出生缺陷樣本庫建設(shè)和發(fā)展方向

1、出生缺陷樣本庫的建設(shè)和發(fā)展方向出生缺陷 定義：嬰兒出生前在母親子宮內(nèi)就已發(fā)生了的發(fā)育異常，并常常導(dǎo)致軀體和精神功能障礙或死亡 病因：遺傳因素（單/多基因缺陷，染色體異常）環(huán)境因素（營養(yǎng)/疾病/感染/用藥和接觸有毒有害物質(zhì)） 種類：先天畸形、染色體異常、遺傳代謝性疾病、功能異常如盲、聾和智力障礙等 發(fā)病率：每年100萬-120萬/年，1名/30秒 預(yù)后：早期流產(chǎn)、死胎、圍產(chǎn)兒死亡、嬰幼兒死亡和先天殘疾的主要原因。30%在5歲前死亡，40%終身殘疾2Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷的分類和病種出生

2、缺陷系統(tǒng)性出生缺陷單基因病多基因病結(jié)構(gòu)性出生缺陷染色體異常出生缺陷病種繁多，目前已知的至少有800010 000 種常見病種包括先天性心臟病、神經(jīng)管發(fā)育缺陷、唇腭裂、四肢短縮、足內(nèi)翻、腦積水、生殖器異常、胎兒水腫、體腔血管發(fā)育異常、多指趾、腸道/肛門閉鎖等。Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital國內(nèi)外知名的出生缺陷研究中心倫敦UCL Great Ormond StreetInstitute of Child Health復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院出生缺陷研究中心MassachusettsBirth Defect

3、s CenterNewlife Birth DefectsResearch Centre南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院奧蘭多 NationalBirth Defect Registry國家基因庫出生缺陷聯(lián)盟西澳大學(xué)出生缺陷研究中心National Birth Defects Prevention NetworkSurveillance Research PreventionNational Birth Defects Prevention Study (NBDPS)Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital南京大學(xué)

4、醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院婦產(chǎn)科國家臨床重點(diǎn)專科和高危妊娠轉(zhuǎn)診中心，年分娩數(shù)在5000左右。江蘇省產(chǎn)前診斷中心、圍生期疾病診療中心、出生缺陷專病防治中心省衛(wèi)生廳“十一五、十二五科教興衛(wèi)工程”重點(diǎn)學(xué)科南京市“十二五”臨床醫(yī)學(xué)中心-婦產(chǎn)科妊娠相關(guān)疾病診療中心近5年獲得國家級課題15項(xiàng)，省部級課題11項(xiàng)。主編/參編專著12部，主持編寫中華醫(yī)學(xué)會相關(guān)指南2個，發(fā)表論文190篇，SCI收錄論文55篇。獲中華醫(yī)學(xué)科技二等獎1項(xiàng)，國家發(fā)明專利2項(xiàng)，省衛(wèi)生廳新技術(shù)引進(jìn)獎6項(xiàng)。Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本庫庫存

5、樣本量統(tǒng)計 從2012年起，與多中心生物樣本庫合作，建立新生兒出生缺陷標(biāo)本庫。 現(xiàn)已收集出生缺陷新生兒標(biāo)本約1,000例（合344,50份） 包括新生兒各器官組織、胎盤、臍帶、臍血、羊水等Nanjing university medical school建庫特色：專業(yè)團(tuán)隊(duì)與優(yōu)勢學(xué)科的聯(lián)合affiliated Drum Tower hospital每年接受全國轉(zhuǎn)診病人1萬余人次。3位醫(yī)生獲英國胎兒醫(yī)學(xué)基金會資質(zhì)認(rèn)證。孕中期胎兒復(fù)雜器官畸形產(chǎn)前診斷率達(dá)70%出生缺陷嚴(yán)重產(chǎn)后產(chǎn)前診斷出血早產(chǎn)、胎兒發(fā)育異常與西澳大利亞大學(xué)附屬婦產(chǎn)醫(yī)院、瑞典皇家研究院長期合作。受邀在美國Portland“全球第7屆胎源

