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文檔簡介

1、WesternBlot 實(shí)驗(yàn)方法及注意事項(xiàng) 實(shí)驗(yàn)原理:WesternBlot印跡方法,又稱為免疫印記,是將獲得的蛋白質(zhì)樣品 通過SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳,對不同分子量的蛋白質(zhì)進(jìn)行分離,并 通過轉(zhuǎn)移電泳將凝膠上分離到的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)印至固相支持物(NC膜或PVD用莫)上,用抗靶蛋白的非標(biāo)記抗體(一抗)與轉(zhuǎn)印后膜上的靶蛋 白進(jìn)行特異性結(jié)合,再與經(jīng)辣根過氧化物酶標(biāo)記(偶聯(lián))的二抗結(jié)合, 最后用ECU敏發(fā)光液試劑檢測。如果車印膜上含有靶蛋白,經(jīng)X光片曝光、顯影后,則會在 X-光片上出現(xiàn)特異性蛋白條帶。 實(shí)驗(yàn)材料:分離膠及積層膠溶液、水飽和異丁醇、iXTris ?Cl/SDS,pH8,8、蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)混合

2、物 、1XSDS電泳緩沖液、電 泳裝置及夾子、玻璃板、灌膠支架、緩沖液梢等附件、0.75mmfef邊墊片、0.75mmt羊品梳子、50膜微量加樣器、恒流電源 常用試劑:30%f烯酰胺/0.8% N,N-亞甲丙烯酰胺將30克丙烯酰胺和0.8克N,N-亞甲丙烯酰胺溶于總體積為60ml 水中,加熱至37c溶解之,補(bǔ)加水至終體積為100ml。0.45 m微孔濾 膜過濾除菌,查證該溶液pH應(yīng)不大于7.0 ,置棕色瓶中保存。小心:丙烯酰胺具有很強(qiáng)的神經(jīng)毒性并可通過皮膚吸收,具作用 具有累積性。稱量丙烯酰胺和N,N-亞甲丙烯酰胺時(shí)應(yīng)戴手套和面具??烧J(rèn)為聚丙烯酰胺無毒,但也應(yīng)謹(jǐn)慎操作,因?yàn)樗€可能含有少量未

3、聚合材料。4x Tris ? Cl/SDS,pH8.8,在 300mlH2計(jì)溶解 91g Tris 堿(1.5mol/L),用 1mol/L 調(diào)節(jié) pH 至8.8,補(bǔ)加H2O至體積500ml。用0.45止m濾膜過濾溶液,再加入2g SDS0.4%(w/v),于 4 c 可保存 1 月。4x Tris ? Cl/SDS,pH6.8,在 40mlH2計(jì)溶解 6.05g Tris 堿(0.5mol/L),用 1mol/L 調(diào)節(jié) pH 至6.8,補(bǔ)加H2O至體積100ml。用0.45 m濾膜過濾溶液,再加入0.4g SDS0.4%(w/v),于 4 c 可保存 1 月。4XSDS電泳緩沖液Tris b

4、ase 24.2 g 、Glycerin 115.3 g 、20%SDS 20 ml加水至總體積1000ml。應(yīng)用時(shí)稀釋4倍即為1XSDS電泳緩沖液(Tris 0.05M,Glycerin 0.38M,SDS 0.1%)。TEMED (N,N,N ,N-四甲基乙二胺)TEMEDI過催化過硫酸鏤形成自由基而加速丙烯酰胺和N,N-亞甲丙烯酰胺的聚合。10%硫酸鏤過硫酸鏤提供驅(qū)動丙烯酰胺和亞甲丙烯酰胺聚合所必需配自由 基??捎萌ルx子水配制小量10%(w/v)配貯存液并保存于4C。由于過 硫酸鏤會緩慢分解,故應(yīng)隔周新鮮配制。實(shí)驗(yàn)步驟: 轉(zhuǎn)染后的樣品,收毒,12000rpm離心,2min,去上清,細(xì)胞碎

