TBIA 14-2023 藥學數(shù)據(jù)集 藥學相關的組學

ICS01.040.19CCSC10 T/BIA團 體 標 準T/BIA14-2023藥學數(shù)集 藥學關的組學Pharmaceuticaldataset-Omics2023-04-17發(fā)布 2023-04-18實施北京信息化協(xié)會 發(fā)布T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023IIIIII目 次前言 III引言 IV1范圍 52規(guī)性用件 53術和義 54數(shù)元本性明 6據(jù)基屬性 6識編規(guī)則 6據(jù)名稱 64.46據(jù)型明 6示式明 7表格中符義描規(guī)則 7表格中符度描規(guī)則 74.784.8束條說明 85概述 86數(shù)元 86.1目86.2究息 96.3試信息 10驗統(tǒng)息 11試系信——實驗物 11試系信——其他 13驗案息 14學關基組錄組驗16學關基組錄組序應息 17學關基組錄組序得息 19學關蛋質(zhì)試驗息 20藥相的譜分析息 21藥相的白數(shù)據(jù)息 22附錄資性）數(shù)元值代表 25參考獻 36T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023IIIIIIIVIV前 言GB/T1.1—20201本文件為首次發(fā)布。引 言T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023PAGEPAGE5PAGEPAGE6藥學數(shù)據(jù)集藥學相關的組學范圍本文件適用于臨床前藥物研究、技術優(yōu)化、研發(fā)關鍵技術工具、數(shù)據(jù)庫構建、數(shù)據(jù)共享等。（GB/T31074科技平臺數(shù)據(jù)元設計與管理GB2312GB3102.1-93GB/T14666分析化學術語8T/CHIA20人類基因測序原始數(shù)據(jù)匯交元數(shù)據(jù)標準T/SZAS40蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)集下列術語和定義適用于本文件。3.1基因組學genomics1986ThomasH.Roderick3.2轉錄組學transcriptomics轉錄組學是指一門在整體水平上研究細胞、組織或生物體中基因轉錄的情況及轉錄調(diào)控規(guī)律的學RNARNA3.3蛋白質(zhì)組學proteomics1994MarcWilkins數(shù)據(jù)元標識符、數(shù)據(jù)元名稱、英文名稱、說明、數(shù)據(jù)類型、表示格式、計量單位、值域、約束條件。數(shù)據(jù)元標識符編碼應遵循以下規(guī)則：271圖1 據(jù)標符結構圖1中：2PD22012013001數(shù)據(jù)元的名稱是標識數(shù)據(jù)元的主要手段，簡稱“名稱”。說明關于數(shù)據(jù)元的含義和基本特征的說明，并使之區(qū)別于其他數(shù)據(jù)元。數(shù)據(jù)元的數(shù)據(jù)類型說明見表1。表1數(shù)據(jù)類型說明數(shù)據(jù)類型描述字符型（string）S~zAZ、（B2S1：）S2：）3（布爾型（boolean）L又稱邏輯型，采用0（False）或1（True）形式表示的邏輯值的類型數(shù)值型（number）N通過“0”到“9”數(shù)字形式表示的值的類型日期型（date）D采用GB/T7408中規(guī)定的YYYYMMDD格式表示的值的類型日期時間型（datetime）DT采用GB/T7408YYYYMMDDThhmmss（字符T作為時間的標志符，說明時間表示的開始）時間型（time）T采用GB/T7408中規(guī)定的hhmmss格式表示的值的類型二進制（binary）BY數(shù)據(jù)元的表示格式中字符含義描述規(guī)則見表2。表2表示格式中字符含義描述規(guī)則字符含義A字母字符N數(shù)字字符AN字母或（和）數(shù)字字符D8采用YYYYMMDD的格式表示，其中，“YYYY”表示年份，“MM”表示月份，“DD”表示日期T6采用hhmmss的格式表示，其中“hh”表示小時，“mm”表示分鐘，“ss”表示秒DT15YYYYMMDDThhmmssT數(shù)據(jù)元的表示格式中字符長度描述規(guī)則見表3。表3表示格式中字符長度描述規(guī)則類別表示方法固定長度在數(shù)據(jù)類型表示符后直接給出字符長度的數(shù)目，如N4類別表示方法可變長度可變長度不超過定義的最大字符數(shù)，在數(shù)據(jù)類型表示符后加“..”后給出數(shù)據(jù)元最大字符數(shù)目，如AN..10可變長度在定義的最小和最大字符數(shù)之間，在數(shù)據(jù)類型表示符后給出最小字符長度數(shù)后加“..”后再給出最大字符數(shù)，如AN4..20有若干字符行表示的長度按固定長度或可變長度的規(guī)定給出每行的字符長度數(shù)后加“X”后，再給出最大行數(shù)，如AN..40X3，有國家規(guī)定行文模板的記做AN..X有小數(shù)位按固定長度或可變長度的規(guī)定給出字符長度數(shù)后，在“,”后給出小數(shù)位數(shù)，字符長度數(shù)包含整數(shù)位數(shù)、小數(shù)點位數(shù)和小數(shù)位數(shù)，如N6,2值域約束數(shù)據(jù)元的約束/條件說明見表4。表4約束/條件說明約束/條件說明必選M該數(shù)據(jù)元必須出現(xiàn)條件選C該數(shù)據(jù)元在需要出現(xiàn)的條件下應當出現(xiàn)可選O該數(shù)據(jù)元根據(jù)需要選擇，可以出現(xiàn)，也可以不出現(xiàn)概述數(shù)據(jù)元項目信息數(shù)據(jù)元見表5。T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023PAGEPAGE111010表5項目信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式值域約束條件備注PD04.01.001項目發(fā)布日期releasedate項目產(chǎn)生數(shù)據(jù)集的發(fā)布日期,為立即發(fā)布日期或指定日期DD8-MPD04.01.002項目標題title項目的標題S1AN..100-MPD04.01.003涉及領域relevance項目涉及的研究領域S1AN..50-MPD04.01.004項目描述description項目的描述信息S1AN..1000-MPD04.01.005資助信息grant項目的基金資助信息S1AN..50-MPD04.01.006資助機構agency項目的資助機構S3AN..50表A.1數(shù)據(jù)MA.1擇多個PD04.01.007資助項目類別program項目資助類別S1AN..50-OPD04.01.008項目資助號grantID項目資助號S1AN..50-M研究信息數(shù)據(jù)元見表6。