6、性疾病”大會上作專題報告；主持中華醫(yī)學(xué)會“早產(chǎn)指南”的編寫重度子癇前期近3年共診治重度子癇前期1045例，70%為轉(zhuǎn)診病人。母體搶救成功率100%，圍產(chǎn)兒死亡率5。相關(guān)工作在Stem Cell，Am J ObstetGynecol, Human Reprod, Placenta等期刊發(fā)表。以專業(yè)CRO團(tuán)隊(duì)設(shè)計的臨床研究所需的病例、樣本及信息為導(dǎo)向，助力婦產(chǎn)疾病的基礎(chǔ)與臨床研究。7Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital建設(shè)目標(biāo)1. 建設(shè)出生缺陷樣本實(shí)體庫推動出生缺陷相關(guān)疾病的研究發(fā)展及診治水平2. 制定出生缺

7、陷樣本庫規(guī)范化操作流程3. 建立病例臨床數(shù)據(jù)庫和隨訪數(shù)據(jù)庫Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本庫的建設(shè) 頂層設(shè)計 規(guī)范庫建設(shè) 實(shí)體庫建設(shè) 信息庫建設(shè)Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital頂層設(shè)計-組織架構(gòu) 鼓樓醫(yī)院生物樣本庫 倫理委員會 鼓樓醫(yī)院生物樣本庫 學(xué)術(shù)委員會由學(xué)科帶頭人、臨床醫(yī)學(xué)專家、資深科研人員、樣本庫專業(yè)管理人員等代表組成，定期召開技術(shù)委員會，指導(dǎo)樣本庫病例樣本采集規(guī)范及信息采集規(guī)范的制定和實(shí)

8、施、審核樣本庫質(zhì)量管理體系文件的制訂實(shí)施。對婦產(chǎn)疾病子庫的樣本采集方案及樣本出入庫活動進(jìn)行審核。 鼓樓醫(yī)院婦產(chǎn)疾病樣本庫執(zhí)行辦公室負(fù)責(zé)婦產(chǎn)疾病樣本庫的樣本采集管理、出入庫管理、質(zhì)量管理體系建設(shè)等日常工作Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本庫的建設(shè) 頂層設(shè)計建立規(guī)范化的倫理審查和知情同意制度建立婦產(chǎn)疾病樣本庫的標(biāo)準(zhǔn)操作流程 規(guī)范庫建設(shè) 實(shí)體庫建設(shè) 構(gòu)建并完善樣本庫質(zhì)量管理體系 信息庫建設(shè)Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower

9、hospital倫理審查和知情同意制度生物樣本庫項(xiàng)目建設(shè)方案及樣本采集活動均已經(jīng)過鼓樓醫(yī)院倫理委員會審批。知情同意書經(jīng)過各級主管單位及倫理委員會的修改和審批后，加入醫(yī)院的先聯(lián)電子病歷系統(tǒng)。簽署的知情同意書連同樣本一起送至生物樣本庫，確保標(biāo)本采集的合法性。Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital電子病歷系統(tǒng)-知情同意書內(nèi)容表述：規(guī)范，可接受患者信息自動提取Nanjing university medical school出生缺陷樣本庫標(biāo)準(zhǔn)操作流程affiliated Drum Tower hospitalNan

10、jing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本庫SOP文件 參考國際及國內(nèi)生物樣本庫指南文件，NCI最佳實(shí)踐，ISBER最佳實(shí)踐Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital術(shù)前血液樣本采集采集時間及方式：通過生物樣本庫術(shù)前釆血通知單，由巡回護(hù)士在術(shù)前靜脈穿刺或動脈穿刺時留取血液 。 病人信息 手術(shù)間/臺次 采血管類型 釆血量 釆血時間 釆血方式（動脈/靜脈）樣本的運(yùn)送、接收血液標(biāo)本采集后放入便攜式醫(yī)用冷藏箱（箱內(nèi)溫度保持為4C）

