
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文檔簡介
“窮則變,變則通,通則久。”《易經(jīng)》
“我命在我,不在于天”(莊子)第一頁,共六十頁。
細菌:一直被用做研究生物遺傳與變異規(guī)律的實驗材料。
●細菌個體微小
●遺傳物質(zhì)較為簡單
●易于人工培養(yǎng)
●繁殖速度快
●突變型容易識別和檢出第二頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)
二、細菌的基因突變
三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組
四、基因工程菌株的構(gòu)建
五、微生物基因組學(xué)細菌的遺傳與變異第三頁,共六十頁。1、染色體(chromosome)細菌染色體是一個裸露的閉合環(huán)狀的雙鏈DNA分子,有核蛋白,缺乏組蛋白,無核膜包裹。
一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)第四頁,共六十頁。細菌基因組結(jié)構(gòu)的主要特征(1)遺傳信息是連續(xù)的,不含內(nèi)含子。很少有重復(fù)序列。(2)通常,編碼相關(guān)功能的基因高度集中,組成操縱子(operon)結(jié)構(gòu),自一個啟動子開始轉(zhuǎn)錄成多基因的mRNA分子,翻譯成多種功能相關(guān)的蛋白質(zhì)。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)第五頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)乳糖操縱子第六頁,共六十頁。2、質(zhì)粒(plasmid)一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)
是細菌染色體外的遺傳物質(zhì),大多由閉合環(huán)狀雙鏈DNA組成。第七頁,共六十頁。●具有自我復(fù)制的能力。質(zhì)粒DNA的特征一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)●
所攜帶的基因賦予宿主菌某些生物學(xué)
性狀(如F質(zhì)粒、R質(zhì)粒、毒力質(zhì)粒、
代謝質(zhì)粒),增加細菌的存活機會。●非生存所必需,可自行丟失或消除?!窨稍诩毦g轉(zhuǎn)移。第八頁,共六十頁。3、轉(zhuǎn)座子(transposon)B.McClintock一生未婚,卻對玉米情有獨鐘,發(fā)現(xiàn)“會跳舞”(在染色體上移動)的基因,于1938年提出“轉(zhuǎn)座因子”理論。因與傳統(tǒng)的遺傳學(xué)觀念背道而馳,成了孤家寡人。DNA雙螺旋和乳糖操縱子獲諾貝爾獎后,仍將B.McClintock理
論視為另類。這一超越時代的理論直
到1983年才被承認,81歲高齡的她榮
獲諾貝爾獎,真正成為基因調(diào)控理論
的先驅(qū)。(Mendel、Morgan)
第九頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)
轉(zhuǎn)座子:是可移動的DNA片段,可在質(zhì)粒與質(zhì)粒之間或質(zhì)粒與染色體之間隨機轉(zhuǎn)移,故稱為“跳躍基因”(jumpinggene)。轉(zhuǎn)座子不能自我復(fù)制。第十頁,共六十頁。轉(zhuǎn)座子的結(jié)構(gòu)特點
●2個末端反向重復(fù)序列:能為整合酶所識別,與插入功能有關(guān)。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)第十一頁,共六十頁。
●中心序列:具有轉(zhuǎn)座酶基因,且常攜帶細菌毒素基因、耐藥基因等。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)腸球菌萬古霉素耐藥基因第十二頁,共六十頁。當轉(zhuǎn)座子插入到某一基因中,可能會產(chǎn)生什么遺傳學(xué)效應(yīng)?一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)第十三頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)
二、細菌的基因突變
三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組
四、基因工程菌株的構(gòu)建
五、微生物基因組學(xué)細菌的遺傳與變異第十四頁,共六十頁?;蛲蛔儯╣enemutation):染色體基因發(fā)生突然而穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)改變,包括一對或少數(shù)幾對堿基的缺失、插入或置換(點突變:pointmutation),導(dǎo)致遺傳性狀的改變。1、概念二、細菌的基因突變第十五頁,共六十頁。
結(jié)核分枝桿菌對一線抗癆藥物如異煙肼、鏈霉素、利福平產(chǎn)生多重耐藥性,與多個耐藥基因突變的逐步累加密切相關(guān)。二、細菌的基因突變第十六頁,共六十頁。
●
隨機發(fā)生,不定向
●
穩(wěn)定(“代代相傳”)
●
自發(fā)突變頻率為10-10~10-6
●
可誘發(fā)性:野生株、突變株
●
僅對1種或2種相類似的藥物耐藥2、特點二、細菌的基因突變第十七頁,共六十頁?!?/p>
耐藥性突變:耐藥菌產(chǎn)生
●
毒力突變:疫苗研制、新現(xiàn)傳染病
●
營養(yǎng)缺陷體突變:新藥誘變作用檢測
●高產(chǎn)突變:抗生素等藥品
●抗原性突變:逃逸免疫機制3、突變現(xiàn)象及其應(yīng)用二、細菌的基因突變第十八頁,共六十頁。日本曾發(fā)生過一次細菌性痢疾暴發(fā)流行。從病人糞便中分離到大量的痢疾桿菌敏感株和耐藥株(同時耐鏈霉素、氯霉素、四環(huán)素、磺胺類),且大腸桿菌與痢疾桿菌有完全相同的多重耐藥性。多重耐藥性傳播迅速。耐藥菌在傳代、保藏過程中可自發(fā)失去耐藥性。
能否用基因突變解釋以上現(xiàn)象?二、細菌的基因突變第十九頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)
二、細菌的基因突變
三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組
四、基因工程菌株的構(gòu)建
五、微生物基因組學(xué)細菌的遺傳與變異第二十頁,共六十頁。
