蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能4_第1頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能4_第2頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能4_第3頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能4_第4頁
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能4_第5頁
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文檔簡介

1)作為生物催化劑(酶)2)代謝調(diào)節(jié)作用3)免疫保護作用4)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運和存儲5)運動與支持作用6)參與細胞間信息傳遞2.蛋白質(zhì)具有重要的生物學功能3.氧化供能當前第1頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)的分子組成

TheMolecularComponentofProtein第一節(jié)當前第2頁\共有73頁\編于星期六\11點組成蛋白質(zhì)的元素主要有C、H、O、N和S。

有些蛋白質(zhì)含有少量磷、硒或金屬元素鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬,個別蛋白質(zhì)還含有碘。當前第3頁\共有73頁\編于星期六\11點各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。100克樣品中蛋白質(zhì)的含量(g%)=每克樣品含氮克數(shù)×6.25×1001/16%蛋白質(zhì)元素組成的特點測氮的方法:凱氏定氮法當前第4頁\共有73頁\編于星期六\11點一、氨基酸

——組成蛋白質(zhì)的基本單位存在自然界中的氨基酸有300余種,但組成人體蛋白質(zhì)的氨基酸僅有20種,且均屬L-氨基酸(甘氨酸除外)。當前第5頁\共有73頁\編于星期六\11點H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式R當前第6頁\共有73頁\編于星期六\11點氨基酸的旋光異構(gòu)當前第7頁\共有73頁\編于星期六\11點非極性疏水性氨基酸極性中性氨基酸酸性氨基酸堿性氨基酸(一)氨基酸的分類當前第8頁\共有73頁\編于星期六\11點色氨酸

tryptophanTryW

5.89絲氨酸

serineSerS

5.68酪氨酸

tyrosineTryY

5.66

半胱氨酸

cysteineCysC

5.07

蛋氨酸

methionine

MetM

5.74天冬酰胺

asparagineAsnN

5.41

谷氨酰胺

glutamineGlnQ

5.65

蘇氨酸

threonineThrT5.602.極性中性氨基酸當前第9頁\共有73頁\編于星期六\11點甘氨酸

glycine

Gly

G

5.97丙氨酸

alanineAlaA

6.00纈氨酸

valineValV

5.96亮氨酸

leucineLeuL

5.98異亮氨酸

isoleucineIleI

6.02苯丙氨酸

phenylalaninePheF

5.48脯氨酸

prolineProP

6.30非極性疏水性氨基酸當前第10頁\共有73頁\編于星期六\11點天冬氨酸

asparticacidAspD

2.97谷氨酸

glutamicacidGluE

3.22賴氨酸

lysineLysK

9.74精氨酸

arginineArgR

10.76組氨酸

histidineHisH

7.593.酸性氨基酸4.堿性氨基酸當前第11頁\共有73頁\編于星期六\11點幾種特殊氨基酸脯氨酸(亞氨基酸)當前第12頁\共有73頁\編于星期六\11點

半胱氨酸

+胱氨酸二硫鍵-HH當前第13頁\共有73頁\編于星期六\11點(二)氨基酸的理化性質(zhì)1.兩性解離及等電點等電點(isoelectricpoint,pI)

在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等,成為兼性離子,呈電中性。此時溶液的pH值稱為該氨基酸的等電點。當前第14頁\共有73頁\編于星期六\11點pH=pI+OH-pH>pI+H++OH-+H+pH<pI氨基酸的兼性離子陽離子陰離子當前第15頁\共有73頁\編于星期六\11點2.紫外吸收色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm附近。大多數(shù)蛋白質(zhì)含有這兩種氨基酸殘基,所以測定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡便的方法。當前第16頁\共有73頁\編于星期六\11點3.茚三酮反應氨基酸與茚三酮水合物共熱,可生成藍紫色化合物,其最大吸收峰在570nm處。由于此吸收峰值與氨基酸的含量存在正比關(guān)系,因此可作為氨基酸定量分析方法。當前第17頁\共有73頁\編于星期六\11點二、肽*肽鍵(peptidebond)是由一個氨基酸的-羧基與另一個氨基酸的-氨基脫水縮合而形成的化學鍵。(一)肽(peptide)當前第18頁\共有73頁\編于星期六\11點+-HOH甘氨酰甘氨酸肽鍵當前第19頁\共有73頁\編于星期六\11點肽鍵有部分雙鍵性質(zhì)肽鍵由于共振而具有部分雙鍵性質(zhì),因此,肽鍵比一般C-N鍵短,且不能自由旋轉(zhuǎn)肽鍵原子及相鄰的a碳原子組成肽平面相鄰的a碳原子呈反式構(gòu)型當前第20頁\共有73頁\編于星期六\11點肽鍵比一般C-N鍵短肽鍵為一平面相鄰的a碳原子呈反式構(gòu)型當前第21頁\共有73頁\編于星期六\11點*肽是由氨基酸通過肽鍵縮合而形成的化合物。*兩分子氨基酸縮合形成二肽,三分子氨基酸縮合則形成三肽……*肽鏈中的氨基酸分子因為脫水縮合而基團不全,被稱為氨基酸殘基(residue)。*由十個以內(nèi)氨基酸相連而成的肽稱為寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相連形成的肽稱多肽(polypeptide)。當前第22頁\共有73頁\編于星期六\11點N末端:多肽鏈中有自由氨基的一端C末端:多肽鏈中有自由羧基的一端多肽鏈有兩端*多肽鏈(polypeptidechain)是指許多氨基酸之間以肽鍵連接而成的一種結(jié)構(gòu)。當前第23頁\共有73頁\編于星期六\11點N末端C末端牛核糖核酸酶當前第24頁\共有73頁\編于星期六\11點(二)生物活性肽1.谷胱甘肽(glutathione,GSH)當前第25頁\共有73頁\編于星期六\11點GSH過氧化物酶H2O22GSH2H2OGSSG

