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--第二位堿基第二位堿基第二位堿基第二位堿基--UCAGUCU(Ser/S)絲氨UGU(Cys/C)半胱氨第一位堿基UUUUUUCUUAUUG(Phe/F)苯丙氨酸(Phe/F)苯丙氨酸(Leu/L)亮氨酸(Leu/L)亮氨酸畋UCC酸UCA酸UCG(Ser/S)(Ser/S)(Ser/S)絲氨絲氨絲氨UAUUACUAAUAG(Tyr/Y)酪氨酸(Tyr/Y)酪氨酸(終止)(終止)酸UGC酸UGAUGG航(Cys/C)半胱氨(終止)(Trp/W)色氨酸CCU(Pro/P)脯氨第酸CAU(His/H)組氨酸CUU(Leu/L)亮氨酸CCC(Pro/P)脯氨CAC(His/H)組氨酸CGU(Arg/R)精氨酸位CCUCCUA(Leu/L)亮氨酸(Leu/L)亮氨酸酸CCA(Pro/P)脯氨CAA(Gln/Q)谷氨酰CGCCGA(Arg/R)精氨酸(Arg/R)精氨酸以外基CUG(Leu/L)亮氨酸酸CCG(Pro/P)脯氨CAG(Gln/Q)谷氨酰CGG(Arg/R)精氨酸酸ACU(Thr/T)蘇氨第一位堿基AAUUAUCAUAAUG始)(Ile/I)異亮氨酸(Ile/I)異亮氨酸(Ile/I)異亮氨酸(Met/M)甲硫氨酸(起酸ACC酸ACA酸ACG(Thr/T)蘇氨(Thr/T)蘇氨(Thr/T)蘇氨AAUAACAAAAAG(Asn/N)天冬酰(Asn/N)天冬酰(Lys/K)賴氨酸(Lys/K)賴氨酸AGUAGCAGAAGG(Ser/S)絲氨酸(Ser/S)絲氨酸(Arg/R)精氨酸(Arg/R)精氨酸酸GCU(Ala/A)丙氨第酸GAU(Asp/D)天冬氨GUU(Val/V)繳氨酸GCC(Ala/A)丙氨酸GGU(Gly/G)甘氨酸位堿GGUCGUA(Val/V)繳氨酸(Val/V)繳氨酸酸GCA(Ala/A)丙氨GAC(Asp/D)天冬氨酸GGCGGA(Gly/G)甘氨酸(Gly/G)甘氨酸基GUG(Val/V)繳氨酸酸GCG(Ala/A)丙氨GAA(Glu/E)谷氨酸GAG(Glu/E)谷氨酸GGG(Gly/G)甘氨酸酸
密碼子反表AlaAGCU,GCC,GCA,GCGLeuLUUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUGArgRCGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGGLysKAAA,AAGAsnNAAU,AACMetMAUGAspDGAU,GACPheFUUU,UUCCysCUGU,UGCProPCCU,CCC,CCA,CCGGlnQCAA,CAGSerSUCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGCGluEGAA,GAGThrTACU,ACC,ACA,ACGGlyGGGU,GGC,GGA,GGGTrpWUGGHisHCAU,CACTyrYUAU,UACIleIAUU,AUC,AUAValVGUU,GUC,GUA,GUG起始AUG終止UAG,UGA,UAA中文名稱英義名稱短寫縮寫繳氨酸ValineVVal酪氨酸TyrosineYTyr色氨酸TryptophanWTrp蘇氨酸ThreonineTThr絲氨酸SerineSSer硒半胱^氨酸*SelenocysteineUSec口比咯賴氨酸*PyrrolysineOPyl脯氨酸ProlinePPro中文名稱英義名稱短寫縮寫苯丙氨酸PhenylalanineFPhe蛋氨酸MethionineMMet賴氨酸LysineKLys亮氨酸LeucineLLeu異亮氨酸IsoleucineIIle組氨酸HistidineHHis甘氨酸GlycineGGly谷氨酰胺GlutamineQGln谷氨酸Glutamicacid/GlutamateEGlu半胱氨酸CysteineCCys天冬氨酸Asparticacid/AspartateDAsp天冬酰胺AsparagineNAsn精氨酸ArginineRArg兩氨酸AlanineAAla除此之外,還有一些三字母或單字母符號可用來表示未明確定義的縮寫:Asx、B可代表大冬氨酸(Asp、D)或大冬酰胺(Asn、N)。Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或異亮氨酸(Ile、I)。Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。結(jié)構(gòu)[編輯]以下是標準遺傳密碼所用來直接合成蛋白質(zhì)的20種氨基酸的結(jié)構(gòu)及表示符號L-丙氨酸(Ala/A)1NH0HL-精氨酸(Arg/R)L-天冬酰胺(Asn/N)