供體菌(donor)將遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移至受體菌(recipient),使后者獲得新的生物學(xué)性狀,稱為基因轉(zhuǎn)移(genetransfer)。1、基因轉(zhuǎn)移的概念三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第二十一頁,共六十頁。2、基因轉(zhuǎn)移的元件●
質(zhì)粒●
轉(zhuǎn)座子●
溫和噬菌體(temperatephage)三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第二十二頁,共六十頁。
●
接合(conjugation)
●
轉(zhuǎn)化(transformation)
●
轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)
●
轉(zhuǎn)座(transposition)3、基因轉(zhuǎn)移的方式三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第二十三頁,共六十頁。
接合:供體菌通過性菌毛與受體菌直接接觸,將遺傳物質(zhì)(主要是質(zhì)粒DNA)轉(zhuǎn)移給受體菌,使受體菌獲得新的遺傳性狀。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第二十四頁,共六十頁。質(zhì)粒質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移示意圖染色體性菌毛受體菌
(敏感菌)供體菌
(耐藥菌)三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組受體菌
(耐藥菌)第二十五頁,共六十頁。耐藥基因:賦予宿主菌一種或多重耐藥性耐藥傳遞基因:編碼性菌毛,決定自主復(fù)制與接合轉(zhuǎn)移耐藥性
(R)質(zhì)粒三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第二十六頁,共六十頁。R質(zhì)粒主要以接合方式從耐藥菌傳遞給敏感菌,使后者變?yōu)槟退幘靡陨?。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組R質(zhì)粒在同一種屬或不同種屬細菌之間傳遞,造成耐藥性的廣泛傳播,給臨床治療帶來很大困難。第二十七頁,共六十頁。日本曾發(fā)生過一次細菌性痢疾暴發(fā)流行。從病人糞便中分離到大量的痢疾桿菌敏感株和耐藥株(耐鏈霉素、氯霉素、四環(huán)素、磺胺類),且大腸桿菌與痢疾桿菌有完全相同的多重耐藥性。多重耐藥性傳播迅速。耐藥菌在傳代、保藏過程中可自發(fā)失去耐藥性。用多重耐藥質(zhì)粒轉(zhuǎn)移可合理解釋。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第二十八頁,共六十頁。Griffith肺炎鏈球菌感染小鼠實驗(1928)無莢膜活菌有莢膜活菌有莢膜死菌三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第二十九頁,共六十頁。有莢膜的活菌?
如何證實?三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第三十頁,共六十頁。Griffith認為,活的無莢膜肺炎鏈球菌(R菌)從死的有莢膜肺炎鏈球菌(S)中獲得某種物質(zhì),而能產(chǎn)生莢膜,這一現(xiàn)象稱之為轉(zhuǎn)化。引起轉(zhuǎn)化現(xiàn)象的物質(zhì)稱為轉(zhuǎn)化因子。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組1、轉(zhuǎn)化因子是DNA還是蛋白質(zhì)?
2、如何證實你的推測?第三十一頁,共六十頁。1944年,
Avery研究揭示,轉(zhuǎn)化因子的本質(zhì)是DNA,即遺傳物質(zhì)是DNA。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組悲催原因:DNA在結(jié)構(gòu)上似乎不像蛋白質(zhì)那樣變化多端,具有個性,很難設(shè)想可作為遺傳信息的載體;Avery過于謹慎,在論文中只愿意說“DNA或許是轉(zhuǎn)化因子的基本單位”。
鑒于對Avery理論抱有懷疑,諾貝爾獎評委會認為推遲發(fā)獎更合適。1952年,當對Avery成就的爭議平息、準備授獎時,Avery已撒手人寰。第三十二頁,共六十頁。
●
接合(conjugation)
●
轉(zhuǎn)化(transformation)
●
轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)
●
轉(zhuǎn)座(transposition)基因轉(zhuǎn)移的方式三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第三十三頁,共六十頁。
轉(zhuǎn)化:受體菌從周圍環(huán)境中直接攝取供體菌游離的DNA片段,并整合入受體菌基因組中,從而獲得供體菌部分遺傳性狀的過程。
三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組莢膜基因第三十四頁,共六十頁。轉(zhuǎn)化條件:●
供體菌DNA片段的大?。?0~20kb
●
供體DNA性質(zhì):同源性高的、未變性的雙鏈DNA;質(zhì)粒DNA。
●
受體菌:處于“感受態(tài)”
(competence)狀態(tài),可采
用CaCl2誘導(dǎo)法、電穿孔法。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第三十五頁,共六十頁。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組
萊德伯格(J.Lederberg)立志成為一名內(nèi)科醫(yī)生,進入哥倫比亞醫(yī)學(xué)院學(xué)習(xí)了2年。1946年暑假,萊德伯格進入耶魯大學(xué)微生物學(xué)家塔特姆(EL.Tatum)實驗室學(xué)習(xí),對細菌遺傳學(xué)十分入迷。假期結(jié)束后,他不再回醫(yī)學(xué)院,
而留下給塔特姆作實驗室助理?!笆フ唠S時而行,賢者應(yīng)事而變,
智者無為而治,達者順天而生”(老子)
第三十六頁,共六十頁。原養(yǎng)型菌落產(chǎn)生原因?如何證實?①基因突變?②接合?
