病毒學第三章 病毒的分類與命名

本章重點1.病毒分類機構2.病毒分類原則3.病毒的分類系統(tǒng)目前一頁\總數(shù)五十八頁\編于十點1961年以前，這個時期是各自研究領域的科學家提出或建立一些分類系統(tǒng)，進展緩慢，缺乏國際間的協(xié)作。1962-1966年，建立了國際病毒學命名委員會（InternationalCommitteeonNomenclatureofViruses,ICNV）1966-1970年，Wildy任國際病毒學命名委員會主席期間，組織國際間協(xié)作，發(fā)表了ICNV的第一次報告。1971-現(xiàn)在，病毒分類與命名的工作得到了鞏固和發(fā)展，國際病毒學命名委員會更名為國際病毒學分類委員會（InternationalCommitteeonTaxonomyofViruses,ICTV）第一節(jié)病毒分類與命名的沿革目前二頁\總數(shù)五十八頁\編于十點一、1961年以前

各研究領域獨立進行病毒分類與命名（一）植物病毒分類

Johnson和Hoggan（1935）：1、病毒的傳播方式及昆蟲介體

2、自然的寄主范圍及鑒別寄主

3、在活體外的存活期

4、致死溫度

5、癥狀特點目前三頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（二）動物病毒分類法目前四頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前五頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前六頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前七頁\總數(shù)五十八頁\編于十點二、1962-1966年

1966年在莫斯科舉行的第九屆國際微生物學代表會議上，成立國際病毒命名委員會（InternationalCommitteeonNomenclatureofViruses;ICNV）。下設4個小組委員會：動物病毒小組委員會植物病毒小組委員會無脊椎動物病毒小組委員會噬菌體小組委員會目前八頁\總數(shù)五十八頁\編于十點

1963年國際微生物命名委員會病毒分會根據(jù)安德魯斯(Andrewes)提出的分類建議提出了新的8項分類原則：

①核酸的類型、結構和分子量；

②病毒粒子的形狀和大??；

③病毒粒子的結構；

④病毒粒子對乙醚、氯仿等脂溶劑的敏感性；

⑤血清學性質(zhì)和抗原關系；

⑥病毒在細胞培養(yǎng)上的繁殖特性；

⑦對除脂溶劑以外的理化因子的敏感性；

⑧流行病學的特征。

目前九頁\總數(shù)五十八頁\編于十點三、1966-1970年

1970年8月，在第十屆國際微生物學代表大會上，報告了國際病毒命名委員會的第一次報告。將當時了解得比較清楚的500多種病毒分為RNA和DNA病毒兩大類，描述并劃定了43個屬及其成員。其中動物病毒22個屬，還確定了兩個科，乳多空病毒科和細小病毒科；植物病毒15個組群；細菌病毒分成6個組群。目前十頁\總數(shù)五十八頁\編于十點四、1971-現(xiàn)在1973年5月，在倫敦召開的ICNV執(zhí)行委員會上，國際病毒命名委員會改為國際病毒分類委員會（InternationalCommitteeonTaxonomyofViruses,ICTV）。1995年國際病毒分類委員會第六次報告中，植物病毒不再采用組、亞組，而統(tǒng)一采用科、屬、種的分類系統(tǒng)。同時將病毒分為3大類：DNA病毒、DNA及RNA反轉(zhuǎn)錄病毒、RNA病毒。目前十一頁\總數(shù)五十八頁\編于十點2005年，國際病毒分類委員會發(fā)布了第八次病毒分類報告。在這個長達1259頁的報告中，將目前ICTV所承認的5450多個病毒歸屬為3個目、73個科、11個亞科、289個屬、1950多個種。在亞病毒感染因子下設類病毒、衛(wèi)星體和朊毒，其中類病毒有2個科、7個屬；衛(wèi)星病毒有2個亞組，衛(wèi)星核酸有3個亞組；朊毒分為哺乳動物朊毒和真菌朊毒。目前十二頁\總數(shù)五十八頁\編于十點

第八次報告的特點:1、進一步明確了“種”作為病毒分類系統(tǒng)中的最小分類階元，在每一個確定種下面列出了至少一個、至多幾十個不同的分離物以及它們在GenBank上的登錄號。2、增加了許多反映病毒基因序列同源性關系的系統(tǒng)樹圖。3、將原子分辨率的粒子三維結構插入到相應的科或?qū)僦?，使讀者對病毒粒子空間結構有更詳細的了解。目前十三頁\總數(shù)五十八頁\編于十點

