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文檔簡介
第三章基因工程載體演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有35頁\編輯于星期五優(yōu)選第三章基因工程載體現(xiàn)在是2頁\一共有35頁\編輯于星期五
(1)在宿主細(xì)胞內(nèi)能獨(dú)立復(fù)制,ori。(3)多克隆位點(diǎn):外源基因插入的單一限制酶位點(diǎn)。2.基因工程對載體的要求(7)具有較好的安全性,不能任意轉(zhuǎn)移。(2)有選擇性標(biāo)記
Ampr、Tetr、Kanr等。(4)分子量小,可容納較大的外源基因片段。(5)拷貝數(shù)多,方便外源基因在細(xì)胞內(nèi)大量擴(kuò)增。(6)具有對受體細(xì)胞的可轉(zhuǎn)移性?,F(xiàn)在是3頁\一共有35頁\編輯于星期五載體的種類
基因工程中常用的載體有5類:
質(zhì)粒(plasmid)
單鏈DNA噬菌體M13
噬菌體的衍生物柯斯質(zhì)粒(cosmid)
動(dòng)物病毒(virus)
現(xiàn)在是4頁\一共有35頁\編輯于星期五第一節(jié)
質(zhì)粒載體
一、質(zhì)粒(plasmid)獨(dú)立于染色體以外的能自主復(fù)制的雙鏈閉合環(huán)狀DNA分子(CovalentlyClosedCircularDNA,ccc
DNA)。并不是細(xì)胞生長所必需的,但可以賦予細(xì)胞某些抵御外界環(huán)境因素不利影響的能力,如抗生素抗性、對重金屬離子的抗性、分泌細(xì)菌毒素等。分子量在1-500kb之間廣泛存在于細(xì)菌?,F(xiàn)在是5頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是6頁\一共有35頁\編輯于星期五5.根據(jù)基因工程的特殊要求加裝特殊的基因元件三、質(zhì)粒載體的構(gòu)建1、質(zhì)粒構(gòu)建基本策略1.加入合適的選擇標(biāo)記基因,如兩個(gè)以上,易于選擇轉(zhuǎn)化體2.增加或減少合適的酶切位點(diǎn),便于重組3.縮短長度,提高導(dǎo)入效率,增加裝載量4.改變復(fù)制子,變嚴(yán)緊為松弛,變少拷貝為多拷貝現(xiàn)在是7頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是8頁\一共有35頁\編輯于星期五1.pBR322:p:質(zhì)粒;BR:質(zhì)粒兩位主要構(gòu)建者姓氏的第一個(gè)字母;322:實(shí)驗(yàn)編號人工構(gòu)建載體三個(gè)親本質(zhì)粒:pMB1:出發(fā)質(zhì)粒(ColE1)pSF2124:AmprpSC101:TetrpSF2124pMB1pSC101四、經(jīng)典的大腸桿菌質(zhì)粒載體現(xiàn)在是9頁\一共有35頁\編輯于星期五氨芐青霉素和四環(huán)素抗性24個(gè)單一克隆位點(diǎn)。9個(gè)導(dǎo)致Tetr基因失活3個(gè)會(huì)導(dǎo)致Ampr基因失活現(xiàn)在是10頁\一共有35頁\編輯于星期五氯霉素?cái)U(kuò)增之后,每個(gè)細(xì)胞可達(dá)1000~3000copies③
安全失去了轉(zhuǎn)移蛋白基因mob(mobilization)。不能通過接合轉(zhuǎn)移。②高拷貝數(shù)
①
分子小,克隆能力大長度4363bp,易于純化,可以攜帶6-8Kb的外源DNA片段。④具有較多的單一酶切位點(diǎn)(24種)現(xiàn)在是11頁\一共有35頁\編輯于星期五4、pUC質(zhì)粒載體1987年,J.Messing和J.Vieria采用MCS技術(shù)在pBR322基礎(chǔ)上構(gòu)建的結(jié)構(gòu):(1)來自于pBR322的Ori(2)氨芐青霉素的抗性基因(ampr)。
但核苷酸序列發(fā)生了變化(3)LacZ′基因
編碼β—半乳糖酶的α—肽鏈(4)MCS區(qū)段