表6研究信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式值域約束條件備注PD04.02.001研究發(fā)布日期releasedate研究產(chǎn)生數(shù)據(jù)集的發(fā)布日期DD8-MPD01.01.001研究標題title研究的題目S1AN..100-MPD01.01.002研究描述description研究內(nèi)容的簡要描述信息S1AN..1000-MPD01.01.003研究領域researchfield研究中所涉及的研究領域，如糖尿病等S1AN..50-M數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式值域約束條件備注PD04.02.005組學數(shù)據(jù)類型datatype所屬組學的數(shù)據(jù)種類S3AN..50表A.2組學數(shù)據(jù)類型數(shù)據(jù)代碼表M可選擇的數(shù)據(jù)類型如表A.2所示，可選擇多個。如果數(shù)據(jù)類型不在此列表中，可以選擇“other”并自行填寫PD04.02.006數(shù)據(jù)訪問政策dataaccesspolicy數(shù)據(jù)訪問政策S2AN..20MPD04.02.007數(shù)據(jù)共享限制datasharinglimitation約束數(shù)據(jù)的使用范圍S2AN..20研究3.商業(yè)使用M受試物信息數(shù)據(jù)元見表7。表7受試物信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束PD01.02.001受試物名稱testarticle通過非臨床研究進行評價的物質(zhì)名稱S1AN..20--MPD01.02.002批號lotnumber提供受試物所屬批號S1AN..20--OPD01.02.003來源source具體說明受試物來源S1AN..50--MPD01.02.004受試物純度purity某物質(zhì)中所含某種組分的質(zhì)量或者體積分數(shù)NN..6,2%＞0MPD01.02.005受試物含量content化學物質(zhì)中，主成分在該物質(zhì)中所占的分數(shù)NN..6,2%＞0OPD01.02.006有效期expirationdate在規(guī)定的貯藏條件下，受試物質(zhì)量能夠符合規(guī)定要求的期限DD8--M數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束PD01.02.007質(zhì)量檢驗報告qualityinspectionreport重要依據(jù)BYAN..X--OPD01.02.008保存條件storageconditions具體說明受試物的保存條件S1AN..50--MPD01.02.009配制方法preparationmethod詳細描述受試物溶液的配制方法S1AN..100--MPD01.02.010溶媒solvent能溶解氣體、固體、液體而成為均勻混合物的一種液體。習慣上把氣體和固體叫溶質(zhì)，液體叫溶劑。需要說明批號、規(guī)格和生產(chǎn)廠家S1AN..100--MPD01.02.011藥用輔料pharmaceuticexcipients需要說明批號、規(guī)格和生產(chǎn)廠家S1AN..100--O試驗系統(tǒng)信息——實驗動物數(shù)據(jù)元見表8。T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-202311PAGE211PAGE3表8試驗系統(tǒng)信息——實驗動物數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件PD01.03.001品種breed“種”以下的非自然分類單位。主要通過人工選擇或定向培育，把動物的某些生物學特性進行改良，并能穩(wěn)定遺傳的一類動物。最常用的實驗動物品種為：小鼠、大鼠、地鼠、豚鼠、兔、犬、小型豬、貓、斑馬魚和非人靈長類中獼猴等S1AN..10--MPD01.03.002品系strain實驗動物品系來源應明確，即“株”。為實驗動物專有分類名詞，根據(jù)不同試驗目的采用一定的交配方式繁殖且祖先明確的動物群，具有獨特的生物學特性并能穩(wěn)定遺傳的群體，如近交系、突變系等，可用于不同試驗目的的動物群體S1AN..50--MPD01.03.003等級grade實驗動物按微生物學等級分為普通級動物、清潔級動物、無特定病原體級動物、無菌級動物S2AN..50-MPD01.03.004來源source實驗動物來源途徑。動物來源單位符合實驗動物管理部門核發(fā)的實驗動物生產(chǎn)許可證、動物合格證、動物檢疫證明等資質(zhì)條件S1AN..50--M數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件PD01.03.005性別gender對實驗動物性別的描述，通過觀察外生殖器的形狀和位置判斷S2AN..10-雌性、雄性MPD01.03.006動物數(shù)number動物實驗中實驗動物的具體使用數(shù)量NN..4只,尾＞0MPD01.03.007年齡age對動物實驗中實驗動物年齡的描述，一般常用周齡，日齡和月齡等NN..3day,week,month,year＞0PD01.03.008體重bodyweight實驗動物體重的測量值NN..7,2kg,g＞0PD01.03.009動物實驗倫理審查表thetabofanimalexperimentalethicalinspection動物實驗前必須進行倫理審批（即動物實驗倫理審查表），審批通過的實驗才能夠進行。審查的內(nèi)容主要包括研究者資質(zhì)、動物的選擇、試驗目的、方法和條件、動物的處死等方面BYAN..X--MPD01.03.010動物質(zhì)量合格證animalqualitycertificate實驗動物來源是否合格的重要文件，一般由具有實驗動物生產(chǎn)許可的公司或研究單位開具，外地購買的實驗動物一般還需要提供檢疫合格證明BYAN..X--MPD01.03.011動物實驗設施使用證明thecertificationofusingtheexperimentfacilityforlaboratoryanimal在動物實驗結束后，到實驗動物中心開具的可以證明此動物實驗在某設施進行的證明性文件BYAN..X--O試驗系統(tǒng)信息——其他數(shù)據(jù)元見表9。