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文檔簡介

1、 PubMedPubMed文獻檢索文獻檢索 天津醫(yī)科大學(xué)圖書館天津醫(yī)科大學(xué)圖書館 劉娟劉娟 教學(xué)內(nèi)容教學(xué)內(nèi)容一、一、PubMed簡介簡介二、檢索規(guī)則與常用檢索技術(shù)二、檢索規(guī)則與常用檢索技術(shù)三、檢索方式與途徑三、檢索方式與途徑四、檢索結(jié)果處理四、檢索結(jié)果處理五、注冊五、注冊六、練習(xí)題六、練習(xí)題l1.PubMed基本情況l2.PubMed的由來l3.PubMed的特點l4.PubMed的數(shù)據(jù)收錄范圍l5.PubMed主頁一、PubMed簡介l1.PubMed基本情況lPubMed是美國是美國NLM所屬的國家生物技術(shù)信息所屬的國家生物技術(shù)信息中心(中心(NCBI)開發(fā)的一個以開發(fā)的一個以Web方式向

2、用戶方式向用戶提供服務(wù)的生物醫(yī)學(xué)文獻檢索系統(tǒng),是繼提供服務(wù)的生物醫(yī)學(xué)文獻檢索系統(tǒng),是繼MEDLINE數(shù)據(jù)庫國際聯(lián)機檢索和光盤檢索之?dāng)?shù)據(jù)庫國際聯(lián)機檢索和光盤檢索之后推出的一種后推出的一種網(wǎng)絡(luò)免費網(wǎng)絡(luò)免費檢索方式。檢索方式。一、PubMed簡介 |包括包括2,1002,100多萬篇來自多萬篇來自MEDLINEMEDLINE和其他和其他生命科學(xué)期刊的生物醫(yī)學(xué)文獻生命科學(xué)期刊的生物醫(yī)學(xué)文獻|最早可回溯到最早可回溯到19481948年年|提供部分全文和其他相關(guān)資源的鏈接提供部分全文和其他相關(guān)資源的鏈接一、PubMed簡介l2.PubMed2.PubMed的由來的由來 創(chuàng)刊創(chuàng)刊:最早可以追溯到最早可以追溯

3、到1879年美國年美國NLM編編譯出版的醫(yī)學(xué)文獻檢索刊物醫(yī)學(xué)索引譯出版的醫(yī)學(xué)文獻檢索刊物醫(yī)學(xué)索引(Index Medicus, IM)。)。一、PubMed簡介1964年年:為了實現(xiàn)為了實現(xiàn)IM的自動化編輯出版,的自動化編輯出版,NLM開發(fā)了開發(fā)了“醫(yī)學(xué)文獻分析與檢索系統(tǒng)醫(yī)學(xué)文獻分析與檢索系統(tǒng)”(Medical Literature Analysis and Retrieval System, 簡稱簡稱MEDLARS).目前目前MEDLARS已擁有已擁有40多個數(shù)據(jù)庫,其多個數(shù)據(jù)庫,其中最重要、最大、且發(fā)展最早的為中最重要、最大、且發(fā)展最早的為MEDLINE(MEDLARS ON LINE)

4、生物醫(yī)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫學(xué)數(shù)據(jù)庫 一、PubMed簡介l1971年年: MEDLINE正式建成聯(lián)機數(shù)據(jù)庫,正式建成聯(lián)機數(shù)據(jù)庫,并通過并通過MEDLARS開展國際聯(lián)機檢索服務(wù)。開展國際聯(lián)機檢索服務(wù)。l自自MEDLINE投入聯(lián)機檢索服務(wù)以來,一直成投入聯(lián)機檢索服務(wù)以來,一直成為為MEDLARS最大的使用頻率最高的數(shù)據(jù)庫。最大的使用頻率最高的數(shù)據(jù)庫。一、PubMed簡介19831983年:隨著光盤技術(shù)的發(fā)展,年:隨著光盤技術(shù)的發(fā)展,MEDLINEMEDLINE光盤數(shù)據(jù)庫建成,并得到了廣光盤數(shù)據(jù)庫建成,并得到了廣泛的應(yīng)用。泛的應(yīng)用。19971997年年9 9月月2626日日, MEDLINEMEDLINE

5、網(wǎng)絡(luò)版開通,網(wǎng)絡(luò)版開通,取名取名PubMedPubMed,并向全球免費開放。,并向全球免費開放。 一、PubMed簡介l 很多醫(yī)務(wù)工作者寧可在每次檢索時都很多醫(yī)務(wù)工作者寧可在每次檢索時都花上成倍的時間,卻不愿花上幾個小時去花上成倍的時間,卻不愿花上幾個小時去認(rèn)真研究一下認(rèn)真研究一下PubMedPubMed。 君欲善其事,必先君欲善其事,必先利其器利其器 ,PubMedPubMed就好像一把功能強大的槍,就好像一把功能強大的槍,你決不能僅僅滿足于知道扣動扳機就可以你決不能僅僅滿足于知道扣動扳機就可以發(fā)射子彈,更重要的是,你要知道如何利發(fā)射子彈,更重要的是,你要知道如何利用準(zhǔn)星瞄準(zhǔn),用準(zhǔn)星瞄準(zhǔn),如

