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第三節(jié)酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)TheKineticsofEnzymaticReactions
概念研究各種因素對(duì)酶促反應(yīng)速率的影響,并加以定量的闡述。影響因素包括有酶濃度、底物濃度、pH、溫度、抑制劑、激活劑等。※研究一種因素的影響時(shí),其余各因素均恒定。單底物、單產(chǎn)物反應(yīng);酶促反應(yīng)速率(velocity,V)一般在規(guī)定的反應(yīng)條件下,用單位時(shí)間內(nèi)底物的消耗量和產(chǎn)物的生成量來(lái)表示;反應(yīng)速率取其初速率,即底物的消耗量很?。ㄒ话阍?﹪以?xún)?nèi))時(shí)的反應(yīng)速率;底物濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于酶濃度。研究前提酶的活性:以國(guó)際單位(internationalunit,IU)表示。在規(guī)定的實(shí)驗(yàn)條件下(如溫度、pH的限定和足夠的底物濃度等),每分鐘催化1mol底物轉(zhuǎn)變成產(chǎn)物所需要的酶量為1個(gè)國(guó)際單位(IU)。
催量(Katal)
1IU=16.67×10-9Kat
1催量是指在特定條件下,每秒鐘將1mol底物轉(zhuǎn)化成產(chǎn)物所需的酶量
比活性(specificactivity):比較酶的純度
比活性單位是每mg蛋白質(zhì)所含酶的國(guó)際單位數(shù),其單位是IUmg蛋白1(二)酶促反應(yīng)初速率是反應(yīng)剛剛開(kāi)始時(shí)測(cè)得的反應(yīng)速率酶促反應(yīng)初速率是指反應(yīng)剛剛開(kāi)始,各種影響因素尚未發(fā)揮作用時(shí)的酶促反應(yīng)速率,即反應(yīng)時(shí)間進(jìn)程曲線(xiàn)為直線(xiàn)部分時(shí)的反應(yīng)速率。(二)有三類(lèi)方法對(duì)底物和產(chǎn)物的變化量進(jìn)行檢測(cè)1.直接測(cè)定法是對(duì)底物或產(chǎn)物的含量變化進(jìn)行直接檢測(cè)
有些酶促反應(yīng)可在反應(yīng)進(jìn)行一定時(shí)間后,不用任何輔助反應(yīng)便可直接測(cè)定反應(yīng)液中底物或產(chǎn)物的濃度。這類(lèi)測(cè)定方法稱(chēng)為直接測(cè)定法(directassay)。
還原型(Fe2+)細(xì)胞色素c在波長(zhǎng)550nm處有明顯的吸收峰,而氧化型(Fe3+)則無(wú);細(xì)胞色素c氧化酶對(duì)細(xì)胞色素c的氧化反應(yīng),可以直接在波長(zhǎng)550nm處檢測(cè)一定時(shí)間內(nèi)還原型細(xì)胞色素c的減少過(guò)程。3.偶聯(lián)測(cè)定法不直接涉及原始反應(yīng)的底物或產(chǎn)物
許多酶促反應(yīng)的底物和產(chǎn)物雖然不能直接檢測(cè),但可以與另外的酶反應(yīng)相偶聯(lián),偶聯(lián)的酶以第一個(gè)酶的產(chǎn)物為底物,或以此類(lèi)推,以最后的酶反應(yīng)產(chǎn)物可以直接檢測(cè)為目的。這種通過(guò)偶聯(lián)其他酶并對(duì)此酶促產(chǎn)物進(jìn)行直接檢測(cè),間接地反映待測(cè)酶反應(yīng)的底物或產(chǎn)物變化量的方法稱(chēng)為酶偶聯(lián)測(cè)定法(enzymecoupledassay)
外加的酶稱(chēng)為工具酶或輔助酶(auxiliaryenzyme)
產(chǎn)物可直接檢測(cè)的酶稱(chēng)為指示酶(indicatorenzyme)
丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶丙氨酸+-酮戊二酸
丙酮酸+谷氨酸乳酸脫氫酶丙酮酸+NADH+H+
乳酸+NAD+
(在340nm處有吸收峰)(在340nm處無(wú)吸收峰)二、酶促反應(yīng)速率受底物濃度的影響(一)酶促反應(yīng)的底物濃度曲線(xiàn)是矩形雙曲線(xiàn)在酶濃度和其他反應(yīng)條件不變的情況下,反應(yīng)速率V對(duì)底物濃度[S]作圖呈矩形雙曲線(xiàn)。