有關病毒分類的論文及信息在ICTV的官方期刊“Archives[a:kaivz]

ofVirology”發(fā)表，1990年前“Intervirology”是其官方期刊。

目前十四頁\總數(shù)五十八頁\編于十點第二節(jié)病毒的命名（一）一般規(guī)則（1）病毒分類和命名應該是國際性的，并且普遍適用于所有的病毒。

（2）國際病毒分類系統(tǒng)采用目（order）、科(family)、亞科(subfamily)、屬(genus)、種(species)、分類階元。

（3）ICTV不負責病毒種以下的分類和命名，病毒種以下的血清型、基因型、毒力株、變異株和分離株的名稱由公認的國際專家小組確定。目前十五頁\總數(shù)五十八頁\編于十點

（4）人工產(chǎn)生的病毒和實驗室構建的雜種病毒在病毒分類上不予考慮，其分類由公認的國際專家小組負責。

（5）只有在病毒代表種的特性得到了充分了解和在公開出版物上進行過描述，才能確定建立一個分類階元，以便與其他類似的分類階元相區(qū)別。

（6）當病毒有明確的科、而分屬未確定時，這一病毒種在分類學上稱為該科的未確定種（unassignedspecies）。

（7）與規(guī)則2各分類階元相關聯(lián)，并得到ICTV批準的名稱是唯一可以接受的。目前十六頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（二）關于分類單元的命名規(guī)定在分類單元和病毒的命名中不遵循優(yōu)先律。在提出新的分類單元時不使用人名。在提出新名稱時，不使用下標、上標、連字符、斜線和希臘字母。新名稱不應與已通過的名稱重復。病毒名稱由ICTV認定，其命名與細菌不同，不再采用拉丁文雙名法，而是采用英文或英語化的拉丁文，只用單名。目、科、亞科、屬分別用拉丁文后綴“-virales”、“-viridae”、“-virinae”和“-virus”，并采用斜體。目前十七頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（三）關于種的規(guī)定一個病毒種應是一類具有多種共同特征的病毒，并組成一個正在復制的世代譜系，且在生態(tài)位中占有特定的位置。1、病毒種應當是群體，是類別。2、病毒種所共有的特征不是一種而是多種。3、病毒種是演化譜系中某時期的一分子。4、病毒種應當占據(jù)某特定生態(tài)位。目前十八頁\總數(shù)五十八頁\編于十點一新種不能確定，或不能將這一新種確定到已設立的屬中時，新種將作為暫定種。種名必須賦予種恰如其分的鑒別特征。目前十九頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（四）關于屬的規(guī)則屬是具有某些共同特征的種。屬名應是一個以“---virus”結尾的單詞。Lyssavirus（狂犬病毒屬）T4likeviruses（T4樣病毒屬）通過一個新屬名的同時，必須承認一個代表種。目前二十頁\總數(shù)五十八頁\編于十點鑒定一個種的歸屬時，有用的特征基因組序列相關性天然寄主范圍細胞和組織的趨向性致病性和細胞病理學傳播方法病毒蛋白的抗原性目前二十一頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（五）關于亞科的規(guī)則亞科是一群具有某些共同特征的屬，這一分類單元只在需要解決復雜等級結構問題時才使用亞科。亞科名應是一個以“---virinae”結尾的單詞。Parvovirinae（細小病毒亞科）目前二十二頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（六）關于科的規(guī)則科是一群具有某些共同特征的屬（不管這些屬是否組成了亞科）科名應是一個以“---viridae”結尾的單詞。Parvoviridae（細小病毒科）目前二十三頁\總數(shù)五十八頁\編于十點區(qū)分屬或科毒粒形態(tài)基因組結構復制方法結構蛋白和非結構蛋白的數(shù)目和大小目前二十四頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（七）關于目的規(guī)則目是一群具有某些共同特征的科。ICTV對病毒目的建立持謹慎態(tài)度，僅限于已有足夠的證據(jù)說明其系統(tǒng)演化的相關性的病毒科。目名應是一個以“---virales”結尾的單詞。有尾噬菌體目（Caudovirales）單分子負鏈RNA病毒目（Mononegavirales）成套病毒目（Nidovirales）目前二十五頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（八）關于亞病毒因子的規(guī)則

類病毒有關病毒的分類規(guī)則，適用于類病毒的分類。類病毒的分類單元的規(guī)范詞尾是：種“viroid”、屬“viroid”、亞科“viroinae”、科“viroidae”。其他亞病毒因子衛(wèi)星體和朊病毒不按病毒分類，采用任意分類（arbitraryclassification）

