(18)-2.1.5重復(fù)序列臨床分子生物學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)

重復(fù)序列重復(fù)序列是指多拷貝的相近或相似的DNA片段，按照復(fù)性動(dòng)力學(xué)的方法可以分為三類：高度重復(fù)序列（≥106）中度重復(fù)序列（10-105）低度重復(fù)序列（2-9）單拷貝序列1、高度重復(fù)序列(highlyrepeatedDNA)B.衛(wèi)星DNA（satelliteDNA）A.反向重復(fù)序列（invertedrepeats)串聯(lián)排列，重復(fù)次數(shù)>106次在人類基因組中占20%序列比較短，長(zhǎng)度多為10~300bp復(fù)性速度快A.反向重復(fù)序列:5′AAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTT3′

3′TTTGGTGGCGACCATCGCCACCAAA5′5′AAACCACCGCTAGCGGTGGTTT3′

3′TTTGGTGGCGATCGCCACCAAA5′回文結(jié)構(gòu)（palindrome）兩個(gè)相同順序的互補(bǔ)拷貝在同一條DNA鏈上反向排列而成。B.衛(wèi)星DNA（satelliteDNA）在基因組中有一類序列的堿基組成不同于其他部分，可用密度梯度離心法將其與主體DNA分開，稱為衛(wèi)星DNA。異常高或低的G+C含量螃蟹2ATATAT…..果蠅5ATAATATAAT…..老鼠9GAAAAATGAGAAAAATGA重復(fù)堿基數(shù)序列衛(wèi)星DNA序列(satelliteDNA)多為2~70bp，成串排列，重復(fù)數(shù)可達(dá)106。高度重復(fù)序列功能參與復(fù)制水平的調(diào)節(jié)：蛋白質(zhì)與DNA的結(jié)合位點(diǎn)參與基因表達(dá)的調(diào)控：基因沉默參與轉(zhuǎn)位作用：反向重復(fù)序列-------十字型結(jié)構(gòu)與進(jìn)化有關(guān)與個(gè)體特征有關(guān)：DNA指紋（DNAfingerprint）與染色體減數(shù)分裂時(shí)染色體配對(duì)有關(guān)：端粒，著絲粒2、中度重復(fù)序列(ModeratelyrepeatedDNA)重復(fù)次數(shù)10~105。復(fù)性速度快于單拷貝序列，慢于高度重復(fù)序列。多與單拷貝基因間隔排列。多數(shù)為非編碼序列，如Alu序列也有編碼基因產(chǎn)物的，如rDNA、tDNA、組蛋白基因家族,一般往往以基因家族的形式組織。依據(jù)重復(fù)序列的長(zhǎng)度，中度重復(fù)序列可以分為：短散在重復(fù)序列（shortinterspersedrepeatedsegments）長(zhǎng)散在重復(fù)序列（longinterspersedrepeatedsegments）短散在核元件(shortinterspersednuclearelements，SINE)：長(zhǎng)度在500bp以下，在人基因組中的重復(fù)拷貝數(shù)達(dá)10萬(wàn)以上，如Alu家族，Hinf家族等。短散在重復(fù)序列有Alu

Ⅰ酶切位點(diǎn)（AG/CT）而得名。真核生物的Alufamily廣泛分布于非重復(fù)序列間，具有種屬特性。300bp300bp300bp~1000bp功能：可能參與hnRNA的加工與成熟。DNA復(fù)制及轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)作用。~1000bp~1000bp~1000bp長(zhǎng)散在核元件(longinterspersednuclearelements，LINE)：重復(fù)序列單元長(zhǎng)度在1000bp以上，如KpnI家族等。Alu序列和LINEs的突變均可導(dǎo)致疾病。長(zhǎng)散在重復(fù)序列在單倍體基因組中只出現(xiàn)一次或數(shù)次，含量＞50％，結(jié)構(gòu)基因主要是單拷貝序列，大量遺傳信息。復(fù)性速度慢3、單拷貝序列（uniquesequenceDNA）

低度重復(fù)序列(Lowcopynumberrepeat)1.高度重復(fù)序列

（≥106）3.低度重復(fù)序列（2~9）

單拷貝序列2.中度重復(fù)序列（10~105）B.衛(wèi)星DNAA.反向重復(fù)序列短散在重復(fù)序列SINE：Alu家族，Hinf家族長(zhǎng)散在重復(fù)序列LINE：

KpnI家族重復(fù)序列小結(jié)高度重復(fù)序列(highlyrepeatedDNA)中度重復(fù)