隨著底物濃度的增高反應(yīng)速率不再成正比例加速;反應(yīng)為混合級(jí)反應(yīng)。[S]VVmax目錄當(dāng)?shù)孜餄舛雀哌_(dá)一定程度酶被底物所飽和,反應(yīng)速率不再增加,達(dá)最大速率;反應(yīng)為零級(jí)反應(yīng)。[S]VVmax目錄(二)底物濃度與反應(yīng)速率的關(guān)系可用米氏方程式表示
1.米氏方程式可以很好地解釋底物濃度曲線(xiàn)
中間產(chǎn)物
酶促反應(yīng)模式——中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)E+S
k1k2k3ESE+P米-曼氏方程式推導(dǎo)基于兩個(gè)假設(shè):E與S形成ES復(fù)合物的反應(yīng)是快速平衡反應(yīng),而ES分解為E及P的反應(yīng)為慢反應(yīng),反應(yīng)速率取決于慢反應(yīng)。即
V=k3[ES](1)S的總濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于E的總濃度,因此在反應(yīng)的初始階段,S的濃度可認(rèn)為不變即[S]=[St]。2.穩(wěn)態(tài)的概念介入米氏方程式的推導(dǎo)過(guò)程
穩(wěn)態(tài):是指ES的生成速率與分解速率相等,即[ES]恒定。k1([Et]-[ES])[S]=k2[ES]+k3[ES]k2+k3=Km
(米氏常數(shù))k1令:則(2)變?yōu)?([Et]-[ES])[S]=Km[ES](2)=([Et]-[ES])[S]k2+k3[ES]k1整理得:將(3)代入(1)得k3[Et][S]Km+[S](4)V=────當(dāng)?shù)孜餄舛群芨撸瑢⒚傅幕钚灾行娜匡柡蜁r(shí),即[Et]=[ES],反應(yīng)達(dá)最大速率Vmax=k3[ES]=k3[Et](5)[ES]=───[Et][S]Km+[S](3)整理得:將(5)代入(4)得米氏方程式:Vmax[S]Km+[S]V=────2.Km是酶的特征性常數(shù)
在酶的結(jié)構(gòu)、溶液pH、溫度等條件不變的情況下,酶促反應(yīng)底物的Km不因反應(yīng)中酶濃度的改變而不同。
同一酶對(duì)其所催化的不同底物有不同的Km;不同酶對(duì)同一底物也有其各自的Km
。Km的范圍多在10-6~10-2mol/L之間。
Km只與酶和底物的種類(lèi)以及反應(yīng)環(huán)境(pH、溫度、離子強(qiáng)度)有關(guān),而與酶濃度無(wú)關(guān)。6.0103己-N-乙酰2葡萄糖胺溶菌酶2.5102H2O2過(guò)氧化氫酶4.0103D-乳糖-半乳糖苷酶2.5103N-苯甲酰酪氨酰胺1.08101甘氨酰酪氨酰甘氨酸胰凝乳蛋白酶2.6102HCO3碳酸酐酶1.5103D-果糖5105D-葡萄糖4104ATP己糖激酶(腦)
Km(mol/L)
底物
酶
一些酶對(duì)底物的Km
3.Km在一定條件下可表示酶對(duì)底物的親和力
k1Km
=k2
+
k3當(dāng)k3<<k2時(shí),Km
k2/k1。即相當(dāng)于ES分解為E+S的解離常數(shù)(dissociationconstant,Ks)。此時(shí),Km代表酶對(duì)底物的親和力。
Km越大,表示酶對(duì)底物的親和力越??;Km越小,表示酶對(duì)底物的親和力越大。
酶底物轉(zhuǎn)換數(shù)(s1)過(guò)氧化氫酶H2O240000000碳酸酐酶HCO3400000乙酰膽堿酯酶乙酰膽堿14000-內(nèi)酰胺酶芐青霉素2000延胡索酸酶延胡索酸800RecA蛋白ATP0.4一些酶的轉(zhuǎn)換數(shù)
5.在低底物濃度時(shí),kcat/Km代表酶的催化效率
[Et][S]KmV
=kcat當(dāng)[S]<<Km時(shí)
kcat/Km是此二級(jí)反應(yīng)的速率常數(shù),也稱(chēng)特異性常數(shù),其單位是L·mol1·
S1
。反應(yīng)速率的大小取決于E和S由于相互滲透而相互碰撞的速率。.這種被滲透控制的碰撞速率(diffusion-controlledrateofencounter,DCRE)的上限是108109L·mol1·s1。kcat/Km越接近此數(shù)據(jù),酶的催化效率越高。直線(xiàn)在縱軸的截距等于1/Vmax,而在橫軸上的截距為1/Km
