數(shù)量性狀基因座演示文稿

數(shù)量性狀基因座演示文稿當前1頁，總共20頁。（優(yōu)選）第五節(jié)數(shù)量性狀基因座當前2頁，總共20頁。前言經(jīng)典數(shù)量遺傳分析法

分析控制數(shù)量性狀表現(xiàn)的眾多基因的綜合遺傳效應，但是無法鑒別基因的數(shù)目、單個基因在染色體上的位置和遺傳效應。作物分子標記+數(shù)量性狀基因座（QTL）定位分析法

確定影響某一數(shù)量性狀的基因在染色體上的數(shù)目、位置及其遺傳效應。當前3頁，總共20頁。第五節(jié)數(shù)量性狀基因座一、QTL定位的原理和步驟二、QTL定位的統(tǒng)計方法三、QTL分析的應用前景當前4頁，總共20頁。一、QTL定位的原理和步驟QTL（quantitativetraitloci）：全稱數(shù)量性狀基因座，它指的是控制數(shù)量性狀的基因在基因組中的位置。QTL定位：也稱QTL作圖；借助分子標記，可以在染色體上檢測出QTL，并可以確定影響某一數(shù)量性狀的QTL在染色體上的數(shù)目、位置和遺傳效應。當前5頁，總共20頁。QTL定位的原理如果分子標記覆蓋整個基因組，控制數(shù)量性狀的基因(Qi)兩側會有相連鎖的分子標記(Mi-

和Mi+

),這些與Qi緊密連鎖的分子標記將表現(xiàn)不同程度的遺傳效應。利用分子標記定位QTL（Qi），實質就是分析分子標記與數(shù)量性狀基因座Qi的連鎖關系，即利用已知座位的分子標記來定位未知座位的Qi，通過分子標記與Qi之間的重組率，來確定Qi的具體位置。當前6頁，總共20頁。圖8-5QTL定位的基本原理示意圖單標記和單基因M&Q不連鎖

M&Q連鎖當前7頁，總共20頁。構建作圖群體確定和篩選遺傳標記檢測分離世代群體中每一個體的標記基因型測量數(shù)量性狀統(tǒng)計分析

QTL定位的步驟當前8頁，總共20頁。

QTL定位的步驟（1）構建作圖群體

適于QTL作圖的群體是待測數(shù)量性狀存在廣泛變異，多個標記位點處于分離狀態(tài)的群體。一般是由親緣關系較遠的親本間雜交，再經(jīng)自交、回交等方法構建。常用的群體有F2群體、回交（BC）群體、雙單倍體（doubledhaploids,DH）群體，重組近交系（recombinantinbredlines,RIL）群體等。其中DH群體和RIL群體可以永久使用。當前9頁，總共20頁。QTL定位的步驟（2）確定和篩選遺傳標記理想的作圖標記應具備以下4個特征：

數(shù)量豐富多態(tài)性好中性共顯性形態(tài)學標記（morphologicalmarker）蛋白質標記(proteinmarker)分子標記(molecularmarker)：或DNA標記。當前10頁，總共20頁。

常用的分子標記中文名稱英文名稱英文縮寫限制性長度片段多態(tài)性RestrictionfragmentlengthpolymorphismRFLP擴增片段長度多態(tài)性AmplifiedfrangmentlengthpolymorphismAFLP隨機擴增多態(tài)DNARandomamplifiedpolymorphismDNARAPD可變數(shù)目串聯(lián)重復VariablenumberoftandemrepeatVNTR微衛(wèi)星（簡單序列重復）SimplesequencerepeatSSR當前11頁，總共20頁。QTL定位的步驟（3）檢測分離世代群體中每一個體的標記基因型用多態(tài)性分子標記檢測分離世代群體中每一個體（系）的標記基因型值。各種分子標記最后顯示的都是電泳分離的帶譜，所以個體的標記基因型需要將每個標記的帶紋與親本比較并賦值來記錄，例如在共顯性情況下，作圖群體中應含有P1，P2和雜合型3種帶型，這3種帶型即代表某一分子標記的3種基因型。如果將含有P1帶型的個體賦值為1，P2帶型的賦值為3，雜合體賦值為2，即可得到數(shù)據(jù)化的分子標記圖。當前12頁，總共20頁。

M&Q連鎖

P1賦值為1P2賦值為3雜合體賦值為2數(shù)據(jù)化的分子標記基因型當前13頁，總共20頁。表8-6水稻窄葉青8×京系17F2群體部分數(shù)量性狀值與RFLP標記基因型值株號數(shù)量型狀RFLP標記生育期株高穎花數(shù)RG573RG13RZ70RG697RG474RG4351126115129113111210712735622233331121233412112114951172021131215115121285331323611012731122121271011031263322128119116237222033911811221712303310115111186333033N………………（4）測量數(shù)量性狀QTL定位的步驟當前14頁，總共20頁。QTL定位的步驟（5）統(tǒng)計分析

用統(tǒng)計方法分析數(shù)量性狀與標記基因型值之間是否存在關聯(lián)，確定QTL在標記遺傳圖譜上的數(shù)目、位置，估計QTL的效應。當前15頁，總共20頁。QTL定位的步驟QTL定位流程圖

當前16頁，總共20頁。二、QTL定位的統(tǒng)計方法單標記分析法區(qū)間定位法復合區(qū)間定位法當前17頁，總共20頁。二、QTL定位的統(tǒng)計方法1、單標記分析法若分子標記與QTL完全連鎖或部分連鎖就意味著標記本身就是QTL，或在標記附近存在QTL。常用的檢測單標記與QTL連鎖的統(tǒng)計方法：（1）方差分析：按標記基因型（MM、Mm、mm）將個體分組，進行單向分組的方差分析。若組間差異顯著，說明QTL與標記連鎖。（2）回歸或相關分析：對個體的性狀值和標記基因型值進行回歸或相關分析，若性狀值對標記基因型值回歸（相關）顯著，說明標記與QTL連鎖。當前18頁，總共20頁。二、QTL定位的統(tǒng)計方法2、區(qū)間定位法以正態(tài)混合分布的最大似然函數(shù)和簡單回歸模型，借助于完整的分子標記圖譜，計算基因組的任一相鄰標記(Mi-和Mi+

)之間存在和不存在QTL(Qi)的似然函數(shù)比值的對數(shù)(LOD值=lgL/L0)根據(jù)整個染色體上各點處的