11、30min內(nèi)送至生物樣本庫液體樣本處理室運(yùn)送人員、樣本庫人員進(jìn)行交接并記錄處理過程質(zhì)量控制 樣本評估：溶血、凝血 處理環(huán)境評估：溫濕度 儀器設(shè)備檢查：正常運(yùn)轉(zhuǎn)、離心條件設(shè)定 處理過程記錄：樣本類型、母樣及分裝管數(shù)Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本庫的建設(shè) 頂層設(shè)計 規(guī)范庫建設(shè) 實(shí)體庫建設(shè) 信息庫建設(shè)實(shí)體庫建設(shè) 現(xiàn)有場地400m ，規(guī)劃擴(kuò)增場地600m ，完善質(zhì)控區(qū)域22環(huán)境設(shè)施空調(diào)及通風(fēng)系統(tǒng)照明系統(tǒng)安全設(shè)施溫/濕度監(jiān)控系統(tǒng)氧濃度監(jiān)測系統(tǒng)進(jìn)出門禁系統(tǒng)入侵監(jiān)測系統(tǒng)消防系統(tǒng)本流通路徑員進(jìn)出路徑電源

12、系統(tǒng)人流物流分開分區(qū)明確環(huán)保系統(tǒng)給排水系統(tǒng)實(shí)體庫建設(shè)儀器&設(shè)備儀器名稱品牌型號數(shù)量條碼打印機(jī)斑馬GX-430T1掃描槍Honeywell美國熱電海爾1900GHD400R1222離心機(jī)超低溫冰箱生物安全柜氣相液氮罐氧濃度監(jiān)控DW-86L8281600A2蘇靜安泰美國熱電沃賽特CryoExtra 40 1DR70C-O2-M 121實(shí)體庫建設(shè)規(guī)劃-完善樣本質(zhì)控區(qū)域的建設(shè) 質(zhì)控實(shí)驗(yàn)室場地600m2，建成符合國際規(guī)范的樣本質(zhì)控區(qū)域。 包括PCR實(shí)驗(yàn)室、細(xì)胞培養(yǎng)室、組織樣本處理質(zhì)控室等功能區(qū)域。添置方式儀器設(shè)備和計算機(jī)軟件名稱經(jīng)費(fèi)概算（RMB、US$）型號用 途國外購置國內(nèi) 自己購置研制Bioptic

13、生物分析儀細(xì)胞計數(shù)儀樣本質(zhì)控樣本質(zhì)控12012Qsep-100CellometerAuto 20001倒置顯微鏡病理顯微鏡olympusolympus-樣本質(zhì)控樣本質(zhì)控樣本質(zhì)控11145全波長超微量酶標(biāo)儀15海爾- DW-立式超低溫冰箱氣相液氮罐樣本存儲樣本存儲6545786L828熱電- CryoExtra240細(xì)胞培養(yǎng)箱組織芯片儀真空干燥儀Thermo細(xì)胞培養(yǎng)樣本深加工樣本干燥保存1115-1612合 計20022Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本尸檢取材 拍照 測量 病理取材 體表檢查

14、 病理解剖 病理取材 樣本庫取材：稱量 A.心臟：主動脈、肺動脈、左心室、右心室、右心房、左心房 B. 皮膚 C.臍帶 D.胎盤：胎兒面 E.肝臟 F.肺 G.胸腺 H.腎臟同一樣本一式三份Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本質(zhì)控計劃Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本質(zhì)控結(jié)果Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hosp

15、ital出生缺陷樣本庫的建設(shè) 頂層設(shè)計 規(guī)范庫建設(shè) 實(shí)體庫建設(shè) 信息庫建設(shè)信息庫建設(shè)引進(jìn)國際先進(jìn)的樣本庫管理及實(shí)驗(yàn)室管理信息系統(tǒng)Limfinity（美國RURO公司）系統(tǒng)功能模塊建設(shè)： 完善樣本信息管理 實(shí)現(xiàn)樣本庫工作流程管理 完善病例臨床信息的管理：與醫(yī)院各信息系統(tǒng)如先聯(lián)電子病歷，LIS，PACS，病理系統(tǒng)、病案系統(tǒng)、醫(yī)囑系統(tǒng)等做數(shù)據(jù)接口并測試使用 建立不斷完善的臨床及隨訪數(shù)據(jù)庫目標(biāo)原則：使樣本數(shù)據(jù)信息采集工作遵循樣本庫行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)及江蘇省重大疾病生物資源庫的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)，使入庫樣本及信息適用于平臺內(nèi)及平臺間的交流，促進(jìn)區(qū)域性共享資源27信息庫建設(shè)樣本信息管理 基本信息：取材時間、體積、大小等 血液