6、何把這把槍的功能發(fā)揮到如何把這把槍的功能發(fā)揮到及至。及至。 一、PubMed簡介3.Pubmed3.Pubmed的特點的特點|收錄生物醫(yī)學(xué)權(quán)威期刊最多收錄生物醫(yī)學(xué)權(quán)威期刊最多 世界上世界上7070多個國家的多個國家的70007000多種權(quán)威期刊多種權(quán)威期刊|多種檢索方法,多條檢索途徑多種檢索方法,多條檢索途徑|時效性極強時效性極強( (每周更新每周更新) )|回溯年代久遠(yuǎn)(回溯年代久遠(yuǎn)(19481948年至今)年至今)|利用利用MeSHMeSH作為轉(zhuǎn)換詞表,標(biāo)引質(zhì)量高作為轉(zhuǎn)換詞表,標(biāo)引質(zhì)量高|部分文獻可以免費獲取全文部分文獻可以免費獲取全文|檢全率、檢準(zhǔn)率高檢全率、檢準(zhǔn)率高一、PubMed簡介

7、Publisher supplied citations(出版商提供的書目信息)出版商提供的書目信息) PreMedlineMEDLINE與與NCBI其它數(shù)據(jù)庫的鏈接其它數(shù)據(jù)庫的鏈接4.PubMed4.PubMed的數(shù)據(jù)收錄范圍的數(shù)據(jù)收錄范圍一、PubMed簡介 4.1 MEDLINE基本情況基本情況l出版:美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(出版:美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(National Library of Medicine, NLM)。)。l印刷版印刷版 1879l聯(lián)機版聯(lián)機版 1971l光盤版光盤版 1983l網(wǎng)絡(luò)版網(wǎng)絡(luò)版 1997MEDLINE數(shù)據(jù)庫簡介l收錄范圍:收錄收錄范圍:收錄7538種(種(20

8、09.10.11) 權(quán)威期刊,包含權(quán)威期刊,包含50種語言,涉及種語言,涉及70多個國家多個國家(其中中國(其中中國48種),約種),約40萬篇萬篇/年,已經(jīng)累計年,已經(jīng)累計2100余萬篇。內(nèi)容涉及生物醫(yī)學(xué)各個領(lǐng)域;余萬篇。內(nèi)容涉及生物醫(yī)學(xué)各個領(lǐng)域;85%原文為英語。原文為英語。l回溯年代:回溯年代:1948年至今年至今l每條記錄標(biāo)有每條記錄標(biāo)有indexed for MEDLIEN標(biāo)記標(biāo)記學(xué)科范圍:學(xué)科范圍:l基礎(chǔ)生命科學(xué)基礎(chǔ)生命科學(xué) 臨床生命科學(xué)臨床生命科學(xué) l生物科學(xué)生物科學(xué) 解剖學(xué)解剖學(xué)l組織學(xué)組織學(xué) 化學(xué)與藥物化學(xué)與藥物l心理學(xué)心理學(xué) 社會醫(yī)學(xué)社會醫(yī)學(xué)l農(nóng)業(yè)農(nóng)業(yè) 醫(yī)技設(shè)備學(xué)醫(yī)技設(shè)備學(xué)

9、 l醫(yī)技工業(yè)學(xué)醫(yī)技工業(yè)學(xué) 醫(yī)學(xué)信息學(xué)醫(yī)學(xué)信息學(xué)使用詞表:使用詞表:MeSH(醫(yī)學(xué)主題詞表)(醫(yī)學(xué)主題詞表)MEDLINE數(shù)據(jù)庫簡介 4.2 PreMEDLINE l是一種由是一種由正在加工處理正在加工處理中中的文獻記錄組成的文獻記錄組成的數(shù)據(jù)庫,這些新記錄還未被標(biāo)引,暫時的數(shù)據(jù)庫,這些新記錄還未被標(biāo)引,暫時存放在存放在PreMEDLINE數(shù)據(jù)庫中。每天更新,數(shù)據(jù)庫中。每天更新,經(jīng)過標(biāo)引(增加主題詞、文獻類型、數(shù)據(jù)經(jīng)過標(biāo)引(增加主題詞、文獻類型、數(shù)據(jù)庫存取號等字段)以后轉(zhuǎn)入庫存取號等字段)以后轉(zhuǎn)入Medline,一一旦記錄被轉(zhuǎn)入到旦記錄被轉(zhuǎn)入到Medline數(shù)據(jù)庫,就被從數(shù)據(jù)庫,就被從PreME

10、DLINE數(shù)據(jù)庫中刪除。數(shù)據(jù)庫中刪除。每條記錄標(biāo)每條記錄標(biāo)有有in Process標(biāo)記。標(biāo)記。Pre-Medline最新信息最新信息MedlineNew DataCollectProcess一周以后一周以后 (出版商提供的書目信息)(出版商提供的書目信息) 出版商直接向出版商直接向PubMed提供的非提供的非Medline收錄的電子刊物,如:收錄的電子刊物,如:Science或或Nature中的地質(zhì)學(xué)文獻中的地質(zhì)學(xué)文獻等。每條記錄標(biāo)有等。每條記錄標(biāo)有 as supplied by publishers標(biāo)記。標(biāo)記。4.3 Publisher-Supplied CitationPubMed-ind

