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第十一章DNA損傷修復(fù)和基因突變一、自發(fā)性損傷1.復(fù)制中的損傷復(fù)制中的損傷指復(fù)制過(guò)程中堿基配對(duì)時(shí)發(fā)生的誤差再經(jīng)過(guò)DNA聚合酶“校讀”和單鏈結(jié)合蛋白等綜合因素作用下仍然存在的DNA損傷。正常情況下,大腸桿菌復(fù)制過(guò)程中的錯(cuò)配率為10-10。影響復(fù)制過(guò)程諸因素中的某一環(huán)節(jié)出現(xiàn)問(wèn)題,錯(cuò)配率就會(huì)增高,如DNA本身功能和底物的改變,二價(jià)陽(yáng)離子的改變等。2.堿基的自發(fā)性化學(xué)改變這類(lèi)損傷包括互變異構(gòu)、堿基的脫氨基作用、自發(fā)的脫嘌呤和脫嘧啶、以及細(xì)胞代謝產(chǎn)物對(duì)DNA的損傷。例如,腺嘌呤的互變異構(gòu)體(A’)可以與胞嘧啶配對(duì),模板鏈上存在這些異構(gòu)體的時(shí)候,子代鏈上就可能發(fā)生錯(cuò)誤,形成損傷。細(xì)胞呼吸的副產(chǎn)物O2-和H2O2都能造成DNA的氧化損傷。二、物理因素引起的損傷1.紫外線引起的DNA損傷紫外線(UV)照射引起的DNA損傷主要是形成嘧啶二聚體。2.電離輻射引起的DNA損傷電離輻射對(duì)DNA的損傷有直接效應(yīng)和間接效應(yīng)兩種途徑。前者指輻射對(duì)DNA直接沉積能量,并引起理化改變;后者是指電離輻射在DNA周?chē)h(huán)境的其它成分上沉積能量,而引起DNA分子的變化。電離輻射的結(jié)果可以引起DNA的堿基損傷、鏈斷裂以及DNA的交聯(lián)。三、化學(xué)因素引起的DNA損傷1.烷化劑對(duì)DNA的損傷烷化劑是一類(lèi)親電子的化合物,極容易與生物體內(nèi)的有機(jī)物大分子的親核位點(diǎn)起反應(yīng)烷化劑核DNA作用時(shí),就可以將烷基加到核酸的堿基上去。DNA鏈上的磷酸二酯鍵被烷化則形成不穩(wěn)定的磷酸三酯鍵,可能在糖與磷酸間發(fā)生水解作用,導(dǎo)致DNA鏈的斷裂。2.堿基類(lèi)似物對(duì)DNA的損傷堿基類(lèi)似物是一類(lèi)結(jié)構(gòu)與堿基相似的人工合成的化合物,它們進(jìn)入細(xì)胞以后,便能替代正常的堿基而摻入到DNA鏈中,干擾了DNA的正常合成。最常見(jiàn)的堿基類(lèi)似物是5-溴尿嘧啶(5-BU)。第二節(jié)DNA修復(fù)為了保證遺傳信息的高度穩(wěn)定性,生物細(xì)胞在進(jìn)化過(guò)程中形成了一系列多步驟的修復(fù)機(jī)制。目前對(duì)DNA損傷和修復(fù)的研究還不多,僅限于輻射-生物反應(yīng)方面。一、切除修復(fù)1.堿基切除修復(fù)(baseexciserepair,BER)BER可以去除因脫氨基或堿基丟失,無(wú)氧射線輻射或內(nèi)源性物質(zhì)引起的環(huán)氮類(lèi)的甲基化等因素產(chǎn)生的DNA損傷。BER是維持DNA穩(wěn)定的重要修復(fù)方式,其步驟是N-糖苷鍵水解,從而切除發(fā)生變化的堿基。堿基釋放過(guò)程是由DNA糖苷酶催化的。2.核苷酸切除修復(fù)(nucleotideexciserepair,NER)NER可以修復(fù)UV照射形成的嘧啶二聚體以外,還能消除體內(nèi)產(chǎn)生的各種嘌呤和嘧啶加合物。NER的關(guān)鍵特征是對(duì)損傷的DNA鏈的兩端進(jìn)行切割。NER在已研究過(guò)的真核生物中都很相似,說(shuō)明其在進(jìn)化過(guò)程中高度保守。二、直接(回復(fù))修復(fù)