2.其他一些作圖法也可較準(zhǔn)確地求取Vmax和Km
海涅斯-沃爾弗作圖法(Hanes-Wolffplot)
雙倒數(shù)方程式兩邊同時(shí)乘以[S]
[S]V=KmVmax[S]+Vmax1直線(xiàn)的斜率等于1/Vmax,橫軸截距為-Km
伊迪-霍夫斯蒂作圖法(Eadie-Hofsteeplot)
米氏方程式兩邊均除以[S]
V=[S]VmaxKmV直線(xiàn)的斜率為-Km,直線(xiàn)的縱軸截距為Vmax
三、酶促反應(yīng)速率與酶的濃度相關(guān)
當(dāng)[S]>>[E],酶可被底物飽和的情況下,反應(yīng)速率與酶濃度成正比。關(guān)系式為:V=k3[E]A:底物濃度曲線(xiàn),其中,[E]1>[E]2>[E]3。從圖中可知,[E]的變化不影響酶促反應(yīng)的Km。B:反應(yīng)速率對(duì)酶濃度作圖,V與[E]呈直線(xiàn)關(guān)系。
四、酶促反應(yīng)速率受反應(yīng)系統(tǒng)溫度的影響
雙重影響溫度升高,酶促反應(yīng)速率升高;由于酶的本質(zhì)是蛋白質(zhì),溫度升高,可引起酶的變性,從而反應(yīng)速率降低。最適溫度(optimum
temperature):酶促反應(yīng)速率最快時(shí)的環(huán)境溫度。哺乳動(dòng)物組織中酶的最適溫度多在35~40℃之間
TaqDNA聚合酶最適溫度為72℃
*低溫的應(yīng)用一般的酶在低溫下活性降低,但酶本身不被破壞,其活性可隨溫度的回升而恢復(fù)。
低溫保存酶和菌種等生物制品
低溫麻醉
五、酶的活性依賴(lài)于反應(yīng)系統(tǒng)的pH
最適pH(optimumpH):酶催化活性最大時(shí)的環(huán)境pH。體內(nèi)酶的最適pH多在6.5~8之間。
胃蛋白酶的最適pH為1.8
精氨酸酶的最適pH為9.8
pH對(duì)幾種酶活性的影響
六、激活劑可加速酶促反應(yīng)速率
酶的激活劑(activator)
使酶從無(wú)活性變?yōu)橛谢钚曰蚴姑富钚栽黾拥奈镔|(zhì)
必需激活劑(essentialactivator)為酶促反應(yīng)所必需,如缺乏則測(cè)不到酶的活性。
Mg2+為己糖激酶的必需激活劑
非必需激活劑(non-essentialactivator)可以提高酶的催化活性,但不是必需的。
Cl-對(duì)唾液淀粉酶的激活作用
七、酶活性可被許多抑制劑可逆地或不可逆地抑制
(一)可逆性抑制劑與酶非共價(jià)結(jié)合
酶的抑制劑(inhibitor)凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白變性的物質(zhì)稱(chēng)為酶的抑制劑。
區(qū)別于酶的變性
抑制劑對(duì)酶有一定選擇性引起變性的因素對(duì)酶沒(méi)有選擇性可逆性抑制(reversibleinhibition)
酶與抑制劑非共價(jià)結(jié)合,可以通過(guò)透析、超濾或稀釋等物理方法將抑制劑除去,恢復(fù)酶的催化活性。
不可逆性抑制(irreversibleinhibition)
與酶共價(jià)結(jié)合,不能通過(guò)透析、超濾或稀釋等方法將其除去。
可逆性抑制劑
抑制劑與酶的調(diào)節(jié)部位結(jié)合,使酶發(fā)生變構(gòu),從而對(duì)酶發(fā)揮抑制作用(別構(gòu)抑制作用)。
抑制劑通過(guò)與游離酶或/和酶-底物復(fù)合物可逆地結(jié)合而影響酶的催化活性。
k1k2k3+kiEII+S+ESESE+PESI+Iki'可逆性抑制作用的抑制劑可以與游離酶結(jié)合,形成二元復(fù)合物EI;也可以與ES結(jié)合,形成三元復(fù)合物ESI。
1.競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑與底物競(jìng)爭(zhēng)酶的活性中心
定義:抑制劑與底物的結(jié)構(gòu)相似或部分相似,能與底物競(jìng)爭(zhēng)酶的活性中心,從而阻礙酶-底物復(fù)合物的形成,使酶的活性降低。這種抑制作用稱(chēng)為競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用。
+++EESIESEIEP有競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑存在的米氏方程式