11、exed for MEDLINEPubMed-indexed for MEDLINEPubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisherPubMed-in processPubMed-in processPubMed與與MEDLINE的區(qū)別的區(qū)別 4.4與與NCBI其它數(shù)據(jù)庫的鏈接其它數(shù)據(jù)庫的鏈接lNucleotideNucleotide:DNADNA序列數(shù)據(jù)庫序列數(shù)據(jù)庫lProteinProtein:蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫lGenomeGenome:基因組序列數(shù)據(jù)庫基因組序列數(shù)據(jù)庫lStructureStruc

12、ture:分子結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫分子結(jié)構(gòu)模型數(shù)據(jù)庫lOMIMOMIM:人類孟德爾遺傳學(xué)在線數(shù)據(jù)庫人類孟德爾遺傳學(xué)在線數(shù)據(jù)庫lPMC: PubMedPMC: PubMed中心,免費全文期刊檢索中心,免費全文期刊檢索 與與NCBI其它其它42個數(shù)據(jù)庫的鏈接個數(shù)據(jù)庫的鏈接頁面介紹PubMed主頁主頁 /pubmed高級檢索入口高級檢索入口基本檢索輸入框基本檢索輸入框個人空間個人空間檢索指南檢索指南檢索工具:檢索工具:特定文獻檢索特定文獻檢索臨床咨詢臨床咨詢專題咨詢專題咨詢其他資源:其他資源:主題詞數(shù)據(jù)庫主題詞數(shù)據(jù)庫期刊數(shù)據(jù)庫期刊數(shù)據(jù)庫臨床試驗等臨床試驗

13、等Pubmed簡介簡介二、檢索規(guī)則及檢索技術(shù)二、檢索規(guī)則及檢索技術(shù)檢索規(guī)則檢索規(guī)則1 1、自動轉(zhuǎn)換匹配、自動轉(zhuǎn)換匹配 PubMed具有對檢索詞的自動轉(zhuǎn)換匹配功能。具有對檢索詞的自動轉(zhuǎn)換匹配功能。 對于輸入檢索框的檢索詞,對于輸入檢索框的檢索詞,PubMed按按4個轉(zhuǎn)換表個轉(zhuǎn)換表進行對照、匹配和轉(zhuǎn)換,然后進行檢索。進行對照、匹配和轉(zhuǎn)換,然后進行檢索。 MeSH表:包括表:包括MeSH的主題詞、副主題詞、款目的主題詞、副主題詞、款目詞。詞。期刊刊名表:期刊刊名表: 所收錄的刊名全稱、縮寫和所收錄的刊名全稱、縮寫和ISSN短語表:文獻篇名或文摘中出現(xiàn)的短語。短語表:文獻篇名或文摘中出現(xiàn)的短語。著者索

14、引表:著者索引表: PubMed所收錄的的作者姓名組成。所收錄的的作者姓名組成。1 1、自動轉(zhuǎn)換匹配、自動轉(zhuǎn)換匹配l如果在如果在4 4個詞表的任何一個中找到匹配的內(nèi)個詞表的任何一個中找到匹配的內(nèi)容,則匹配結(jié)束。容,則匹配結(jié)束。l例如:如果輸入的檢索詞在主題詞轉(zhuǎn)換表中例如:如果輸入的檢索詞在主題詞轉(zhuǎn)換表中找到與其相匹配的主題詞,則使用該主題詞找到與其相匹配的主題詞,則使用該主題詞進行檢索并結(jié)束匹配,不會在其他詞表中進進行檢索并結(jié)束匹配,不會在其他詞表中進行匹配。行匹配。檢索規(guī)則檢索規(guī)則1 1、自動轉(zhuǎn)換匹配、自動轉(zhuǎn)換匹配檢索規(guī)則檢索規(guī)則l如果輸入的單個詞在如果輸入的單個詞在4個詞表中都未找到匹個詞

15、表中都未找到匹配的內(nèi)容,其將被在配的內(nèi)容,其將被在All fields中進行檢索;中進行檢索;如果輸入的詞組未找到匹配的內(nèi)容,該詞如果輸入的詞組未找到匹配的內(nèi)容,該詞組將被拆成單詞并分別對其進行匹配后將組將被拆成單詞并分別對其進行匹配后將匹配結(jié)果以匹配結(jié)果以AND連接。連接。l輸入的檢索詞被自動匹配后的具體檢索式輸入的檢索詞被自動匹配后的具體檢索式可通過檢索結(jié)果頁面右側(cè)的可通過檢索結(jié)果頁面右側(cè)的Search details欄中查看。欄中查看。l如:如:renal failure renal insufficiencyMeSH Terms OR (renalAll Fields AND insu

16、fficiencyAll Fields) OR renal insufficiencyAll Fields OR (renalAll Fields AND failure結(jié)果顯示頁右側(cè)結(jié)果顯示頁右側(cè)Details顯示系統(tǒng)自動匹配轉(zhuǎn)換顯示系統(tǒng)自動匹配轉(zhuǎn)換的檢索詞的檢索詞檢索規(guī)則檢索規(guī)則2 2、短語檢索:、短語檢索: 如果在短語上加雙引號,如果在短語上加雙引號, PubMed將不執(zhí)行將不執(zhí)行自動轉(zhuǎn)換功能,也不進行自動轉(zhuǎn)換功能,也不進行MeSH詞的擴檢。詞的擴檢。 例:例: “l(fā)ung cancer”常用的檢索技術(shù)常用的檢索技術(shù)1.布爾檢索布爾檢索1.布爾檢索布爾檢索2.截詞檢索(又稱通配符檢索)截

