原核基因表達調(diào)控(2)_第1頁
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文檔簡介

1、關(guān)于原核基因的表達調(diào)控 (2)第一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月組成型、永久型(constitutive)蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì)并不是以相同拷貝數(shù)存在于每個細胞中,有些蛋白質(zhì)的數(shù)目相當固定,如糖酵解酶體系、DNA聚合酶、RNA聚合酶等。適應(yīng)型、調(diào)節(jié)型(adaptive or regulated)蛋白質(zhì) 合成速率明顯受環(huán)境影響的蛋白質(zhì)。第二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.1 原核基因表達調(diào)控總論 基因表達(gene expression)是指 從DNA到蛋白質(zhì)或功能RNA的過程。對這個過程的調(diào)節(jié)就稱為基因表達調(diào)控(gene regulation or gene control)

2、第三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月基因表達調(diào)控水平 轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptional regulation) 轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控(post-transcriptional regulation) mRNA加工成熟水平上的調(diào)控 翻譯水平上的調(diào)控第四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月調(diào)控信號 原核生物 營養(yǎng)狀況和環(huán)境因素 真核生物 激素水平和發(fā)育階段第五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第六張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月原核基因調(diào)控分類 負轉(zhuǎn)錄調(diào)控負控誘導阻遏蛋白與效應(yīng)物(誘導物)結(jié)合時,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄;負控阻遏阻遏蛋白與效應(yīng)物結(jié)合時,結(jié)構(gòu)基因

3、不轉(zhuǎn)錄。 正轉(zhuǎn)錄調(diào)控正控誘導效應(yīng)物分子(誘導物)的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài);正控阻遏效應(yīng)物分子的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)。第七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第八張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月大腸桿菌中的因子(以70為例)主要包括四個結(jié)構(gòu)域大腸桿菌中最普遍的調(diào)控方式是因子介導的第九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月70 (上)和54 (下)因子識別并結(jié)合在所調(diào)控基因上游的不同區(qū)域第十張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月Francis Jacob Jacques Monod 7.2 乳糖操縱子第十一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月1951年,M

4、onod與Jacob合作,發(fā)現(xiàn)兩對基因:Z基因:與合成-半乳糖苷酶有關(guān);I基因:決定細胞對誘導物的反應(yīng)。Szilard:I基因決定阻遏物的合成,當阻遏物存在時,酶無法合成,只有有誘導物存在,才能去掉該阻遏物。 Jacob:結(jié)構(gòu)基因旁有開關(guān)基因(操縱基因),阻遏物通過與開關(guān)基因的結(jié)合,控制結(jié)構(gòu)基因的表達。第十二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月乙?;D(zhuǎn)移酶半乳糖苷透性酶-半乳糖苷酶操作位點乳糖操縱子結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)基因第十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月操縱子是一種完整的具有特定功能的細菌基因表達和調(diào)節(jié)的單位,包括調(diào)節(jié)基因,啟動子,操縱位點,結(jié)構(gòu)基因,組成一個控制單元結(jié)構(gòu)基因:產(chǎn)生m

5、RNA,合成蛋白質(zhì)操縱位點 operator:阻遏蛋白結(jié)合位點調(diào)節(jié)基因:產(chǎn)生調(diào)節(jié)蛋白(與操縱位點結(jié)合) 結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄 誘導物存在時,可與阻遏蛋白結(jié)合 結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄Control elementStructural genes第十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.2.2 Lac 體系受調(diào)控的證據(jù):酶的誘導現(xiàn)象-半乳糖苷酶第十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月分解底物的酶只有在底物存在時才出現(xiàn)!無乳糖時,幾個-gal/cell 加入乳糖時,105個 再去掉乳糖,lac mRNA下降 乳糖能激發(fā)lac mRNA的合成 乳糖的誘導作用是由酶前體轉(zhuǎn)化而來,還是誘導新酶合成? 培

6、養(yǎng)基(35S-aa, 無乳糖) E.coli繁殖 培養(yǎng)基(無35S -aa, 加入乳糖) -gal(無35S)第十六張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月gratuitous inducer 安慰誘導物 義務(wù)誘導物可誘導半乳糖苷酶產(chǎn)生,但不是其底物IPTG,異丙基半乳糖苷TMG ,巰甲基半乳糖苷ONPG, O-硝基半乳糖苷在研究誘導作用時,很少使用乳糖第十七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.2.3 操縱子模型(負控誘導)1 調(diào)控區(qū)結(jié)構(gòu) lacI, 1040bp,獨立PiP, 82bp,821O, 35bp,728lacZYA第十八張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月阻遏狀