(MCS)區(qū)段位于lacZ’基因中的靠近5’-端的一段多克隆位點(diǎn)。但它并不破壞該基因的功能?,F(xiàn)在是12頁\一共有35頁\編輯于星期五與pBR322相比,pUC質(zhì)粒載體優(yōu)點(diǎn):(1)具有更小的分子量和更高的拷貝數(shù)
如pUC8為2750bp,pUCl8為2686bp,控制質(zhì)粒復(fù)制rop基因的缺失,平均每個(gè)細(xì)胞即可達(dá)500~700個(gè)拷貝(2)適用于組織化學(xué)法檢測重組體
通過-互補(bǔ)作用,利用菌落顏色篩選重組子。而pBR322質(zhì)粒的重組子要進(jìn)行兩步的選擇。
(3)具有多克隆位點(diǎn)區(qū)段(MCS)
適合不同粘性末端的DNA片段插入,不必連接接頭
現(xiàn)在是13頁\一共有35頁\編輯于星期五
釋放出的藍(lán)色物質(zhì)可以將整個(gè)菌落染成藍(lán)色,非常容易辨別,如果LacZ’插入外源基因被破壞,菌落則是白色的
。組織化學(xué)法檢測重組體X-Gal-半乳糖苷酶IPTG誘導(dǎo)物異丙基-β-D-硫代半乳糖苷
半乳糖
5-溴-4-氯-靛藍(lán)+現(xiàn)在是14頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是15頁\一共有35頁\編輯于星期五第二節(jié)噬菌體載體組成:蛋白質(zhì)、核酸.結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)外殼、尾巴尾巴上的微絲可以把噬菌體的DNA注入細(xì)菌內(nèi)。是比細(xì)菌還小得多的微生物,噬菌體侵犯細(xì)菌,可以認(rèn)為它是細(xì)菌里的“寄生蟲”。Bacteriophage(phage)現(xiàn)在是16頁\一共有35頁\編輯于星期五一、大腸桿菌的λ-噬菌體DNA(1)線狀雙鏈DNA,兩端各有一個(gè)12bp的互補(bǔ)單鏈(粘性末端,cohesive-endsite),稱λcossite,粘性末端粘連接變成環(huán)狀DNA。(一)λ-噬菌體的生物學(xué)特性1、由外殼包裝蛋白和λ-DNA組成λcos位點(diǎn)是噬菌體包裝必需序列。
2、λ-DNA的物理圖譜48.5kb現(xiàn)在是17頁\一共有35頁\編輯于星期五(2)功能相近的基因在基因組中聚集在一起
目前已經(jīng)被確定的基因至少61種,一半為必需基因現(xiàn)在是18頁\一共有35頁\編輯于星期五(二)λ噬菌體載體的構(gòu)建1.選用λ噬菌體作為構(gòu)建克隆載體材料的依據(jù)是一種溫和噬菌體。能承載比較大的外源DNA片段λDNA分子上有多種限制酶的識別位點(diǎn)2.構(gòu)建λ噬菌體克隆載體的技術(shù)路線用限制酶切去λDNA上的非必需區(qū)在λDNA上非必需區(qū)內(nèi)插入選擇標(biāo)記基因建立λDNA分子體外包裝系統(tǒng)現(xiàn)在是19頁\一共有35頁\編輯于星期五現(xiàn)在是20頁\一共有35頁\編輯于星期五
(1)插入式載體只具有一個(gè)可供外源DNA插入的限制酶位點(diǎn)的λ噬菌體。常用:λgt10、λNM1149等載體.(2)置換型載體(取代型載體)具有成對的限制酶位點(diǎn),在這兩個(gè)位點(diǎn)之間的λDNA區(qū)段可以被外源插入的DNA片段所取代。
常用:EMBL3、EMBL4二.λ噬菌體載體的主要類型現(xiàn)在是21頁\一共有35頁\編輯于星期五三、λ-DNA作為載體的優(yōu)點(diǎn)可在體外包裝成噬菌體顆粒,高效轉(zhuǎn)染大腸桿菌λ-DNA載體的裝載能力為25kb,遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于質(zhì)粒的裝載量重組。λ-DNA分子的篩選較為方便。
λ-DNA載體適合克隆和擴(kuò)增外源DNA片段,常用于構(gòu)建基因文庫缺點(diǎn):(1)需要包裝比較麻煩,包裝率又不穩(wěn)定,購買包裝蛋白的費(fèi)用又高;(2)沒有質(zhì)粒的用途廣泛?,F(xiàn)在是22頁\一共有35頁\編輯于星期五第三節(jié)、人工染色體克隆載體
