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文檔簡(jiǎn)介
基因的表達(dá)與調(diào)控上詳解演示文稿目前一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)優(yōu)選基因的表達(dá)與調(diào)控上目前二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
組成性表達(dá)(constitutiveexpression)
適應(yīng)性表達(dá)(adaptiveexpression)二、基因表達(dá)的方式目前三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
1、組成型表達(dá):
指不大受環(huán)境變動(dòng)而變化的一類(lèi)基因表達(dá)。某些基因在一個(gè)個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá),通常被稱(chēng)為管家基因(housekeepinggene)。無(wú)論表達(dá)水平高低,管家基因較少受環(huán)境因素影響,而是在個(gè)體各個(gè)生長(zhǎng)階段的大多數(shù)或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。區(qū)別于其他基因,這類(lèi)基因表達(dá)被視為組成型表達(dá)(constitutiveexpression)。目前四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
2、適應(yīng)性表達(dá)指環(huán)境的變化容易使其表達(dá)水平變動(dòng)的一類(lèi)基因表達(dá)。應(yīng)環(huán)境條件變化基因表達(dá)水平增高的現(xiàn)象稱(chēng)為誘導(dǎo)(induction),這類(lèi)基因被稱(chēng)為可誘導(dǎo)的基因(induciblegene);相反,隨環(huán)境條件變化而基因表達(dá)水平降低的現(xiàn)象稱(chēng)為阻遏(repression),相應(yīng)的基因被稱(chēng)為可阻遏的基因(repressiblegene)。在一定機(jī)制控制下,功能上相關(guān)的一組基因,無(wú)論其為何種表達(dá)方式,均需協(xié)調(diào)一致、共同表達(dá),即為協(xié)調(diào)表達(dá)(coordinateexpression),這種調(diào)節(jié)稱(chēng)為協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)(coordinateregulation)。目前五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)三、基因表達(dá)的規(guī)律
——時(shí)間性和空間性1、時(shí)間特異性(temporalspecificity)按功能需要,某一特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生,稱(chēng)之為基因表達(dá)的時(shí)間特異性。多細(xì)胞生物基因表達(dá)的時(shí)間特異性又稱(chēng)階段特異性(stagespecificity)。
目前六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)2、空間特異性(spatialspecificity)基因表達(dá)伴隨時(shí)間順序所表現(xiàn)出的這種分布差異,實(shí)際上是由細(xì)胞在器官的分布決定的,所以空間特異性又稱(chēng)細(xì)胞或組織特異性(cellortissuespecificity)。在個(gè)體生長(zhǎng)全過(guò)程,某種基因產(chǎn)物在個(gè)體按不同組織空間順序出現(xiàn),稱(chēng)之為基因表達(dá)的空間特異性。目前七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義適應(yīng)環(huán)境、維持生長(zhǎng)和增殖(原核、真核)
維持個(gè)體發(fā)育與分化(真核)目前八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)五、基因表達(dá)調(diào)控的層次轉(zhuǎn)錄水平基因結(jié)構(gòu)活化轉(zhuǎn)錄起始(基因表達(dá)基本控制點(diǎn))轉(zhuǎn)錄后水平轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的轉(zhuǎn)運(yùn)翻譯水平翻譯調(diào)控翻譯后加工蛋白質(zhì)降解目前九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)六、轉(zhuǎn)錄水平----基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素
(一)特異DNA序列(二)調(diào)節(jié)蛋白(三)RNA聚合酶目前十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)原核生物的特異DNA序列
原核生物基因表達(dá)與調(diào)控是通過(guò)操縱子機(jī)制來(lái)實(shí)現(xiàn)的。操縱子
是由功能上相關(guān)聯(lián)的多個(gè)編碼序列(結(jié)構(gòu)基因)及其上游的調(diào)控序列成簇串聯(lián)在一起構(gòu)成的一個(gè)轉(zhuǎn)錄協(xié)調(diào)單位。調(diào)控序列包括操縱序列(O)、啟動(dòng)序列(P)和調(diào)節(jié)基因(I/R)等組件。
(一)特異DNA序列目前十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
操縱子調(diào)節(jié)基因啟動(dòng)序列操縱序列編碼序列(結(jié)構(gòu)基因)
表達(dá)
轉(zhuǎn)錄ICAPPOZYA阻遏蛋白結(jié)合部位RNA聚合酶結(jié)合部位啟動(dòng)序列(P):其中的-35區(qū)-10區(qū)是RNA聚合酶識(shí)別并結(jié)合的部位。多順?lè)醋觤RNA阻遏蛋白(負(fù)性調(diào)節(jié))
(正性調(diào)節(jié))多種蛋白質(zhì)目前十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)真核生物的特異DNA序列
真核生物基因組中含有可以調(diào)控自身基因表達(dá)的特異DNA序列,稱(chēng)為順式作用元件。
順式作用元件能夠被各種轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白特異識(shí)別和結(jié)合,從而影響基因表達(dá)活性。啟動(dòng)子順式作用元件又分增強(qiáng)子沉默子目前十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)1)順式作用元件(cis-actingelement)——可影響自身基因表達(dá)活性的DNA序列BADNA編碼序列轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)不同真核生物的順式作用元件中也會(huì)發(fā)現(xiàn)一些共有序列,如TATA盒、CAAT盒等,這些共有序列是RNA聚合酶或特異轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。目前十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)(二)調(diào)節(jié)蛋白原核生物的調(diào)節(jié)蛋白(3類(lèi))特異因子
決定RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)序列的特異識(shí)別和結(jié)合能力;
(如,RNA聚合酶的因子)阻遏蛋白
通過(guò)與操縱序列結(jié)合,阻遏基因轉(zhuǎn)錄,發(fā)揮負(fù)性調(diào)控作用;(由調(diào)節(jié)基因表達(dá)的阻遏蛋白)激活蛋白
與啟動(dòng)子上游DNA序列結(jié)合,促進(jìn)RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄活性,發(fā)揮正性調(diào)控作用。(如,CAP—分解代謝物基因活化蛋白)目前十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)2.真核生物的調(diào)節(jié)蛋白
反式作用因子
能直接或間接與順式作用元件相互作用,進(jìn)而調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的一類(lèi)調(diào)節(jié)蛋白,統(tǒng)稱(chēng)為反式(作用)因子。(trans-actingfactor)
按其功能不同,常有以下三類(lèi):