7、態(tài)第十九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月誘導狀態(tài)誘導物第二十張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月2.兩個矛盾生成lac誘導物乳糖代謝Allolctose 異構(gòu)乳糖 別乳糖細胞內(nèi)-半乳糖苷酶來源?細胞內(nèi)透過酶來源?第二十一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月3 大腸桿菌對乳糖的反應(yīng)E.coli+乳糖本底水平表達的透過酶乳糖進入細胞-半乳糖苷酶異構(gòu)乳糖與阻遏蛋白結(jié)合 釋放操縱區(qū),lac基因轉(zhuǎn)錄-半乳糖苷酶透過酶-半乳糖苷酶更多乳糖分子進入細胞葡萄糖+半乳糖得到碳源和能量一部分第二十二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月4 阻遏蛋白的作用機制阻遏蛋白結(jié)構(gòu)38KD,4 聚體

8、,一個亞基結(jié)合一個IPTG分子lacI 組成型轉(zhuǎn)錄 Pi 弱啟動子, 510個cell具有二重性 阻止轉(zhuǎn)錄(與lacO結(jié)合) 開始轉(zhuǎn)錄(與誘導物結(jié)合)第二十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月 阻遏蛋白的結(jié)構(gòu)域N端159aa,頭部片段HTH,與操縱基因DNA的大溝結(jié)合;核心區(qū):有6個折疊,誘導物結(jié)合在兩個核心區(qū)之間的裂縫中;C端為兩組亮氨酸拉鏈,形成四聚體。誘導物的結(jié)合可導致阻遏蛋白產(chǎn)生重要的構(gòu)象改變,兩個分子的誘導物和四聚體阻遏蛋白相結(jié)合就足以使誘導物釋放。第二十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月 阻遏蛋白對RNA pol功能的影響阻遏蛋白和RNA pol可同時與DNA結(jié)合

9、 RNA pol 與啟動子結(jié)合的平衡常數(shù) 1.9X107 有阻遏蛋白時, 2.5X109結(jié)合著的RNA pol不能轉(zhuǎn)錄. 但加入誘導物后, 釋放出阻遏蛋白, 變?yōu)殚_放型啟動子復(fù)合物.阻遏蛋白實際上使RNA pol貯存在啟動子上。第二十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月+ glucose- glucoseTime (hr)Units of -galactosidase+ lactoseGlucose added7.2.4 lac operon的正調(diào)控1 葡萄糖對lac操縱子的影響實驗,在lacGlu培養(yǎng)基上 E.coli只利用G,只有G 耗盡時,才會利用lac葡萄糖抑制lac mRNA

10、的轉(zhuǎn)錄: 可阻止誘導物引起的阻遏物失活效應(yīng) 僅去掉阻遏物并不能啟動lac基因表達,有其它因素參與第二十六張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月CAP, catabolite activator protein 由crp編碼,代謝物激活蛋白CRP, catabolite receptor proteinGlu ,cAMP ; Glu,cAMPcAMP的濃度受葡萄糖代謝的影響糖酵解途徑中位于葡萄糖-6-磷酸與甘油之間的某些代謝產(chǎn)物是腺苷酸環(huán)化酶活性的抑制劑。腺苷酸環(huán)化酶基因和crp突變體不能合成lac mRNAcAMP-CAP復(fù)合物第二十七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第二十八張,

11、PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月2 CRP結(jié)合位點CRP為二聚體, 45KD ,被cAMP激活結(jié)合位點 I -70 -50 II -50 -40第二十九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月 3 CRP的結(jié)合對DNA構(gòu)型的影響DNA彎曲彎曲點位于CRP結(jié)合位點二重對稱的中心彎曲使CRP能與啟動子上的RNA pol 接觸第三十張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月(1)CRP結(jié)合位點與轉(zhuǎn)錄起始點的位置CRP與轉(zhuǎn)錄起始點的距離,相距數(shù)個雙螺旋,結(jié)合位點在啟動子的上游.4 CRP對轉(zhuǎn)錄的影響第三十一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月(2)基因轉(zhuǎn)錄對cAMPCRP系統(tǒng)存在依賴性