表9試驗系統(tǒng)信息——其他數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域PD01.03.012組織tissue樣本的來源組織/器官信息，具體寫明試驗中使用的組織/器官的名稱和來源S1AN..50--PD01.03.013類器官organoids樣本的來源類器官信息，具體寫明試驗中使用的類器官的名稱和來源S1AN..50--PD04.04.001胚胎embryo樣本的來源胚胎信息，具體寫明試驗中使用的胚胎的名稱和來源S1AN..50--PD01.03.014細胞cell樣本的來源細胞信息，具體寫明試驗中使用的細胞的名稱及來源S1AN..50--PD01.03.015細菌strain樣本的來源細菌信息，具體寫明試驗中使用的細菌的名稱及來源S1AN..50--PD01.03.016病毒virus樣本的來源病毒信息，具體寫明試驗中使用的病毒的名稱及來源S1AN..50--PD04.04.002體液bodyfluid樣品的來源體液信息，包括血液、尿液、唾液、腦脊液等，具體說明試驗中使用的體液的來源S1AN..50--PD04.04.003外泌體exosome樣品的來源外泌體信息，包括培養(yǎng)細胞分泌的，以及存在于體液中的，具體說明試驗中使用的外泌體的來源S1AN..50--試驗方案信息數(shù)據(jù)元見表10。表10試驗方案信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域PD01.04.001給藥劑量dosage試驗中使用的受試物的具體劑量NN..7,3單位重量以㎏、g、㎎、μg等四級重量計量單位表示；容量以L、mL、μL三級計量單位表示；放射性藥物評價過程中的活度劑量表述，諸如：Ci、mCi、μCi、Bq、mBq0-999PD01.04.002（concentration試驗中使用的受試物的具體藥物濃度（濃度）指物質(zhì)B作為溶質(zhì)時，物質(zhì)B的濃度為溶質(zhì)的物質(zhì)的量nB與溶液的體積v之比NN..7,3mol/L,mmol/L,μmol/L,nmol/L0-999PD01.04.003藥物濃度（質(zhì)量濃度）massconcentration（BNN..7,3g/L,mg/L,μg/L,ng/L,g/mL,mg/mL,μg/mL,ng/mL0-999PD01.04.004放射性藥物活度濃度activityconcentration試驗中使用的放射性藥物的具體活度濃度指單位體積溶液中所含的放射性活度NN..7,3Ci/L,mCi/mL,μCi/μL,Bq/mL,mBq/mL0-999PD01.04.005放射性藥物比活度specificactivity試驗中使用的放射性藥物的具體比活度指單位質(zhì)量物質(zhì)的放射性活度NN..7,3Bq/g,mCi/g0-999數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域PD01.04.006給藥途徑administrationroute具體描述受試物進入試驗系統(tǒng)的方法S1AN..20--PD01.04.007給藥次數(shù)administrationtimes試驗期間內(nèi)用藥的次數(shù)NN..3-＞0PD01.04.008觀察時間observationtime試驗期間，具體的觀察時間NN..3min,h,day,week,month＞0PD01.04.009給藥頻率administrationfrequency一段時間內(nèi)用藥的頻率NN..2/day,/week,/month＞0PD01.04.010給藥期/給藥期限administrationduration給藥時間的長短，也稱給藥期限NN..3min,h,day,week,month,year＞0PD01.04.011作用時間durationofn受試物作用于受試系統(tǒng)后的具體時間NN..3min,h,day,week,month,year＞0PD01.04.012動物處理時間sacrificetimeofanimal說明試驗中處理實驗動物的具體時間NN..3min,h,day,week,month，year＞0PD01.04.013樣本標題sampletitle樣本的標題，要求簡短S1AN..100--PD01.04.014采樣時間collectiontime說明采集試驗樣本的具體時間DD8--PD01.04.015采樣次數(shù)collectiontimes說明采集試驗樣本的具體次數(shù)NN..2-＞0PD01.04.016檢測時間examinetime說明檢測/觀察試驗指標的具體時間DD8--PD04.05.001樣本范圍samplescope用于研究的生物樣品的范圍和純度S3AN..50-表A.3樣本范圍代碼表藥學相關的基因組/轉錄組試驗信息數(shù)據(jù)元見表11。表11藥學相關的基因組/轉錄組試驗信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量值域約束條件PD04.06.001測序平臺platform試驗選用的測序平臺S1AN..100--MPD04.06.002文庫構建/試驗設計libraryconstruction/experimentaldesign試驗的文庫構建方法或試驗設計方法S3AN..20-表A.4試驗測序設計代碼表MPD04.06.003文庫名稱nameoflibrary文庫的名稱S1AN..100--MPD04.06.004建庫策略strategy試驗的建庫策略S3AN..50-表A.5試驗建庫策略代碼表MPD04.06.005樣本來源source文庫的試驗材料來源類型S3AN..50-表A.6試驗樣本來源代碼表MPD04.06.006基因組/轉錄組試驗方式選擇selection選擇和/或富集被測序材料的方式S3AN..50-表A.7基因組/轉錄組試驗方式選擇代碼表MPD04.06.007文庫布局layout雙端測序，單端測序,還是鏈特異性轉錄組測序S2AN..20-雙端測序、單端測序、鏈特異性轉錄組測序MPD04.06.008正向測序讀長readlengthformate1正向測序讀長NN..4bp＞0MPD04.06.009反向測序讀長readlengthformate2反向測序讀長NN..4bp＞0CPD04.06.010插入片段長度insertsize雙端測序的插入片段長度，可取值為插入片段長NN..4bp＞0O藥學相關的基因組/轉錄組測序反應信息數(shù)據(jù)元見表12。表12藥學相關的基因組/轉錄組測序反應信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件備注PD04.07.001測序反應標題title測序反應的標題S1AN..100--MPD04.07.002數(shù)據(jù)類型datatype測序反應產(chǎn)生的文件類型S3AN..50-表A.8OPD04.07.003文件名filename要上傳的序列文件的名S1AN..100--O同一個數(shù)據(jù)集中，必須是唯一的，不可包含空格、連字符、括號、句點，或正反斜PD04.07.004MD5校驗碼MD5MD5校驗碼，長度為32位，用于校驗文件的一致性S1AN..100--MPD04.07.005參考序列名或編號assemblynameoraccession參考序列為公共數(shù)據(jù)庫中的公開序列時，參考序列的名稱或編號S1AN..100--O如果上傳序列為BAM格式，需要提供序列比對時的參考序列信息PD04.07.006參考序列鏈接assemblyURL參考序列為公共數(shù)據(jù)庫中的公開序列時，參考序列對應的訪問網(wǎng)址S1AN..100--O如果上傳序列為BAM格式，需要提供序列比對時的參考序列信息PD04.07.007參考序列文件名referencefilename參考序列為公共數(shù)據(jù)庫中的公開序列時，需上傳參考序列，本項指參考序列的文件名S1AN..100--O如果上傳序列為BAM格式，需要提供序列比對時的參考序列信息數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件備注PD04.07.008參考序列MD5校驗碼MD5forreferencefile參考序列為公共數(shù)據(jù)庫中的公開序列時，需上傳參考序列，本項指參考序列的MD5校驗碼，長度32位S1AN..100--O如果上傳序列為BAM格式，需要提供序列比對時的參考序列信息藥學相關的基因組/轉錄組測序獲得信息數(shù)據(jù)元見表13。