豬12號(hào)染色體幾個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記與部分生產(chǎn)性狀的關(guān)系研究

1、研究簡(jiǎn)報(bào)豬12號(hào)染色體幾個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記與部分生產(chǎn)性狀的關(guān)系研究3趙書(shū)紅1楊曉鵬1劉榜1李奎1彭中鎮(zhèn)1張建生2孫仕銓2顧建平2(1華中農(nóng)業(yè)大學(xué)牧醫(yī)學(xué)院動(dòng)物分子生物學(xué)與育種實(shí)驗(yàn)室,武漢430070;2國(guó)營(yíng)常熟畜禽良種場(chǎng),常熟421550A Study on R elation Betw een Some Production Traits and a Fe w Microsatellites on Porcine Chromosome 12Zhao Shuhong 1Y ang X iaopeng 1Liu Bang 1Li K ui 1Peng Zhongzhen 1Zhang Jiansheng

2、 2Sun Shiquan 2G u Jianping 2(1Huazhong Agricultural Univer sity ,Wuhan 430070,China ;2Changshu Animal Breeding Farm ,Changshu 421550,China 關(guān)鍵詞豬;12號(hào)染色體;微衛(wèi)星;生產(chǎn)性狀K ey w ords pig ,chrom os ome 12,microsatellite ,production traits中圖法分類號(hào)S 828.2眾多的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其豐富的多態(tài)性是微衛(wèi)星在各領(lǐng)域廣泛應(yīng)用的基礎(chǔ)。在定位QT L 方面,現(xiàn)在通過(guò)建立豬資源家系,人們已把一些

3、與繁殖、生長(zhǎng)、胴體和肉質(zhì)等方面有關(guān)的數(shù)量性狀位點(diǎn)定位在某些微衛(wèi)星附近。例如,3號(hào)染色體上微衛(wèi)星SW2427-SW251區(qū)域與豬的日增重、4號(hào)染色體上S0101-S0107區(qū)域與背膘、腹脂、7號(hào)染色體上S0064-S0066區(qū)域與胴體組成和初生重有著很大的關(guān)聯(lián)1。12號(hào)染色體為最短的中部著絲粒染色體,因與豬生產(chǎn)性狀緊密相關(guān)的生長(zhǎng)激素(GH 基因位于其上而倍受重視2,3。雖然目前對(duì)GH 基因研究得比較詳細(xì),但對(duì)此染色體上其它位置的微衛(wèi)星位點(diǎn)與生產(chǎn)性狀相關(guān)的研究報(bào)道卻很少。本研究就是利用一參考家系的回交后代個(gè)體對(duì)豬12號(hào)染色體上的4個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性和某些性狀資料,分析該4個(gè)位點(diǎn)與性狀的關(guān)聯(lián),為進(jìn)

4、一步尋找影響這些性狀的QT L 提供新資料。1材料與方法1頭大白公豬配3頭二花臉母豬,從F 1中選出11頭母豬與其父親進(jìn)行回交,頭2胎共得到154頭回交后代(14窩。記錄每頭豬的乳頭數(shù),測(cè)定初生重、20日齡重、45日齡重、初生至45日齡日增重等性狀。位點(diǎn):SW1350、SW1553、SW874、SW957。引物序列參照Alexander 等4,R ohrer 等5。引物合成由上海生物工程公司完成。采取每頭豬個(gè)體血樣,提取DNA 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,應(yīng)用非變性聚丙烯凝膠電泳及收稿日期:19991019;修回日期:200006053國(guó)家自然科學(xué)基金(批準(zhǔn)號(hào):39770539、湖北省自然科學(xué)基金(97

5、J 0598、留學(xué)回國(guó)人員啟動(dòng)基金、高校博士點(diǎn)基金和國(guó)家杰出青年科學(xué)基金(39925027資助項(xiàng)目趙書(shū)紅,女,1967年生,博士,副教授.工作單位:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)畜牧獸醫(yī)學(xué)院,武漢430070第19卷第4期2000年8月華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)Journal of Huazhong Agricultural University V ol.19N o.4Aug.2000,360362銀染檢測(cè)每頭豬12號(hào)染色體上4個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的基因型,具體參照趙書(shū)紅等2資料。用S AS軟件進(jìn)行每類樣本含量不等的單向分組方差分析6,判斷各類標(biāo)記基因型之間數(shù)量性狀的差異。2結(jié)果不同位點(diǎn)上擴(kuò)增成功的樣本含量及不同基因型豬2,7

