實戰(zhàn)：Google 再次“登月”Baseline工程把基因大數(shù)據(jù)化

實戰(zhàn)：Google再次“登月”Baseline工程把基因大數(shù)據(jù)化

縱觀幾年，谷歌蘋果三星微軟幾家巨頭在健康領域投入越來越大，勢頭愈加生猛。據(jù)華爾街日報報道，緊接無人駕駛汽車，隱形眼鏡式血糖儀，高原氣球網(wǎng)絡服務，Google儼然開始了一項自公司成立以來最具野心，最為困難的科學項目，一個“登月”工程。GoogleX實驗室開始了Baseline“基線”項目，大量收集人類基因組標本并利用大數(shù)據(jù)合成一份完美的健康人類基因圖譜，為多種疾病的提早發(fā)現(xiàn)及治療提供前提。基線工程的第一步是采集175個參與者的匿名基因和分子信息，取樣包括基因排序，血液，唾液，眼淚，尿液，以及參與者的食物及藥物代謝信息，心率，家族病史等，第一波測量過后，參與者將佩戴可穿戴測量設備，持續(xù)提供體征信息。Google將通過第三方的隱私過濾得到匿名的基因組信息。下一步將把實驗群體擴大到數(shù)千人，獲得更多更廣的基因數(shù)據(jù)。項目領導者分子生物學家安德魯·康拉德(AndrewConrad)2013年3月加盟Google，現(xiàn)在已經(jīng)建立起了一支70-100人的隊伍，包括生理，生物化學，成像和細胞生物學的專家。康拉德認為基線工程處在剛剛起步階段，基因圖譜的制作和分析是一項極其艱難的工作，我們對于DNA，蛋白，酶類間的相互關系和外界的影響知之甚少，但隨著掌握的數(shù)據(jù)量增多，依賴Google強大的大數(shù)據(jù)計算能力，研究者們可以從海量的基因組數(shù)據(jù)中獲得生物標記(biomarker)的規(guī)律，而這些生物標記將對預防，治療，制藥領域產(chǎn)生強大的引領和促進作用。舉例來說，每個人對于食物脂肪的代謝功能都是不一樣的，部分人的基因組中缺乏幫助人體代謝多余食物脂肪的生物標記，從而導致早年的心血管疾病，通過數(shù)據(jù)收集，研究者們可以準確的定位生物標記在基因中的位置，確定新病人是否缺乏這段標記，及時做出準確的治療和飲食推薦。大量減少心血管疾病的發(fā)生。既然基因組的作用如此強大，在Google之前為什么沒有人開始同樣的收集工作呢？原因很簡單，沒錢沒時間。人類的基因組及其龐大，一個基因組由十萬以上的基因分段組成，每個基因段又由成百上千個核苷酸配對組成，放在幾十年前，受集一份整套的基因組的工作量是不可想象的。2001年，第一份基因組才被排序成功，而在十年前，單單一份基因排序需要一億美金，隨著排序技術的發(fā)展，如今只需要1000美金就可以完成。但一般的公司和個人還是支付不起系統(tǒng)性收集基因組的。記著之前在學校學起DNA排序時，十分激動的問生物老師我們要是收集幾萬人的DNA后通過大數(shù)據(jù)豈不是可以把人體的秘密通通展現(xiàn)出來，老師淡然一笑：好想法，你有錢嗎？我沒有，但是Google財大氣出，魄力十足。有人可能會好奇當今基因排序技術的準確度，老實說，不是很高，Emory大學的神經(jīng)學系主任AllanLevey在講座中勸告聽眾不要盲目花錢做基因排序，提到一位老友的故事：50歲后這位仁兄去做了一個基因排序以防基因病來得錯手不急，結果發(fā)現(xiàn)他的APP基因突變了，這個基因突變理論上必然導致老年癡呆癥(Alzheimer’sDisease)，結果老兄喪氣地找到Levey教授尋求解釋，經(jīng)過一番測試后發(fā)現(xiàn)他已經(jīng)過了開始發(fā)病年齡卻一點癥狀沒有，后來發(fā)現(xiàn)是基因排序出了差錯。這類事件時有發(fā)生，但是終歸是針對個人案例的。大數(shù)據(jù)的絕對優(yōu)點就是海量數(shù)據(jù)彌補個別差錯?；蛟S基線工程的第一波實驗結果會出現(xiàn)不準確的風險，但是幾年后，當實驗群擴張到千人甚至萬人的時候，通過計算足以剔除DNA中的大量無用分段和錯誤信息，將研究者的目光直接導向致病的基因段。人類的健康基因圖譜將得到越來越多的完善，接近完美。那么關于老生常談的隱私問題呢？Google已經(jīng)建立起當今世界上最為強大的電腦和信息網(wǎng)絡來支撐搜索引擎和YouTube這樣強勁的數(shù)據(jù)捕獲手段，今年年底又要利用安卓涉足穿戴式設備領域，數(shù)據(jù)的掌控量之恐怖，自然會讓我們不放心Google獲得大量的基因組數(shù)據(jù)。康拉德在采訪中提到Google將與斯坦福和杜克大學的醫(yī)學院合作，兩個大學將把基線工程參與者的身份信息抹掉，把匿名數(shù)據(jù)交給Google，聽起來讓人稍稍安心一些，但仔細想想，那些被抹掉的也只是參與者的信息，Google獲得的卻是人類身體中最為珍貴的秘密，如果Google不將這些計算后的結果公開，而單獨和幾家制藥公司分享，我們作為普通老百姓可能一點辦法沒有，任由巨頭們把我們的弱點和需求看個透。Google創(chuàng)始人之一拉里佩奇(LarryPage)多次提到大數(shù)據(jù)在健康和醫(yī)藥領域的巨大潛能，常常不忿隱私法律對于人體數(shù)據(jù)獲取的制約，現(xiàn)在來看，Google可能在建立一個獨立的龐大數(shù)據(jù)池，僅供自己所用，直接繞過隱私法獲得數(shù)據(jù)，為其數(shù)據(jù)計算能力找到了新的用武之地。我們只能寄希望