17、詞檢索(又稱通配符檢索)2.截詞檢索截詞檢索3.字段限制檢索字段限制檢索 Pubmed常用字段常用字段文摘文摘第一著者單位地址第一著者單位地址出版商提供文獻識別號出版商提供文獻識別號著者群著者群版權(quán)說明版權(quán)說明參考評論文獻參考評論文獻合著者合著者文獻參考評論文獻參考評論定稿版定稿版校樣版校樣版輸入日期輸入日期輸入完成日期輸入完成日期電子出版日期電子出版日期常用字段標(biāo)識符常用字段標(biāo)識符電子出版日期電子出版日期文獻出版日期文獻出版日期數(shù)據(jù)加入數(shù)據(jù)加入PubMed日期日期文獻勘誤文獻勘誤參考文獻勘誤參考文獻勘誤全部著者姓名全部著者姓名全部調(diào)研者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱作為文章主題的著

18、者全稱文獻相關(guān)注釋文獻相關(guān)注釋基金編號基金編號基因符號基因符號期編號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研者資助調(diào)研單位資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱期刊全稱最后修訂日期最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者版權(quán)擁有者題錄提供機構(gòu)的識別號題錄提供機構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機構(gòu)提供其他關(guān)鍵詞的機構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機構(gòu)文章總頁數(shù)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時間出版商提供數(shù)據(jù)時間期刊出版國期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻編號數(shù)據(jù)庫文獻編號作為主

19、題詞的個人姓名作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)出版狀態(tài)文獻類型文獻類型出版模式(紙張或電子)出版模式(紙張或電子) 參考文獻數(shù)參考文獻數(shù)已撤回的文獻已撤回的文獻酶或化學(xué)物質(zhì)代碼酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文獻初版文獻修訂和再版的文章修訂和再版的文章子專題文檔子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻數(shù)據(jù)庫以及文章討論的二次文獻數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號分子序列訪問號原文來源原文來源引用了病例的文獻內(nèi)部處理代碼引用了病例的文獻內(nèi)部處理代碼標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫標(biāo)準(zhǔn)期刊縮寫文獻標(biāo)題文獻標(biāo)題翻譯標(biāo)題翻譯標(biāo)題更新文獻更新文獻文獻正在更新文獻正在更新期刊卷號期刊卷號4.擴展檢索

20、擴展檢索5.加權(quán)檢索加權(quán)檢索(主要用于(主要用于Mesh主題詞檢索)主題詞檢索)l加權(quán)檢索的基本方法是:在每個提問詞后面給定一個數(shù)值表示其重要程度,這個數(shù)值稱為權(quán),在檢索時,先查找這些檢索詞在數(shù)據(jù)庫記錄中是否存在,然后計算存在的檢索詞的權(quán)值總和。權(quán)值之和達到或超過預(yù)先給定的閾值,該記錄即為命中記錄。于判定檢索詞或字符串在滿足檢索邏輯后對文獻命中與否的影響程度。l運用加權(quán)檢索可以命中核心概念文獻,因此它是一種縮小檢索范圍提高檢準(zhǔn)率的有效方法。三、檢索方式與途徑三、檢索方式與途徑 1 1、基本檢索、基本檢索 2 2、高級檢索、高級檢索3 3、主題詞檢索、主題詞檢索4 4、期刊檢索、期刊檢索5 5、

21、題錄檢索、題錄檢索6 6、臨床咨詢、臨床咨詢7 7、臨床試驗、臨床試驗在檢索欄中輸入在檢索欄中輸入:一個或多個檢索詞一個或多個檢索詞 (系統(tǒng)默認(rèn)空格為系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢檢索)索) 例:例:aloe psoriasis(蘆薈治療牛皮癬的文獻)(蘆薈治療牛皮癬的文獻)1、基本檢索、基本檢索1.1 自由詞檢索自由詞檢索l對于輸入對于輸入PubMedPubMed的多詞詞組,的多詞詞組,PubMedPubMed會查詢詞組索引,會查詢詞組索引,如果查到相應(yīng)詞組則將其作為一個檢索詞來檢索。如如果查到相應(yīng)詞組則將其作為一個檢索詞來檢索。如果未查到相應(yīng)詞組,則將其拆分成單個詞,分別進行果未查到相應(yīng)詞組,則將

22、其拆分成單個詞,分別進行檢索并以邏輯和檢索并以邏輯和(ANDAND)進行組配。進行組配。1、基本檢索、基本檢索1.2 詞組檢索詞組檢索l如:如:single cellsingle cell相當(dāng)于檢索相當(dāng)于檢索single AND cellsingle AND cell??赏?。可通過如下方式強制將其作為一個詞組進行檢索過如下方式強制將其作為一個詞組進行檢索: 1.1.加雙引號:加雙引號:“single cell”single cell” 2. 2.加標(biāo)段標(biāo)識加標(biāo)段標(biāo)識tw: single celltwtw: single celltw 3. 3.使用短橫線使用短橫線“-”-”將兩詞連接起來:將兩