GSH還原酶NADPH+H+NADP+當前第26頁\共有73頁\編于星期六\11點

體內(nèi)許多激素屬寡肽或多肽神經(jīng)肽(neuropeptide)2.多肽類激素及神經(jīng)肽當前第27頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)

TheMolecularStructureofProtein

第二節(jié)當前第28頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括一級結(jié)構(gòu)(primarystructure)二級結(jié)構(gòu)(secondarystructure)三級結(jié)構(gòu)(tertiarystructure)四級結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)高級結(jié)構(gòu)當前第29頁\共有73頁\編于星期六\11點定義蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)指多肽鏈中氨基酸的排列順序。一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)主要的化學鍵肽鍵,有些蛋白質(zhì)還包括二硫鍵。

當前第30頁\共有73頁\編于星期六\11點一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學功能的基礎(chǔ)。當前第31頁\共有73頁\編于星期六\11點二、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象

。定義

主要的化學鍵:

氫鍵

當前第32頁\共有73頁\編于星期六\11點(一)肽單元參與肽鍵的6個原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平面,C1和C2在平面上所處的位置為反式(trans)構(gòu)型,此同一平面上的6個原子構(gòu)成了所謂的肽單元(peptideunit)

。當前第33頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要形式

-螺旋(-helix)

-折疊(-pleatedsheet)

-轉(zhuǎn)角(-turn)無規(guī)卷曲(randomcoil)

當前第34頁\共有73頁\編于星期六\11點(二)-螺旋當前第35頁\共有73頁\編于星期六\11點(三)-折疊當前第36頁\共有73頁\編于星期六\11點(四)-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲-轉(zhuǎn)角無規(guī)卷曲是用來闡述沒有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結(jié)構(gòu)。當前第37頁\共有73頁\編于星期六\11點(五)模體在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)二個或三個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構(gòu)象,被稱為模體(motif)。當前第38頁\共有73頁\編于星期六\11點鈣結(jié)合蛋白中結(jié)合鈣離子的模體鋅指結(jié)構(gòu)當前第39頁\共有73頁\編于星期六\11點(六)氨基酸殘基的側(cè)鏈對二級結(jié)構(gòu)形成的影響蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)是以一級結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的。一段肽鏈其氨基酸殘基的側(cè)鏈適合形成-螺旋或β-折疊,它就會出現(xiàn)相應的二級結(jié)構(gòu)。當前第40頁\共有73頁\編于星期六\11點三、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)疏水鍵、離子鍵、氫鍵和VanderWaals力等。主要的化學鍵整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。(一)定義當前第41頁\共有73頁\編于星期六\11點當前第42頁\共有73頁\編于星期六\11點肌紅蛋白(Mb)N端C端當前第43頁\共有73頁\編于星期六\11點纖連蛋白分子的結(jié)構(gòu)域(二)結(jié)構(gòu)域大分子蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)常可分割成一個或數(shù)個球狀或纖維狀的區(qū)域,折疊得較為緊密,各行使其功能,稱為結(jié)構(gòu)域(domain)。當前第44頁\共有73頁\編于星期六\11點(三)分子伴侶分子伴侶(chaperon)通過提供一個保護環(huán)境從而加速蛋白質(zhì)折疊成天然構(gòu)象或形成四級結(jié)構(gòu)。*分子伴侶可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開,如此重復進行可防止錯誤的聚集發(fā)生,使肽鏈正確折疊。*分子伴侶也可與錯誤聚集的肽段結(jié)合,使之解聚后,再誘導其正確折疊。*分子伴侶在蛋白質(zhì)分子折疊過程中二硫鍵的正確形成起了重要的作用。當前第45頁\共有73頁\編于星期六\11點亞基之間的結(jié)合力主要是疏水作用,其次是氫鍵和離子鍵。四、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。有些蛋白質(zhì)分子含有二條或多條多肽鏈,每一條多肽鏈都有完整的三級結(jié)構(gòu),稱為蛋白質(zhì)的亞基(subunit)。當前第46頁\共有73頁\編于星期六\11點血紅蛋白的四級結(jié)構(gòu)