12、cAMP-CRP復(fù)合物的結(jié)合于啟動子上游,能使DNA雙螺旋發(fā)生彎曲,有利于形成開放型啟動子-RNA聚合酶復(fù)合物。CRP直接作用于RNA pol 亞基缺失RNA pol 亞基的C末端時,失去受CRP激活的能力第三十二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.2.5 lac operon 的其它問題1. lac operon的功能是在正負兩個調(diào)控體系的協(xié)調(diào)作用(coordinate regulation)下實現(xiàn)的。阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時,CRP不發(fā)揮作用;如沒有CRP加強轉(zhuǎn)錄,即使阻遏蛋白從0上解聚仍無轉(zhuǎn)錄活性CRP組成型合成,所以cAMPCRP復(fù)合物取決于cAMP含量腺苷酸環(huán)化酶位于細胞膜上,其

13、活性與葡萄糖運輸?shù)拿赣嘘P(guān),因此cAMPCAP調(diào)控乳糖、半乳糖等糖類代謝有關(guān)的酶 第三十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月2. A基因及其生理功能 編碼-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶,使半乳糖苷乙?;?。該酶不參與乳糖代謝! 生理意義:在細胞中有許多能被半乳糖苷酶降解的半乳糖苷類物質(zhì),其分解產(chǎn)物不能進一步代謝,積累,抑制細胞生長。半乳糖苷乙?;?,即無毒. 所以lacA雖不在乳糖降解中起作用,但可抑制有害物質(zhì)的積累3. lac基因產(chǎn)物數(shù)量, 1:0.5:0.2 不同酶的數(shù)量差異,是由于在翻譯水平上的調(diào)節(jié)。方式有二:核糖體脫離: 多順反子的差別性翻譯 內(nèi)切酶作用: 在lac mRNA分子內(nèi)部,a基

14、因比z基因更易受內(nèi)切酶作用第三十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月Summary第三十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第三十六張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月乳糖操縱子由lacZYA三個結(jié)構(gòu)基因組成,分別編碼半乳糖苷酶,半乳糖苷透過酶和半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶,結(jié)構(gòu)基因上游有啟動子,操縱位點和cAMP-CRP激活蛋白結(jié)合位點,乳糖操縱子由正負兩個調(diào)控系統(tǒng)協(xié)調(diào)調(diào)控的。負控誘導系統(tǒng):正調(diào)控系統(tǒng):正負調(diào)控系統(tǒng)的協(xié)調(diào)乳糖操縱子僅在有乳糖而沒有葡萄糖的時候表達,此時,阻遏蛋白從操縱區(qū)釋放,cAMP含量高,cAMP-CRP激活蛋白結(jié)合。第三十七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于202

15、2年6月7.3 Trp operon 生物細胞中的氨基酸合成, 也受操縱子的調(diào)節(jié)。細胞需要某種氨基酸時,其基因即表達,不需要時基因關(guān)閉,達到經(jīng)濟的原則。第三十八張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月trpR, 阻遏蛋白P,-40+18 O, -21+1L, +1+162結(jié)構(gòu)基因7.3.1 基因組成第三十九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第四十張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.3.2 Trp operon 的阻遏系統(tǒng)1 Trp R 四聚體第四十一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月阻遏蛋白trp 有活性的阻遏物SNE299trp O 不轉(zhuǎn)錄第四十二張,PPT共九十

16、七頁,創(chuàng)作于2022年6月2 阻遏蛋白的結(jié)合位點 trpO -21 +1,反向重復(fù)序列trpP -40 +18活性阻遏物與trpO 的結(jié)合與RNA pol與啟動子的結(jié)合發(fā)生競爭第四十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月3 阻遏系統(tǒng)主管轉(zhuǎn)錄是否啟動,在缺乏TrpR時, mRNA起始合成,但不能自動延伸,一般在trpE之前終止轉(zhuǎn)錄 粗調(diào)開關(guān)第四十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.3.3 弱化作用 attenuation1 弱化子,衰減子,前導RNA,140bp第四十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月弱化子,衰減子,第四十六張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月序

