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文檔簡(jiǎn)介
高級(jí)植物生理學(xué)第一章植物生理與分子生物學(xué)詳解演示文稿本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第1頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分優(yōu)選高級(jí)植物生理學(xué)第一章植物生理與分子生物學(xué)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第2頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分啟動(dòng)子上游調(diào)節(jié)區(qū)起點(diǎn)外顯子1外顯子2外顯子3RNA-5′DNA一個(gè)結(jié)構(gòu)基因終點(diǎn)單順?lè)醋?/p>
①真核基因是單順?lè)醋樱╟istron),一條成熟的mRNA鏈只能翻譯出一條多肽鏈。原核生物是多基因操縱子。1、真核細(xì)胞基因結(jié)構(gòu)的特征例外:C.elegans有13500個(gè)基因,約25%是多順?lè)醋?。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第3頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分啟動(dòng)子上游調(diào)節(jié)區(qū)起點(diǎn)基因1基因2基因3RNA-5′DNA三個(gè)結(jié)構(gòu)基因終點(diǎn)多順?lè)醋哟竽c桿菌乳糖操縱子mRNA編碼3條多肽鏈,色氨酸操縱子mRNA編碼5條多肽鏈本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第4頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分真核生物rRNA基因結(jié)構(gòu)ETSITS不轉(zhuǎn)錄間隔18S5.8S28S45SrNA前體rRNA基因真核rRNA基因是多考貝(中度重復(fù)序列);三種rRNA基因總是按18S、5.8S、28S順序排列;此基因簇是串聯(lián)重復(fù)的,簇與簇之間由不轉(zhuǎn)錄間隔分開(kāi);間期核中rDNA濃縮成核仁,在核仁中被轉(zhuǎn)錄、加工。18S5.8S28S本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第5頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分核小體DNA核小體螺線管超螺線管染色單體
②真核基因組是以染色體(質(zhì))形式存在,小部分DNA是裸露的。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第6頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分DNA(基因)mRNA編碼區(qū)尾部區(qū)起始密碼終止密碼extronintron前導(dǎo)區(qū)
③真核基因組中存在著重復(fù)序列。高度重復(fù)序列;中度重復(fù)序列;單一序列。
④真核基因?qū)儆跀嗔鸦颍幋a序列中存在有內(nèi)含子。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第7頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
⑤真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)很大,可遠(yuǎn)離啟動(dòng)子上千個(gè)堿基。
⑥真核基因的表達(dá)——轉(zhuǎn)錄和翻譯存在著時(shí)間和空間間隔。
⑦真核基因表達(dá)的調(diào)控可從染色體結(jié)構(gòu)至翻譯后加工多個(gè)層次(水平)上進(jìn)行。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第8頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分原核生物基因表達(dá)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第9頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分真核細(xì)胞基因表達(dá)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第10頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
2、植物的基因組基因(gene)?基因組(genome)?基因組學(xué)(genomics)?
遺傳物質(zhì)單元,在染色體上占據(jù)特定位置、具有某種特定遺傳功能的DNA序列。編碼一個(gè)完整mRNA的一段DNA序列。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第11頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分基因有兩個(gè)特點(diǎn):一、忠實(shí)復(fù)制自己:以保持生物的基本特征;二、基因能夠突變:為自然選擇貯備了材料;
基因是遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),是DNA分子上具有遺傳信息的特定核苷酸序列的總稱(chēng),是具有遺傳效應(yīng)的DNA分子片段。基因通過(guò)復(fù)制把遺傳信息傳遞給下一代,使后代出現(xiàn)與親代相似的性狀。突變絕大多數(shù)會(huì)導(dǎo)致疾病,另外的一小部分是非致病突變。非致病突變給自然選擇帶來(lái)了原始材料,使生物可以在自然選擇中被選擇出最適合自然的個(gè)體。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第12頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
