演示文稿蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

（優(yōu)選）蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測當(dāng)前1頁，總共28頁。3.4蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測164預(yù)測目的：看一看所提交的蛋白質(zhì)序列在哪里會形成α-螺旋和β-折疊？現(xiàn)階段：準(zhǔn)確率不高。當(dāng)前2頁，總共28頁。3.4.1SOPMA網(wǎng)址：

2)Clickhere.1)Pasteyoursequencehere.當(dāng)前3頁，總共28頁。Example3-23對下面的蛋白質(zhì)序列做二級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGPEGERPARFTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ當(dāng)前4頁，總共28頁。ResultofSOPMA(1/2)當(dāng)前5頁，總共28頁。ResultofSOPMA(2/2)當(dāng)前6頁，總共28頁。3.4.2PredictProtein(1/6)166網(wǎng)址：

Clickhere當(dāng)前7頁，總共28頁。PredictProtein(2/6)8879705988797059ShengwuJishuThenclickhere當(dāng)前8頁，總共28頁。PredictProtein(3/6)Clickhere當(dāng)前9頁，總共28頁。PredictProtein(4/6)88797059Thenclickhere當(dāng)前10頁，總共28頁。PredictProtein(5/6)Clickhere當(dāng)前11頁，總共28頁。PredictProtein(6/6)Study1Thenclickhere.Pasteyoursequencehere.當(dāng)前12頁，總共28頁。Example3-24165對下面的序列進(jìn)行二級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析。MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGPEGERPARFTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ當(dāng)前13頁，總共28頁。Wait...(about5minutes)Clickhere當(dāng)前14頁，總共28頁。Toreceiveyouremail將該網(wǎng)址復(fù)制后粘貼到網(wǎng)頁瀏覽器中打開當(dāng)前15頁，總共28頁。預(yù)測結(jié)果目錄當(dāng)前16頁，總共28頁。圖3.87對序列進(jìn)行PROSITE搜索蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn)S/T-R/K酪蛋白激酶II磷酸化位點(diǎn)S/T--D/E酪氨酸激酶磷酸化位點(diǎn)十四烷酰化位點(diǎn)當(dāng)前17頁，總共28頁。圖3.88SEG搜索的低復(fù)雜度序列是指編碼這些氨基酸的DNA序列為低復(fù)雜度序列當(dāng)前18頁，總共28頁。圖3.89ProDom搜索結(jié)果當(dāng)前19頁，總共28頁。PSI-BLAST搜索結(jié)果當(dāng)前20頁，總共28頁。圖3.90以MSF格式顯示比對(1/2)當(dāng)前21頁，總共28頁。圖3.90以MSF格式顯示比對(2/2)當(dāng)前22頁，總共28頁。圖3.91PROF預(yù)測結(jié)果（普通）

AA:

氨基酸OBS_sec:

二級結(jié)構(gòu)的觀測值PROF_sec:

預(yù)測的二級結(jié)構(gòu)Rel_sec:

預(yù)測二級結(jié)構(gòu)的可信度SUB_sec:

預(yù)測的二級結(jié)構(gòu)的集合H:

螺旋E:

折疊L:

隨機(jī)卷曲O_3_acc:

相對親水表面的觀測值P_3_acc:

預(yù)測的相對親水表面(b

=0~9%,

i=9%~36%,

e=36%~100%)Rel_acc:

預(yù)測親水表面的可信度SUB_sec:

預(yù)測的親水表面的集合當(dāng)前23頁，總共28頁。PROF預(yù)測結(jié)果（詳細(xì)）

當(dāng)前24頁，總共28頁。圖3.92球蛋白預(yù)測當(dāng)前25頁，總共28頁。Practice把剛才課堂上講的內(nèi)容練習(xí)一遍。當(dāng)前26頁，總共28頁。SummarySOPM