17、列分析發(fā)現(xiàn),其中4個片段進行配對,形成不同的二級結(jié)構(gòu)Terminator第四十七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月S3122 前導肽14aa第四十八張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月3 轉(zhuǎn)錄弱化作用Lack of trp Lack of aminoacyl tRNA Ribosome pause at trp codons , occluding sequence 1Form 2:3 hairpin anti-terminator Transcription into trpE and beyond 第四十九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月High trp Trp i

18、s inserted at the trp codons Translate to the end of leader message Ribosome occlude sequence 2Terminate transcription at (3:4 form terminator)第五十張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月弱化子對轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵空間結(jié)構(gòu),10th and 11th codons encode trp residues (rare AA)時間,核糖體停頓在2個Trp 密碼子上時, 4區(qū)未轉(zhuǎn)錄出來Trp濃度高時,4區(qū)轉(zhuǎn)錄之前核糖體到達2區(qū)。summary第五十一張,PPT

19、共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月Negativerepressible operon可以被最終合成產(chǎn)物所阻遏R P O leading seq. E D C B Atrp+為什么需要阻遏體系? 當大量Trp 存在時,阻遏系統(tǒng)起作用。阻遏物與之結(jié)合,阻止先導mRNA合成。 經(jīng)濟第五十二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月為什么需要弱化子系統(tǒng)?第五十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.4 其他操縱子7.4.1 半乳糖操縱子 大腸桿菌半乳糖操縱子(galactoseoperon)在大腸桿菌遺傳圖上位于17分鐘處,包括3個結(jié)構(gòu)基因:異構(gòu)酶(UDP-galactose-4-epimer

20、ase,galE),半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galactosetransferase,galT),半乳糖激酶(galactosekinase,galK),使半乳糖變成葡萄糖-1-磷酸。第五十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月 半乳糖操縱子的調(diào)節(jié)基因是galR,位于遺傳圖上55分鐘處。 與lac操縱子所不同的是,galR與galE、T、K及操縱區(qū)O等的距離都很遠,而galR產(chǎn)物對galO的作用與lacI-lacO的作用相同。在galR-和galOc突變體中,E、T、K基因得到永久性表達,gal操縱子的誘導物主要是半乳糖。第五十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十六張

21、,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月gal操縱子有兩個特點:它有兩個啟動子,其mRNA可從兩個不同的起始點開始轉(zhuǎn)錄;它有兩個O區(qū),一個在P區(qū)上游-67-73,另一個在結(jié)構(gòu)基因galE內(nèi)部。第五十七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月1、cAMP-CRP對gal啟動子的作用 有葡萄糖存在時仍可以被誘導; 有些細胞株能在不含葡萄糖的培養(yǎng)基中高水平合成半乳糖代謝酶類(gal結(jié)構(gòu)基因高效表達),在另一類細胞株中,沒有葡萄糖,gal基因不表達。 在gal操縱子P-O區(qū)有兩個相距僅為5bp的啟動子,gal操縱子可以從兩個啟動子分別起始基因轉(zhuǎn)錄,每個啟動子擁有各自的RNA聚合酶結(jié)合位點S1和S2。

22、第五十八張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第五十九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月 從S1起始的轉(zhuǎn)錄只有在無葡萄糖時才能順利進行,RNA聚合酶與S1的結(jié)合需要半乳糖、CRP和較高濃度的cAMP。當腺苷環(huán)化酶突變(cya-)或cAMP受體蛋白突變(crp-)時,gal操縱子不能從S1起始轉(zhuǎn)錄。當有cAMP-CRP時,轉(zhuǎn)錄從S1開始;當無 cAMP-CRP時,轉(zhuǎn)錄從S2開始。第六十張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月2、雙啟動子的生理功能 為什么gal操縱子需要兩個轉(zhuǎn)錄起始位點呢?因為半乳糖不僅可以作為唯一碳源供細胞生長,而且與之相關(guān)的物質(zhì)尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是