基因可分為:
①結(jié)構(gòu)基因:編碼蛋白質(zhì)的基因。包括編碼酶和結(jié)構(gòu)蛋白的基因;
②調(diào)節(jié)基因:編碼作用于結(jié)構(gòu)基因的阻遏蛋白或激活蛋白的基因;
③沒(méi)有翻譯產(chǎn)物的基因:RNA基因,轉(zhuǎn)錄成為tRNA和rRNA基因;
④不轉(zhuǎn)錄的DNA區(qū)段:調(diào)控序列,如啟動(dòng)子、操縱子、增強(qiáng)子等等。
(順式作用元件)基因的屬性:結(jié)構(gòu)單位,功能單位,突變單位。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第13頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分基因組:一個(gè)生物遺傳物質(zhì)的總和。細(xì)胞中的全部DNA。植物的基因組:細(xì)胞核基因組+細(xì)胞質(zhì)基因組葉綠體基因組+線粒體基因組基因組學(xué):研究基因組的結(jié)構(gòu)、功能和進(jìn)化的科學(xué)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第14頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
基因組研究包括兩方面的內(nèi)容:以全基因組測(cè)序?yàn)槟繕?biāo)的結(jié)構(gòu)基因組學(xué)(structuralgenomics)以基因功能鑒定為目標(biāo)的功能基因組學(xué)(functionalgenomics)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第15頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
2.1植物基因組的復(fù)雜性
(3)植物基因組中重復(fù)序列變化極大;
擬南芥和一些多倍體植物中:20%;小麥、豌豆中,80%以上基因是重復(fù)序列;(1)植物除了細(xì)胞核基因組外,還有細(xì)胞質(zhì)基因組;(2)植物基因組的長(zhǎng)度差異是整個(gè)生物界最大的;
擬南芥單倍體基因組:6.3×107bp;百合單倍體基因組:1.0×1011bp;本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第16頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分物種堿基對(duì)數(shù)目/物理長(zhǎng)度/cm(×108bp/細(xì)胞)擬南芥(Arabidopsisthaliana)1.253.8栽培稻(Oryzasativm)4.313.1普通小麥(TriticumAestivum)160493一粒小麥(Triticum
Monococcum)57173玉米(Zeamays)2370貝母(Fritillariaassyriaca)10003039人類(lèi)(Hemosapiens)31102大腸桿菌(E.coli)0.0420.14玉米葉綠體0.00160.006玉米線粒體0.00570.02一些物種細(xì)胞核基因組(二倍體)大小本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第17頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
基因組的復(fù)雜性是指基因組中不同序列的總和,用DNA變性和復(fù)性實(shí)驗(yàn)檢測(cè);可用參數(shù):Co
t1/2表示;Co:復(fù)性時(shí)相同(單鏈)DNA的濃度;t:復(fù)性的時(shí)間
Co
t1/2:一半DNA復(fù)原成雙鏈所用的時(shí)間;基因組越復(fù)雜,Co
t1/2
值越大。
基因組的序列可分為單一序列(singlecopysequence)和重復(fù)序列(repetitivesequence)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第18頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分植物基因組中的重復(fù)序列:高度重復(fù)序列:重復(fù)幾百萬(wàn)次,一般是少于10bp的片段;
中度重復(fù)序列:幾十到上千次,約300~500bp相近順序;
單一序列:在基因組中只出現(xiàn)一次或少數(shù)幾次的序列。串聯(lián)重復(fù)序列(tandemlyrepeatedsequences):重復(fù)序列以各自的核心序列(重復(fù)單元)首尾相連多次重復(fù),重復(fù)序列間被間隔序列分開(kāi)。散布重復(fù)序列(dispersedRepeatedSequence):主要是一些可移位的遺傳因子:轉(zhuǎn)座子和逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第19頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分rRNA基因:ETSITS不轉(zhuǎn)錄間隔18S5.8S28S45SrNA前體rRNA基因串聯(lián)重復(fù),簇之間由不轉(zhuǎn)錄間隔分開(kāi);18S5.8S28S衛(wèi)星DNA(satelliteDNA):動(dòng)物的衛(wèi)星DNA富含AT;植物衛(wèi)星DNA富含GC;端粒重復(fù)序列:真核生物間高度保守;人和椎蟲(chóng):TTAGGG;擬南芥和小麥:TTTAGGG本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第20頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分葉綠體基因組(chloroplastgenome):
多數(shù)被子植物cpDNA在120~160kb之間;含有87~183個(gè)已知基因;煙草86684253391848225339LSCSSCIRAIRBrRNArRNA