表13藥學相關的基因組/轉錄組測序獲得信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)表示格式計量值域約束備注PD04.08.001基因IDgeneIDEntrezgeneID、EnsemblID等ANAN..50--MPD04.08.002基因名genesymbol官方基因名ANAN..50--OPD04.08.003類型typemRNA、smallRNA、lncRNA、circRNA等ANAN..25--OPD04.08.004reads數(shù)readcount比對到某基因的reads數(shù)NN..6-＞0MPD04.08.005TPMtranscriptsperkilobaseofexonmodelpermillionmappedreads每千個堿基的轉錄每百萬映射讀取的transcriptsNN..9.4-≥0MRPM一項）T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-20232020221數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件備注PD04.08.006FPKMfragmentsperkilobaseofexonmodelpermillionmappedfragments每千個堿基的轉錄每百萬映射讀取的fragmentsNN..9.4-≥0MRPKM,RPM一項）PD04.08.007RPKMreadsperkilobasepermillionmappedreads每千個堿基的轉錄每百萬映射讀取的readsNN..9.4-≥0MRPKM,RPM一項）PD04.08.008RPMreadsofexonmodelpermillionmappedreads每百萬映射讀取的readsNN..9.4-≥0M標準化后的數(shù)據(jù)TPM（TPM,FPKM,RPKM,RPM選填其中一項）藥學相關的蛋白質(zhì)組試驗信息數(shù)據(jù)元見表14。表14藥學相關的蛋白質(zhì)組試驗信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)表示格式計量值域約束PD04.09.001定量方法quantitativemethod蛋白質(zhì)定量的方法S3AN..50-表A.9定量方法的名稱代碼MPD04.09.002酶解方法enzymolysismethod酶解的方法S1AN..100--MPD04.09.003蛋白質(zhì)翻譯后修飾post-translationalmodification蛋白質(zhì)翻譯后修飾的方式S1AN..100--M數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件PD04.09.004蛋白質(zhì)組試驗方法experimentmethod試驗的方式選擇S3AN..50-表A.10MPD04.09.005MS儀器MSinstrument質(zhì)譜儀器的名稱S1AN..100--MPD04.09.006試驗過程描述descriptionofexperimentprocess詳細的試驗過程描述信息S1AN..1000--MPD04.09.007其他信息otherinformation補充描述不含在試驗過程信息中的其他信息，包括但不限于酶解、分級、富集（針對翻譯后修飾項目）、質(zhì)譜、數(shù)據(jù)分享等過程S1AN..1000--OPD04.09.008試驗總結experimentsummary對試驗檢測結果的總結，包括但不限于鑒定到的譜圖數(shù)，肽段數(shù)，蛋白質(zhì)數(shù)以及定量到的蛋白質(zhì)等信息S1AN..1000--M藥學相關的質(zhì)譜檢測分析信息數(shù)據(jù)元見表15。表15藥學相關的質(zhì)譜檢測分析信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)表示格式計量值域約束PD04.10.001數(shù)據(jù)庫搜索軟件名稱nameofsoftwareforthedatabasesearching蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)庫檢索軟件的名稱S1AN..100--MPD04.10.002數(shù)據(jù)庫搜索軟件版本versionofsoftwareforthedatabasesearching蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)庫檢索軟件的版本S1AN..100--MT/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-202322PAGE222PAGE3數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件PD04.10.003搜索的數(shù)據(jù)庫類型typeofdatabaseforsearching蛋白質(zhì)組學搜索的數(shù)據(jù)庫類型S1AN..100--MPD04.10.004搜索的數(shù)據(jù)庫版本versionofdatabaseforsearching蛋白質(zhì)組學搜索的數(shù)據(jù)庫版本S1AN..100--MPD04.10.005誘餌數(shù)據(jù)庫類型typeofdecoydatabase誘餌數(shù)據(jù)庫的類型S1AN..100--MPD04.10.006肽段鑒定軟件名稱nameofsoftwareforpeptideidentification信息分析過程中肽段鑒定軟件名稱S3AN..50-表A.11MPD04.10.007肽段鑒定軟件版本versionofsoftwareforpeptideidentification信息分析過程中肽段鑒定軟件版本號S1AN..100--MPD04.10.008肽段鑒定軟件參數(shù)parameterofsoftwareforpeptideidentification信息分析過程中肽段鑒定軟件參數(shù)信息（固定修飾，可變修飾，一級二級質(zhì)譜質(zhì)量誤差，蛋白多肽鑒定閾值等）S1AN..100--MPD04.10.009蛋白質(zhì)定量軟件名稱nameofsoftwareforproteinquantitation信息分析過程中蛋白質(zhì)定量軟件名稱S3AN..50-表A.12MPD04.10.010蛋白質(zhì)定量軟件版本versionofsoftwareforproteinquantitation信息分析過程中蛋白質(zhì)定量軟件版本號S1AN..100--MPD04.10.011蛋白質(zhì)定量軟件參數(shù)parameterofsoftwareforproteinquantitation信息分析過程中蛋白質(zhì)定量軟件參數(shù)信息S1AN..100--M藥學相關的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)信息數(shù)據(jù)元見表16。