，這種任意分類對專門領域的研究工作者似乎是有用的。目前二十六頁\總數(shù)五十八頁\編于十點（九）關于書寫的規(guī)則在規(guī)范的分類學慣例，病毒目、科、亞科、屬的認可名稱，均用斜體印刷，名稱的第一個字母需大寫。Adenoviridae(腺病毒科)種的名稱用斜體印刷，第一個詞的首字母需大寫，除專有名詞或?qū)Ｓ忻~的一部分之外，其他詞首字母一律不大寫。Humanimmunodeficiencyvirus1(人免疫缺陷病毒1型)目前二十七頁\總數(shù)五十八頁\編于十點規(guī)范的慣例，各分類單元正式的描述是

…Reovirideae(科),…Phytoreovirus(屬),…Woundtumorvirus（種）呼腸孤病毒科，植物呼腸孤病毒屬，傷瘤病毒未通過或暫定的名稱均印成標準體，并在西文中綴以-like字樣。T1-likeviruses(T1樣噬菌體屬)目前二十八頁\總數(shù)五十八頁\編于十點第三節(jié)病毒的分類原理及依據(jù)穩(wěn)定性：是指病毒名稱及其隸屬關系一旦確定下來，就應該盡可能的保留。

實用性：是指病毒分類體制應該對病毒學研究領域是有用的。

認可性：是指病毒分類階元和名稱應該為病毒學研究者樂意接受和使用，所以，認可性也是實用性的必然結果。

靈活性：是指病毒分類階元可以依據(jù)某些新發(fā)現(xiàn)而進行重新修訂和再確定。目前二十九頁\總數(shù)五十八頁\編于十點

依據(jù)：主要以病毒粒子特性、抗原性質(zhì)和病毒生物學特性等作為依據(jù)。病毒粒子特性：①病毒形態(tài)：如大小、形狀、包膜和包膜突起的有無，衣殼結構及其對稱性;②病毒生理生化和物理性質(zhì)：如分子量，沉降系數(shù)，浮力密度，病毒粒子在不同pH、溫度、Mg2+、Mn2+、變性劑、輻射中的穩(wěn)定性；③病毒基因組，如基因組大小、核酸類型、單雙鏈、線狀或環(huán)狀，正負鏈，G+C所占的比例、核苷酸序列等；目前三十頁\總數(shù)五十八頁\編于十點④病毒蛋白，如結構蛋白和非結構蛋白的數(shù)量、大小以及功能和活性，氨基酸序列等⑤病毒脂類含量和特性；⑥碳水化合物含量和特性；⑦病毒基因組組成和復制。目前三十一頁\總數(shù)五十八頁\編于十點病毒抗原性質(zhì)：

包括病毒血清學性質(zhì)與其抗原的關系。病毒生物學特性：

包括病毒天然的宿主范圍；

病毒在自然狀態(tài)下的傳播與媒介體的關系；

病毒的地理分布，致病機理，組織嗜親性；

病毒引起的病理和組織病理學特點。目前三十二頁\總數(shù)五十八頁\編于十點第四節(jié)病毒分類系統(tǒng)國際病毒分類委員會第七次報告（1999）認可病毒4000種，設有3個病毒目。目前三十三頁\總數(shù)五十八頁\編于十點將所有已知的病毒根據(jù)核酸類型分為：DNA病毒——單股DNA病毒，DNA病毒——雙股DNA病毒，DNA與RNA反轉(zhuǎn)錄病毒，RNA病毒——雙股RNA病毒，RNA病毒——正單鏈RNA病毒，RNA病毒——負單鏈RNA病毒，裸露RNA病毒（真菌病毒，+ssRNA與其編碼的RNA依賴的RNA聚合酶結合在一起，存在于細胞質(zhì)中）類病毒（亞病毒因子）目前三十四頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前三十五頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前三十六頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前三十七頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前三十八頁\總數(shù)五十八頁\編于十點第8次報告動物病毒新增4個科線頭病毒科（Nimaviridae）白斑病毒屬（Whispovirus）白斑綜合征病毒Ⅰ型（WhitespotsyndranevirusⅠ

）雙順反子病毒科（Dicistroviridae）桃拉綜合征病毒（TSV）桿狀套病毒科（Romviridae）黃頭病毒（YHV）蕪菁黃花葉病毒科（Tymoviridae）目前三十九頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前四十頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前四十一頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前四十二頁\總數(shù)五十八頁\編于十點目前四十三頁\總數(shù)