5、片就直接進(jìn)行下面步驟:(1)力口入 10 x RIPA buffer/ 每孑L 200 , 4 裂解 30min。(2)準(zhǔn)備熱變性,用八連管,每孔加入 5 x loading buffer 5(3)用20膜 移液槍,將裂解后的細(xì)胞取出20屋,力口入對應(yīng)的八連管 中,并吹打混勻。(4)封口,用PCFa進(jìn)行熱變性處理:97 8min。(5) 4儲存變性后的樣品,待檢。1、 SDS膠的配制預(yù)先配制混合液(Tris-HCL/Acr-bis/SDS/H2O ) ,APS 以及 TEMED 在配制凝膠時(shí)現(xiàn)加。分離膠:用1.5M Tris-HCL 8.8、10粉離膠。(所謂的10麻度為Acr-Bis的濃度,

6、即丙烯酰胺的濃度,用水定容,其他成分不變);濃縮膠:用 1M Tirs-HCL 6.8、濃度:5%2、上樣電泳:所用梳子為15孔,Marker占用一孔,故每塊凝膠可以檢測14支樣品。上樣量:Marker: 5屋/孔; 樣品:20區(qū)l/孔;參數(shù):80V,待樣品跑出上樣孔;120V,樣品進(jìn)入分離膠;200V,直至結(jié)束(藍(lán)色指示帶 到凝膠底部即完成電泳)3、轉(zhuǎn)膜:轉(zhuǎn)膜三明治結(jié)構(gòu)順序:黑色板、網(wǎng)墊、一層濾紙、凝膠(習(xí)慣將Marker 放在右側(cè))、NC膜(在膜的蛋白面左上角做好標(biāo)記)、兩層濾紙、網(wǎng)墊、白色板。備注:所用的濾紙也分粗糙面和細(xì)膩面,細(xì)膩面對著凝膠和NC膜,粗糙面對著網(wǎng)墊。將三明治結(jié)構(gòu)的夾子放

7、入電極時(shí),黑色板對應(yīng)電極的黑色一面(負(fù)極)、白色版對應(yīng)電極的紅色一面(正極)。強(qiáng)調(diào):凝膠和NCI (硝化纖維素膜)的順序千萬不要放反,所用的 NC 膜分粗糙面和光滑面,粗糙面為接受蛋白面,該面和凝膠直接接觸。蓋梢蓋時(shí),同樣注意黑色對應(yīng)黑色、紅色對應(yīng)紅色;同樣導(dǎo)線電極連接電源的時(shí)候,也是黑色對黑色、紅色對紅色。上述任何一步弄反,都會導(dǎo)致蛋白轉(zhuǎn)膜失敗,切記。轉(zhuǎn)膜所用參數(shù):穩(wěn)流45mA過夜(999min)。4、封閉所用封閉液:5% Nonfat milk ,用 TBSTt己制,RT (室溫),30min1h(根據(jù)實(shí)際情況確定時(shí)間,比如封閉液已使用次數(shù)、ECL顯色的背景)。為了防止奶粉變質(zhì),加入疊氮鈉

8、即 NaN3( 一種光譜的防腐劑),終濃度為0.02% (本實(shí)驗(yàn)室疊氮鈉儲存液濃度為 2%洗:TBST洗去殘余的奶粉。5、一抗孵育所用抗體:mouse Anti-Flag。一抗稀釋:4%BSA by Super Block, 1:1000。亦加入 0.02% 的疊氮鈉NaN3孵育:R1 23h。洗:TBST 3 x 5min6、二抗孵育所用抗體:HRP anti-mouse。二抗稀釋:5%Nonfat milk by TBST , 1:2000.(二抗一般用兩次或三 次就更新)(強(qiáng)調(diào):二抗中不可以加NaN3,因?yàn)槠鋾种艸R用勺活性) 孵育:RT, 1h。洗:TBST 6 x 5min。7、顯

