生存分析-預(yù)防本科-2011.11.20

生存分析

張俊輝

2011.11.22

生存分析中的幾個基本概念“死亡”事件——失敗事件(failureevent)生存時間(survivaltime)：完全數(shù)據(jù)、截尾數(shù)據(jù)、截尾死亡概率(mortalityprobability)

生存概率(survivalprobability)生存率(survivalrate)中位生存時間(mediansurvivaltime)

(一)死亡事件(deathevent)

又稱失效事件(failureevent)或終點(diǎn)事件。死亡事件是一個廣義的概念，不單是指通常意義下的生物體死亡，而是泛指標(biāo)志某種處理措施失敗或失效的特征事件。(二)生存時間(survivaltime)：指觀察到的存活時間。生存時間是一個廣義概念，不單是指通常意義下生物體的存活時間，而是泛指研究者所關(guān)心的某現(xiàn)象的持續(xù)時間。生存時間的兩種類型完全數(shù)據(jù)(completedata)：指從觀察起點(diǎn)到發(fā)生死亡事件所經(jīng)歷的時間。截尾數(shù)據(jù)(censoreddata)：簡稱截尾值(censoredvalue)，又稱刪失值或終檢值。生存時間觀察過程的截止不是由于死亡事件，而是由于其他原因引起的，稱為截尾(censored)。截尾的原因包括失訪、退出和終止。截尾數(shù)據(jù)指從觀察起點(diǎn)到截尾所經(jīng)歷的時間。死亡概率：指在某單位時段開始時存活的個體在該時段內(nèi)死亡的可能性大小。生存概率

：指某單位時段開始時存活的個體到該時段結(jié)束時仍存活的可能性大小。生存率：指觀察對象活過tk時刻的概率。生存率也是一個廣義概念，研究者定義的死亡事件不同，其含義也不同，可以是緩解率或有效率。中位生存時間又稱半數(shù)生存期，是指生存率為0.5時對應(yīng)的生存時間，表示有50%的觀察對象可活這么長時間。主要內(nèi)容1.未分組資料數(shù)據(jù)的生存分析

(Kaplan-Meier過程)2.分組資料數(shù)據(jù)的生存分析

(LifeTables過程)3.生存曲線的比較

(log-rankTest)未分組資料的生存分析特點(diǎn)：每個觀察個體都有一個生存時間例15.1某醫(yī)師采用手術(shù)療法治療12例宮頸癌患者，隨訪時間(月)記錄如下：1，2，4，5，7，8+，11，15，18，33+，36，38+。試估計(jì)各時點(diǎn)生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤、各時點(diǎn)總體生存率的95%置信區(qū)間、中位生存時間，并繪制生存曲線。

未分組資料的生存分析乘積極限法——由Kaplan-Meier于1958年首先提出，又稱Kaplan-Meier法(簡記為KM法)

SPSS操作步驟：設(shè)置兩個變量：生存時間(time)

結(jié)局(status)：死亡=1，截尾=0SPSS操作步驟：AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框選入時間變量timeStatus框選入結(jié)局變量statusDefineEvent(定義死亡事件的取值)按鈕Singlevalue框輸入1

ContinueOptions按鈕勾選Survivaltables(生存分析表)默認(rèn)

Meanandmediansurvival(均數(shù)和中位數(shù))默認(rèn)

Survival(生存曲線圖)

ContinueOK結(jié)果解釋生存曲線表平均生存時間(mean)和中位生存時間(median)生存曲線分組資料的生存分析例15.2某醫(yī)師對110例原發(fā)性肺癌患者確診后進(jìn)行隨訪，得資料見表15.3第(2)欄~第(4)欄，試估計(jì)各時點(diǎn)生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤、各時點(diǎn)總體生存率的95%置信區(qū)間、中位生存時間，并繪制生存曲線。壽命表法SPSS操作步驟設(shè)置3個變量：時間time(采用組段的下限)

結(jié)局status(死亡=1，截尾=0)

頻數(shù)fSPSS操作步驟指定頻數(shù)變量fDataWeightCases

選中WeightcasesbyFrequencyvariable框：選入fSPSS操作步驟AnalyzeSurvivalLifeTablesTime框：選入時間變量timeDisplayTimeIntervals框：輸入10by1Status框：選入結(jié)局變量statusDefineEvent按鈕：SingleValue框輸入1ContinueOptions按鈕勾選Lifetables、SurvivalContinueOK

結(jié)果解釋此為SPSS作的分組資料的生存率曲線，為階梯型曲線。

注意：分組資料繪制的生存曲線應(yīng)該是折線連接，因?yàn)楣烙?jì)的是時段右點(diǎn)的生存率。因此需要對該曲線進(jìn)行編輯。通過點(diǎn)擊右鍵進(jìn)行編輯：

Charteditor→elements(format)→InterpolationLine

并刪掉短線，可得到折線形生存率曲線如下圖：對數(shù)秩檢驗(yàn)例15.3某臨床醫(yī)生將22例肺癌患者隨機(jī)分成兩組，分別采用化療和放化療聯(lián)合治療，從緩解出院日開始隨訪，隨訪時間(月)如下，試比較化療和放化療聯(lián)合治療的療效是否有差別。化療組1，2，3，5，6，9+，11，13，16，26，37+放化療聯(lián)合組10，11+，14，18，22，22，26，32，38，40+，42+SPSS操作步驟設(shè)置3個變量：時間time

結(jié)局status(死亡=1，截尾=0)

組別groupSPSS操作步驟：AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框選入時間變量timeStatus框選入結(jié)局變量statusDefineEvent按鈕Singlevalue框輸入1