Graphpadprism6.0的基礎應用

1、張張妮妮妮妮2016-5-31 19:00圖書館二樓多媒體培訓教室圖書館二樓多媒體培訓教室醫(yī)學繪圖與分析軟件醫(yī)學繪圖與分析軟件GraphPad Prism 6.05基礎應用基礎應用 GraphPad Prism是一款集數(shù)據(jù)分析和作圖為一體的數(shù)據(jù)處理軟件，尤其適合生物醫(yī)學類，可以直接輸入原始數(shù)據(jù)獲得高質量的科學圖表。 它在統(tǒng)計分析上劣于SPSS 等統(tǒng)計軟件。 不需要輸入程序語言，只需輸入原始數(shù)據(jù)。 容易操作，繪圖美觀。 可與ppt，word相鏈接。 Graphpad與origin的比較簡介大綱 統(tǒng)計圖基本知識 GraphPad Prism6繪圖界面 案例分析 統(tǒng)計圖的排版與導出 統(tǒng)計圖的基本知識

2、 統(tǒng)計圖基本要素 常見統(tǒng)計方法的圖形表達統(tǒng)計圖的基本要素 1.標題：一般位于圖的正下方，簡明扼要說明主要內容 2.X軸：有兩種 分類軸：表示兩種不同的類別 數(shù)據(jù)軸：表示一個數(shù)值概念 3.Y軸：一般為數(shù)值軸 4.圖形區(qū)：二維平面內點、線、條表達數(shù)據(jù)From 常見統(tǒng)計方法的圖形表達 1.獨立樣本t檢驗 2.配對t檢驗 3.完全隨機設計資料的方差分析 4.析因設計資料的方差分析 5.重復測量資料的方差分析 6.兩組獨立樣本的秩和檢驗 7.多組獨立樣本的秩和檢驗 GraphPad Prism6繪圖界面 一、歡迎界面 二、軟件主界面 三、目錄樹 四、快捷菜單欄 五、圖像模塊詳解 六、坐標軸調整 七、圖形

3、設定界面歡迎界面 歡迎界面要對統(tǒng)計方法進行選擇 特定的統(tǒng)計方法對應的數(shù)據(jù)錄入格式和圖像類型設定統(tǒng)計類別、圖像類型和數(shù)據(jù)輸入格式后，進入軟件主界面1.統(tǒng)計類型統(tǒng)計類型2.數(shù)據(jù)輸入格式數(shù)據(jù)輸入格式3.示例數(shù)據(jù)，示例數(shù)據(jù)，也是統(tǒng)計方法也是統(tǒng)計方法的提示的提示二、軟件主界面三、目錄樹數(shù)據(jù)集；點擊，進入數(shù)據(jù)錄入窗口，在歡迎界面選擇不同的統(tǒng)計類型，數(shù)據(jù)集的表格會有所不同圖形；當完成數(shù)據(jù)錄入，點擊該圖標，則自動生成圖像布局文檔操作模塊，如打開、新建、保存、前進、后退、復制和粘貼。該模塊與office軟件操作一致。分析模塊。圖形模塊，將對圖形類型、坐標軸和圖形本身進行分析，將重點解釋。文字修飾模塊，可以繪制線

4、條、添加文字，并對文字進行調整。圖形輸出模塊，包括圖形導出，打印和一鍵輸入至word，ppt中。四、快捷菜單欄五、圖形模塊詳解相當于統(tǒng)計方法和圖形類型選擇項，可以對統(tǒng)計方法重新選擇，但一般只對圖形類型進行選擇。對坐標軸進行具體設定，包括原點、X軸和Y軸。對圖形進行具體調整。圖表的配色方案，默認為黑白圖表。六、坐標軸調整1.坐標框與原點（1）Origin原點的設定（2）繪圖區(qū)的形狀、大小和位置進行設定，一般不需要設定。繪圖區(qū)的顏色背景顏色（3）坐標軸的顏色（4）對圖形框和網(wǎng)格線進行設定 X axis(X軸) Gaps and Direction：只有XY圖形，才能進行設定X軸是否分段和方向一般為

5、線性，濃度選擇logo刻度對刻度圖示進行調整添加輔助線，還可對兩條輔助線內區(qū)域進行填色3. Left Y axis(左Y軸)4. Right Y axis(右Y軸)軟件默認無右Y軸與X軸設定方法類似Note：添加右Y后，所有圖像仍跟隨左Y,如果某些數(shù)據(jù)需要按照右Y,需要在Format Graph對話框中實現(xiàn)。5. Titles & Fonts(標題和字體)七、圖像設定界面Data SetStyle:樣式，不同的圖形Additional options可以選擇數(shù)據(jù)集是否依據(jù)左Y還是右Y進行顯示，如果出現(xiàn)第二Y軸，此處應進行設定。案例分析配對t檢驗 適用情況（4種）： 配對的兩組受試對象分