直接修復(fù)即簡(jiǎn)單地把損傷的堿基回復(fù)到原來(lái)狀態(tài)的修復(fù),可分為以下幾種:1.O6-甲基鳥(niǎo)嘌呤-DNA甲基轉(zhuǎn)移酶直接修復(fù)
通過(guò)從O6-甲基鳥(niǎo)嘌呤上把甲基直接轉(zhuǎn)移到酶的半胱氨酸殘基上來(lái)直接回復(fù)DNA的損傷。2.光解酶復(fù)活酶學(xué)光復(fù)活過(guò)程是修復(fù)UV導(dǎo)致的環(huán)丁烷嘧啶二聚體的直接機(jī)制,這種修復(fù)具有高度的專(zhuān)一性。3.單鏈斷裂修復(fù)DNA單鏈斷裂是損傷的一種常見(jiàn)形式,可以通過(guò)DNA連接酶的重接而修復(fù)。三、錯(cuò)配修復(fù)錯(cuò)配修復(fù)可以糾正幾乎所有的錯(cuò)配。此外對(duì)于對(duì)于插入或刪除引起的DNA遺傳信息的改變也有作用。錯(cuò)配修復(fù)是以底物鏈上的信息為模板進(jìn)行的,因此這個(gè)系統(tǒng)有區(qū)分底物鏈和新合成鏈的機(jī)制,細(xì)胞通過(guò)識(shí)別DNA鏈的甲基化狀態(tài)來(lái)區(qū)分底物鏈和新合成的鏈。整個(gè)修復(fù)過(guò)程可以分為識(shí)別、切除和修補(bǔ)等步驟。四、交聯(lián)修復(fù)鏈間交聯(lián)是由多種多樣的致癌劑和化療藥物等引起的。大腸桿菌和哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)都存在這種修復(fù)機(jī)制,但細(xì)節(jié)還不清楚。五、雙鏈斷裂修復(fù)雙鏈斷裂(DSB)發(fā)生在體細(xì)胞重組和轉(zhuǎn)座的生理?xiàng)l件下,也是電離輻射和氧化應(yīng)激的主要損傷形式。依賴DNA的蛋白激酶對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的雙鏈斷裂重接是必需的。六、轉(zhuǎn)錄和修復(fù)從目前的研究來(lái)看,修復(fù)發(fā)生于轉(zhuǎn)錄的整個(gè)過(guò)程,如激活、起始和延伸都與修復(fù)有關(guān)。在轉(zhuǎn)錄激活過(guò)程中,主要是AP-1和NF-KB兩種轉(zhuǎn)錄因子可能參與轉(zhuǎn)錄-偶聯(lián)修復(fù)。在轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程中轉(zhuǎn)錄輔助因子TFIIH也是一種修復(fù)因子。轉(zhuǎn)錄的延伸過(guò)程中,轉(zhuǎn)錄的序列修復(fù)比非轉(zhuǎn)錄的序列更迅速。七、大腸桿菌的挽回系統(tǒng)挽回系統(tǒng)(retrievalsystem)也稱(chēng)“復(fù)制后修復(fù)”(post-replicationrepair)因?yàn)樗鼈冊(cè)趶?fù)制后起作用,也稱(chēng)為“重組修復(fù)”(recombination-repair)。此系統(tǒng)在處理復(fù)制含有損傷堿基模板后產(chǎn)生的子代二倍體的缺陷中起作用。八、SOS系統(tǒng)許多損傷DNA或抑制大腸桿菌復(fù)制的手段引起一系列綜合的表現(xiàn)型改變,稱(chēng)為SOS反應(yīng)。這是由RecA蛋白和LexA抑制物相互作用而引起的。SOS反應(yīng)表現(xiàn)為修復(fù)損傷DNA的能力增強(qiáng),這是通過(guò)誘導(dǎo)長(zhǎng)補(bǔ)丁修復(fù)系統(tǒng)和RecA重組修復(fù)系統(tǒng)組分的合成來(lái)實(shí)現(xiàn)的。第三節(jié)基因突變所有生物基因組中的D
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