23、詞連接起來:single-cellsingle-cell 4. 4.使用截詞符使用截詞符* *:single cellsingle cell* *1、基本檢索、基本檢索1.2 詞組檢索詞組檢索1、基本檢索、基本檢索1.3 字段限制檢索字段限制檢索常用字段標(biāo)識符常用字段標(biāo)識符lAffiliationAD :第一作者所屬單位和地址:第一作者所屬單位和地址lAuthorAU:作者姓名:作者姓名lLanguageLA:原文語種:原文語種 chinese la 或或 chi la (前(前3個字母)個字母) lMeSH TermsMH:主題詞:主題詞 自動擴展下位主題詞;如需關(guān)閉該功能,使自動擴展下位主

24、題詞;如需關(guān)閉該功能,使mh:noexp lMeSH SubheadingsSH:副主題詞:副主題詞 自動擴展下位副主題詞;如需關(guān)閉該功能,使用自動擴展下位副主題詞;如需關(guān)閉該功能,使用 sh:noexp 常用字段標(biāo)識符常用字段標(biāo)識符lPublication DateDP :出版時間:出版時間 1998/03dp; 1998dp; 1996:1998dp; 1998/01:1998/04 dplPublication TypePT:出版類型:出版類型 reviewptlTitleTI :文章題名:文章題名lText WordsTW:文本詞:文本詞 包括包括Title, Abstract, Me

25、SH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段等字段lTitle/AbstractTIAB:題名摘要:題名摘要l刊名刊名: SourceSO 、JournalJour 、Journal Title AbbreviationTA1、基本檢索、基本檢索1.3 字段限制檢索(標(biāo)題、語種)字段限制檢索(標(biāo)題、語種)在檢索欄中輸入在檢索欄中輸入:例:例:liver cancerti AND chinesela1、基本檢索、基本檢索1.3 字段限制檢索字段限制檢索(刊名)刊名)在檢索欄中輸

26、入在檢索欄中輸入:刊名輸全稱或刊名輸全稱或MEDLINE認(rèn)認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式,so 例:例:JAMA so1、基本檢索、基本檢索在檢索欄中輸入在檢索欄中輸入:刊名輸全稱或刊名輸全稱或MEDLINE認(rèn)認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式,jour 例:例:JAMA jour1.3 字段限制檢索字段限制檢索 (刊名)刊名)1、基本檢索、基本檢索1.3 字段限制檢索字段限制檢索 (刊名)刊名)在檢索欄中輸入在檢索欄中輸入:刊名輸全稱或刊名輸全稱或MEDLINE認(rèn)認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式,ta 例:例:JAMA ta1、基本檢索、基本檢索1.4 著者檢索著者檢索作者書寫格式作者

27、書寫格式西方人姓名書寫格式:西方人姓名書寫格式:First nameFirst name、Middle NameMiddle Name、Last nameLast name。l如:美國肯尼迪總統(tǒng)名為:如:美國肯尼迪總統(tǒng)名為: John Frank KenedyJohn Frank Kenedy,KenedyKenedy為為Last nameLast name(姓)(姓)。lFrankFrank為為Middle nameMiddle name,比較少看到,多看到,比較少看到,多看到 John F. KenedyJohn F. Kenedy,中間名縮寫了。中間名縮寫了。l如果看到姓名中間有逗號,則

28、逗號前一定是姓。如:如果看到姓名中間有逗號,則逗號前一定是姓。如: Kenedy, Kenedy, John F. John F. 中國人姓名格式:中國人姓名格式:Last nameLast name、First nameFirst name。 如:鐘世鎮(zhèn),就有如下拼寫形式可供檢索:如:鐘世鎮(zhèn),就有如下拼寫形式可供檢索: lZhong shizhenZhong shizhenlshizheng zhong shizheng zhong lzhong sz zhong szhong sz zhong s1、基本檢索、基本檢索1.4 著者檢索著者檢索在檢索欄中輸入在檢索欄中輸入:例:例:Wong

29、JS / Wong Julia S姓在前,名首字母縮寫在后,姓在前,名首字母縮寫在后,之間要有空格之間要有空格l截詞檢索截詞檢索: :可通過在詞干后加可通過在詞干后加“* *”檢索以該詞干開頭檢索以該詞干開頭的所有詞的文獻。的所有詞的文獻。需要注意的是:需要注意的是:截詞檢索將關(guān)閉截詞檢索將關(guān)閉PubMedPubMed的自動單詞匹配功能以及的自動單詞匹配功能以及MeshMesh主題詞的擴展檢主題詞的擴展檢索功能索功能 。l如:輸入如:輸入heart attackheart attack* *,不會啟動自動匹配功能檢索,不會啟動自動匹配功能檢索與之匹配的與之匹配的MeshMesh主題詞主題詞“M

30、yocardial Infarction”Myocardial Infarction”及及其下位更專指的主題詞的相關(guān)文獻。其下位更專指的主題詞的相關(guān)文獻。l截詞功能最多可使用截詞功能最多可使用600600個詞形變化。超過個詞形變化。超過600600個會顯個會顯示如下圖的提示信息。示如下圖的提示信息。1、基本檢索、基本檢索1.5 截詞檢索截詞檢索1、基本檢索、基本檢索PubMed在檢索時忽略一些常用的英語詞匯,在檢索時忽略一些常用的英語詞匯,下表為禁用詞列表下表為禁用詞列表2、高級檢索、高級檢索檢索式編制檢索式編制布爾邏輯檢索技術(shù)布爾邏輯檢索技術(shù)檢索字段檢索字段通過檢索框后面的通過檢索框后面的“