(Gln/Q)甘氨酸(Gly/G)L-組氨酸(His/H)L-異亮氨酸(Ile/I)L-亮氨酸(Leu/L)L-賴氨酸(Lys/K)L-蛋氨酸(Met/M)L-苯丙氨酸(Phe/F)L-脯氨酸(Pro/P)(Tyr/Y)L-繳氨酸(Val/V)L-硒半胱氨酸(Sec/U)L-口比咯賴氨酸(Pyl/O)主要化學性質(zhì)[底J以下的分子量是根據(jù)各元素的同位素在自然界的豐度所做的平均俏。此外由于形成肽鍵時,會減少一個水分子、因此蛋白質(zhì)中單一氨基酸的分子量,比下表數(shù)值少了18.01524Da。氨基酸分子量(Da)PLpK1(a-COOHpK2(a-+NH)丙氨酸89.094046.012.359.87半胱氨酸121.154045.051.9210.70硒半胱氨酸169.06
氨基酸分子量(Da)PlpK1(a-COOHpK(a-+NH)天冬氨酸133.103842.851.999.90谷氨酸147.130743.152.109.47苯丙氨酸165.191845.492.209.31甘氨酸75.067146.062.359.78組氨酸155.156347.601.809.33異亮氨酸131.174646.052.329.76賴氨酸146.189349.602.169.06口比咯賴氨酸255.31亮氨酸131.174646.012.339.74蛋氨酸149.207845.742.139.28天冬酰胺132.119045.412.148.72脯氨酸115.131946.301.9510.64谷氨酰胺146.145945.652.179.13精氨酸174.2027410.761.828.99
氨基酸分子量(Dai)PlpK1(a-COOHpK(a-+NH)絲氨酸105.093445.682.199.21蘇氨酸119.120345.602.099.10繳氨酸117.147846.002.399.74色氨酸204.228445.892.469.41酪氨酸181.191245.642.209.21支鏈性質(zhì)[編輯]以下列表中的pKa值,可能與這些氨基酸在蛋白質(zhì)內(nèi)部時有所不同氨基酸支鏈疏水性pKa極一性一電荷芳香族或吃肪族范德瓦爾斯半徑丙氨酸-CH3X----67半胱氨酸-CH2SHX8.18-酸性-86硒半胱氨酸-ChbSeHX5.73---天冬氨酸-CH2COOH-3.90X酸性-91谷氨酸-CH2CHCOOH-4.07X酸性-109
氨基酸支鏈疏水性pKa理性電一荷一芳香魅遜肪族范德瓦爾斯半徑苯丙氨酸-ChbC6H5X---芳香性135甘氨酸-H--■--48組氨酸-CH2-C3HN-6.04X弱堿性芳香性118異亮氨酸-CH(CH)CHCHX---脂肪性124賴氨酸-(CH2)4NH-10.54)<堿性-135口比咯賴氨峻-C12HNQ亮氨酸-CH2CH(CH)2X---脂肪性124蛋氨酸-CH2CHSCHX----124天冬酰胺-CH2CONH--X--96脯氨酸-CH2CHCH-X----90谷氨酰胺-CH2CHCONH--X--114精氨酸-(CH2)3NH-C(NH)NH12.48)<堿性-148
氨基酸支鏈疏水性pKa理性電一荷一芳香魅遜肪族范德瓦爾斯半徑絲氨酸-ChbOH--X--73蘇氨酸-CH(OH)CH--X弱酸性-93繳氨酸-CH(CH)2X---脂肪性105色氨酸-CH2-C8HNX---芳香性163酪氨酸-CH2-C6HOHX10.46)<-芳香性141基因表達與生物化學[辿]氨基酸短寫縮寫省碼十在蛋白質(zhì)中出現(xiàn)頻率(%)對人類的必需性丙氨酸AAlaGCU,GCC,GCA,GCG7.8-半胱氨酸CCysUGU,UGC1.9-硒半胱氨酸USecUGA-天冬氨酸DAspGAU,GAC5.3-谷氨酸EGluGAA,GAG6.3-
氨基酸短寫縮寫省碼十在蛋白質(zhì)中出現(xiàn)頻率(%)對人類的必需性苯丙氨酸FPheUUU,UUC3.9X甘氨酸GGlyGGU,GGC,GGA,GGG7.2一組氨酸HHisCAU,CAC2.3一異亮氨酸IIleAUU,AUC,AUA5.3X賴氨酸KLysAAA,AAG5.9X口比咯賴氨酸OPylUAG亮氨酸LLeuUUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUG9.1X蛋氨酸MMetAUG2.3X天冬酰胺_NAsnAAU,AAC4.3一脯氨酸PProCCU,CCC,CCA,CCG5.2一谷氨酰胺QGlnCAA,CAG4.2一精氨酸RArgCG
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