當前第47頁\共有73頁\編于星期六\11點從一級結(jié)構(gòu)到四級結(jié)構(gòu)血紅蛋白當前第48頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是它的氨基酸序列蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是由氫鍵導致的肽鏈卷曲與折疊Primary

structureSecondary

structure當前第49頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)是多肽鏈自然形成的三維結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)是亞基的空間排列Polypeptide

(singlesubunit

oftransthyretin)Transthyretin,withfour

identicalpolypeptidesubunitsTertiary

structureQuaternary

structure當前第50頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系TheRelationofStructureandFunctionofProtein第三節(jié)當前第51頁\共有73頁\編于星期六\11點(一)一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系牛核糖核酸酶的一級結(jié)構(gòu)二硫鍵當前第52頁\共有73頁\編于星期六\11點天然狀態(tài),有催化活性尿素、β-巰基乙醇去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無活性當前第53頁\共有73頁\編于星期六\11點(二)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系例:鐮刀形紅細胞貧血N-val·his·leu·thr·pro·glu·glu·····C(146)HbSβ肽鏈HbAβ肽鏈N-val·his·leu·thr·pro·val·glu·····C(146)當前第54頁\共有73頁\編于星期六\11點(一)肌紅蛋白與血紅蛋白的結(jié)構(gòu)二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系目錄當前第55頁\共有73頁\編于星期六\11點Hb與Mb一樣能可逆地與O2結(jié)合,Hb與O2結(jié)合后稱為氧合Hb。氧合Hb占總Hb的百分數(shù)(稱百分飽和度)隨O2濃度變化而改變。(二)血紅蛋白的構(gòu)象變化與結(jié)合氧當前第56頁\共有73頁\編于星期六\11點肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白(Hb)的氧解離曲線當前第57頁\共有73頁\編于星期六\11點*協(xié)同效應(cooperativity)一個寡聚體蛋白質(zhì)的一個亞基與其配體結(jié)合后,能影響此寡聚體中另一個亞基與配體結(jié)合能力的現(xiàn)象,稱為協(xié)同效應。如果是促進作用則稱為正協(xié)同效應(positivecooperativity)如果是抑制作用則稱為負協(xié)同效應

(negativecooperativity)當前第58頁\共有73頁\編于星期六\11點當前第59頁\共有73頁\編于星期六\11點O2血紅素與氧結(jié)合后,鐵原子半徑變小,就能進入卟啉環(huán)的小孔中,繼而引起肽鏈位置的變動。當前第60頁\共有73頁\編于星期六\11點變構(gòu)效應(allostericeffect)蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的改變伴隨其功能的變化,稱為變構(gòu)效應。當前第61頁\共有73頁\編于星期六\11點(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象改變與疾病蛋白質(zhì)構(gòu)象疾?。喝舻鞍踪|(zhì)的折疊發(fā)生錯誤,盡管其一級結(jié)構(gòu)不變,但蛋白質(zhì)的構(gòu)象發(fā)生改變,仍可影響其功能,嚴重時可導致疾病發(fā)生。當前第62頁\共有73頁\編于星期六\11點蛋白質(zhì)構(gòu)象改變導致疾病的機理:有些蛋白質(zhì)錯誤折疊后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉樣纖維沉淀,產(chǎn)生毒性而致病,表現(xiàn)為蛋白質(zhì)淀粉樣纖維沉淀的病理改變。這類疾病包括:人紋狀體脊髓變性病、老年癡呆癥、亨停頓舞蹈病、瘋牛病等。當前第63頁\共有73頁\編于星期六\11點瘋牛病中的蛋白質(zhì)構(gòu)象改變瘋牛病是由朊病毒蛋白(prionprotein,PrP)引起的一組人和動物神經(jīng)退行性病變。正常的PrP富含α-螺旋,稱為PrPc。PrPc在某種未知蛋白質(zhì)的作用下可轉(zhuǎn)變成全為β-折疊的PrPsc,從而致病。PrPcα-螺旋PrPscβ-折疊正常瘋牛病當前第64頁\共有73頁\編于星期六\11點第四節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)與分離純化ThePhysicalandChemicalCharactersandSeparationandPurificationofProtein當前第65頁\共有73頁\編于星期六\11點(一)蛋白質(zhì)的兩性電離一、理化性質(zhì)蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團,在一定的溶液pH條件下都可解離成帶負電荷或正電荷的基團。*蛋白質(zhì)的等電點(isoelectricpoint,pI)當?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時,蛋白質(zhì)解離成正、負離子的趨勢相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點。當前第66頁\共有

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