31、Show Index list”選項可查詢在所有字選項可查詢在所有字段或某一特定字段中段或某一特定字段中的索引,可以從索引的索引,可以從索引中選擇一個或幾個詞中選擇一個或幾個詞來完善檢索策略。來完善檢索策略。2、高級檢索、高級檢索檢索歷史檢索歷史檢索式檢索式檢出結(jié)果檢出結(jié)果檢索時間檢索時間檢索式編號可替代檢索式進行輸入檢檢索式編號可替代檢索式進行輸入檢 索如:索如:#5 AND #6可組配檢索式,如:可組配檢索式,如:#1 OR #2, #1 AND child點擊編號可對檢索式進行刪除、保存點擊編號可對檢索式進行刪除、保存 等操作等操作檢索歷史檢索歷史(簡稱檢索史)(簡稱檢索史)l檢索史按檢

32、索式運行的順序列出各檢索式,包括檢索式序號、檢索策略、檢索時間、檢索到的文獻條數(shù)。l檢索史最多保存100條檢索式,檢索史將在離開PubMed或其他Entrez數(shù)據(jù)庫8小時小時后消失。l單擊檢索式后的文獻數(shù)鏈接可顯示該檢索式的檢索結(jié)果。l可通過檢索策式的序號對檢索策略進行組配l單擊檢索史窗口上方的Download history或者Clear History按鈕可將所有檢索式下載或者刪除。例題例題1: 利用高級檢索途徑,檢索天津醫(yī)科大學(xué)利用高級檢索途徑,檢索天津醫(yī)科大學(xué)(tianjin medical university)姚智)姚智(yao zhi)教授發(fā)表在)教授發(fā)表在Peptides的文獻

33、的文獻。 點擊檢索點擊檢索點擊檢索點擊檢索u文獻太多,如何保證查全和查準(zhǔn)?文獻太多,如何保證查全和查準(zhǔn)?uMesh詞表幫助您!詞表幫助您! 它是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館編制的它是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館編制的權(quán)威性主題詞表權(quán)威性主題詞表。 Mesh在文獻檢索中的重要作用主要表現(xiàn)在兩個方面:在文獻檢索中的重要作用主要表現(xiàn)在兩個方面:準(zhǔn)確性(準(zhǔn)確揭示文獻內(nèi)容的主題)和專指性。準(zhǔn)確性(準(zhǔn)確揭示文獻內(nèi)容的主題)和專指性。3、主題詞檢索、主題詞檢索 主題詞主題詞(Subject HeadingSubject Heading)是經(jīng)人工規(guī)范化處理的最能)是經(jīng)人工規(guī)范化處理的最能表達文章主題概念的語詞。所謂規(guī)范化處理,就

34、是在文獻存表達文章主題概念的語詞。所謂規(guī)范化處理,就是在文獻存儲時,對文獻中的同義詞、近義詞、多義詞等加以嚴(yán)格的控儲時,對文獻中的同義詞、近義詞、多義詞等加以嚴(yán)格的控制和規(guī)范,使得同一主題概念的文獻相對集中在一個主題詞制和規(guī)范,使得同一主題概念的文獻相對集中在一個主題詞下。下。 主題詞主題詞關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞禽流感禽流感禽流感、鳥流感、家禽瘟癥、雞瘟禽流感、鳥流感、家禽瘟癥、雞瘟NeoplasmsNeoplasm、Tumors、Tumor、CancerAspirinAspirin、Acetylsalicylic Acid、Micristin、Solprin3、主題詞檢索、主題詞檢索、第一種進、第一種

35、進入方法入方法、第二種進、第二種進入方法入方法例題例題2:l 利用主題詞檢索途徑,檢索近有關(guān)利用主題詞檢索途徑,檢索近有關(guān)肝癌藥物治療肝癌藥物治療(liver cancer, drug therapy)方面的英文文獻。方面的英文文獻。 3、主題詞檢索、主題詞檢索輸入檢索詞輸入檢索詞詞義解釋詞義解釋主題詞輪排表主題詞輪排表3、主題詞檢索、主題詞檢索副主題詞副主題詞主題詞加權(quán)、主題詞加權(quán)、不擴展選項(默認(rèn)選項)不擴展選項(默認(rèn)選項)可對檢索結(jié)果進行限定??蓪z索結(jié)果進行限定。如果進行了限定,系統(tǒng)默認(rèn)以下的操作如果進行了限定,系統(tǒng)默認(rèn)以下的操作都進行此限定,如要進行新的檢索應(yīng)將限都進行此限定,如要進

36、行新的檢索應(yīng)將限定清除定清除“clear”。主題詞加權(quán)檢索主題詞加權(quán)檢索主題詞不擴展檢索主題詞不擴展檢索(系統(tǒng)默認(rèn)按照擴展進行檢索)(系統(tǒng)默認(rèn)按照擴展進行檢索)入口詞入口詞樹狀結(jié)構(gòu)樹狀結(jié)構(gòu)主題詞主題詞下位主題詞下位主題詞上位主題詞上位主題詞MeSH檢索的優(yōu)點l查全同義詞查全同義詞:如:如:renal/kidney failure; tongue cancer/tumorl查全子概念查全子概念:如:如:chronic/acute kidney failure, ATNl根據(jù)樹形結(jié)構(gòu)調(diào)整檢索詞根據(jù)樹形結(jié)構(gòu)調(diào)整檢索詞縮小:不擴展下位詞,或選用某個下位詞;縮小:不擴展下位詞,或選用某個下位詞;擴大:選