V
=Vmax[S]Km+
[S](1
+[I]ki)雙倒數(shù)方程式是
VmaxKm[S]V1=1Vmax1+(1
+[I]ki)反應(yīng)模式+E+SESE+PIEIkik1k2k3SI競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用V對(duì)[S]的雙倒數(shù)作圖
*特點(diǎn)抑制程度取決于抑制劑與酶的相對(duì)親和力及底物濃度;I與S結(jié)構(gòu)類(lèi)似,或部分相似,競(jìng)爭(zhēng)酶的活性中心;動(dòng)力學(xué)特點(diǎn):Vmax不變,表觀(guān)Km增大。[I]1V1[S]0Km1Km1(1+)[I]kiVmax1--*舉例
丙二酸與琥珀酸競(jìng)爭(zhēng)琥珀酸脫氫酶琥珀酸琥珀酸脫氫酶FADFADH2延胡索酸磺胺類(lèi)藥物的抑菌機(jī)制與對(duì)氨基苯甲酸競(jìng)爭(zhēng)二氫葉酸合成酶二氫蝶呤+對(duì)氨基苯甲酸+谷氨酸二氫葉酸合成酶二氫葉酸2.非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑不影響酶對(duì)底物的親和力
+
S-S+
S-S+ESIEIEESEPk1k2k3+kiEII+ESESE+P+Iki+SESI*反應(yīng)模式非競(jìng)爭(zhēng)性抑制的米氏方程式的雙倒數(shù)形式
VmaxKm[S]V1=1Vmax1+(1
+[I]ki)(1
+[I]ki)*特點(diǎn)抑制劑與酶活性中心外的必需基團(tuán)結(jié)合,底物與抑制劑之間無(wú)競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系;抑制程度取決于抑制劑的濃度;動(dòng)力學(xué)特點(diǎn):Vmax降低,表觀(guān)Km不變。[I]1V1[S]Km1(1+)[I]kiVmax1Vmax0非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用V對(duì)[S]的雙倒數(shù)作圖
3.反競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合
++ESESESIEPk1k2k3+ESESE+P+IkiESI*反應(yīng)模式反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用的米氏方程式的雙倒數(shù)形式
VmaxKm[S]V1=1Vmax1+(1
+[I]ki)[I]1V1[S]Km1(1+)[I]kiVmax1Vmax0(1+)[I]kiKm反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用V對(duì)[S]的雙倒數(shù)作圖
*特點(diǎn):抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合;抑制程度取決于抑制劑的濃度及底物的濃度;動(dòng)力學(xué)特點(diǎn):Vmax降低,表觀(guān)Km降低。各種可逆性抑制作用的比較動(dòng)力學(xué)參數(shù)表觀(guān)Km
Km增大不變減小最大速度Vmax不變降低降低林-貝氏作圖斜率Km/Vmax增大增大不變縱軸截距1/Vmax不變?cè)龃笤龃髾M軸截距-1/Km增大不變減小與I結(jié)合的組分EE、ESES作用特征無(wú)抑制劑競(jìng)爭(zhēng)性抑制非競(jìng)爭(zhēng)性抑制反競(jìng)爭(zhēng)性抑制(二)不可逆性抑制劑與酶共價(jià)結(jié)合不可逆性抑制作用的抑制劑
基團(tuán)特異性抑制劑(group-specificinhibitor)底物類(lèi)似物(substrateanalog)自殺性抑制劑(suicideinhibitor)
1.基團(tuán)特異性抑制劑與酶分子中特異的基團(tuán)共價(jià)結(jié)合
一些酶活性中心的催化基團(tuán)是絲氨酸殘基上的羥基,這些酶稱(chēng)為羥基酶。
如膽堿酯酶和絲氨酸蛋白酶
有機(jī)磷化合物羥基酶失活的酶酸CH3CHN+HONROPR'OOOE+NROPR'OOOCHCH3N++EOH
解磷定失活的酶有機(jī)磷-解磷定復(fù)合物活化的酶