表16藥學相關的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)信息數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件PD04.11.001原始數(shù)據(jù)rawdata原始數(shù)據(jù)S3raw-詳見標準T/SZAS40—2021MwiffmzmlmzxmlmgfPD04.11.002鑒定結果文件fileofidentificationresult鑒定結果文件S3mzIdentml-詳見標準T/SZAS40—2021McsvtxtdatpdresultmsfgroupPD04.11.003定量結果文件fileofquantitativeanalysisresult定量結果文件S3mzTab-詳見標準T/SZAS40—2021MmzQuantMLPD04.11.004蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫文件fileofproteindatabasebank蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫文件S3fasta-詳見標準T/SZAS40—2021MpeffPD04.11.005蛋白IDproteinIDSwiss-ProtID、UniprotID等S1AN..50--MPD04.11.006蛋白名稱proteinname官方蛋白名稱S1AN..50--OPD04.11.007蛋白功能function蛋白功能的簡單描述S1AN..100--O數(shù)據(jù)元標識符數(shù)據(jù)元名稱英文名稱說明數(shù)據(jù)類型表示格式計量單位值域約束條件PD04.11.008覆蓋率coverage鑒定到的氨基酸數(shù)目占蛋白質(zhì)總氨基酸數(shù)目的比例NN..5,2%＞0OPD04.11.009肽段數(shù)numberofpeptides鑒定到的肽段數(shù)NN..3-＞0OPD04.11.010特有肽段的個數(shù)numberofuniquepeptides專屬于某一蛋白質(zhì)的唯一肽段數(shù)NN..3-＞0OPD04.11.011強度intensitygroupsuniquerazorpeptides的信號強度加起來，作為一個原始強度值NN..12,3-＞0MPD04.11.012蛋白質(zhì)分子量molecularweight蛋白質(zhì)的理論分子量NN..7,2kDa＞0OPD04.11.013功能描述description其他描述，如GO功能注釋、KEGG功能注釋、定位注釋等S1或者BYAN..X--OT/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-202322PAGE522PAGE6附 錄 A（）A.1項目資助機構代碼表項目資助機構代碼表見表A.1。表A.1項目資助機構代碼表代碼值含義說明01MinistryofScienceandTechnologyofthePeople'sRepublicofChina(MOST)中華人民共和國科學技術部02NationalNaturalScienceFoundationofChina(NSFC)國家自然科學基金委員會03ChineseAcademyofSciences(CAS)中國科學院04other其他機構05nofundingsupport無資金支持A.2組學數(shù)據(jù)類型代碼表組學數(shù)據(jù)類型代碼表見表A.2。表A.2組學數(shù)據(jù)類型代碼表代碼值含義說明01wholegenomesequencing全基因組測序02genomesequencingandassembly基因組測序和組裝03rawsequencereads組學原始序列測序04variation基因變異相關測序05cloneends克隆末端測序06wholeexomesequencing外顯子測序07phenotype/Genotype表型與基因型相關的測序08epigenomicsDNA甲基化，組蛋白修飾，染色質(zhì)數(shù)據(jù)集09transcriptomeorgeneexpression轉錄組或基因表達相關測序10map無測序數(shù)據(jù)的圖位數(shù)據(jù)，圖位克隆測序，輻射雜種細胞圖11randomsurvey從收集到的樣品的隨機取樣的測序，即不打算對材料進行全面取樣12metagenome宏基因組測序13targetedlocus,Loci特定位點的測序，如16SrRNA測序14targetedlocicultured來自培養(yǎng)樣本的靶向位點測序15targetedlocienvironmental來自環(huán)境樣本（未培養(yǎng)）的靶向位點測序16proteome蛋白質(zhì)組17other其他數(shù)據(jù)類型，需要用戶做文字描述A.3樣本范圍代碼表樣本范圍代碼表見表A.3。表A.3樣本范圍代碼表代碼值含義說明01monoisolate同一物種且同一基因型樣本集，主要用于模式動物/植物或細胞系等02multisolate同一物種的多基因型的個體樣本集03multi-species多物種樣本集04environment環(huán)境樣本集，多用于宏基因組研究05synthetic在實驗室里制造/合成的樣本集06singlecell單細胞測序樣本集07other其他樣本集或無法歸入以上類別的特殊樣本集A.4試驗測序設計代碼表試驗測序設計代碼表見表A.4。