4rRNA基因、30tRNA基因、4RNA聚合酶基因、21核糖體蛋白質(zhì)基因、31光合作用相關(guān)基因、40其它蛋白質(zhì)基因。擬南芥84170262641778026264本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第21頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分植物長(zhǎng)度/bpP基因數(shù)R基因數(shù)GenBank編號(hào)擬南芥1544788845NC-000932煙C-001897月見(jiàn)草16395311846NC-002693水C-001320菠C-002202小麥1345458450NC-002762玉C-001666已知DNA序列的植物質(zhì)體基因組
cpDNA存在于“類(lèi)核體(nucleoid)”中,葉綠體中可有10~20個(gè)類(lèi)核體(每個(gè)可有2~20個(gè)DNA分子)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第22頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分線粒體基因組(mitochondrialgenome)
植物mtDNA長(zhǎng)度變異很大,195~2600kb;動(dòng)物mtDNA為15~18kb;真菌在18~78kb;基因組的大小并不表示基因數(shù)量的多少:
擬南芥mtDNA376kb,人mtDNA為16.6kb,前者比后者RNA基因多1個(gè),蛋白質(zhì)基因27:13。在同一細(xì)胞中可有不同長(zhǎng)度的mtDNA。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第23頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
mtDNA有分子內(nèi)、分子間重組,也可與核、葉綠體基因組DNA重組。因此mtDNA的重排、序列加倍、與外源DNA整合的幾率很高,由此產(chǎn)生新的嵌合基因。細(xì)胞質(zhì)雄性不育就是由于新的嵌合基因?qū)е碌摹?/p>
植物細(xì)胞內(nèi)的三類(lèi)基因組存在著廣泛的相互作用。葉綠體和線粒體的結(jié)構(gòu)蛋白多數(shù)由核基因組編碼:細(xì)胞器基因轉(zhuǎn)移至核基因組;
也有基因從核基因組轉(zhuǎn)移至細(xì)胞器基因組:核糖體L23蛋白質(zhì)基因。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第24頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
葉綠體、線粒起源:馬古利斯的內(nèi)共生理論
分子生物學(xué)證據(jù):1、線粒體和葉綠體僅能來(lái)自已有的線粒體和葉綠體;2、基因組結(jié)構(gòu)與原核生物相似;3、有自已的蛋白質(zhì)合成體系,且與原核生物相似;4、能抑制細(xì)菌RNA聚合酶的抗生素也能 抑制線粒體和葉綠體RNA聚合酶。5、葉綠體基因結(jié)構(gòu)中有象細(xì)菌那的啟動(dòng)子、操縱子結(jié)構(gòu)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第25頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
2.2基因組學(xué)簡(jiǎn)介
1995,第一個(gè)細(xì)胞生物,流感嗜血菌基因組1.8Mb測(cè)序完成;1996,第一個(gè)真核生物,啤酒酵母基因組12Mb測(cè)序完成;1998,第一個(gè)動(dòng)物,美麗線蟲(chóng)基因組(97Mb)測(cè)序完成;2000,第一個(gè)昆蟲(chóng),果蠅基因組(120Mb)測(cè)序完成;2000,第一個(gè)植物,擬南芥基因組(125Mb)測(cè)序完成;2001,第一個(gè)哺乳動(dòng)物,人的基因組(3100Mb)測(cè)序完成;2002,第一個(gè)重要作物,水稻基因組(430Mb)測(cè)序完成;599病毒,205種自然質(zhì)粒,185種細(xì)胞質(zhì)基因組,31種細(xì)菌;本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第26頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分?jǐn)M南芥:十字花科,擬南芥屬;基因組較簡(jiǎn)單:染色體n=5核基因組=1億bp。生命周期短,種子產(chǎn)量大:一代的時(shí)間為3~5周單株可產(chǎn)無(wú)數(shù)粒種子;之稱(chēng)為植物中的“果蠅”模式植物
基因組分析中包含的內(nèi)容較多,主要分為三個(gè)緊密相連的部分,即作圖、通過(guò)突變體研究基因功能和基因克隆及測(cè)序。
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第27頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分突變體的研究擬南芥基因組研究的目標(biāo)之一,是利用基因突變的方法研究基因功能。基因突變的方法包括化學(xué)誘變,放射性照射,T-DNA或轉(zhuǎn)座子插入等。若按擬南芥菜的基因組中有25000個(gè)單拷貝的轉(zhuǎn)錄單位來(lái)算,現(xiàn)在已鑒定了的基因位點(diǎn)約為這些轉(zhuǎn)錄單位的六分之一。通過(guò)對(duì)胚胎及幼苗致死突變體的研究,發(fā)現(xiàn)大約有4000多個(gè)基因位點(diǎn)與胚胎及幼苗致死有關(guān);對(duì)葉綠素缺陷型植物的研究又鑒定了500多個(gè)新的基因位點(diǎn)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第28頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