基本轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子共調(diào)節(jié)因子目前十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)(1)基本轉(zhuǎn)錄因子(TF)是指能夠在啟動(dòng)子部位與核心序列TATA盒和RNAPolⅡ結(jié)合,形成轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC)的一類(lèi)調(diào)節(jié)蛋白,以起動(dòng)轉(zhuǎn)錄。與RNA聚合酶(RNAPolⅡ)結(jié)合的(基本)轉(zhuǎn)錄因子有:TFⅡA,TFⅡB,TFⅡD,TFⅡE,TFⅡF,TFⅡH,TFⅡJ等。
首先由TFⅡD與啟動(dòng)子TATA盒結(jié)合,然后按一定的時(shí)空順序依次結(jié)合RNAPolⅡ和其它轉(zhuǎn)錄因子,形成PIC。目前十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)(2)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子
這類(lèi)調(diào)節(jié)蛋白能識(shí)別并結(jié)合轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游的調(diào)控序列或遠(yuǎn)端的增強(qiáng)子元件,通過(guò)蛋白質(zhì)-DNA相互作用而影響轉(zhuǎn)錄活性。起激活轉(zhuǎn)錄作用——轉(zhuǎn)錄激活因子;起阻遏轉(zhuǎn)錄作用——轉(zhuǎn)錄阻遏因子。(3)共調(diào)節(jié)因子另有一類(lèi)與轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子發(fā)生蛋白-蛋白相互作用,進(jìn)而影響它們的分子構(gòu)象,影響轉(zhuǎn)錄活性,稱(chēng)共調(diào)節(jié)因子。如果與轉(zhuǎn)錄激活因子有協(xié)同作用——共激活因子;與轉(zhuǎn)錄阻遏因子有協(xié)同作用——共阻遏因子。目前十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)7.1原核基因表達(dá)調(diào)控總論7.1.1原核基因表達(dá)調(diào)控的類(lèi)型與特點(diǎn)1、根據(jù)操縱子對(duì)調(diào)節(jié)蛋白(阻遏蛋白或激活蛋白)的應(yīng)答,正轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控調(diào)節(jié)基因RNA調(diào)節(jié)蛋白目前十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因激活蛋白正轉(zhuǎn)錄調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控如果在沒(méi)有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時(shí)基因是關(guān)閉的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因活性就被開(kāi)啟,這樣的調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控。目前二十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控在沒(méi)有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時(shí)基因是表達(dá)的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因表達(dá)活性便被關(guān)閉,這樣的調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控。目前二十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
根據(jù)輔因子(小分子)結(jié)合后調(diào)控效果,可分:
開(kāi)啟調(diào)控系統(tǒng)中結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄活性——誘導(dǎo)關(guān)閉調(diào)控系統(tǒng)中結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄活性——阻遏操縱子調(diào)控系統(tǒng)的基本類(lèi)型可誘導(dǎo)負(fù)控制系統(tǒng)可誘導(dǎo)正控制系統(tǒng)可阻遏負(fù)控制系統(tǒng)可阻遏正控制系統(tǒng)目前二十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前二十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)幾個(gè)概念:誘導(dǎo)物(inducer):指當(dāng)作用于細(xì)胞群體時(shí),通過(guò)誘導(dǎo)機(jī)制、能增加特定基因轉(zhuǎn)錄的mRNA含量的一種化學(xué)因子或物理因子,輔阻遏物(corepressor):一種能與阻遏蛋白形成功能阻遏物,而使合成代謝的操縱子受到阻遏的代謝終產(chǎn)物。
目前二十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)正調(diào)控與負(fù)調(diào)控并非互相排斥的兩種機(jī)制,而是生物體適應(yīng)環(huán)境的需要,有的系統(tǒng)既有正調(diào)控又有負(fù)調(diào)控;
原核生物以負(fù)調(diào)控為主,真核生物以正調(diào)控為主;
降解代謝途徑中既有正調(diào)控又有負(fù)調(diào)控;合成代謝途徑中一般以負(fù)調(diào)控來(lái)控制產(chǎn)物自身的合成。
目前二十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)可誘導(dǎo)調(diào)節(jié)可阻遏調(diào)節(jié)7.1.2原核基因表達(dá)調(diào)控的主要特點(diǎn)7.1.3弱化子對(duì)基因活性的影響7.1.4降解物對(duì)基因活性的影響7.1.5細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)目前二十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)1、DiscoveryofOperon
1961年,F.Jacob&J.Monod提出,此后不斷完善。獲1965年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)1940年,Monod發(fā)現(xiàn):細(xì)菌在含葡萄糖和乳糖的培養(yǎng)基上生長(zhǎng)時(shí),細(xì)菌先利用葡萄糖,葡萄糖用完后,才利用乳糖;在糖源轉(zhuǎn)變期,細(xì)菌的生長(zhǎng)會(huì)出現(xiàn)停頓。即產(chǎn)生細(xì)胞中存在兩種酶,即組成酶與誘導(dǎo)酶1947年,報(bào)告:“酶的適應(yīng)現(xiàn)象及其在細(xì)胞分化中的意義”FrancisJacob
JacquesMonod
7.2乳糖操縱子與負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)目前二十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)1951年,Monod與Jacob合作,發(fā)現(xiàn)兩對(duì)基因:Z基因:與合成β-半乳糖苷酶有關(guān);I基因:決定細(xì)胞對(duì)誘導(dǎo)物的反應(yīng)。Szilard:I基因決定阻遏物的合成,當(dāng)阻遏物存在時(shí),酶無(wú)法合成,只有有誘導(dǎo)物存在,才能去掉該阻遏物。
Jacob:結(jié)構(gòu)基因旁有開(kāi)關(guān)基因(操縱基因),阻遏物通過(guò)與開(kāi)關(guān)基因的結(jié)合,控制結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)。目前二十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)操縱子是一種完整的具有特定功能的細(xì)菌基因表達(dá)和調(diào)節(jié)的單位,包括調(diào)節(jié)基因,操縱位點(diǎn),結(jié)構(gòu)基因,組成一個(gè)控制單元。結(jié)構(gòu)基因:產(chǎn)生mRNA,合成蛋白質(zhì)操縱位點(diǎn)operator:?jiǎn)?dòng)子結(jié)合位點(diǎn)調(diào)節(jié)基因:產(chǎn)生調(diào)節(jié)蛋白(與操縱位點(diǎn)結(jié)合)→結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)物存在時(shí),可與阻遏蛋白結(jié)合→結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄2、操縱子的定義目前二十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)7.2.1酶的誘導(dǎo)——lac體系受調(diào)控的證據(jù)目前三十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)細(xì)菌對(duì)乳糖的利用及其相關(guān)的酶:
乳糖(在通透酶作用下進(jìn)入細(xì)菌)
β-半乳糖苷酶
別構(gòu)乳糖
β-半乳糖苷酶
葡萄糖+半乳糖
β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶目前三十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)1)lac操縱子的本底水平(basallevel)表達(dá)有兩個(gè)矛盾是操縱子理論所不能解釋的:①誘導(dǎo)物需要穿過(guò)細(xì)胞膜才能與阻遏物結(jié)合,而轉(zhuǎn)運(yùn)誘導(dǎo)物需要透過(guò)酶,后者的合成有需要誘導(dǎo)。②真正的誘導(dǎo)物是異構(gòu)乳糖而非乳糖,前者是在β-半乳糖甘酶的催化下由乳糖形成的,因此,需要有β-半乳糖甘酶的預(yù)先存在。一些誘導(dǎo)物可以在透過(guò)酶不存在時(shí)進(jìn)入細(xì)胞?一些透過(guò)酶可以在沒(méi)有誘導(dǎo)物的情況下合成?解釋?zhuān)罕镜姿降慕M成型合成:非誘導(dǎo)狀態(tài)下有少量的lacmRNA合成。目前三十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)分解底物的酶只有在底物存在時(shí)才出現(xiàn)!無(wú)乳糖時(shí),幾個(gè)b-gal/cell
加入乳糖時(shí),5000個(gè)
乳糖的誘導(dǎo)作用是由酶前體轉(zhuǎn)化而來(lái),還是誘導(dǎo)新酶合成?培養(yǎng)基(35S-aa,無(wú)乳糖)→E.coli繁殖→培養(yǎng)基(無(wú)35S-aa,加入乳糖)→β-gal(無(wú)35S)目前三十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)大腸桿菌對(duì)乳糖的反應(yīng)
培養(yǎng)基:甘油按照l(shuí)ac操縱子本底水平的表達(dá),每個(gè)細(xì)胞內(nèi)有幾個(gè)分子的β-半乳糖苷酶和β-半乳糖苷透過(guò)酶;培養(yǎng)基:加入乳糖少量乳糖透過(guò)酶進(jìn)入細(xì)胞β-半乳糖苷酶異構(gòu)乳糖誘導(dǎo)物誘導(dǎo)lacmRNA的生物合成大量乳糖進(jìn)入細(xì)胞多數(shù)被降解為葡萄糖和半乳糖(碳源和能源)異構(gòu)乳糖目前三十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)乙?;D(zhuǎn)移酶半乳糖苷透性酶?-半乳糖苷酶操縱位點(diǎn)調(diào)節(jié)基因7.2.2lacOperon的模型及其影響因子目前三十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)Z編碼β-半乳糖苷酶:將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖Y編碼β-半乳糖苷透過(guò)酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過(guò)大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。A編碼β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶:乙酰輔酶A上的乙酰基轉(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。目前三十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒(méi)有乳糖存在時(shí)阻遏蛋白的調(diào)節(jié)阻遏基因1.乳糖操縱子調(diào)控模型目前三十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時(shí)IDNAZYAOPpol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄mRNA乳糖別構(gòu)乳糖β-半乳糖苷酶目前三十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)(1)mRNA分子的啟動(dòng)子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動(dòng)子區(qū)(P),不能單獨(dú)起動(dòng)合成β-半乳糖苷酶和透過(guò)酶的生理過(guò)程。2.乳糖操縱子調(diào)控機(jī)制阻遏物lacI基因產(chǎn)物及功能
lac操縱子阻遏物mRNA是由弱啟動(dòng)子控制下組成型合成的,每個(gè)細(xì)胞中有5-10個(gè)阻遏物分子。當(dāng)I基因由弱啟動(dòng)子突變成強(qiáng)啟動(dòng)子,細(xì)胞內(nèi)就不可能產(chǎn)生足夠的誘導(dǎo)物來(lái)克服阻遏狀態(tài),整個(gè)lac操縱子在這些突變體中就不可誘導(dǎo)。目前三十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)RNA聚合酶結(jié)合部位阻遏物結(jié)合部位(2)操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)。目前四十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)操縱位點(diǎn)的回文序列目前四十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)(3)當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時(shí),lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。
目前四十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)(4)誘導(dǎo)物通過(guò)與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。當(dāng)有誘導(dǎo)物存在時(shí),操縱基因區(qū)沒(méi)有被阻遏物占據(jù),所以啟動(dòng)子能夠順利起始mRNA的合成。目前四十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)阻遏蛋白單體的結(jié)構(gòu)阻遏蛋白單體的三級(jí)結(jié)構(gòu)目前四十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前四十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)乳糖(5)誘導(dǎo)物不是乳糖乳糖代謝生成lac誘導(dǎo)物Allolctose異構(gòu)乳糖別構(gòu)乳糖β-半乳糖苷酶目前四十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)IPTG,異丙基-β–D-硫代半乳糖苷TMG,巰甲基半乳糖苷ONPG,O-硝基半乳糖苷在研究誘導(dǎo)作用時(shí),很少使用乳糖安慰誘導(dǎo)物(gratuitousinducer):如果某種物質(zhì)能夠促使細(xì)菌產(chǎn)生酶而本身又不被分解,這種物質(zhì)被稱(chēng)為安慰誘導(dǎo)物,如:目前四十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前四十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)α-complementation
lacZ△M15基因是缺失了編碼β-半乳糖苷酶中第11-41個(gè)氨基酸的lacZ基因,無(wú)酶學(xué)活性。對(duì)于只編碼N-端140個(gè)氨基酸的lacZ基因(稱(chēng)為lacZ'),其產(chǎn)物也沒(méi)有酶學(xué)活性。但這兩個(gè)無(wú)酶學(xué)活性的產(chǎn)物混合在一起時(shí),可恢復(fù)
β-半乳糖苷酶的活性,實(shí)現(xiàn)基因內(nèi)互補(bǔ)。在lacZ'