16、樣本：采血管類型、預(yù)處理方式 組織樣本：熱缺血時間、冷缺血時間 測試數(shù)據(jù)：生物大分子完整性、OD值、正常/病變細(xì)胞比例等。 冷鏈監(jiān)控系統(tǒng)：樣本溫度監(jiān)控 凍融次數(shù)：樣本歷史記錄 警告（過期樣本、低質(zhì)量樣本）28信息庫建設(shè)樣本入庫條碼掃描（組織，血液樣本）組織樣本血液樣本29信息庫建設(shè)捐贈者信息管理捐獻(xiàn)者信息1. 基本信息2. 住院信息3. 檢查信息4. 隨訪信息5. 擁有的樣本30信息庫建設(shè)HIS系統(tǒng)數(shù)據(jù)接口：用住院號提取捐獻(xiàn)者信息。同時實(shí)現(xiàn)對患者在醫(yī)院其他信息系統(tǒng)的臨床信息進(jìn)行一鍵更新31婦產(chǎn)疾病臨床資料采集及隨訪信息表-專業(yè)CRO團(tuán)隊(duì)設(shè)計32信息庫建設(shè)完善隨訪信息管理模塊的建設(shè)：在樣本庫信息

17、管理系統(tǒng)中實(shí)現(xiàn)自定義隨訪內(nèi)容和個性化設(shè)置 根據(jù)不同疾病設(shè)定隨訪內(nèi)容和隨訪時間，設(shè)置隨訪提醒，自動提醒隨訪計劃的落實(shí)。 通過接口數(shù)據(jù)提取或批量導(dǎo)入等方式將隨訪表信息錄入系統(tǒng)。 系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)對各數(shù)據(jù)采集點(diǎn)的高級搜索功能：及時準(zhǔn)確的篩選、查詢、計算和分析患者治療、用藥、預(yù)后等隨訪數(shù)據(jù)33Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital目標(biāo)與展望建立規(guī)范化的出生缺陷和高危妊娠疾病生物樣本實(shí)體庫，新增樣本3萬份與醫(yī)院信息系統(tǒng)做接口，建立臨床數(shù)據(jù)庫和隨訪數(shù)據(jù)庫，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的整合和共享利用信息系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)樣本及信息的精細(xì)化管理，建立完善的樣

18、本庫質(zhì)量管理體系為婦產(chǎn)疾病的基礎(chǔ)與臨床研究提供所高質(zhì)量樣本和信息資源Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital出生缺陷樣本庫發(fā)展方向Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital廣度：多中心共享共建多中心共享共建：出生缺陷是一大類復(fù)雜的疾病，多數(shù)未明確病因，從基礎(chǔ)到臨床的轉(zhuǎn)化還有很長的路要走。該合作模式有助于推動出生缺陷類疾病的研究。范例：國家基因庫全國出生缺陷聯(lián)盟聯(lián)盟成員共同開發(fā)和分享出生缺陷疾病樣本收集、保存、應(yīng)用的國際標(biāo)準(zhǔn)，完善了樣本及信息共享機(jī)制，豐富了出生缺陷疾病樣本及科研信息數(shù)據(jù)，開發(fā)了多項(xiàng)基因檢測技術(shù)并已實(shí)現(xiàn)臨床轉(zhuǎn)化，促進(jìn)了出生缺陷疾病的診療。Nanjing university medical schoolaffiliated Drum Tower hospital廣度：多中心共享共建南京市多中心樣本庫：探索和完善區(qū)域性的多中心建庫模式建設(shè)模式：樣本分開存儲，信息共享交流，即共建單位以統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)對樣本進(jìn)行采集和處理，建設(shè)一個統(tǒng)一的信息平臺，以相同標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范數(shù)據(jù)信息格式，將可共享的樣本信息上傳至信息平臺信息系統(tǒng)架構(gòu)：