37、用上位詞,或選用多個同位詞;擴大:選用上位詞,或選用多個同位詞;l了解同一概念的同義詞、近義詞,供自由詞檢索參考了解同一概念的同義詞、近義詞,供自由詞檢索參考l提高文獻相關(guān)度提高文獻相關(guān)度 標(biāo)有標(biāo)有MeSH詞的都是文章的主題,篩去非主題的文章詞的都是文章的主題,篩去非主題的文章 Major Topic Headings(加權(quán),重點論述的主題)(加權(quán),重點論述的主題)MeSH檢索的缺陷l人工標(biāo)引費時,最新論文還未標(biāo)人工標(biāo)引費時,最新論文還未標(biāo)MeSH詞(詞( In Process),用),用MeSH會漏檢。會漏檢。lMedline不收錄的文獻,不收錄的文獻,Supplied by publish

38、er的文獻,不標(biāo)的文獻,不標(biāo)MeSH詞。詞。l新詞、一些很專指的概念沒有對應(yīng)的規(guī)范詞。新詞、一些很專指的概念沒有對應(yīng)的規(guī)范詞。如:如:SARS(03年詞表中沒有),舌根癌年詞表中沒有),舌根癌l查上述類型的文獻需查上述類型的文獻需結(jié)合自由詞檢索結(jié)合自由詞檢索4、期刊檢索、期刊檢索l通過輸入刊名全稱或縮寫、通過輸入刊名全稱或縮寫、ISSN號等瀏覽期刊出版社號等瀏覽期刊出版社等詳細(xì)信息。等詳細(xì)信息。l提供期刊:提供期刊:在在PMC中的免費全文鏈接中的免費全文鏈接在在Nucleotide,Protein,Pubmed等庫中的記錄鏈接。等庫中的記錄鏈接。相關(guān)的其他期刊相關(guān)的其他期刊、第一種進、第一種進

39、入方法入方法、第二種進、第二種進入方法入方法4、期刊檢索、期刊檢索l如果刊名是如果刊名是Mesh詞(如:詞(如:Gene Therapy、Science、Cell),或刊名是單個單詞,或刊名是單個單詞(Scanning),如只想將其作為刊名檢索,需,如只想將其作為刊名檢索,需加刊名字段標(biāo)識加刊名字段標(biāo)識so、ta、jour。l 推薦使用刊名全稱或縮寫查找,因為有些推薦使用刊名全稱或縮寫查找,因為有些過早的文獻沒有過早的文獻沒有ISSN。4、期刊檢索、期刊檢索例題例題3: 檢索檢索Lancet刊登的所有文獻篇數(shù)。刊登的所有文獻篇數(shù)。 4、期刊檢索、期刊檢索清除之前的檢索式清除之前的檢索式出版頻率

40、:周刊出版頻率:周刊創(chuàng)刊年代:創(chuàng)刊年代:1823年年主題詞:醫(yī)學(xué)主題詞:醫(yī)學(xué)可對檢索結(jié)果進行限定可對檢索結(jié)果進行限定5、題錄檢索、題錄檢索l通過輸入文獻出處信息,查找特定文獻。通過輸入文獻出處信息,查找特定文獻。(刊名要準(zhǔn)確,縮寫要標(biāo)準(zhǔn);著者姓名大小寫不敏(刊名要準(zhǔn)確,縮寫要標(biāo)準(zhǔn);著者姓名大小寫不敏感)感) 有兩種方式:有兩種方式: 1、單一引文匹配(、單一引文匹配(Single Citation Matcher) 輸入已知的信息,可得到相應(yīng)的特定文輸入已知的信息,可得到相應(yīng)的特定文 獻,如投稿遺漏的頁碼或第二、三作者等。獻,如投稿遺漏的頁碼或第二、三作者等。 2、成組引文匹配(、成組引文匹配

41、(Batch Citation Matcher) 允許一次輸入多條檢索要求,返回結(jié)果為相允許一次輸入多條檢索要求,返回結(jié)果為相 應(yīng)文獻的應(yīng)文獻的PMID。進入Single Citation Matcher單一引文匹配單一引文匹配如果希望檢索結(jié)果的專指性更強,可以填寫更多的已知信息 ,如: journal,date, volume, author name, title words例題例題4: 檢索檢索1975年發(fā)表在年發(fā)表在Taiwan yi xue hui za zhi 上,上, 由由Chang PY撰寫撰寫的文獻的合著者。的文獻的合著者。 5、題錄檢索、題錄檢索合著者合著者檢索表達式檢索表

