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文檔簡(jiǎn)介
DNA
過程(一)原核生物DNA
過程1.
的起始DNA
的起始就是要解開雙鏈和生成引物。(1)DNA解成單鏈由拓?fù)洚悩?gòu)酶松弛超螺旋,解螺旋酶解開雙鏈,SSB結(jié)合到單鏈上使其穩(wěn)定。起始的解鏈需要多種蛋白質(zhì)參與。這些蛋白質(zhì)與
起始點(diǎn)的特有序列結(jié)合,促使其鄰近的DNA解鏈。首先起始復(fù)合體(DnaA-ATP)與4×9bp重復(fù)序列結(jié)合,3×13bp(富含AT)重復(fù)序列在Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶的作用下,使3×13bp重復(fù)序列區(qū)域松弛,再在DNA解旋酶(DnaB蛋白)的作用下,3×13bp區(qū)域發(fā)生解鏈;
泡被單鏈結(jié)合蛋白(SSB蛋白)覆蓋,以免斷裂和再復(fù)性;引物酶結(jié)合到模板DNA上并
一段短的RNA,作為
DNA的引物,
第一個(gè)
叉的先導(dǎo)鏈的
,接下來是雙向
。體引導(dǎo)引物酶到達(dá)適當(dāng)?shù)奈恢?/p>
引(2)引物物2.
的延長(zhǎng)在DNA聚合酶Ⅲ的作用下前導(dǎo)鏈
1000-2000個(gè)核苷酸后隨從鏈開始
,
片段的長(zhǎng)度為1000-2000個(gè)(大腸桿菌)PolⅢ為不對(duì)稱二聚體,一個(gè)作用于前導(dǎo)鏈,另一個(gè)作用于隨從鏈(loop)。5′3′領(lǐng)頭鏈(leading
strand)順著解鏈方向生成的子鏈,其
是連續(xù)進(jìn)行的,得到一條連續(xù)的子鏈。5'3'3'5'5'解鏈方向3'隨從鏈(laggingstrand)方向與解鏈方向相反,須等解開足夠長(zhǎng)度的模板鏈才能繼續(xù)
,得到的子鏈由不連續(xù)的片段所組成。5'3'3'3'5'3'5'解鏈方向5'3'5'三、
的終止去除RNA引物補(bǔ)充空缺連接DNA聚合酶Ⅰ的小片段5’
3’外切酶DNA聚合酶Ⅰ的大片段3’
5’外切酶5’
3’聚合酶DNA連接酶(二)真核生物DNA的
特點(diǎn)酵母的
起始點(diǎn)稱為ARS(autonomously
replicatingsequences,自主左右,包括數(shù)個(gè)序列),長(zhǎng)約15Obp起始必需的保守區(qū),其
序列富含AT。真核生物DNA
的起始需要起點(diǎn)辨認(rèn)復(fù)合物(ORC)參與。真核生物DNA
叉的移動(dòng)速度比原核生物慢得多(大約只有5Obp/s,還不到大腸桿菌的1/20)。1.DNA起始過程起始點(diǎn)(ori)。
起始點(diǎn)真核生物有多個(gè)有特殊的序列。起點(diǎn)辯認(rèn)復(fù)合物(ORC)組裝在起始部位上,形成叉。ORC在起始點(diǎn)上的組裝還不足以開始起動(dòng),另一種復(fù)合物稱小維系蛋白(MCM)必須參與。MCM有較弱的解旋酶的活性。此外,還需拓?fù)洚悩?gòu)酶、因子(RF)、增值細(xì)胞核抗原(PCNA)的參與。此外需要DNA-polα(引物酶活性)和pol
δ(解螺旋酶活性)參與。細(xì)胞能否,決定于進(jìn)入S期及M期這兩個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)。G1→S及G2→M的調(diào)節(jié),與蛋白激酶活性有關(guān)。蛋白激酶通過磷酸化激活或抑制各種因子而實(shí)施調(diào)控作用。相關(guān)的激酶都有調(diào)節(jié)亞基即細(xì)胞周期蛋白(cyclin),和催化亞基即細(xì)胞周期蛋白依賴激酶(CDK)。CDK2Cyclin
D1,
D2,
D3G1期CDK3和CDK4Cyclin
ECyclin
ACyclin
D1,
D2,
D3G1→S期S期G2期CDK1(CDC2)CyclinA,
BG2→M期CDK 相匹配的周期蛋白 作用點(diǎn)哺乳類動(dòng)物的周期蛋白和CDK哺乳類動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)還發(fā)現(xiàn)天然抑制CDK的蛋白質(zhì),例如錨蛋白(ankynin)是CDK4的特異性抑制物,P21蛋白能抑制多種CDK。錨蛋白和P21蛋白的抑制/活化可使細(xì)胞周期開放/關(guān)閉,因此被形容為細(xì)胞周期的檢查點(diǎn)蛋白。RF有多種如RFA、RFB、RFC等,是調(diào)節(jié)細(xì)胞DNA
的重要蛋白質(zhì)。在蛋白激酶的作用下被磷酸化,激活或抑制RF的活性。而蛋白激酶包括調(diào)節(jié)亞基(又稱細(xì)胞周期蛋白)和催化亞基(又稱細(xì)胞周期蛋白依賴激酶,CDK),且各有多種。從而對(duì)DNA
起始進(jìn)行精確及多樣化控制,使多位點(diǎn)
呈時(shí)序性而非同步性。PRA: 蛋白A2.RNA引物的DNA聚合酶α能識(shí)別起始位點(diǎn),并且以核糖核苷三磷酸為底物(NTP),以解開的一段DNA為模板,一個(gè)短鏈RNA(8~10個(gè)核苷酸)引物。然后從酶的活性轉(zhuǎn)變?yōu)镈NA聚合酶α的活性,RNA引物的3’-OH末端為新的DNA單鏈的起點(diǎn),以dNTP為原料,延長(zhǎng)引物大約15-30個(gè)脫氧核苷酸。3.DNA鏈的延伸的方向仍然為5’→3’。一旦片段達(dá)到一定長(zhǎng)度,DNA聚合酶α便從DNA上解離下來。RFC結(jié)合到這一延長(zhǎng)的引物上,并組裝到PCNA滑動(dòng)夾上,然后DNA聚合酶δ(polδ)結(jié)合到PCNA上并完成 片段的最終長(zhǎng)度130-200bp.當(dāng)它遇到原先已形成的 片段5`末端時(shí),polδ A復(fù)合物從DNA上下來兩條鏈均按5’到3’方向 ,一條鏈3’末端的方向朝著 叉前進(jìn)的方向,可連續(xù) ,稱前導(dǎo)鏈(leading
strand)。另一條鏈5’末端朝著 叉,是不連續(xù)的,形成
片段,此鏈稱后隨鏈(lagging
strand)。4.RNA引物的水解引物的去除通過兩個(gè)步驟,首先由RNaseH降解RNA引物,留下單個(gè)核糖核苷酸連接到片段上。然后,由側(cè)翼內(nèi)切核酸酶(flapendonucleae1,FEN1)除去最后一個(gè)核苷酸。FEN1也能除去由于DNA聚合酶δ產(chǎn)生的某些錯(cuò)誤的堿基。5.DN
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