6、別接受兩種處理 同一受試對象處理前后的比較 同一受試對象兩個不同部位的比較 同一樣品用兩種方法（儀器等）檢索結果的比較*實例1 抽取15名某大學的學生進行了為期3個月的發(fā)展腿部爆發(fā)力的訓練，運用實驗的方法在訓練前后分別測試了每一人的立定跳遠成績。統(tǒng)計15名學生訓練前后的數(shù)據(jù)。該實例的圖像表達 應該采用單一研究對象前后值連線的方式表達 與獨立t檢驗區(qū)別開來 若數(shù)據(jù)太多，則不適合用圖形表達圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗 2.新建數(shù)據(jù)集 進入主界面圖形繪制圖形繪制 Step 2：數(shù)據(jù)錄入 1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù) 2.點擊左側目錄樹中的G

7、raphs。 3.選擇圖形。 4.圖形生成。初始圖形 Step 3：坐標軸和圖形調整 1. 點擊快捷菜單欄change模塊中 彈出坐標軸對話框 2.選擇左Y軸，對Y軸進行調整修改前后對比 3.選擇標題和字體，對其進行調整Note：不論中文還是英文，一旦亂碼，就要對“字體”進行調整。 4.選擇X軸，對X軸進行調整 5.對圖形的Symbols（符號）進行修改圖形繪制 Step 4：文字修飾 1. 不需要的文字點擊刪除即可 2.可通過Write插入文字 3.在Text菜單欄對字體進行調整分析數(shù)據(jù)圖形繪制 最后圖形如下：*成組t檢驗實例2該實例的圖形表達 1.散點圖（圖1）：清晰描述各點數(shù)據(jù)，易發(fā)現(xiàn)離

8、群點，橫線為均值，適合數(shù)據(jù)較少時。 2.誤差圖（圖2）：箱頂為均數(shù)，觸須線表示SD，也可表示SE,適合數(shù)據(jù)較多時。 3.誤差圖（圖3）：點表示均數(shù)，直線表示兩側SD。圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗 2.新建數(shù)據(jù)集圖形繪制 Step 2：數(shù)據(jù)錄入 1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù) 2.點擊左側目錄樹中的Graphs。 3.選擇圖形。 4.圖形生成。圖形繪制圖形繪制 添加P值的bar圖形繪制 最后圖形如下：實例3 為了探討雌激素預防骨質疏松癥的作用，研究者將30只10月齡SD雌性大鼠隨機等分到假手術組（組1）、卵巢切除組（組2）和卵巢切除后補充

9、17-雌二醇組（組3），12周后處死大鼠，取其股骨，測量股骨重量。定量資料-統(tǒng)計方法選擇 定量資料 正態(tài)：均值的比較 兩組：t檢驗 多組：方差分析 非正態(tài)：中位數(shù)的比較 兩組：非參（Mean-Whitney U檢驗） 多組：非參（Cruskal-Wallis H檢驗）圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗 2.新建數(shù)據(jù)集 3.選擇圖形類型 -垂直柱狀圖圖形繪制圖形繪制最終的圖形實例4 某醫(yī)生將病人隨機分為兩組，分別以新療法和傳統(tǒng)療法治療。比較兩種療法的退熱時間有無差別。兩組獨立樣本資料比較的秩和檢驗兩組獨立樣本資料比較的檢驗方法 - 滿足正態(tài)分

10、布和方差齊性 -可用t檢驗或完全隨機設計的方差分析 - 不滿足正態(tài)分布或方差齊性不滿足正態(tài)分布或方差齊性 -可采用可采用Wilcoxn秩和檢驗（秩和檢驗（rank sum test） -推斷兩獨立樣本分別代表總體分布位置是否不推斷兩獨立樣本分別代表總體分布位置是否不同。同。 二、圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.Column 適合t檢驗、ANOVA、秩和檢驗圖形繪制 Step 2：數(shù)據(jù)錄入 1.在data窗口，錄入數(shù)據(jù) 2.點擊左側目錄樹中的GraphsData4，自動生成圖形。 3. 選擇Median，用橫線表示中位數(shù)。圖形區(qū)：均值與中位數(shù)的修改最終的圖形實例5折線圖研究進食量與體重增加的關系二、圖形繪制 Step 1：圖形類型選擇 1.XY 線性回歸，非線性回歸，相關分析 2.新建數(shù)據(jù)集 3.選擇圖形類型 -散點圖兩變量的關聯(lián)性分析二、圖形繪制圖形繪制-