42、達式進入Batch Citation Matcher成組引文匹配成組引文匹配6、臨床咨詢、臨床咨詢(獲取循證醫(yī)學(xué)證據(jù)獲取循證醫(yī)學(xué)證據(jù)) 利用利用PubMed 提供的提供的“Clinical Queries”功能,功能,獲取各種類型的循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。獲取各種類型的循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。 只需在檢索框中輸入疾病名稱或干預(yù)手段等只需在檢索框中輸入疾病名稱或干預(yù)手段等檢索詞,點擊檢索詞,點擊Search,即可獲取系統(tǒng)評價、,即可獲取系統(tǒng)評價、Meta分析、臨床試驗等循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。分析、臨床試驗等循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。供查找疾病的供查找疾病的病因、診斷、病因、診斷、治療、預(yù)后的治療、預(yù)后的文獻文獻查找疾病的系查找疾病的系

43、統(tǒng)評價文獻統(tǒng)評價文獻查找醫(yī)學(xué)遺傳查找醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)方面的文獻學(xué)方面的文獻供查找疾病的供查找疾病的病因、診斷、病因、診斷、治療、預(yù)后的治療、預(yù)后的文獻文獻供查全或查準(zhǔn)供查全或查準(zhǔn)7、臨床試驗、臨床試驗(獲取循證醫(yī)學(xué)證據(jù)獲取循證醫(yī)學(xué)證據(jù))7、臨床試驗、臨床試驗 美國國立醫(yī)學(xué)圖書館研制開發(fā)的臨床試驗數(shù)美國國立醫(yī)學(xué)圖書館研制開發(fā)的臨床試驗數(shù)據(jù)庫。收錄了美國及世界據(jù)庫。收錄了美國及世界170多個國家經(jīng)注冊多個國家經(jīng)注冊登記的登記的8萬多條臨床試驗的詳細(xì)信息,是十分萬多條臨床試驗的詳細(xì)信息,是十分重要的循證醫(yī)學(xué)信息資源。重要的循證醫(yī)學(xué)信息資源。四、檢索結(jié)果處理四、檢索結(jié)果處理1、顯示方式選擇、顯示方式選擇2、

44、輸出方式選擇、輸出方式選擇3、全文的獲取及相關(guān)鏈接、全文的獲取及相關(guān)鏈接 1、顯示方式選擇(、顯示方式選擇(Display settings ) 顯示格式選擇(顯示格式選擇(format ): summary(默認(rèn)格式:題名、作者、刊(默認(rèn)格式:題名、作者、刊名)名) Abstract (文摘格式)(文摘格式) Medline(包括所有字段,并有字段標(biāo)識(包括所有字段,并有字段標(biāo)識符)符) 增加網(wǎng)頁顯示的記錄數(shù)(增加網(wǎng)頁顯示的記錄數(shù)(items per page ) 排序選擇(排序選擇(sort by): 可按日期、作者、刊名、題名等順序排列。可按日期、作者、刊名、題名等順序排列。 2、輸出方

45、式選擇(、輸出方式選擇(send to)lFile:保存檢索結(jié)果為文本文件:保存檢索結(jié)果為文本文件lClipboard 剪貼板,多次檢索,可暫存每次剪貼板,多次檢索,可暫存每次檢索需下載的記錄,最后一起保存。檢索需下載的記錄,最后一起保存。 最多允最多允許存儲許存儲500條,保留條,保留8小時。小時。lEmail: 通過郵件發(fā)送通過郵件發(fā)送lCollections:將檢索結(jié)果存到:將檢索結(jié)果存到My NCBI中中l(wèi)Order:全文傳遞服務(wù),需帳號、收費。:全文傳遞服務(wù),需帳號、收費。3、全文的獲取及相關(guān)鏈接、全文的獲取及相關(guān)鏈接1、聯(lián)機獲取全文(文摘中超鏈接)、聯(lián)機獲取全文(文摘中超鏈接) 在

46、文摘顯示的界面上通過刊名(彩色活動圖標(biāo))鏈接在文摘顯示的界面上通過刊名(彩色活動圖標(biāo))鏈接電子期刊的網(wǎng)站,部分能獲取該文獻的電子全文。電子期刊的網(wǎng)站,部分能獲取該文獻的電子全文。2、PubMed Central(PMC) PMC是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館生命科學(xué)期刊文獻的免費是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館生命科學(xué)期刊文獻的免費數(shù)據(jù)化文檔、訪問該數(shù)據(jù)庫可不加任何限制獲取全文。數(shù)據(jù)化文檔、訪問該數(shù)據(jù)庫可不加任何限制獲取全文。3、Linkout(全文外部資源鏈接)(全文外部資源鏈接) “Linkout”鏈接了鏈接了PubMed的全文電子期刊網(wǎng)站,的全文電子期刊網(wǎng)站,在有效的在有效的IP地址控制下,如圖書館訂購了地址控制下,如圖書館訂購了“Linkout”鏈接的電子期刊,就可獲取這些電子期刊全文。(必鏈接的電子期刊,就可獲取這些電子期刊全文。(必須在校園網(wǎng)物理地址范圍內(nèi))須在校園網(wǎng)物理地址范圍內(nèi))五、注冊五、注冊 PubMed提供個性化服務(wù)(My NCBI),用戶可通過注冊(免費)享受包括保存檢索式、信息提醒(Alerts)等個性化服務(wù)。 新用戶注冊新用戶注冊用戶登錄用戶登錄定制主題定制主題 免費推送免費推送練習(xí)題練習(xí)題l1.1.分別通過基本檢索和主題

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