半胱氨酸殘基上的巰基是許多酶的必需基團(tuán)。低濃度的重金屬離子(Hg2+、Ag2+、Pb2+等)及As3+等可與巰基酶分子中的巰基結(jié)合,使酶失活。
路易士氣巰基酶失活的酶酸失活的酶BAL巰基酶BAL與砷劑結(jié)合物2.底物類(lèi)似物可共價(jià)地修飾酶的活性中心
與基團(tuán)特異性抑制劑不同,底物類(lèi)似物與底物的結(jié)構(gòu)相似,可特異地與酶的活性中心共價(jià)結(jié)合,不可逆地抑制酶的活性。此類(lèi)抑制劑可作為親和標(biāo)記物,用來(lái)定性酶活性中心的功能基團(tuán)。
TPCK對(duì)胰凝乳蛋白酶活性中心組氨酸咪唑環(huán)的親和標(biāo)記
酶的自殺性抑制劑可以作為酶的底物與酶活性中心相結(jié)合,生成酶-底物復(fù)合物,并接受酶的催化作用。然而,經(jīng)催化后的中間產(chǎn)物不游離出產(chǎn)物,而是轉(zhuǎn)化為酶的抑制劑,進(jìn)一步與酶活性中心共價(jià)結(jié)合,對(duì)酶產(chǎn)生抑制作用。
E+SESE·IE-I
3.自殺性抑制劑是經(jīng)過(guò)修飾的酶的底物+
酶-底物復(fù)合物無(wú)活性酶中被修飾的FAD
N,N-二甲基丙炔酰胺自殺性抑制劑N,N-二甲基丙炔酰胺在被單胺氧化酶氧化后,由于填加1個(gè)質(zhì)子,使之與酶的輔基FAD結(jié)合生成穩(wěn)定的烷化物,從而酶被抑制。
單胺氧化酶通過(guò)其輔基FAD氧化N,N-二甲基丙炔酰胺(N,N-dimethylpropargylamine):
第四節(jié)
多底物反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)KineticsofMultisubstrateReactions一、多底物反應(yīng)有其特定的表示法雙底物和多底物反應(yīng)的表示法與前述的單底物反應(yīng)不同,用A、B、C表示底物,用P、Q、R表示產(chǎn)物。雙底物和多底物反應(yīng)用單(uni)、雙(bi)、三(ter)等表示底物和產(chǎn)物的數(shù)量。
反應(yīng)
名稱(chēng)AB單單反應(yīng)(uniunireaction)A+BP雙單反應(yīng)(biunireaction)A+BP+Q雙雙反應(yīng)(bibireaction)A+B+CP+Q三雙反應(yīng)(terbireaction)A+B+CP+Q+R三三反應(yīng)(terterreaction)
酶促反應(yīng)的一般名稱(chēng)舉例
二、雙雙反應(yīng)可按底物與酶結(jié)合和產(chǎn)物釋放的順序進(jìn)行分類(lèi)
(一)有序序列雙雙反應(yīng)中底物結(jié)合和產(chǎn)物釋放有嚴(yán)格的先后次序
有些酶促雙雙反應(yīng)中,兩底物與酶的結(jié)合和兩產(chǎn)物從酶-底物復(fù)合物中的釋放有其嚴(yán)格次序,這類(lèi)雙雙反應(yīng)稱(chēng)為有序序列雙雙反應(yīng)(compulsoryorderedbibireaction),或稱(chēng)有序序列機(jī)制(compulsoryorderedmechanism)。
乳酸脫氫酶催化的反應(yīng)
丙酮酸+NADH+H+
乳酸+NAD+
(二)隨機(jī)序列雙雙反應(yīng)的底物結(jié)合和產(chǎn)物釋放沒(méi)有嚴(yán)格的先后次序
有些酶促雙雙反應(yīng)中,兩底物與酶結(jié)合和兩產(chǎn)物釋放的次序是隨機(jī)的,這類(lèi)雙雙反應(yīng)稱(chēng)為隨機(jī)序列雙雙反應(yīng)(randomorderedbibireaction),或稱(chēng)隨機(jī)序列機(jī)制(randomorderedmechanism)。
(三)乒-乓雙雙反應(yīng)的兩底物尚未全部與酶結(jié)合便有產(chǎn)物釋放
有些酶促雙雙反應(yīng)中,兩底物與酶的結(jié)合和兩產(chǎn)物從酶-底物復(fù)合物的釋放是交替進(jìn)行的,這類(lèi)雙雙反應(yīng)稱(chēng)為乒-乓雙雙反應(yīng)(Ping-Pongbibireaction),或雙置換機(jī)制(doubledisplacementmechanism)。
第五節(jié)酶活性的調(diào)節(jié)RegulationofEnzymeActivities
