生化實驗技術(shù)與方法_第1頁
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文檔簡介

生化實驗技術(shù)與方法第一頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三實驗操作硅膠薄板的制備:注意膠要均勻。1.2g硅膠H加4.0ml0.5%CMC溶液,研磨數(shù)分鐘后,倒在預(yù)先準備好的玻璃板上,鋪開,使?jié){液分部均勻,放在水平臺上,自然晾干。第二頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三2.板的處理:薄板的活化:105℃,0.5h

薄板的刮分:徑向?qū)游龅膬?yōu)點是:樣品展層后圖譜呈弧形帶狀,使Rf值相近的化合物也能清楚地分開。3.點樣:樣品為鼠李糖、木糖和葡萄糖。點樣量8-10μl。注意:點樣點的直徑小于5mm,點樣要少量多次,吹風(fēng)機風(fēng)力不能過大。4.展層:展層溶劑為:乙酸乙酯:甲醇:乙酸:水=12:3:3:2(體積比),新鮮配制。5.顯色:顯色劑:苯胺-二苯胺-磷酸試劑。第三頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三20mm10mm30mm8mm第四頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三第五頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三苯丙氨酸解氨酶的提取純化

實驗原理苯丙氨酸解氨酶(L-phenylalanine:ammonialyase,簡稱PAL;EC4.3.1.5)是植物體內(nèi)苯丙烷類代謝的關(guān)鍵酶,與一些重要的次生物質(zhì)如木質(zhì)素、異黃酮類植保素、黃酮類色素等合成密切有關(guān),在植物正常生長發(fā)育和抵御病菌侵害過程中起重要作用。本次實驗是以銀杏葉為原料采用分步鹽析、透析脫鹽、離子交換等方法得到苯丙氨酸解氨酶。第六頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三儀器高速冷凍離心機;恒溫水浴;電子天平;柱層析系統(tǒng)試劑酶提取液:0.1mol/L硼酸-硼砂緩沖液(含1mmol/LEDTA、20mmol/Lβ-巰基乙醇)固體硫酸銨0.02mol/L磷酸鹽緩沖液(pH8.0,含0.5mmol/LEDTA,2.5%甘油,20mmol/Lβ-巰基乙醇);DEAE纖維素52第七頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三操作步驟酶液提?。?)植物材料2g,剪成小段,加入5倍體積的酶提取液,于冰浴上用研缽研磨。(2)將已勻漿的酶液轉(zhuǎn)入離心管,4000r冷凍離心30min。(3)取離心后的上清液(酶粗提液),量出其體積,留樣0.5ml

。硫酸銨分級沉淀酶蛋白(1)根據(jù)實際體積、溫度和硫酸銨飽和度用量表,算出達到38%飽和度應(yīng)加入酶粗提液中的硫酸銨量,并稱硫酸銨。(240g/L)(2)將酶液倒入燒杯內(nèi),邊緩慢攪拌邊緩慢加入稱好的固體硫酸銨,待全部加完后,再緩慢攪拌10min;然后于9000r離心15min,保留上清液于燒杯內(nèi)。(3)根據(jù)硫酸銨飽和度用量表,算出從38%到75%飽和度所需硫酸銨用量。(222g/L)(4)按上述(2)步同法處理,離心后,棄去上清液,保留沉淀。(5)將沉淀溶于2ml酶抽提液中,留樣0.5ml

。透析脫鹽酶液裝入透析袋,放入低鹽溶液中透析過夜,留樣0.5ml。第八頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三銀杏葉2g+10ml酶提取液研磨4000rpm、30min取上清液加硫酸銨至飽和度38%

9000rpm、15min取上清液加硫酸銨至飽和度75%

9000rpm、15min取沉淀溶于2ml酶抽提液透析第九頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三純化離子交換層析DEAE纖維素(1)稱取DEAE纖維素52干粉1~1.5g,加20ml的0.02mol/L磷酸鹽緩沖液(pH8.0)浸泡4h以上(或浸泡過夜)。(2)裝柱:把預(yù)處理的DEAE纖維素52裝柱。裝柱完成后,用2~3個床體積的0.02mol/L磷酸鹽緩沖液(pH8.0)洗脫平衡該柱。(3)上樣:把所得的酶洗脫液小心地注入柱床面中央,上樣結(jié)束后,在床面以上小心地加入0.02mol/L磷酸鹽緩沖液2~3cm厚液層。注意上樣開始就收集流出液。(4)洗柱:約用2倍床體積的A液(0.02mol/L磷酸鹽緩沖液)及B液(含1mol/LNaCl的0.02mol/L磷酸鹽緩沖液)洗柱,按洗脫管編號,取A280值高的管中洗脫液測其PAL的活力;合并主要含有PAL活力的各管洗脫液,并量出其體積(ml)。第十頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三苯丙氨酸解氨酶的活力測定

PAL催化L-苯丙氨酸裂解為反式肉桂酸,反式肉桂酸在290nm處有最大吸收值。若酶的加入量適當(dāng),A290升高的速率可在幾小時內(nèi)保持不變,因此通過測定A290升高的速率以測定PAL活力。規(guī)定1h內(nèi)A290增加0.01為PAL的一個活力單位。第十一頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三取試管2支,按表中所述(0號為調(diào)零管,1號為測定管。注意按表格從上到下的順序加入試劑)。(單位:ml)