編碼區(qū)上游插入一小段DNA片段(如51個(gè)堿基對(duì)的多克隆位點(diǎn)),不影響β-半乳糖苷酶的功能內(nèi)互補(bǔ)。但是,若在該DNA小片段中再插入一個(gè)片段,將幾乎不可避免地導(dǎo)致產(chǎn)生無(wú)α-互補(bǔ)能力的β-半乳糖苷酶片段。利用這一互補(bǔ)性質(zhì),可用于篩選在載體上插入了外源片段的重組質(zhì)粒。在相應(yīng)的載體系統(tǒng)中,lacZ△M15放在F質(zhì)粒上,隨宿主傳代;lacZ'放在載體上,作為篩選標(biāo)記。XL1-Blue菌株基因型:endA1gyrA96(nalR)thi-1recA1relA1lacglnV44F‘[Tn10proAB+lacIqΔ(lacZ)M15]hsdR17(rK-mK+)目前四十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)+glucose-glucoseTime(hr)Unitsofb-galactosidase+lactoseGlucoseadded(6)葡萄糖對(duì)lac操縱子的影響
代謝物阻遏效應(yīng)實(shí)驗(yàn),在Lac+Glu培養(yǎng)基上
E.coli只利用G,只有G
耗盡時(shí),才會(huì)利用lac葡萄糖抑制lacmRNA的轉(zhuǎn)錄:可阻止誘導(dǎo)物引起的阻遏物失活效應(yīng),僅去掉阻遏物并不能啟動(dòng)lac基因表達(dá),有其它因素參與分解代謝阻遏(cataboliterepression)目前五十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)只有當(dāng)以乳糖為唯一碳源時(shí),β-半乳糖苷酶的合成才增加。但是在以乳糖和葡萄糖為碳源時(shí),如果加入cAMP,β-半乳糖苷酶的合成速率也會(huì)大大提高,可達(dá)到只用乳糖為碳源時(shí)的水平。這說(shuō)明,cell內(nèi)cAMP的濃度能影響到β-半乳糖苷酶的合成速率。葡萄糖對(duì)lac操縱子表達(dá)的抑制是間接的目前五十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)ATP腺甘酸環(huán)化酶cAMP(環(huán)腺甘酸)
大腸桿菌中:無(wú)葡萄糖,cAMP濃度高;有葡萄糖,cAMP濃度低cAMP(環(huán)化腺苷一磷酸,cyclicAMP)1965年,B.Magasonik發(fā)現(xiàn)在大腸桿菌中也含有cAMP,而且菌株內(nèi)cAMP的含量常隨細(xì)胞的生理狀態(tài)發(fā)生變化,即當(dāng)細(xì)胞處于碳源饑餓條件下,cAMP水平顯著提高,反之.在細(xì)胞生長(zhǎng)的培養(yǎng)基中含有大量葡萄糖時(shí),cAMP水平明顯降低;目前五十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)腺苷環(huán)化酶腺苷酸環(huán)化酶位于細(xì)胞膜上,其活性與葡萄糖運(yùn)輸?shù)拿赣嘘P(guān),因此cAMP調(diào)控乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等其他糖類(lèi)代謝有關(guān)的酶。目前五十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前五十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
葡萄糖的降解是通過(guò)cAMP與CAP結(jié)合起作用。
CAP,cataboliteactivatorprotein,由crp編碼CRP,catabolitereceptorprotein代謝物激活蛋白(CAP)/環(huán)腺甘酸受體蛋白(CRP)CAP激活轉(zhuǎn)錄?(1)可能直接和RNAPol相互作用;
(2)作用于DNA,改變其結(jié)構(gòu),從而幫助RNAPol結(jié)合。目前五十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)CAP結(jié)合位點(diǎn)CAP為二聚體,45KD,被cAMP激活結(jié)合位點(diǎn)~22bpI-70~-50II-50~-40目前五十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)CAP的結(jié)合對(duì)DNA構(gòu)型的影響DNA彎曲彎曲點(diǎn)位于CAP結(jié)合位點(diǎn)二重對(duì)稱(chēng)的中心彎曲使CAP能與啟動(dòng)子上的RNApol接觸目前五十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)++++轉(zhuǎn)錄無(wú)葡萄糖,cAMP濃度高時(shí)促進(jìn)轉(zhuǎn)錄有葡萄糖,cAMP濃度低時(shí)不促進(jìn)轉(zhuǎn)錄ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAPCAP的正調(diào)控目前五十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)當(dāng)阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CAP對(duì)該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用如無(wú)CAP存在,即使沒(méi)有阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,操縱子仍無(wú)轉(zhuǎn)錄活性。cAMP—CAP復(fù)合物與啟動(dòng)子區(qū)的結(jié)合是轉(zhuǎn)錄起始所必需的。協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)葡萄糖對(duì)lac
操縱子的阻遏作用稱(chēng)分解代謝阻遏(catabolicrepression)。
單純?nèi)樘谴嬖跁r(shí),細(xì)菌利用乳糖作碳源;若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時(shí),細(xì)菌首先利用葡萄糖。目前五十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)ZYAOPDNA
調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動(dòng)序列操縱序列
結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:通透酶A:乙酰基轉(zhuǎn)移酶cAMP—CAP復(fù)合物目前六十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)ThelacOperon:
WhenGlucoseIsPresentButNotLactoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRNAPol.RepressorRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveComeon,letmethroughNowayJose!CAP目前六十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)TheLacOperon:
WhenGlucoseAndLactoseArePresentRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveCAPLacRepressorRepressorXRNAPol.RNAPol.Great,Icantranscribe!Sometranscriptionoccurs,butataslowrateThislactosehasbentmeoutofshape目前六十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)ThelacOperon:
WhenLactoseIsPresentButNotGlucoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveCAPcAMPLacRepressorRepressorXThislactosehasbentmeoutofshapeCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RNAPol.Yipee…!目前六十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)TheLacOperon:
WhenNeitherLactoseNorGlucoseIsPresentRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingCAPcAMPCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveRepressorSTOPRighttherePolymeraseAlright,I’mofftotheraces...Comeon,letmethrough!目前六十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)SummaryoflacoperonregulationGlucosecAMPLactoseTranscriptionoflacmRNAHighLowPresentlowrateofexpressionHighLowAbsentessentiallynoneLowHighAbsentessentiallynoneLowHighPresenthighrateofexpression目前六十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)lacoperon的其它問(wèn)題lacoperon的功能是在正負(fù)兩個(gè)調(diào)控體系的協(xié)調(diào)作用(coordinateregulation)下實(shí)現(xiàn)的。阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CAP不發(fā)揮作用;如沒(méi)有CAP加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄,即使阻遏蛋白從P上解聚仍無(wú)轉(zhuǎn)錄活性CAP組成型合成,所以cAMP-CAP復(fù)合物取決于cAMP含量腺苷酸環(huán)化酶位于細(xì)胞膜上,其活性與葡萄糖運(yùn)輸?shù)拿赣嘘P(guān),因此cAMP-CAP調(diào)控乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等糖類(lèi)代謝有關(guān)的酶降解物敏感型操縱子:只要有葡萄糖存在,這些操縱子就不表達(dá)目前六十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)2.A基因及其生理功能編碼b-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶,使半乳糖苷乙?;?。該酶不參與乳糖代謝!生理意義:在細(xì)胞中有許多能被半乳糖苷酶降解的半乳糖苷類(lèi)物質(zhì),其分解產(chǎn)物不能進(jìn)一步代謝,積累,抑制細(xì)胞生長(zhǎng)。半乳糖苷乙?;?,即無(wú)毒.所以lacA雖不在乳糖降解中起作用,但可抑制有害物質(zhì)的積累3.lac基因產(chǎn)物數(shù)量,1:0.5:0.2
不同酶的數(shù)量差異,是由于在翻譯水平上的調(diào)節(jié).方式有二:核糖體脫離;多順?lè)醋拥牟顒e性翻譯
內(nèi)切酶作用:在lacmRNA分子內(nèi)部,a基因比z基因更易受內(nèi)切酶作用目前六十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)總結(jié)---乳糖操縱子的作用機(jī)制1、乳糖操縱子的組成:大腸桿菌乳糖操縱子含Z、Y、A三個(gè)結(jié)構(gòu)基因,分別編碼半乳糖苷酶、透酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶,此外還有一個(gè)操縱序列O,一個(gè)啟動(dòng)子P和一個(gè)調(diào)節(jié)基因I。2、阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié):沒(méi)有乳糖存在時(shí),I基因編碼的阻遏蛋白結(jié)合于操縱序列O處,乳糖操縱子處于阻遏狀態(tài),不能合成分解乳糖的三種酶;有乳糖存在時(shí),乳糖作為誘導(dǎo)物誘導(dǎo)阻遏蛋白變構(gòu),不能結(jié)合于操縱序列,乳糖操縱子被誘導(dǎo)開(kāi)放合成分解乳糖的三種酶。所以,乳糖操縱子的這種調(diào)控機(jī)制為可誘導(dǎo)的負(fù)調(diào)控。目前六十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)3、CAP的正調(diào)節(jié):在啟動(dòng)子上游有CAP結(jié)合位點(diǎn),當(dāng)大腸桿菌從以葡萄糖為碳源的環(huán)境轉(zhuǎn)變?yōu)橐匀樘菫樘荚吹沫h(huán)境時(shí),cAMP濃度升高,與CAP結(jié)合,使CAP發(fā)生變構(gòu),CAP結(jié)合于乳糖操縱子啟動(dòng)序列附近的CAP結(jié)合位點(diǎn),激活RNA聚合酶活性,促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄,調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合于操縱子后促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄,對(duì)乳糖操縱子實(shí)行正調(diào)控,加速合成分解乳糖的三種酶。4、協(xié)調(diào)調(diào)節(jié):乳糖操縱子中的I基因編碼的阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控與CAP的正調(diào)控兩種機(jī)制,互相協(xié)調(diào)、互相制約??偨Y(jié)---乳糖操縱子的作用機(jī)制目前六十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)7.4其他操縱子
GalactoseOperon
ArabinoseOperon目前七十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)半乳糖操縱子大腸桿菌半乳糖操縱子(galactoseoperon)包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:
異構(gòu)酶(UDP-galactose-4epimerase,galE),半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galactosetransferase,galT)半乳糖激酶(galactosekinase,galk)。
目前七十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)MapoftheE.coligaloperonandnucleotidesequenceoftheregulatoryregion3個(gè)酶的作用:使半乳糖變成葡萄糖-1-磷酸。galR與galE、T、K及操縱區(qū)O等離得很遠(yuǎn),而galR產(chǎn)物對(duì)galO的作用與lacI-lacO的作用相同。目前七十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)gal操縱子的特點(diǎn):①它有兩個(gè)啟動(dòng)子,其mRNA可從兩個(gè)不同的起始點(diǎn)開(kāi)始轉(zhuǎn)錄;②它有兩個(gè)O區(qū),一個(gè)在P區(qū)上游-67--53,另一個(gè)在結(jié)構(gòu)基因galE內(nèi)部。CAP,cataboliteactivatorprotein,由crp編碼CRP,catabolitereceptorprotein代謝物激活蛋白(CAP)/環(huán)腺甘酸受體蛋白(CRP)目前七十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)因?yàn)榘肴樘堑睦眯时绕咸烟堑?,人們猜想葡萄糖存在時(shí)半乳糖操縱子不被誘導(dǎo),但實(shí)際上有葡萄糖存在時(shí),gal操縱子仍可被誘導(dǎo)?,F(xiàn)已分離到一些突變株,其中一類(lèi)突變株能在不含葡萄糖的培養(yǎng)基中高水平合成半乳糖代謝酶類(lèi)(gal結(jié)構(gòu)基因高效表達(dá));而另一類(lèi)突變株中g(shù)al基因的表達(dá)完全依賴(lài)于葡萄糖,培養(yǎng)基中如無(wú)葡萄糖存在,這些細(xì)菌的gal基因不表達(dá),不合成半乳糖代謝酶類(lèi)。目前七十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)分析gal操縱子P-O區(qū)的DNA序列發(fā)現(xiàn),該操縱子確實(shí)存在兩個(gè)相距僅5bp的啟動(dòng)子,可以分別起始mRNA的合成。每個(gè)啟動(dòng)子擁有各自的RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)S1和S2。從S1起始的轉(zhuǎn)錄只有在培養(yǎng)基中無(wú)葡萄糖時(shí),才能順利進(jìn)行,RNA聚合酶與S1的結(jié)合需要半乳糖、CAP和較高濃度的cAMP。從S2起始的轉(zhuǎn)錄則完全依賴(lài)于葡萄糖,高水平的cAMP-CAP能抑制由這個(gè)啟動(dòng)子起始的轉(zhuǎn)錄。當(dāng)有cAMP-CAP時(shí),轉(zhuǎn)錄從S1開(kāi)始,當(dāng)無(wú)cAMP-CAP時(shí),轉(zhuǎn)錄從S2開(kāi)始。1.cAMP-CRP對(duì)gal啟動(dòng)子的作用目前七十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)為什么gal操縱子需要兩個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)?半乳糖不僅可以作為唯一碳源供細(xì)胞生長(zhǎng),而且與之相關(guān)的物質(zhì)--尿苷二磷酸半乳糖(UDP-gal)是大腸桿菌細(xì)胞壁合成的前體。在沒(méi)有外源半乳糖的情況下,UDP-gal是通過(guò)半乳糖差向異構(gòu)酶的作用由UDP-葡萄糖合成的,該酶是galE基因的產(chǎn)物。異構(gòu)酶(UDP-galactose-4epimerase,galE),目前七十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)生長(zhǎng)過(guò)程中的所有時(shí)間里細(xì)胞必須能夠合成差向異構(gòu)酶?,F(xiàn)在設(shè)想只有S1一個(gè)啟動(dòng)子,那么由于這個(gè)啟動(dòng)子的活性依賴(lài)于cAMP-CRP,當(dāng)培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時(shí)就有能合成異構(gòu)酶。假如唯一的啟動(dòng)子是S2,那么,即使在葡萄糖存在的情況下,半乳糖也將使操縱子處于充分誘導(dǎo)狀態(tài),這無(wú)疑是一種浪費(fèi)。無(wú)論從必要性或經(jīng)濟(jì)性考慮,都需要一個(gè)不依賴(lài)于cAMP-CAP的啟動(dòng)子(S1)對(duì)高水平合成進(jìn)行調(diào)節(jié)。目前七十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