基本元件:含有質(zhì)??寺≥d體所必需的第一受體(大腸桿菌)的質(zhì)粒復(fù)制起始點(diǎn);第二受體(如酵母菌)染色體DNA著絲點(diǎn)、端粒和復(fù)制起始點(diǎn)的序列.合適的選擇標(biāo)記基因。
利用染色體的復(fù)制元件來驅(qū)動(dòng)外源DNA片段復(fù)制的載體。酵母人工染色體(YAC)細(xì)菌人工染色體(BAC)現(xiàn)在是23頁\一共有35頁\編輯于星期五(一)酵母人工染色體(YAC)
把酵母染色體與基因復(fù)制和表達(dá)有關(guān)的主要組件都組裝在質(zhì)粒上,令質(zhì)粒行使酵母chr的轉(zhuǎn)錄功能和復(fù)制功能。
裝載量為350-400kb含有的元件:酵母自主復(fù)制序列(ARS)著絲粒序列(cen)四膜蟲端粒(tel)質(zhì)粒選擇標(biāo)記酵母系統(tǒng)的選擇標(biāo)記質(zhì)粒復(fù)制起點(diǎn)現(xiàn)在是24頁\一共有35頁\編輯于星期五一、YAC的基本序列元件酵母染色體DNA自主復(fù)制序列(ARS)酵母染色體的著絲粒序列(CEN)酵母染色體的端粒序列(TEL)酵母人工染色體(YAC)YAC載體主要是用來構(gòu)建大片段DNA文庫,特別用來構(gòu)建高等真核生物的基因組文庫,并不用作常規(guī)的基因克隆。
現(xiàn)在是25頁\一共有35頁\編輯于星期五酵母自主復(fù)制序列(ARS)一段特殊的序列,含有酵母菌中DNA進(jìn)行雙向復(fù)制所必需的信號。
現(xiàn)在是26頁\一共有35頁\編輯于星期五酵母著絲點(diǎn)(CEN)在YAC中起到保證一個(gè)細(xì)胞內(nèi)只有一個(gè)人工染色體的作用。pYAC4:酵母第四條染色體的著絲?!,F(xiàn)在是27頁\一共有35頁\編輯于星期五正常酵母人工染色體含有:*四膜蟲端粒(tel)定位于染色體末端一段序列,用于保護(hù)線狀的DNA不被胞內(nèi)的核酸酶降解,形成穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)?,F(xiàn)在是28頁\一共有35頁\編輯于星期五二、
YAC載體的選擇標(biāo)記主要采用營養(yǎng)缺陷型基因TRP1:色氨酸生物合成基因缺陷型
URA3:尿嘧啶生物合成基因缺陷型
LEU2:亮氨酸合成基因缺陷型
SUP
4:赭石突變抑制基因
現(xiàn)在是29頁\一共有35頁\編輯于星期五克隆位點(diǎn):位于sup4基因內(nèi)SuP4是一個(gè)赭石突變(UAA)抑制基因。宿主酵母菌的胸腺嘧啶合成基因帶有一個(gè)赭石突變ade2。在赭石突變宿主中,沒有外源基因插入時(shí),sup4基因抑制赭石突變,則形成正常白色菌落;有外源基因插入時(shí),sup4基因遭破壞,則形成紅色菌落,十分容易挑選出有DNA插入片段的紅色菌落,建成YAC文庫?,F(xiàn)在是30頁\一共有35頁\編輯于星期五YAC克隆DNA片段的過程是:目的基因在限制性內(nèi)切酶酶解后變成大片段DNA,克隆進(jìn)酵母載體DNA,轉(zhuǎn)染酵母縮主細(xì)胞,擴(kuò)增后,根據(jù)標(biāo)記性狀篩選出重組的人工染色體。三、克隆策略現(xiàn)在是31頁\一共有35頁\編輯于星期五酵母人工染色體的使用現(xiàn)在是32頁\一共有35頁\編輯于星期五四、酵母人工染色體(YAC)缺點(diǎn)首先,在YAC載體的插入片段會(huì)出現(xiàn)缺失和基因重排的現(xiàn)象。其次,容易形成嵌合體。嵌合就是在單個(gè)YAC中的插入片段由2個(gè)或多個(gè)的獨(dú)立基因組片段連接組成。嵌合克隆約占總克隆的5%~50%。第三,YAC染色體與宿主細(xì)胞的染色體大小相近,就很難從中分離出來,影響了YAC載體的廣泛應(yīng)用。
現(xiàn)在是33頁\一共有35頁\編輯于星期五(二)細(xì)菌人工染色體(BAC)
1992年Shizuya利用F因子的復(fù)制起點(diǎn)和氯霉素抗性標(biāo)記基因,在F質(zhì)粒(pMBO131)基礎(chǔ)上構(gòu)建了第一代BAC人工染色體。能夠克隆和保持大于
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