蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)

1、關(guān)于蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)第一張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第一節(jié) 研究蛋白質(zhì)構(gòu)象的方法 第二節(jié) 穩(wěn)定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的作用力第三節(jié) 多肽主鏈折疊的空間限制 第四節(jié) 二級(jí)結(jié)構(gòu)的基本類型 第五節(jié) 纖維狀蛋白質(zhì) 第六節(jié) 超二級(jí)結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域 第七節(jié) 球狀蛋白質(zhì)與三級(jí)結(jié)構(gòu) 第八節(jié) 膜蛋白的結(jié)構(gòu) 第九節(jié) 蛋白質(zhì)折疊 第十節(jié) 亞基締合和四級(jí)結(jié)構(gòu) 第二張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第一節(jié) 研究蛋白質(zhì)構(gòu)象的方法 一. X射線衍射法二研究溶液中蛋白質(zhì)構(gòu)象的光譜學(xué)方法1紫外差光譜：2. 熒光和熒光偏振：3. 圓二色性：4. 核磁共振（NMR）：第三張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月X-Ra

2、y Diffraction第四張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Two-dimensional NMR第五張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月共價(jià)鍵次級(jí)鍵化學(xué)鍵 肽鍵一級(jí)結(jié)構(gòu)氫鍵 二硫鍵二、三、四級(jí)結(jié)構(gòu) 疏水鍵鹽鍵范德華力三、四級(jí)結(jié)構(gòu)第二節(jié) 穩(wěn)定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的作用力第六張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第七張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第三節(jié) 多肽主鏈折疊的空間限制 酰胺平面（肽平面） -碳原子的二面角（和）三. 拉氏構(gòu)象圖(Ramachandran plot )第八張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第九張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第十

3、張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第十一張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Most of combination of f and y are sterically forbidden. 第十二張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月G. N. Ramachandran and his coworkers in Madras, India, first showed that it was convenient to plot to show the distribution of allowed values in a protein or in a family of p

4、roteins. A typical Ramachandran plot is shown in this figure.第十三張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第十四張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月 多肽鏈在一級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，按照一定的方式有規(guī)律的旋轉(zhuǎn)或折疊形成的空間構(gòu)象。-螺旋、-折疊、 -轉(zhuǎn)角、無(wú)規(guī)卷曲第四節(jié) 二級(jí)結(jié)構(gòu)的基本類型 第十五張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月一. -螺旋（ -helix ）第十六張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月螺旋上升一周包含3.6個(gè)氨基酸殘基；每個(gè)殘基沿軸旋轉(zhuǎn)100。；每?jī)蓚€(gè)殘基之間的距離為0.15nm；螺距0.54nm;

5、 -螺旋中氨基酸殘基側(cè)鏈伸向外側(cè)，相鄰的螺圈之間形成氫鍵（每個(gè)氨基酸殘基的N-H都與前面第四個(gè)殘基C=O形成氫鍵），氫鍵的取向幾乎與軸平行。-螺旋有左手螺旋和右手螺旋兩種。天然蛋白質(zhì)的-螺旋多為右手螺旋。-螺旋的結(jié)構(gòu)要點(diǎn)：第十七張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第十八張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月-螺旋：偶極矩帽化第十九張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月氨基端羧基端-螺旋的手性右手的比左手的更穩(wěn)定-螺旋具有旋光能力形成具有協(xié)同性第二十張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月影響蛋白質(zhì)-螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素2.R基的大小1.相同電荷的氨基酸ProGly第二十一張，PP

6、T共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月-螺旋的類型:3.613螺旋；310螺旋；螺旋（4.416螺旋） 第二十二張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月二. -折疊結(jié)構(gòu) (-sheet)第二十三張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月多肽鏈呈鋸齒狀（或扇面狀）排列成比較伸展的結(jié)構(gòu)；側(cè)鏈R基團(tuán)交替地分布在片層平面的上下方，片層間有氫鍵相連；有平行式和反平行式兩種。-折疊結(jié)構(gòu)要點(diǎn)：第二十四張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第二十五張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月N端C端第二十六張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月N端C端N端C端第二十七張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年

7、6月第二十八張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第二十九張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第三十張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第三十一張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月三. -轉(zhuǎn)角 (-turn)第三十二張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第三十三張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月 -turn 第三十四張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第三十五張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月- 凸起（-Bulge）第三十六張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月氨基酸在二級(jí)結(jié)構(gòu)中出現(xiàn)的幾率：第三十七張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第

8、三十八張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月沒(méi)有一定規(guī)律的松散肽鏈結(jié)構(gòu)。酶的活性部位。四. 無(wú)規(guī)卷曲第三十九張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月是支架和外保護(hù)，占脊椎動(dòng)物體內(nèi)蛋白質(zhì)總量的一半或一半以上。包括：（1）不溶性（硬蛋白，如：角蛋 白、膠原蛋白、彈性蛋白）； （2）可溶性（如：肌球蛋白、纖 維蛋白原）。 第五節(jié) 纖維狀蛋白質(zhì) （Fibrous proteins）第四十張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第四十一張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月一. 角蛋白：角蛋白和角蛋白 (1) -角蛋白（-Keratin） (2) -角蛋白（-Keratin） 二. 膠原蛋白

9、（Collagen）三. 彈性蛋白 第四十二張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月一. 角蛋白：(1) -角蛋白（-Keratin） 右手- 螺旋 原纖維（左旋的三股- 螺旋，直徑2nm）微原纖維（直徑8nm） 大原纖維（直徑200nm） 第四十三張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月硬角蛋白含硫量高（二硫鍵多），如：蹄、爪、角、甲軟角蛋白含硫量低（二硫鍵少），如：皮膚第四十四張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月(2) -角蛋白（-Keratin）第四十五張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第四十六張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第四十七張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作

10、于2022年6月silk fibroin第四十八張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月二. 膠原蛋白（Collagen）1膠原蛋白的組織分布與類型： I型XII型，2膠原蛋白的AA組成： Gly, Pro, 4-OH-Pro, 3-OH-Pro, 5-OH-Lys，膠原蛋白是糖蛋白，少量糖與5-OH-Lys的OH共價(jià)連接。 第四十九張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月 Hydroxylation depends on Vitamin C . Vitamin C deficiency causes scurvy (壞血病).第五十張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月 Gly ,

11、because its small size, is required at the tight junction where the three chains are in contact.第五十一張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月肽鏈（非螺旋，更伸展，左手） 三股螺旋（右手超螺旋纜） 原膠原分子 膠原（原）纖維 第五十二張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月第五十三張，PPT共五十八頁(yè)，創(chuàng)作于2022年6月Tropocollagen assemble into collagen fibers. Crosslinks are formed between lysines through aldol condensation and dehydration. The newly translated collagen is hydroxylated and glycosylated and triple helices are formed. The procollagen triplexes are exported and the globular domains are cut off to form the tropocollagen 第五十四