③轉(zhuǎn)化?接種至基礎(chǔ)培養(yǎng)基Met+His+Phe+Trp+,產(chǎn)生頻率為1×10-5Met-His-Phe+Trp+Met+His+Phe-Trp-營養(yǎng)缺陷型細菌第三十七頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)不需細菌之間接觸,排除接合;一種比細菌更小的生物將菌株(左)遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移給菌株(右)。Met-His-Phe+Trp+Met+His+Phe-Trp-Met+His+Phe+Trp+↓加入DNA酶(+)不受DNA酶干擾,排除轉(zhuǎn)化。加熱殺死細菌(-)第三十八頁,共六十頁。
●
接合(conjugation)
●
轉(zhuǎn)化(transformation)
●
轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)
●
轉(zhuǎn)座(transposition)基因轉(zhuǎn)移的方式三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第三十九頁,共六十頁。
以噬菌體為媒介,將供體菌DNA片段轉(zhuǎn)移到受體菌內(nèi),經(jīng)基因重組,使受體菌獲得新的遺傳學(xué)性狀。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組(1)轉(zhuǎn)導(dǎo)的概念
第四十頁,共六十頁?!袷歉腥炯毦?、放線菌等的病毒。
●分為頭部和尾部。頭部由核心(核酸)
和衣殼(蛋白質(zhì))構(gòu)成。
●必須寄生在活的易感宿主菌體內(nèi),依靠尾部牢
牢吸附宿主菌。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組(2)噬菌體(phage)第四十一頁,共六十頁。(3)噬菌體感染細菌的結(jié)局
●
烈(毒)性噬菌體(virulentphage):噬菌體在宿主菌內(nèi)復(fù)制增殖,產(chǎn)生大量子代噬菌體,最終裂解細
菌,建立溶菌周期。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第四十二頁,共六十頁。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組前噬菌體溶原性細菌
●溫和噬菌體(temperatephage):感染宿主菌后,其核酸整合到宿主菌基因組中,與宿主菌DNA一起復(fù)制,隨細菌的分裂而傳至子代細菌(“和平相處”)。第四十三頁,共六十頁。三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組(4)轉(zhuǎn)導(dǎo)的機制
第四十四頁,共六十頁。在子代噬菌體組裝時,可能會發(fā)生錯誤(1次/105~107),誤將大小合適的供體菌DNA片段裝入噬菌體頭部,
成為“假噬菌體”。
假噬菌體第四十五頁,共六十頁。當“假噬菌體”再度感染受體菌時,可將供體菌DNA帶入受體菌,發(fā)生基因重組。完全轉(zhuǎn)導(dǎo)與流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組假噬菌體供體菌DNA受體菌第四十六頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)Met-His-Phe+Trp+Met+His+Phe-Trp-Met+His+Phe+Trp+↓溫和噬菌體將Phe、Trp合成酶基因在細菌之間發(fā)生轉(zhuǎn)移。第四十七頁,共六十頁。●用于某些細菌(如鼠疫桿菌、霍亂弧
菌)的鑒定和分型
●耐藥菌感染的治療
●分子生物學(xué)研究工具
●遺傳工程:噬菌體展示
技術(shù)三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組(5)噬菌體的應(yīng)用第四十八頁,共六十頁。
●
接合(conjugation)
●
轉(zhuǎn)化(transformation)
●
轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)
●
轉(zhuǎn)座(transposition)基因轉(zhuǎn)移的方式三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第四十九頁,共六十頁。4、轉(zhuǎn)座(transposition)三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組
轉(zhuǎn)座子在質(zhì)粒之間或質(zhì)粒與染色體之間的自行轉(zhuǎn)移現(xiàn)象。第五十頁,共六十頁。轉(zhuǎn)座子能在2個沒有任何同源性的基因組之間轉(zhuǎn)座(即插入到某一基因),引起一系列遺傳效應(yīng)。
●
引起插入基因失活,產(chǎn)生基因突變●在插入部位引入一個或多個新的基因
(如耐藥基因)
三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第五十一頁,共六十頁。一、細菌遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)
二、細菌的基因突變
三、細菌的基因轉(zhuǎn)移與重組
四、基因工程菌株的構(gòu)建
五、微生物基因組學(xué)細菌的遺傳
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