表A.4試驗測序設計代碼表代碼測序平臺儀器型號說明P1.1LS454454GS利用LS454測序平臺的454GS儀器測序P1.2LS454454GS20利用LS454測序平臺的454GS20儀器測序P1.3LS454454GSFLX利用LS454測序平臺的454GSFLX儀器測序P1.4LS454454GSFLXTitaniumLS454454GSFLXTitanium測序P1.5LS454454GSFLX+利用LS454測序平臺的454GSFLX+儀器測序P1.6LS454454GSJunior利用LS454測序平臺的454GSJunior儀器測序P2.1CAPILLARYAB310GeneticAnalyzer利用CAPILLARY測序平臺的AB310GeneticAnalyzer儀器測序P2.2CAPILLARYAB3130GeneticAnalyzer利用CAPILLARY測序平臺的AB3130GeneticAnalyzer儀器測序P2.3CAPILLARYAB3130xLGeneticAnalyzer利用CAPILLARY測序平臺的AB3130xLGeneticAnalyzer儀器測序P2.4CAPILLARYAB3500GeneticAnalyzer利用CAPILLARY測序平臺的AB3500GeneticAnalyzer儀器測序P2.5CAPILLARYAB3500xLGeneticAnalyzer利用CAPILLARY測序平臺的AB3500xLGeneticAnalyzer儀器測序P2.6CAPILLARYAB3730GeneticAnalyzerCAPILLARYAB3730GeneticAnalyzerP2.7CAPILLARYAB3730xLGeneticAnalyzer利用CAPILLARY測序平臺的AB3730xLGeneticAnalyzer儀器測序P3.1ABISolidAB5500GeneticAnalyzer利用ABISolid測序平臺的AB5500GeneticAnalyzer儀器測序P3.2ABISolidAB5500xlGeneticAnalyzer利用ABISolid測序平臺的AB5500xLGeneticAnalyzer儀器測序P3.3ABISolidAB 5500x-WlGeneticAnalyzerABISolidAB5500x-WlGeneticAnalyzer儀器測序P3.4ABISolidABSOLiD3PlusSystem利用ABISolid測序平臺的ABSOLiD3PlusSystem儀器測序代碼測序平臺儀器型號說明P3.5ABISolidABSOLiD4SystemABISolidABSOLiD4System器測序P3.6ABISolidABSOLiD4hqSystemABISolidABSOLiD4hqSystem儀器測序P3.7ABISolidABSOLiDPISystem利用ABISolid測序平臺的ABSOLiDPISystem儀器測序P3.8ABISolidABSOLiDSystem1.0ABISolidABSOLiDSystem1.0儀器測序P3.9ABISolidABSOLiDSystem2.0ABISolidABSOLiDSystem2.0儀器測序P3.10ABISolidABSOLiDSystem3.0ABISolidABSOLiDSystem3.0儀器測序P4.1BGISeqBGISEQ-100利用BGISeq測序平臺的BGISEQ-100儀器測序P4.2BGISeqBGISEQ-1000利用BGISeq測序平臺的BGISEQ-1000儀器測序P4.3BGISeqBGISEQ-500利用BGISeq測序平臺的BGISEQ-500儀器測序P4.4BGISeqDNBSEQ-G400利用BGISeq測序平臺的DNBSEQ-G400儀器測序P4.5BGISeqDNBSEQ-T7利用BGISeq測序平臺的DNBSEQ-T7儀器測序P4.6BGISeqDNBSEQ-G50利用BGISeq測序平臺的DNBSEQ-G50儀器測序P5.1CapitalBioCompanyBioelectronSeq4000利用CapitalBioCompany測序平臺的BioelectronSeq4000儀器測序P6.1BionanoGenomicsBioNanoIRYSBionanoGenomicsBioNanoIRYS儀器測序P6.2BionanoGenomicsBioNanoSAPHYR利用BionanoGenomics測序平臺的BioNanoSAPHYR儀器測序P7.1CompleteGenomicsCompleteGenomics利用CompleteGenomics測序平臺的CompleteGenomics儀器測序P8.1DAANGENEDA8600利用DAANGENE測序平臺的DA8600儀器測序P9.1HelicosBioSciencesCorporationHelicosHeliScopeHelicosBioSciencesCorporationHelicosHeliScopP10.1HYKGeneticHYK-PSTAR-IIAHYKGeneticHYK-PSTAR-IIA測序P11.1IlluminaIlluminaGenomeAnalyzer利用Illumina測序平臺的IlluminaGenomeAnalyzer儀器測序P11.2IlluminaIlluminaGenomeAnalyzerII利用Illumina測序平臺的IlluminaGenomeAnalyzerII儀器測序P11.3IlluminaIlluminaGenomeAnalyzerIIx利用Illumina測序平臺的IlluminaGenomeAnalyzerIIx儀器測序P11.4IlluminaIlluminaHiScanSQIlluminaIlluminaHiScanSQ器測序P11.5IlluminaIlluminaHiSeq1000IlluminaIlluminaHiSeqP11.6IlluminaIlluminaHiSeq1500利用Illumina測序平臺的IlluminaHiSeq1500儀器測序P11.7IlluminaIlluminaHiSeq2000利用Illumina測序平臺的IlluminaHiSeq2000儀器測序P11.8IlluminaIlluminaHiSeq2500利用Illumina測序平臺的IlluminaHiSeq2500儀器測序代碼測序平臺儀器型號說明P11.9IlluminaIlluminaHiSeq3000利用Illumina測序平臺的IlluminaHiSeq3000儀器測序P11.10IlluminaIlluminaHiSeq4000利用Illumina測序平臺的IlluminaHiSeq4000儀器測序P11.11IlluminaIlluminaHiSeqXTenIlluminaIlluminaHiSeqXTen儀器測序P11.12IlluminaIlluminaMiSeqIlluminaIlluminaMiSeq序P11.13IlluminaIlluminaMiniSeqIlluminaIlluminaMiniSeq測序P11.14IlluminaIlluminaNextseq500IlluminaIlluminaNextseq500儀器測序P11.15IlluminaIlluminaNextseq550IlluminaIlluminaNextseq550儀器測序P11.16IlluminaIlluminaiSeq100IlluminaIlluminaiSeq100P11.17IlluminaIlluminaNovaSeq5000利用Illumina測序平臺的IlluminaNovaSeq5000儀器測序P11.18IlluminaIlluminaNovaSeq6000利用Illumina測序平臺的IlluminaNovaSeq6000儀器測序P12.1IonTorrentIonTorrentPGMIonTorrentIonTorrentPGM器測序P12