在E.coli中阿拉伯糖的降解需要3個(gè)基因:araB、araA和araD,形成一個(gè)基因簇,簡(jiǎn)寫(xiě)為araBAD
分別編碼阿拉伯糖代謝需要的三種酶:核酮糖激酶(ribulosekinase),阿拉伯糖異構(gòu)酶(arabinoseisomerase)核酮糖-5-磷酸差向異構(gòu)酶(ribulose-5-phosphateeimerase)7.4.2阿拉伯糖操縱子目前七十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)araBAD和araC基因的轉(zhuǎn)錄是以相反的方向進(jìn)行的。在標(biāo)準(zhǔn)的遺傳學(xué)圖譜上,araBAD基因簇從啟動(dòng)子PBAD開(kāi)始向右進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,而araC基因則是從Pc向左轉(zhuǎn)錄。復(fù)合啟動(dòng)子區(qū)主要有:1、PBAD區(qū):AraBAD啟動(dòng)子區(qū)2、araC位點(diǎn):C蛋白·阿拉伯糖復(fù)合物與操縱子結(jié)合區(qū)3、-280區(qū):是C蛋白與操縱子結(jié)合區(qū)目前七十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)結(jié)構(gòu):具有正負(fù)調(diào)節(jié)功能的操縱子與araB、araA和araD這3結(jié)構(gòu)基因相鄰的是一個(gè)復(fù)合啟動(dòng)子區(qū)和一個(gè)調(diào)節(jié)基因C,由調(diào)節(jié)基因C合成的AraC蛋白是一個(gè)自我調(diào)節(jié)蛋白(autoregulatedprotein),它既是ara操縱子的正調(diào)節(jié)蛋白,又是ara操縱子的負(fù)調(diào)節(jié)蛋白。目前八十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)1.阿拉伯糖操縱子的調(diào)節(jié)機(jī)制目前八十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前八十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)ara操縱子的調(diào)控有三個(gè)特點(diǎn):第一,araC表達(dá)受到AraC的自動(dòng)調(diào)控。第二,AraC既可充當(dāng)阻遏物,也可作為激活劑。第三,AraC與CAP結(jié)合可充分誘導(dǎo)ara操縱子。
目前八十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
AraC蛋白作為PBAD活性正、負(fù)調(diào)節(jié)因子的雙重功能是通過(guò)該蛋白的兩種異構(gòu)體來(lái)實(shí)現(xiàn)的。Pr是起阻遏作用的形式,而Pi是起誘導(dǎo)作用的形式,它通過(guò)與PBAD啟動(dòng)子結(jié)合進(jìn)行調(diào)節(jié)。在沒(méi)有阿拉伯糖時(shí),Pr形式占優(yōu)勢(shì);一旦有阿拉伯糖存在,它就能夠與AraC蛋白結(jié)合,使平衡趨向于Pi形式。這樣,阿拉伯糖的誘導(dǎo)作用就可以解釋為阿拉伯糖與Pr的結(jié)合,使Pr離開(kāi)它的結(jié)合位點(diǎn),然后,產(chǎn)生大量的Pi,并與啟動(dòng)子結(jié)合。目前八十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
因?yàn)榕囵B(yǎng)基中含有葡萄糖,所以cAMP-CAP沒(méi)有與操縱區(qū)位點(diǎn)相結(jié)合,AraC蛋白處于Pr形式并與A位點(diǎn)結(jié)合,RNA聚合酶很少再與Pc結(jié)合,araC基因雖然仍有轉(zhuǎn)錄,但受到抑制,只有少量AraC蛋白形成,整個(gè)系統(tǒng)幾乎處于靜止?fàn)顟B(tài)。沒(méi)有葡萄糖,也沒(méi)有阿拉伯糖,因?yàn)闆](méi)有誘導(dǎo)物,盡管有cAMP-CAP與操縱區(qū)位點(diǎn)相結(jié)合,AraC蛋白仍以Pr形式為主,無(wú)法與操縱區(qū)B位點(diǎn)相結(jié)合,無(wú)araBADmRNA轉(zhuǎn)錄。無(wú)葡萄糖,有阿拉伯糖時(shí),大量araC基因產(chǎn)物以Pi形式存在,并分別與操縱區(qū)B、A位點(diǎn)相結(jié)合,在cAMP-CAP的共同作用下,araC和araBAD基因大量表達(dá),操縱子充分激活。目前八十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)araC的表達(dá)受到自身產(chǎn)物AraC的自動(dòng)調(diào)控。當(dāng)沒(méi)有阿拉伯糖時(shí),AraC起著一個(gè)轉(zhuǎn)錄阻遏物的作用。細(xì)胞中AraC蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)水平的測(cè)量表明,阻遏araC轉(zhuǎn)錄大約需要40個(gè)AraC。因此當(dāng)AraC蛋白水平低時(shí)(就是說(shuō)在細(xì)胞剛分裂之后),araC將表達(dá)直至存在足夠的AraC去阻遏它的轉(zhuǎn)錄。
2.阿拉伯糖操縱子的自主調(diào)節(jié)目前八十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)阿拉伯糖的作用象AraC的一個(gè)調(diào)控器,可將AraC由一個(gè)阻遏物轉(zhuǎn)換為一個(gè)激活劑。阿拉伯糖與AraC結(jié)合似乎改變了AraC同源二聚體化特性和促進(jìn)了AraC-CAP復(fù)合物的形成。在這樣的條件下,AraC-阿拉伯糖的作用象是一個(gè)轉(zhuǎn)錄激活劑,這正是CAP-cAMP誘導(dǎo)araB,araA,araD轉(zhuǎn)錄所需要的。目前八十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)當(dāng)由于araBAD編碼的蛋白質(zhì)的代謝使得阿拉伯糖水平下降時(shí),AraC又轉(zhuǎn)換成一個(gè)阻遏物,同時(shí)araBAD轉(zhuǎn)錄減少,此時(shí)盡管CAP-cAMP復(fù)合物仍然存在于細(xì)胞中。有趣的是,當(dāng)葡萄糖和阿拉伯糖都很豐富時(shí),ara操縱子被阻遏,這個(gè)結(jié)果表明araBAD誘導(dǎo)與AraC-阿拉伯糖和CAP-cAMP復(fù)合物都有關(guān)。目前八十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前八十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)7.3trpoperon與負(fù)調(diào)控阻遏系統(tǒng)目前九十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
lac,
gal和ara操縱子是編碼分解代謝途徑酶系的操縱子,負(fù)責(zé)碳源(例如乳糖和阿拉伯糖等)的分解利用,這些操縱子的表達(dá)受相應(yīng)碳源的誘導(dǎo)。在細(xì)菌中還有負(fù)責(zé)一些物質(zhì)合成代謝的操縱子,例如色氨酸操縱子(tryptophanoperon,trpoperon)就是負(fù)責(zé)色氨酸合成的操縱子。目前九十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)Trpoperon生物細(xì)胞中的氨基酸合成,也受操縱子的調(diào)節(jié)。細(xì)胞需要某種氨基酸時(shí),其基因即表達(dá),不需要時(shí)基因關(guān)閉,達(dá)到經(jīng)濟(jì)的原則。目前九十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
