(yīng)的堿基（黑色），相同如果要在3端加保護(hù)堿基，就在酶切位

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