9、色:ECLA液/B液,各取300屋等體積混合,現(xiàn)用現(xiàn)配。用熒光筆標(biāo)記好 NC 膜上的Marker以及上樣孔的位置。將反應(yīng)液均勻的加到膜上(蛋白面), 浸濕整張膜,然后輕輕的將膜的蛋白面向下放入顯色儀,蓋上蓋子, 點(diǎn)擊開始。注意事項(xiàng)1、開始配膠的板子一定得夾緊,防止漏膠。2、上樣的板子也得夾緊,防止漏電緩液,在跑膠出現(xiàn)膠的快慢不一樣, 原因上樣前兩塊膠的板子沒有加緊漏電緩液,還有就是膠的濃度不一 樣。3、上樣時(shí),marker5ul加5 x loading buffer混勻一起上樣,這樣可 以防止在跑電泳的過程,樣品把 marker給擠的越來越窄。4、轉(zhuǎn)膜時(shí),NC膜的正面左上角先用marker筆做

10、好標(biāo)記,防止后面孵 育抗體與顯色的過程分不清 NC膜的正反面。5、轉(zhuǎn)膜之前,先把NC膜放在轉(zhuǎn)膜液浸泡,注意從一端慢慢的往下浸泡,否者NC膜容易泡不透,影響轉(zhuǎn)膜。6、顯色時(shí),往NC膜上加轉(zhuǎn)膜液也得從一邊慢慢往下加,否者最后顯色效果也不好。7、轉(zhuǎn)膜時(shí),NC膜與膠的接觸之前千萬不可有氣泡, 否者對結(jié)果的目的 條帶有影響。常見問題1、膠片是一片空白,是怎么回事?如果能夠排除下面的幾個問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。1)二抗的HRP活性太強(qiáng),將底物消耗光;ECL底物中H2O杯穩(wěn)定,失活;ECL底物沒覆蓋到相應(yīng)位置;一抗選擇不當(dāng);5)二抗失活。2、背景高咋回事?膜沒有完全均勻濕透,建議 使用100

11、% methanol浸透膜;洗膜不充分,可以增加洗液體積和洗滌次數(shù);電極不平衡或者加樣位置偏斜,可以調(diào)整電極和加樣;封閉物用量不足,可以提高封閉物濃度,孵育時(shí)保證封閉液完全浸沒轉(zhuǎn)印膜;封閉物使用不當(dāng),比如檢測生物素標(biāo)記的蛋白時(shí)不可用脫脂奶粉封閉;封閉時(shí)間不夠,一般情況下室溫37度封閉1小時(shí)以上或者4度封閉過 夜;7)抗體非特異性結(jié)合,可以降低抗體濃度,減少孵育時(shí)間一抗稀釋度不適宜,可以對抗體進(jìn)行滴度測試,選擇最適宜的抗體 稀釋度一抗孵育的溫度偏高,建議4c結(jié)合過夜10)抗體濃度過高或洗滌不夠,建議降低抗體濃度,增加洗滌次數(shù)和時(shí)間11)化學(xué)顯色底物過多,建議按說明書加入適量的顯色底物3、為啥條帶

12、形狀不好看?1)膠凝的不均勻或聚合不好,建議灌膠前將溶液充分混勻2)某些樣品鹽濃度較高,建議除鹽或?qū)悠符}濃度調(diào)成一致3)緩沖液陳舊,成分改變,可以重配4)凝膠下面有氣泡,電泳前要先將氣泡趕走5)電泳時(shí)溫度過高,可以降低電流或電壓6)樣品中含有不溶性顆粒,建議樣品充分?jǐn)嚢杌靹?、蛋白條帶位置(大小)不對咋整?膠濃度不對,不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差,可以調(diào)整濃度抗體孵育不充分,建議增加抗體濃度,延長孵育時(shí)間3)酶失活,建議直接將酶和底物進(jìn)行混合,如果不顯色則說明酶失活 了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物4)目的蛋白存在翻譯后修飾或剪切體,建議查詢相關(guān)文獻(xiàn)確定5)標(biāo)本中不含靶蛋白