由于trp體系參與生物合成而不是降解,它不受葡萄糖或cAMP-CRP的調(diào)控。色氨酸的合成主要分5步完成,有7個(gè)基因參與整個(gè)合成過(guò)程。trpE和trpG編碼鄰氨基苯甲酸合酶,trpD編碼鄰氨基苯甲酸磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶,trpF編碼異構(gòu)酶,trpC編碼吲哚甘油磷酸合酶,trpA和trpB則分別編碼色氨酸合酶的α和β亞基。一、色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)目前九十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)催化分枝酸轉(zhuǎn)變?yōu)樯彼岬拿敢?、色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):(1)trpR和trpABCDE不連鎖;
(2)操縱基因在啟動(dòng)子內(nèi)
(3)有衰減子(attenuator)/弱化子
(4)啟動(dòng)子和結(jié)構(gòu)基因不直接相連,二者被前導(dǎo)序列(Leader)所隔開(kāi)目前九十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)trpoperon的阻遏系統(tǒng)TrpR四聚體目前九十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)阻遏蛋白+trp
→有活性的阻遏物SNE299+trpO→不轉(zhuǎn)錄目前九十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)2阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)trpO-21~+1,反向重復(fù)序列trpP-40~+18活性阻遏物與trpO的結(jié)合與RNApol與啟動(dòng)子的結(jié)合發(fā)生競(jìng)爭(zhēng)目前九十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)3阻遏系統(tǒng)主管轉(zhuǎn)錄是否啟動(dòng),低濃度Trp時(shí),mRNA起始合成
粗調(diào)開(kāi)關(guān)目前九十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)3阻遏系統(tǒng)在trpmRNA5‘端trpE基因的起始密碼前有一個(gè)長(zhǎng)162bp的mRNA片段,如果其中123~150位堿基序列缺失,trp基因表達(dá)可提高6-10倍,而且無(wú)論是在阻遏細(xì)胞內(nèi)還是在永久性突變的細(xì)胞內(nèi)都一樣。當(dāng)mRNA合成起始以后,除非培養(yǎng)基中完全沒(méi)有色氨酸,轉(zhuǎn)錄總是在這個(gè)區(qū)域終止,產(chǎn)生一個(gè)僅有140個(gè)核苷酸的RNA分子,終止trp基因轉(zhuǎn)錄。162bp的片段----前導(dǎo)區(qū)123~150區(qū)序列----弱化子終止的轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)區(qū)域稱(chēng)為弱化子(衰減子)目前九十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)1)弱化子:
DNA中可導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄過(guò)早終止的一段核甘酸序列(123-150區(qū))。123~150目前一百頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)實(shí)驗(yàn)表明弱化作用需要負(fù)載tRNATrp參與,意味著前導(dǎo)序列的某些部分被翻譯了。分析前導(dǎo)序列發(fā)現(xiàn),它包括起始密碼子AUG和終止密碼子UGA;如果翻譯起始于AUG,應(yīng)該產(chǎn)生一個(gè)含有14個(gè)氨基酸的多肽。這個(gè)假設(shè)的多肽(實(shí)際未觀察到)稱(chēng)為前導(dǎo)肽。目前一百零一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)前導(dǎo)序列具有一個(gè)非常有意義的特點(diǎn),在其第10和第11位上有相鄰的兩個(gè)色氨酸密碼子。組氨酸操縱子中,也具有弱化子,也具有一個(gè)類(lèi)似的能編碼前導(dǎo)肽的堿基序列,此序列中含有7個(gè)相鄰的組氨酸密碼子。苯丙氨酸操縱子中同樣存在弱化子結(jié)構(gòu),其前導(dǎo)序列中也有7個(gè)苯丙氨酸密碼子。這些密碼子參與了trp及其他操縱子的轉(zhuǎn)錄弱化機(jī)制。目前一百零二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前一百零三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)
POE4321LDNARNAATGTGA2trpcodons1432mRNA前導(dǎo)區(qū)的序列分析
trp前導(dǎo)區(qū)的堿基序列已經(jīng)全部測(cè)定,引人注目的是其中4個(gè)分別以1、2、3和4表示的片段能以?xún)煞N不同的方式進(jìn)行堿基配對(duì),有時(shí)以1-2和3-4配對(duì),有時(shí)只以2-3方式互補(bǔ)配對(duì)。RNaseT1降解實(shí)驗(yàn)(此酶不能水解配對(duì)的RNA)表明,純化的trp前導(dǎo)序列中確有1-2和3-4的配對(duì)方式,由此定位的3-4配對(duì)區(qū)正好位于終止密碼子的識(shí)別區(qū),當(dāng)這個(gè)區(qū)域發(fā)生破壞自我配對(duì)的堿基突變時(shí)有利于轉(zhuǎn)錄的繼續(xù)進(jìn)行。目前一百零四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)UUUU……UUUU……調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因trpROP前導(dǎo)序列弱化子區(qū)域UUUU……前導(dǎo)mRNA1234弱化子結(jié)構(gòu)第10、11密碼子為trp密碼子終止密碼子14aa前導(dǎo)肽編碼區(qū):
包含序列1形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)能力強(qiáng)弱:序列1/2>序列2/3>序列3/4
trp密碼子UUUU……目前一百零五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)Terminator
研究引起終止的mRNA堿基序列,發(fā)現(xiàn)該區(qū)mRNA通過(guò)自我配對(duì)可以形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu),有典型的終止子特點(diǎn)。目前一百零六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)UUUU……34UUUU3’34核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA1.當(dāng)色氨酸濃度高時(shí)轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制125’trp密碼子弱化子結(jié)構(gòu)就是終止子可使轉(zhuǎn)錄前導(dǎo)DNAUUUU3’RNA聚合酶終止目前一百零七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)UUUU……342423UUUU……核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA15’trp密碼子
結(jié)構(gòu)基因前導(dǎo)DNARNA聚合酶2.當(dāng)色氨酸濃度低時(shí)Trp合成酶系相關(guān)結(jié)構(gòu)基因被轉(zhuǎn)錄序列3、4不能形成弱化子結(jié)構(gòu)目前一百零八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)弱化子對(duì)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵空間結(jié)構(gòu),10thand11thcodonsencodethetrpresidues(rareAA)時(shí)間,核糖體停頓在2個(gè)Trp密碼子上時(shí),產(chǎn)生延宕(delay