一、調(diào)節(jié)酶的催化活性隨著對(duì)環(huán)境信號(hào)的反應(yīng)而變化
調(diào)節(jié)酶(regulatoryenzyme)
對(duì)環(huán)境因素的作用表現(xiàn)出催化活性增高或降低、或酶量的增多或減少,進(jìn)而能影響和調(diào)整反應(yīng)途徑反應(yīng)速率的酶。
機(jī)體通過(guò)改變調(diào)節(jié)酶的活性或誘導(dǎo)、阻遏酶的生物合成,可實(shí)現(xiàn)細(xì)胞代謝水平的調(diào)節(jié);物質(zhì)代謝的整體調(diào)節(jié)和激素水平的調(diào)節(jié)最終也都是通過(guò)影響酶促反應(yīng)速率實(shí)現(xiàn)的。
酶的調(diào)節(jié)抑制抑制劑激活激活劑雙重調(diào)節(jié)別構(gòu)調(diào)節(jié)共價(jià)修飾多形性調(diào)節(jié)酶原的激活同工酶酶含量調(diào)節(jié):調(diào)節(jié)合成:誘導(dǎo)、阻遏調(diào)節(jié)降解酶活性調(diào)節(jié):
二、別構(gòu)酶通過(guò)構(gòu)象的改變影響酶促反應(yīng)速率
(一)別構(gòu)效應(yīng)劑與別構(gòu)酶結(jié)合引發(fā)酶的構(gòu)象改變別構(gòu)調(diào)節(jié)(allostericregulation)一些代謝物可與某些酶分子活性中心外的某部分可逆地結(jié)合,使酶構(gòu)象改變,從而改變酶的催化活性,此種調(diào)節(jié)方式稱(chēng)別構(gòu)調(diào)節(jié)。別構(gòu)酶(allostericenzyme):能發(fā)生別構(gòu)效應(yīng)的酶別構(gòu)效應(yīng)劑(allostericeffector)
:能引起酶發(fā)生構(gòu)象改變的化合物調(diào)節(jié)部位(regulatorysite):別構(gòu)效應(yīng)劑與酶結(jié)合的部位別構(gòu)酶也有兩種構(gòu)象形式,緊縮態(tài)(tensestate,Tstate)和松馳態(tài)(relaxedstate,Rstate)。T態(tài)和R態(tài)對(duì)底物的親和力或催化活性不同,別構(gòu)效應(yīng)劑就是通過(guò)引起酶R態(tài)與T態(tài)的互變,改變酶的催化速率。
(二)別構(gòu)效應(yīng)劑可引起別構(gòu)酶分子中各亞基間的協(xié)同作用
亞基的構(gòu)象改變可以相互影響,發(fā)生協(xié)同效應(yīng)。(cooperativity)
正協(xié)同效應(yīng)(positivecooperativity)
后續(xù)亞基的構(gòu)象改變?cè)黾悠鋵?duì)別構(gòu)效應(yīng)劑的親和力,使效應(yīng)劑與酶的結(jié)合越來(lái)越容易。
負(fù)協(xié)同效應(yīng)(negativecooperativity)
后續(xù)亞基的構(gòu)象改變降低酶對(duì)別構(gòu)效應(yīng)劑的親和力,使效應(yīng)劑與酶的結(jié)合越來(lái)越難。同種協(xié)同效應(yīng)(homotropiccooperativity)
別構(gòu)效應(yīng)劑引起的構(gòu)象改變?cè)黾踊蚪档秃罄m(xù)亞基對(duì)同種別構(gòu)效應(yīng)劑的親和力。
異種協(xié)同效應(yīng)(heterotropiccooperativity)
別構(gòu)效應(yīng)劑引起的構(gòu)象改變?cè)黾踊蚪档秃罄m(xù)亞基對(duì)他種別構(gòu)效應(yīng)劑的親和力。
別構(gòu)效應(yīng)劑引起的構(gòu)象改變?cè)黾用笇?duì)底物的親和力,這種現(xiàn)象(屬于異種正協(xié)同效應(yīng))稱(chēng)為別構(gòu)激活作用(allostericactivation)。此別構(gòu)效應(yīng)劑稱(chēng)為別構(gòu)激活劑(allostericactivator)
引起酶對(duì)底物親和力降低的現(xiàn)象(屬于異種負(fù)協(xié)同效應(yīng))稱(chēng)為別構(gòu)抑制作用(allostericinhibition)。此別構(gòu)效應(yīng)劑稱(chēng)為別構(gòu)抑制劑(allostericinhibitor)(三)別構(gòu)酶的動(dòng)力學(xué)特性不遵守米-曼氏動(dòng)力學(xué)