試劑類型調(diào)零管(0號)待測管(1號)pH8.7的0.1mol/L硼酸緩沖液320.1mol/LL-苯丙氨酸溶液0

1樣品(酶)溶液0.1

0.1將各管混勻,放入40℃恒溫水浴保溫1h(準確計時),到時各加0.2ml2mol/LHCl終止反應(yīng)。紫外分光光度于波長290nm處測定1號管的A290。第十二頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三蛋白質(zhì)測定(考馬斯亮藍染色法)取酶液0.1ml,用蒸餾水稀釋至5ml取試管8支,按下表加入各溶液:將上述各試管混勻,靜置2min,測定各管的A595。

試管編號01234567標(biāo)準蛋白質(zhì)溶液(ml)50ug/ml00.20.40.60.81.0//稀釋酶液(ml)//////1.01.0蒸餾水(ml)2.01.81.61.41.21.01.01.0考馬斯亮藍(ml)2.02.02.02.02.02.02.02.0第十三頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三PAL總活力、比活力、蛋白質(zhì)含量的計算步驟體積(ml)蛋白質(zhì)含量(mg)總活力(m)比活力(m/mgprotein)粗提硫酸銨沉淀透析離子交換層析第十四頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳

(SDS-PAGE)測定蛋白質(zhì)分子量

原理:SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白質(zhì)的電泳方法,特別是用于蛋白質(zhì)純度檢測和測定蛋白質(zhì)分子量。電泳遷移率與顆粒的電荷、形狀、大?。ǚ肿恿浚┯嘘P(guān),如電荷、形狀都一樣,則電泳遷移率只與分子量有關(guān)。第十五頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三SDS是在PAG系統(tǒng)中引進SDS(十二烷基磺酸鈉)。

SDS的作用:1.能斷裂分子內(nèi)和分子間氫鍵,破壞蛋白質(zhì)的二級和三級結(jié)構(gòu),強還原劑(巰基乙醇)能使二硫鍵斷裂,使蛋白質(zhì)完全變性。2.能與變性的蛋白質(zhì)按比例結(jié)合,形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物。SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物的特點:1.由于結(jié)合大量的SDS,使蛋白質(zhì)喪失了原有的電荷狀態(tài),從而降低或消除了各種蛋白質(zhì)分子之間天然的電荷差異。2.復(fù)合物都是橢圓棒狀,從而降低或消除了各種蛋白質(zhì)分子之間天然的形狀差異。因此在進行電泳時,蛋白質(zhì)分子的遷移速度取決于分子大小。第十六頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三測定各條帶的相對遷移率,根據(jù)已知蛋白質(zhì)分子量和它們的相對遷移率,以相對遷移率為橫坐標(biāo),lgMr為縱坐標(biāo)作標(biāo)準曲線。根據(jù)未知蛋白質(zhì)的相對遷移率從標(biāo)準曲線上查出它們的lgMr,再換算成蛋白質(zhì)分子量.第十七頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三

在一定范圍內(nèi),蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關(guān)系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW為分子量,X為遷移率,k、b均為常數(shù)。若將已知分子量的標(biāo)準蛋白質(zhì)的遷移率對分子量對數(shù)作圖,可獲得一條標(biāo)準曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標(biāo)準曲線上求得分子量。第十八頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三操作如同PAGE。樣品:蛋白質(zhì)要完全變性。蛋白質(zhì)+SDS+巰基乙醇100℃2-5分鐘標(biāo)準蛋白市場有售,被測蛋白質(zhì)的分子量應(yīng)在標(biāo)準蛋白分子量以內(nèi)。染色:考馬氏亮藍、銀染色該法測定蛋白質(zhì)分子量的局限性:1.蛋白質(zhì)是由亞基(如血紅蛋白)或兩條以上肽鏈(如胰凝乳蛋白酶)組成的,測定時只是它們的亞基或單條肽鏈的MW。2.電荷異常的蛋白質(zhì)(如組蛋白,帶大量正電荷)3.結(jié)構(gòu)異常,不于分子量呈線性關(guān)系(如膠原蛋白)4.帶有較大輔基的蛋白質(zhì)(如糖蛋白)第十九頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三實驗操作編號溶液名稱12%分離膠4%濃縮膠130%Acr–0.8%Bis2.0ml0.2ml2pH8.8Tris-HCI1.25ml-3pH6.8Tris-HCI-0.375ml410%SDS50ul15ul5TEMED5ul5ul610%AP50ul15ul7H2O1.65mlo.9ml總體積約5mL約1.5mL

膠的制備第二十頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三標(biāo)準蛋白質(zhì)分子量兔磷酸化酶B97400牛血清白蛋白66200兔肌動蛋白43000牛碳酸酐酶31000胰蛋白酶抑制劑20100雞蛋清溶菌酶14400第二十一頁,共二十三頁,編輯于2023年,星期三樣品的處理:按0.5mg蛋白質(zhì)/1mL溶液的比例向標(biāo)準蛋白質(zhì)或待測樣品中加入樣品溶解液(小試管),充分溶解后,置沸水浴3min,取出冷至室溫。加樣量:20μl,標(biāo)準蛋白(M)全加。電泳:點樣端負極,恒壓:開始80V,待樣品進入分離膠后120V。電極緩

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