),此時(shí)4區(qū)未轉(zhuǎn)錄出來(lái)Theleaderpeptideistodeterminertrpavailabilityandtoregulatetranscriptiontermination14–amino-acid(encodedby27-68oftheleaderRNAsummary目前一百零九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)trpOperon:阻遏作用與弱化作用的協(xié)調(diào)trp操縱子具有雙重調(diào)節(jié)體系細(xì)菌通過(guò)弱化作用彌補(bǔ)阻遏作用的不足,因?yàn)樽瓒糇饔弥荒苁罐D(zhuǎn)錄不起始,對(duì)于已經(jīng)起始的轉(zhuǎn)錄,只能通過(guò)弱化作用使之中途停下來(lái)。阻遏作用的信號(hào)是細(xì)胞內(nèi)色氨酸的多少;弱化作用的信號(hào)則是細(xì)胞內(nèi)載有色氨酸的tRNA的多少。它通過(guò)前導(dǎo)肽的翻譯來(lái)控制轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行,在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)這兩種作用相輔相成,體現(xiàn)著生物體內(nèi)周密的調(diào)控作用。目前一百一十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)Negative—repressibleoperon可以被最終合成產(chǎn)物所阻遏RPOleadingseq.EDCBAtrp+為什么需要阻遏體系?當(dāng)大量Trp存在時(shí),阻遏系統(tǒng)起作用。阻遏物與之結(jié)合,阻止先導(dǎo)mRNA合成。
經(jīng)濟(jì)目前一百一十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)僅有少量trp時(shí),RNApol啟動(dòng)RPOleadingseq.EDCBA少量trp+不足以結(jié)合
O
位點(diǎn),弱化子不起作用為什么需要弱化系統(tǒng)?當(dāng)Trp濃度低時(shí),阻遏物從有活性變?yōu)闊o(wú)活性,以保持培養(yǎng)基中適當(dāng)?shù)腡rp水平。目前一百一十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)細(xì)菌演化出弱化系統(tǒng)的生物學(xué)意義
通過(guò)tRNA荷載與否進(jìn)行調(diào)控,更為靈敏氨基酸的主要用途是合成蛋白質(zhì),因而tRNA荷載為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行調(diào)控更為恰當(dāng)兩個(gè)調(diào)控系統(tǒng),避免浪費(fèi)提高效率阻遏系統(tǒng)高水平trp時(shí),不轉(zhuǎn)錄低水平trp時(shí),轉(zhuǎn)錄至滿(mǎn)足生長(zhǎng)需求
弱化系統(tǒng)細(xì)調(diào)原核生物細(xì)致的精細(xì)調(diào)控機(jī)制增強(qiáng)原核生物對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性目前一百一十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)在負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是阻遏蛋白(repressor),起著阻止結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的作用。根據(jù)其作用特征又可分為負(fù)控誘導(dǎo)和負(fù)控阻遏:在負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,阻遏蛋白與誘導(dǎo)物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄;在負(fù)控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白輔阻遏物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。原核基因調(diào)控機(jī)制的類(lèi)型總結(jié)目前一百一十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)負(fù)控誘導(dǎo)在負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,阻遏蛋白與誘導(dǎo)物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。目前一百一十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)負(fù)控阻遏在負(fù)控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白與輔阻遏物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。目前一百一十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)在正轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白(activator)。根據(jù)激活蛋白的作用性質(zhì)分為正控誘導(dǎo)和正控阻遏:在正控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,誘導(dǎo)物的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài);在正控阻遏系統(tǒng)中,輔阻遏物的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)。目前一百一十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)正控誘導(dǎo)在正控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,效應(yīng)物分子(誘導(dǎo)物)的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài);目前一百一十八頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)正控阻遏在正控阻遏系統(tǒng)中,輔阻遏物的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)。目前一百一十九頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)未發(fā)現(xiàn)目前一百二十頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)7.4.3阻遏蛋白LexA的降解與細(xì)胞中的SOS應(yīng)答AnoverviewoftheSOSresponseinE.coli.目前一百二十一頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)7.4.3阻遏蛋白LexA的降解與細(xì)胞中的SOS應(yīng)答AnoverviewoftheSOSresponseinE.coli.目前一百二十二頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)7.4.4二組分調(diào)控系統(tǒng)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
7.4.5受多啟動(dòng)子調(diào)控的操縱子
目前一百二十三頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)操縱子的融合與基因工程POZYA結(jié)構(gòu)基因缺失lacoperon結(jié)構(gòu)基因I目前一百二十四頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)IPTG,異丙基-β–D-硫代半乳糖苷TMG,巰甲基半乳糖苷ONPG,O-硝基半乳糖苷在研究誘導(dǎo)作用時(shí),很少使用乳糖安慰誘導(dǎo)物(gratuitousinducer):如果某種物質(zhì)能夠促使細(xì)菌產(chǎn)生酶而本身又不被分解,這種物質(zhì)被稱(chēng)為安慰誘導(dǎo)物,如:目前一百二十五頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)目前一百二十六頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)10.11重疊基因的調(diào)控作用重疊基因最早在大腸桿菌噬菌體ΦX174中發(fā)現(xiàn),用不同的閱讀方式得到不同的蛋白質(zhì),絲狀RNA噬菌體、線粒體DNA和細(xì)菌染色體上都有重疊基因存在。目前一百二十七頁(yè)\總數(shù)一百四十頁(yè)\編于十三點(diǎn)TrpB–谷氨酸-異亮氨酸-終止
GAA--AUC--UGA
--UGG--AA
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