.2IonTorrentIonTorrentProton利用IonTorrent測序平臺的IonTorrentroton儀器測序P12.3IonTorrentIonTorrentS5XL利用IonTorrent測序平臺的IonTorrentS5XL儀器測序P12.4IonTorrentIonTorrentS5IonTorrentIonTorrentS5測序P13.1OxfordNanoporeMinIONOxfordNanoporeMinION序P13.2OxfordNanoporeGridIONOxfordNanoporeGridION序P13.3OxfordNanoporePromethIONOxfordNanoporePromethIONP14.1BerryGenomicsNextSeqCN500利用BerryGenomics測序平臺的NextSeqCN500儀器測序P15.1PacBioSMRTPacBioRSPacBioSMRTPacBioRSP15.2PacBioSMRTPacBioRSIIPacBioSMRTPacBioRSIIP15.3PacBioSMRTPacBioSequelPacBioSMRTPacBioSequelP15.4PacBioSMRTPacBioSequelII利用PacBioSMRT測序平臺的PacBioSequelII儀器測序A.5試驗建庫策略代碼表試驗建庫策略代碼表見表A.5。表A.5試驗建庫策略代碼表代碼值含義說明01WGS非PCR擴增全基因組的隨機測序技術02WGA全基因組隨機測序技術03WES外顯子隨機測序技術04WXS外顯子特定區(qū)域基因組隨機測序技術05RNA-Seq全轉錄組的隨機測序技術06miRNA-Seq小RNA的隨機測序技術07WCS全染色體隨機測序技術08CLONE基于基因組克隆的測序技術09POOLCLONE混合克隆鳥槍法測序技術10AMPLICONOverlappingPCR或RT-PCR產(chǎn)物的測序技術11CLONEEND克隆末端（5'/3'或兩者）測序技術12FINISHING終止法測序技術13ChIP-Seq染色質(zhì)免疫沉淀測序技術14MNase-SeqMNase消化后直接測序技術.15DNase-Hypersensitivity超敏感位點測序技術16Bisulfite-Seq亞硫酸氫鈉測序技術17Tn-Seq轉座子插入位點測序技術18ESTcDNA模板的單次測序技術19FL-cDNAcDNA模板的全長測序技術20CTS級聯(lián)標簽測序技術21MRE-Seq甲基化敏感限制性內(nèi)切酶測序技術22MeDIP-Seq甲基化DNA免疫沉淀測序技術23MBD-Seq甲基化組分測序的直接測序技術24synthetic-long-read長讀長測序技術25ATAC-seq染色質(zhì)開放性測序技術26ChIA-PETChIA-PET配對末端標簽測序技術27FAIRE-seq借助有機溶劑甲醛對染色體中裸露的DNA進行固定，之后通過酚氯仿抽提獲取裸露DNA的測序技術28Hi-C染色體構象捕獲測序技術，其中生物素標記的核苷酸結合在連接結點，使得能夠選擇性純化嵌合DNA連接結點，然后進行深度測序29ncRNA-seq非編碼RNA測序技術30RAD-seq限制性位點相關DNA序列測序技術31RIP-seqRNA免疫沉淀物的直接測序技術（包括CLIP-Seq、HITS-CLIP和PAR-CLIP）32SELEX指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進化技術33ssRNA-seq鏈特異性測序34targeted-capture靶向捕獲測序技術35tetheredchromatinconformationcapture染色質(zhì)構象捕獲測序技術36linkedreadsequencing利用微流體技術來進行微滴分離并在高分子量（HMW）DNA上添加標簽序列，從而生成一種全新的數(shù)據(jù)類型，能夠提供短讀長測序數(shù)據(jù)在基因組中的上下文信息T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-20233030333代碼值含義說明37Iso-seq全長轉錄組測序，可獲得mRNA的全長序列38other其他未收錄測序技術A.6試驗樣本來源代碼表試驗樣本來源代碼表見表A.6。表A.6試驗樣本來源代碼表代碼值含義說明01genomic基因組02transcriptomic轉錄組03metagenomic宏基因組混合材料04metatranscriptomic宏基因組的轉錄產(chǎn)物05syntheticDNA合成DNA06viralRNA病毒RNA07genomicsinglecell基因組單細胞08transcriptomicsinglecell轉錄組單細胞09other其他，未指定的或未知的來源類型A.7基因組/轉錄組試驗方式選擇代碼表基因組/轉錄組試驗方式選擇代碼表見表A.7。表A.7基因組/轉錄組試驗方式選擇代碼表代碼值含義說明01unspecified非特異性篩選02random隨機03PCR利用特定引物對材料進行篩選04randomPCR利用隨機產(chǎn)生的引物對材料進行篩選05RT-PCR用逆轉錄PCR方法篩選06HMPR（hypo-methylatedpartialrestrictiondigest）07MF甲基篩選（methylfiltrated）08CF-SCot-filtered單拷貝/低拷貝基因組DNA方式篩選（Cot-filteredsingle/low-copygenomicDNA）09CF-MCot-filteredDNA（Cot-filteredmoderatelyrepetitivegenomicDNA）10CF-HCot-filtered高重復性基因組DNA方式篩選（Cot-filteredhighlyrepetitivegenomicDNA）11CF-TCot-filteredDNA（Cot-filteredtheoreticalsingle-copygenomicDNA）12MDA多重置換擴增（multipledisplacementamplification,MDA）利用隨機引物和等溫擴增可以獲得高保真的DNA大片段13MSLLmethylationspanninglinkinglibrary14cDNAcDNA篩選15ChIP染色質(zhì)免疫沉淀技術（chromatinimmunoprecipitation）16MNase微球菌核酸酶（MNase）消化17DNAse脫氧核糖核酸酶（MNase）消化18hybridselection雜交體選擇（法）代碼值含義說明19reducedrepresentation通常由限制性片段大小選擇產(chǎn)生，包含可控數(shù)量的基因座以便于重新取樣20restrictiondigest限制性內(nèi)切酶用于DNA分離215-methylcytidineantibody用抗5-met抗體選擇甲基化DNA片段22MBD2proteinmethyl-CpGbindingdomainMBD2蛋白甲基-CpG結合域篩選23CAGE帽分析基因表達篩選（cap-analysisgeneexpression）24RACE末端的快速擴增（rapidamplificationofcDNAEnds）25sizefractionationphysicalselectionofsizeappropriatetargets26padlockprobescapturemethod環(huán)化寡核苷酸探針27cDNA_oligo_dToligodT引物逆轉錄cDNA28cDNA_randompriming隨機引物構建cDNA文庫29inverserRNA寡核苷酸雜交消除核糖體RNA30Oligo-dT通過與Oligo-dT雜交來富集信使RNA（mRNA）31poly-ApolyA富集篩選32repeatfractionationCot（CF）DNA較低（且基因含量更高）的序列。