正協(xié)同效應(yīng)的底物濃度-反應(yīng)速率曲線(xiàn)為S形曲線(xiàn)
負(fù)協(xié)同效應(yīng)的底物-速率曲線(xiàn)外形類(lèi)似矩形雙曲線(xiàn),但不是矩形雙曲線(xiàn)
三、一些調(diào)節(jié)酶可在催化方向相反的兩種酶的作用下發(fā)生共價(jià)修飾
(一)磷酸化與去磷酸化是最多見(jiàn)的共價(jià)修飾方式
共價(jià)修飾(covalentmodification)或化學(xué)修飾(chemicalmodification)
酶分子中的某些基團(tuán)可在其他酶的催化下,共價(jià)結(jié)合某些化學(xué)基團(tuán);同時(shí)又可在另一種酶的催化下,將此結(jié)合上的化學(xué)基團(tuán)去掉,從而影響酶的活性。
酶的共價(jià)修飾種類(lèi):
1.磷酸化(phosphorylation)和去磷酸化(dephosphorylation)
2.甲基化(methylation)和去甲基化(demethylation)
3.腺苷化(adenylation)和去腺苷化(deadenylation)
4.尿苷化(uridylation)
和去尿苷化(deuridylation)
磷酸化和去磷酸化修飾是最常見(jiàn)的共價(jià)修飾
酶的磷酸化與脫磷酸化-OHThrSerTyr酶蛋白H2OPi磷蛋白磷酸酶ATPADP蛋白激酶ThrSerTyr-O-PO32-酶蛋白(二)共價(jià)修飾可引起級(jí)聯(lián)放大效應(yīng)
在一個(gè)連鎖反應(yīng)中,一個(gè)酶被磷酸化或去磷酸化激活后,后續(xù)的其他酶可同樣的依次被其上游的酶共價(jià)修飾而激活,引起原始信號(hào)的放大,這種多重共價(jià)修飾的連鎖反應(yīng)稱(chēng)為級(jí)聯(lián)反應(yīng)(cascadereaction)。
級(jí)聯(lián)反應(yīng)的主要作用是產(chǎn)生快速、高效的放大效應(yīng)。
四、一些酶只有通過(guò)對(duì)其前體剪切后才有活性酶原(zymogen)有些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時(shí)只是酶的無(wú)活性前體,此前體物質(zhì)稱(chēng)為酶原。酶原的激活在一定條件下,酶原向有活性酶轉(zhuǎn)化的過(guò)程。
酶原激活的原理酶原分子構(gòu)象發(fā)生改變形成或暴露出酶的活性中心
一個(gè)或幾個(gè)特定的肽鍵斷裂,水解掉一個(gè)或幾個(gè)短肽在特定條件下賴(lài)?yán)i天天天天甘異賴(lài)?yán)i天天天天纈組絲SSSS46183甘異纈組絲SSSS腸激酶胰蛋白酶活性中心胰蛋白酶原的激活過(guò)程酶原激活因子激活途徑胃蛋白酶原H+或胃蛋白酶胃蛋白酶+六肽胰蛋白酶原腸激酶、胰蛋白酶胰蛋白酶+六肽胰凝乳蛋白酶原胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶+2個(gè)二肽彈性蛋白酶原胰蛋白酶彈性蛋白酶+幾個(gè)肽段羧基肽酶原胰蛋白酶羧基肽酶+幾個(gè)肽段消化蛋白酶原的激活
胰腺1
245SSSS胰蛋白酶11516
245SSSS11316
245SSSSSer14-Arg15,Thr147-Asn148酶原-胰凝乳蛋白酶-胰凝乳蛋白酶-胰凝乳蛋白酶-胰凝乳蛋白酶194Ile16轉(zhuǎn)180°Asp194Met192內(nèi)表,Gly193伸長(zhǎng)Ser195,His57移位Asp192146149-胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶Asp102C-C=OH2OH-NNH-O-CH2Ser195⊕Asp102C-C=OH2OH-NNH------O-CH2Ser195His57CH2His57CH2–––His57⊕Ser195親核攻擊Asp102穩(wěn)定His57⊕-胰凝乳蛋白酶活性中心專(zhuān)一性:-胰凝乳蛋白酶:Leu13-Ser14,Tyr146-Thr147,Asn148-Ala149-胰凝乳蛋白酶:芳香族:Phe,Tyr,Trp