6、各性狀的差異顯著性檢驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表1。方差分析表明:性狀乳頭數(shù)在位點(diǎn)SW957的不同基因型間差異顯著;初生重、20日齡重、45日齡重及初生至45日齡平均日增重在位點(diǎn)SW1350的不同基因型間差異顯著;初生重、45日齡重及初生至45日齡平均日增重在位點(diǎn)SW874的不同基因型間差異顯著;各性狀在SW1553各基因型間差異均不顯著。表1不同基因型豬的生產(chǎn)性能差異顯著性檢驗(yàn)結(jié)果T able1Productivity testing of different genotypes pigs位點(diǎn)Locus 基因型G enotype樣品數(shù)Sam pleN o.乳頭數(shù)Nipple N o.初生重/kgBirth w

7、eight20日齡重/kg20day weight45日齡重/kg45day weight初生至45日齡平均日增重/gAverage daily gainfrom birth to45daySW957AA4715.90.19a 1.140.03 4.540.1013.050.38264.998.11 AB5415.20.13b 1.170.03 4.450.0912.540.34250.247.23AC214.50.50c 1.350.05 4.450.0512.250.75233.334.45 SW1350BB5215.70.1712.00.03ab 4.490.08a13.320.28a2

8、70.155.94a AB3215.20.19 1.210.03ab 4.560.11a13.340.30a269.586.49aAA1115.70.380.740.10b 3.730.31b8.441.32c171.1127.39aBC715.10.26 1.180.09ab 4.570.18a12.440.72a248.0015.99bAC414.80.48 1.250.10a 4.850.27a10.500.90b205.5519.80bCC114.00.00 1.200.00ab 6.500.00c9.400.00bc182.220.00c SW1553AB5515.50.16 1.1

9、10.04 4.310.0912.240.39247.627.97 BB1215.30.33 1.190.08 4.220.1812.250.87241.6618.11AA3015.50.20 1.170.03 4.480.1112.670.33255.047.50 SW874BC5515.50.14 1.190.03a 4.530.1013.150.31a264.546.51a BB3415.30.20 1.170.03a 4.320.1013.050.33a265.697.18aAB2215.60.25 1.020.07b 4.260.209.940.74b203.5415.27b3討論目

10、前在豬中已定位了大量的微衛(wèi)星標(biāo)記,應(yīng)用這些標(biāo)記通過(guò)基因組掃描尋找與數(shù)量性狀連鎖的標(biāo)記也在進(jìn)行3,但豬中已定位的QT L數(shù)尚較少,還需進(jìn)行大量的標(biāo)記基因型與數(shù)量性狀連鎖分析鑒別以定位更多的QT L。檢測(cè)不同基因型的性狀值是否存在顯著差異是QT L定位的第一步。本研究即基于此。所用微衛(wèi)星標(biāo)記位于豬12號(hào)染色體上,該染色體由于一些具有重要生理功能的基因位于其上,對(duì)其遺傳圖及已定位的標(biāo)記與性狀的關(guān)聯(lián)研究也受到了重視。本研究通過(guò)方差分析達(dá)到極顯著水平的標(biāo)記/性狀組合有:SW1350/初生重、SW1350/20日齡重、SW1350/45日齡重、SW1350/初生至45日齡平均日齡重、SW874/45日齡重

11、、SW874/初生至45日齡平均日齡重;達(dá)顯著水平的組合有SW874/初生重、SW957/乳頭數(shù),這些達(dá)顯著水平的關(guān)聯(lián)可能是由于標(biāo)記QT L連鎖的結(jié)果。163第4期趙書(shū)紅等:豬12號(hào)染色體幾個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記與部分生產(chǎn)性狀的關(guān)系研究參考文獻(xiàn)1彭中鎮(zhèn),趙書(shū)紅,李奎等.豬數(shù)量性狀基因及其標(biāo)記研究進(jìn)展.國(guó)外畜牧科技,1999,26(1:28322趙書(shū)紅,張建生,孫仕銓等.應(yīng)用參考家系信息構(gòu)建豬12號(hào)染色體部分微衛(wèi)星位點(diǎn)遺傳圖的研究.華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),1998,17(5:4694733Niels on V H,Larsen N J.S tudy of the ass ociation of production traits with haplotypes of the growth horm one gene in pigs.Anim G enet,1992,(Suppl.1:1054Alexander L J,R ohrer G A,Beattie C W.Cloning and characterization of414polym orphic porcine microsatellites.Anim G enet.1996,27:137 1485R ohrer G A,Alexander J W,K eele T P,et al.A mic