23、大腸桿菌細胞壁合成的前體,細胞必須隨時合成差向異構(gòu)酶,以保證尿苷二磷酸的供應(yīng)。在沒有外源半乳糖的情況下,細胞通過半乳糖差向異構(gòu)酶(galactoseepimerase,galE基因產(chǎn)物)的作用由UDP-葡萄糖合成UDPgal。第六十一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月 如果只有S1一個啟動子,由于這個啟動子的活性依賴于cAMP-CRP,當培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時就不能合成異構(gòu)酶。 如果S2是唯一的啟動子,那么,即使有葡萄糖存在,半乳糖也將使操縱子處于充分誘導狀態(tài),能量被浪費。第六十二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.4.2 阿拉伯糖操縱子araB、araA和araD基因參與阿

24、拉伯糖的降解,它們是一個基因簇,簡寫為araBAD。araB基因編碼核酮糖激酶,araA編碼L-阿拉伯糖異構(gòu)酶,araD編碼L-核酮糖-5-磷酸-4-差向異構(gòu)酶。araE和araF負責將阿拉伯糖運入細胞內(nèi)。它們位于遠離這個基因簇的地方,分別編碼一個膜蛋白和一個位于細胞壁與細胞膜之間的阿拉伯糖結(jié)合蛋白。第六十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月啟動子區(qū)域,與araBAD相鄰兩個操縱區(qū)(O1,O2)調(diào)節(jié)基因araC。cAMP-CRP是正調(diào)節(jié)因子,AraC蛋白同時顯示正、負調(diào)節(jié)因子的功能。Ara操縱子的結(jié)構(gòu)第六十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月ara操縱子上游調(diào)控區(qū)序列與功能分析

25、第六十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月ara操縱子是可誘導的。誘導物是阿拉伯糖,cAMP-CRP起正調(diào)控作用。AraC蛋白具有PBAD活性正、負調(diào)節(jié)因子的雙重功能。Pr是起阻遏作用的形式,可與類操縱區(qū)位點相結(jié)合,而Pi是起誘導作用的形式,它通過與PBAD啟動子結(jié)合進行調(diào)節(jié)。第六十六張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第六十七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月a.沒有AraC蛋白時,由Pc啟動子起始araC基因轉(zhuǎn)錄;b.葡萄糖水平較高時,AraC蛋白與操縱區(qū)O2以及araI上半?yún)^(qū)相結(jié)合,形成DNA回轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu),araBAD基因不表達;c.有阿拉伯糖但無葡萄糖存在時,AraC

26、與阿拉伯糖相結(jié)合,變構(gòu)成為激活蛋白,與araO1和araI區(qū)相結(jié)合,在CRP-cAMP的共同作用下起始結(jié)構(gòu)基因表達。第六十八張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月a.培養(yǎng)基含有葡萄糖,無阿拉伯糖時,cAMP-CRP沒有與操縱區(qū)位點相結(jié)合,AraC蛋白處于Pr形式并與操縱區(qū)O2位點結(jié)合,RNA聚合酶不能與Pc結(jié)合,araC基因受到抑制,整個系統(tǒng)幾乎處于靜止狀態(tài)。第六十九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月b.沒有葡萄糖糖,也沒有阿拉伯糖。因為沒有誘導物,盡管有cAMP-CRP與操縱區(qū)位點相結(jié)合,AraC蛋白仍以Pr形式為主,無法與操縱區(qū)O2位點相結(jié)合,無araBADmRNA轉(zhuǎn)錄。第七十

27、張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月c.無葡萄糖,有阿拉伯糖。大量araC基因產(chǎn)物以Pi形式存在,并分別與操縱區(qū)O1 、I位點相結(jié)合,在cAMP-CRP的共同作用下,araC和araBAD基因大量表達,操縱子充分激活。第七十一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7. 4. 4 二組分調(diào)控系統(tǒng)和信號轉(zhuǎn)導 最簡單的細胞信號系統(tǒng)稱為二組分系統(tǒng)(two-component systems),由二種不同的蛋白質(zhì)組成:即位于細胞質(zhì)膜上的傳感蛋白(sensor protein)及位于細胞質(zhì)中的應(yīng)答調(diào)節(jié)蛋白(response regulator protein)。第七十二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作