酶原激活的生理意義避免細(xì)胞產(chǎn)生的酶對(duì)細(xì)胞進(jìn)行自身消化,并使酶在特定的部位和環(huán)境中發(fā)揮作用,保證體內(nèi)代謝正常進(jìn)行。有的酶原可以視為酶的儲(chǔ)存形式。在需要時(shí),酶原適時(shí)地轉(zhuǎn)變成有活性的酶,發(fā)揮其催化作用。第五節(jié)酶與醫(yī)學(xué)
EnzymesandMedicalSciences
一、酶與疾病的發(fā)生、臨床診斷與治療密切相關(guān)
(一)許多疾病與酶的質(zhì)和量的異常相關(guān)1.酶的先天性缺陷是先天性疾病的重要病因之一
酪氨酸酶缺乏引起白化?。槐奖彼崃u化酶缺乏引起苯丙酮酸尿癥。
2.酶活性改變可引起疾病
胰腺炎因胰蛋白酶在胰腺中被激活。
3.一些疾病可以引起酶活性的改變
嚴(yán)重肝病時(shí)可因肝合成的凝血因子減少而影響血液凝固。
(二)體液中酶的活性可作為疾病的診斷指標(biāo)
2.惡性腫瘤可因腫瘤組織的增殖加快,其標(biāo)志酶釋放入血增多,有助于對(duì)該組織腫瘤的診斷。
前列腺癌病人血清酸性磷酸酶含量增高。
組織器官損傷可使其組織特異性的酶釋放入血,有助于對(duì)此組織器官疾病的診斷。
急性肝炎時(shí),血清中丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶活性升高。
3.有些酶的清除和排泄障礙也可造成血清含量升高。
肝硬化時(shí)血清堿性磷酸酶活性升高。
4.酶的誘導(dǎo)合成增多也可以從血清中檢測(cè)出來(lái),用于協(xié)助診斷和預(yù)后判斷。
膽管阻塞時(shí)膽汁返流可刺激肝合成堿性磷酸酶增多。
(三)酶作為藥物可用于疾病的治療
1.有些酶作為助消化的藥物
消化腺分泌功能不良所致的消化不良可服用胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰脂肪酶、胰淀粉酶等予以糾正。
3.有些酶具有溶解血栓的療效鏈激酶、尿激酶及纖溶酶等溶解血栓,用于治療心、腦血管栓塞等。
胰蛋白酶、溶菌酶、木瓜蛋白酶、菠蘿蛋白酶等可加強(qiáng)傷口的凈化、抗炎和防止?jié){膜粘連等。在某些外敷藥中加入透明質(zhì)酸酶可以增強(qiáng)藥物的擴(kuò)散作用。2.有些酶用于清潔傷口和抗炎(四)有些藥物通過(guò)抑制或激活體內(nèi)某種酶的活性起治療作用一些藥物通過(guò)抑制某些酶的活性,糾正體內(nèi)代謝紊亂。如抗抑郁藥通過(guò)抑制單胺氧化酶而減少兒茶酚胺的滅活,治療抑郁癥。洛伐他汀通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性抑制HMG-CoA還原酶的活性,抑制膽固醇的生物合成,降低血膽固醇。給新生兒服用苯巴比妥可誘導(dǎo)肝細(xì)胞UDP-葡萄糖醛酸基轉(zhuǎn)移酶的生物合成,減輕新生兒黃疸,防止出現(xiàn)膽紅素腦病。二、酶作為試劑可用于生物化學(xué)分析
(一)有些酶可作為酶偶聯(lián)測(cè)定法中的指示酶或輔助酶當(dāng)有些酶促反應(yīng)的底物或產(chǎn)物不能被直接測(cè)定時(shí),可偶聯(lián)另一種或兩種酶,使初始反應(yīng)產(chǎn)物定量地轉(zhuǎn)變?yōu)榭蓽y(cè)量的某種產(chǎn)物,從而測(cè)定初始反應(yīng)的底物、產(chǎn)物或初始酶活性。這種方法稱(chēng)為酶偶聯(lián)測(cè)定法。若偶聯(lián)一種酶,這個(gè)酶即為指示酶(indicatorenzyme);若偶聯(lián)兩種酶,則前一種酶為輔助酶(auxiliaryenzyme),后一種酶為指示酶。葡糖氧化酶法測(cè)定血糖時(shí),過(guò)氧化物酶為指示酶。酶聯(lián)免疫分析又稱(chēng)酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定
(enzyme-linkedimmunosorbentassays,ELISA)
是利用酶的快速、靈敏、可定量檢測(cè)的優(yōu)點(diǎn)和免疫學(xué)方法中抗原-抗體特異性結(jié)合的優(yōu)點(diǎn),將指示酶與抗體偶連,對(duì)抗原進(jìn)行檢測(cè)的一種方法。(二)有些酶可作為酶標(biāo)記測(cè)定法中的標(biāo)記酶常用的標(biāo)記酶:辣根過(guò)氧化物酶堿性磷酸酶
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