33other其他，未指定的或未知的篩選方式A.8基因測序數(shù)據(jù)類型代碼表基因測序數(shù)據(jù)類型代碼表見表A.8。表A.8基因測序數(shù)據(jù)類型代碼表代碼數(shù)據(jù)類型文件擴展名是否推薦說 明1fastq.fastq,.fq提交時，需上傳.gz或.bz2的壓縮格式所有Yes存儲了核酸序列以及相應的質(zhì)量評價的文本格式2bam.bam所有Yes短序列比對生成的二進制文件3sff.sffLS454ION_TORRENTBGISEQ-100DA8600否StandardFlowgramFormatFile的縮寫，為從454得到的DNA測序的二進制文件4CG_native.tar.gz.tar（tar包須包括以下文件夾：1.ASM,2.LIB，3.MAP）CompleteGenomicsBGISEQ-500BGISEQ-1000否CompleteGenoics5solid_native.tar.gz.tar（tarxxx.csfastaxxx.qual）ABISOLID否SOLID測序儀下機的數(shù)據(jù)存儲文件6PacBio_HDF5.tar.tar.gz（PacBioRS：PacBioRSPacBioRSIIPacBioRS/PacBioRSIIT/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-2023T/BIA14-202333PAGE233PAGE3代碼數(shù)據(jù)類型文件擴展名是否推薦說 明tar包須包括以下文件：xxx.metadata.xmlxxx.bas.h5；PacBioRSII：tarxxxx.metadata.xmlxxx.bas.h5xxx.1.bax.h5xxx.2.bax.h5xxx.3.bax.h5）平臺推薦庫和文件格式7PacBio_sequel_native.tar（tar包須包括以下文件夾：1.xxx.bam，2.xxx.xml，3.xxx.pbi）.tar.gzPacBioSequelPacBioSequelPacBioSequel8abi.abiCAPILLARY否ABI測序儀下機的原始數(shù)據(jù)保存文件，包含DNA序列信息的二進制文件A.9定量方法名稱代碼表定量方法名稱代碼表見表A.9。表A.9定量方法名稱代碼表代碼定量方法說明00iTRAQ全稱isobarictagsforrelativeandabsolutequantitation。采用4種或8種同位素的標簽，通過特異性標記多肽的氨基基團，接著進行串聯(lián)質(zhì)譜分析，可同時比較4種或8種不同樣品中蛋白質(zhì)的相對含量或絕對含量?；诙壻|(zhì)譜進行定量01label_free不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段或蛋白質(zhì)在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應信號便可得到樣品間蛋白質(zhì)表達量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白質(zhì)鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)?；谝患壻|(zhì)譜進行定量02MRM一種基于已知信息或假定信息有針對性地獲取數(shù)據(jù)，進行質(zhì)譜信號采集的技術，利用母子離子對進行定量03SILACstableisotopelabelingbyaminoacidsincellculture）肽段進行序列測定從而進行蛋白質(zhì)鑒定的方法04SWATH該技術將整個質(zhì)譜掃描質(zhì)量范圍分為若干小窗口，依次對每個窗口的所有離子進行碎裂，使其能夠?qū)呙鑵^(qū)間內(nèi)的所有肽段離子進行高速一級MS掃描再進行二級MS/MS分析05TMT16（16-plex）2-10組更廣泛的檢測范圍06PRM一種基于已知信息或假定信息有針對性地獲取數(shù)據(jù)，進行質(zhì)譜信號采集的技術。對子離子進行全掃描，無需選擇離子對，更易于分析方法的建立代碼定量方法說明07ICAT全稱isotope-codedaffinitytags。一種同位素標記定量方法08other其他定量方式A.10蛋白質(zhì)組試驗方式名稱代碼表蛋白質(zhì)組試驗方式名稱代碼表見表A.10。表A.10蛋白質(zhì)組試驗方式名稱代碼表代碼試驗方式名稱00top-downproteomics01shotgunproteomics02gel-basedproteomics03cross-link(CX-MX)04affinitypurificationcoupledwithtandemmassspectrometry(AP-MS/MS)05SRM/MRM(selectedreactionmonitoring/multiplereactionmonitoring)06PRM(parallelreactionmonitoring)07DDA(data-dependentacquisition)08DIA(data-independentacquisition)09MSE(data-independentacquisition)10HDMSE(data-independentacquisition)11PAcIFIC(data-independentacquisition)12MSimaging13otherA.11肽段鑒定軟件名稱代碼表肽段鑒定軟件名稱代碼表見表A.11。表A.11肽段鑒定軟件名稱代碼表代碼肽段鑒定軟件參考鏈接00CPFPhttps://cpfp.sourceforge.io/01IPeak/fghali/mzidlib/blob/master/IPeak%20v1.0.1.zip02Mascothttps:///03MASSHUNTERhttps:///zh-cn/product/software-informatics/mass-spectrometry-software04MS-GF+/MSGFPlus/msgfplus05Myrimatch/msrc-bioinformatics/myrimatch-source/06Omssa/protocols06/omssa.php07PEAKShttps:///peaks-online/08Percolatorhttp://percolator.ms/09pFin