28、于2022年6月細菌中參與信號轉(zhuǎn)導的二組分調(diào)控系統(tǒng)第七十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7. 4. 5 多啟動子調(diào)控的操縱子1、rRNA操縱子rRNA操縱子(rrnE)有兩個啟動子P1和P2。其中,P1為強啟動子。當細菌處于緊急狀態(tài),細胞中ppGpp濃度增加,P1的作用被抑制。為維持細菌最低能量需求,由P2起始rrnE基因轉(zhuǎn)錄。第七十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第七十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月魔斑核苷酸魔斑核苷酸為ppGpp或pppGpp,因其能在色譜上檢測出斑點而被稱為魔斑氨基酸缺乏時,空載tRNA進入A位點。A位點積聚的GTP進入另一反應(yīng)途徑:

29、 GTP+ATP pppGpp + AMP ppGpp第七十六張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月2、核糖體蛋白S1操縱子 核糖體蛋白SI操縱子rpsA有4個啟動子,P1、P2是強啟動子,平時主要依靠它們來啟動基因的表達,合成S1蛋白。P3、P4是弱啟動子,只有在緊急情況下,P1、P2啟動子受ppGpp的抑制,由P3、P4起始合成的S1蛋白維持了生命的最低需要。第七十七張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月3、DnaQ蛋白操縱子DnaQ蛋白是DNA聚合酶全酶的亞基。其操縱子有兩個啟動子,P1為強啟動子,P2為弱啟動子。增殖速度慢時,在細胞中RNA聚合酶活性較低時,操縱子的轉(zhuǎn)錄由弱啟動

30、子P2控制;而RNA聚合酶活性較高時,就開始利用強啟動子P1。第七十八張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第七十九張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.6 轉(zhuǎn)錄水平上的其他調(diào)控方式7.6.1 因子的調(diào)節(jié)作用E和K 存在于母細胞中, F 和G 存在于孢子細胞中。母細胞階段, F 與抗因子SpoAB結(jié)合,不能作為聚合酶組分。孢子形成時,SpoAA結(jié)合SpoAB,釋放F因子,轉(zhuǎn)錄孢子形成期基因。包括G和降解E的蛋白酶基因。G轉(zhuǎn)錄孢子形成后期基因和降解K蛋白酶基因。第八十張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月母細胞期活性E活性K 非活性形式:F+SpoAB孢子形成初期釋放FK因子蛋白

31、酶降解早期基因活性G孢子形成后期基因E因子蛋白酶降解第八十一張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.6.3 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的作用 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子指能夠與基因的啟動子區(qū)相結(jié)合,對基因的轉(zhuǎn)錄起激活或抑制作用的DNA結(jié)合蛋白質(zhì); 有些能夠調(diào)控大量基因的表達,而有些僅調(diào)控一兩個基因; 有些轉(zhuǎn)錄因子對某個基因起激活作用卻對另一個基因起抑制作用; 有些轉(zhuǎn)錄因子對同一基因也能發(fā)揮兩種不同的作用; 許多基因的啟動子區(qū)有多個轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的結(jié)合位點。第八十二張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7. 7 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控7. 7. 1 翻譯起始的調(diào)控 起始密碼子對翻譯效率的影響; SD序列結(jié)構(gòu)及其與起始密碼子AU

32、G的距離; mRNA 5端二級結(jié)構(gòu); 核糖開關(guān) 能夠感受細胞內(nèi)諸如代謝物濃度、離子濃度、溫度等的變化而改變自身的二級結(jié)構(gòu)和調(diào)控功能,從而改變基因的表達狀態(tài)。第八十三張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月甲硫氨酸途徑的基因編碼區(qū)上游一段序列,通過小分子物質(zhì)(SAM,S-腺苷甲硫氨酸)的結(jié)合,改變該區(qū)域mRNA的二級結(jié)構(gòu),從而調(diào)控核糖體翻譯或RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄第八十四張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月glmS基因5端有一段核酶; 6-磷酸葡糖胺濃度高時激活核酶活性;核酶切割自身mRNA,蛋白翻譯受阻。溫度調(diào)控pfrA的翻譯第八十五張,PPT共九十七頁,創(chuàng)作于2022年6月7.7.2 mRNA穩(wěn)定性對轉(zhuǎn)錄水平的影響CsrAB調(diào)節(jié)系統(tǒng);CsrA為RNA結(jié)合蛋白, CsrB是一個非編碼RNA分子。 CsrA還可與mRNA結(jié)合。調(diào)節(jié)實例,糖酵解過程,糖原合成受抑制。第八十六張,PPT共九十七

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