13、或靶蛋白含量太低,建議設(shè)置陽性對照比對結(jié)果, 增加標(biāo)本上樣量5、有很多雜帶咋回事?1)目的蛋白有多個修飾位點(diǎn),本身可以呈現(xiàn)多條帶,建議查閱文獻(xiàn)或 進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點(diǎn)信息,通過去修飾確 定蛋白實(shí)際大小2)樣本處理過程中目的蛋白發(fā)生降解,建議加入蛋白酶抑制劑;樣本 處理時(shí)在冰上操作3)雜蛋白多,建議處理目的蛋白4)抗體特異性不強(qiáng),建議使用特異性強(qiáng)的抗體5)抗體孵育時(shí)間過久,建議減少抗體孵育時(shí)間6)二抗與抗原有交叉反應(yīng),建議選擇合適的封閉物7)二聚體或多聚體存在,建議增加蛋白質(zhì)變性過程及強(qiáng)度8)底物顯色與曝光時(shí)間過長,建議縮短顯色及曝光的時(shí)間6、背景有黑色斑點(diǎn)或有不均勻的白色

14、斑點(diǎn)以及暗背景上白色帶1)抗體與封閉試劑反應(yīng),建議使用前過濾封閉試劑HR哈量過高,建議降低酶聯(lián)二抗的濃度HRH禺聯(lián)二抗中有聚集體,建議過濾二抗試劑,去除聚集體4)抗體分布不均勻,建議孵育抗體時(shí)使用搖床7、細(xì)胞水平要做 WB多少細(xì)胞提的蛋白夠做 WB答:一般5X10八6就足夠。8、為什么我的細(xì)胞提取液中沒有檢測到目的蛋白?可能的原因有:1)細(xì)胞中不表達(dá)這種蛋白質(zhì),換一種細(xì)胞;2)抗體不能識別目標(biāo)蛋白,多看看說明,是否有問題;3)可能是沒有保持低溫操作,樣品保存不當(dāng),樣品放置時(shí)間過長;4)細(xì)胞中的蛋白質(zhì)被酶降解掉了,可加入蛋白酶抑制劑,抑制蛋白酶 活性。9、我的目的帶很弱,如何加強(qiáng)?1)可以加大抗

15、原上樣量,這是最主要的;2)也可以將一抗稀釋比例降低;3)還可以延長曝光時(shí)間。10、我做的蛋白質(zhì)分子量很小(10KD ,請問怎么做 WB1)可選擇孔徑0.22um的PVDF膜或者NC膜,轉(zhuǎn)膜時(shí)間縮短,另外可采用 Tricine-SDS體系;2)也可以選擇PSQ膜,同時(shí)縮短轉(zhuǎn)移時(shí)間。也可以將兩張膜疊在一起, 再轉(zhuǎn)移。其他按步驟即可。11、大分子量蛋白200KD在做W嚷注意什么?1)做200kd蛋白的WB寸要注意,分離膠最好選擇7%勺;剝膠時(shí)要小 心;2)轉(zhuǎn)移時(shí)間需要相應(yīng)延長;要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如 何分析);3)轉(zhuǎn)膜液中甲醇含量可適當(dāng)降低,推薦使用濕裝轉(zhuǎn)膜效率更高哦!12、如果上樣

16、量超載,要用什么方法來增加上樣量?可以濃縮樣品,也可以根據(jù)目標(biāo)分子量透析掉一部分小分子蛋白。一 般地,超載30%是不會有問題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子 量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試 1.5mm的。13、WE抗體的可以重復(fù)應(yīng)用嗎?抗體工作溶液一般不主張儲存反復(fù)使用,但是如抗體比較珍貴,可反 復(fù)使用2- 3次。稀釋后應(yīng)在2 3天內(nèi)使用,4度保存,避免反復(fù)凍融。 14、上下梢緩沖液有何要求,怎樣才能達(dá)到最佳效果?無特殊要求。但一般是上梢放新鮮的緩沖液,下梢可以是重復(fù)使用過 一兩次的緩沖液。15、免疫組化和 W麗以用同一種抗體嗎?免疫組化時(shí)抗體識別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位), 有些表位是線性的,而有的屬于構(gòu)象型;線性表位不受蛋白變性的影 響,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;構(gòu)象型表位由于受蛋白空間結(jié)構(gòu) 限制,煮后變性會消失。如果所用的抗體識別的是蛋白上連續(xù)的幾個 氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗體可同時(shí)用于

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