基因組學(xué)研究的具體內(nèi)容有:(1)建立以互聯(lián)網(wǎng)為平臺(tái)的數(shù)據(jù)庫(kù);(2)組建基因組的物理圖譜和遺傳圖譜;(3)確定基因及基因組的序列;(4)分析基因組的結(jié)構(gòu)特點(diǎn);(5)鑒定基因組中所有基因,并確定其功能;(6)建立基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù);(7)建立基因及表型之間的關(guān)系(功能基因組學(xué));(8)確定DNA的復(fù)雜性;(9)為比較不同生物的基因組提供資料;本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第29頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
世界上有三大基因序列數(shù)據(jù)庫(kù):美國(guó)“國(guó)家生物技術(shù)信息中心”(NCBI)主持的GeneBank:
“歐洲生物信息學(xué)研究所”(EBI)主持的EMBL數(shù)據(jù)庫(kù);
日本“國(guó)家遺傳學(xué)研究所”(NIG)主持的日本DNA數(shù)據(jù)庫(kù)(DDBJ)
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第30頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分基因的命名:
植物基因命名委員會(huì):
CommissiononPlantGeneNomenclature,CPGN
根據(jù)基因序列,把植物基因分成不同的家族;CPGN規(guī)定:基因符號(hào)最多8個(gè):
XyzN,核基因組基因;
xyzN,細(xì)胞質(zhì)基因組基因本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第31頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
根據(jù)突變型的表型命名:基因名稱(chēng)與正常功能相反;
矮化基因——高生長(zhǎng)基因
基因符號(hào)用三個(gè)斜體字母表示,基因產(chǎn)物用正體大寫(xiě):突變型基因用小寫(xiě):abc野生型基因用大寫(xiě):ABCABC是該基因的產(chǎn)物
Abc+指ABC基因的表型(野生型);
Abc-指abc基因的表型(突變型);
ABC1和ABC2是不同的基因;abc4-1和
abc4-2為相同基因的不同等位基因;本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第32頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
3植物基因的結(jié)構(gòu)某種生物全部基因的克隆總體——基因組文庫(kù)
克隆植物中編碼蛋白質(zhì)基因的方法:
①根據(jù)蛋白質(zhì)測(cè)序結(jié)果,合成一段寡聚探針,從該植物的基因組文庫(kù)與cDNA(complementaryDNA)文庫(kù)中分別釣出編碼該蛋白質(zhì)的基因與cDNA克隆。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第33頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分克隆與基因組文庫(kù)的構(gòu)建本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第34頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分文庫(kù)的構(gòu)建cDNA本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第35頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
探針是一段與目的基因有互補(bǔ)序列的用放射性同位素(32P)標(biāo)記的DNA或RNA分子。利用“探針”分子釣取目的基因
構(gòu)建基因文庫(kù)的目的主要是為了直接從基因組中分離目的基因,有了基因文庫(kù)后,目的基因的制備可以理解為從基因文庫(kù)中“釣出”目的基因。
兩條來(lái)源不同的具有一定同源性(即具有堿基互補(bǔ)關(guān)系)的DNA單鏈分子或DNA單鏈與RNA分子經(jīng)退火形成雙鏈DNA分子或DNA-RNA異質(zhì)雙鏈分子的過(guò)程稱(chēng)為核酸分子雜交。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第36頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分核酸分子雜交電泳分離轉(zhuǎn)膜探針雜交放射顯影本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第37頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分核酸分子雜交操作程序本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第38頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第39頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
②根據(jù)蛋白質(zhì)測(cè)序結(jié)果,合成一對(duì)或數(shù)對(duì)PCR引物,以植物總DNA為模板,擴(kuò)增出目標(biāo)基因片段。
以此片段為探針,從基因組文庫(kù)與cDNA文庫(kù)中分別釣出編碼該蛋白質(zhì)的基因與cDNA克隆。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第40頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
③基因產(chǎn)物不明,但知道基因突變后的表型,可用轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法分離基因。
×顯性純合子隱性純合子
雜合子顯性表型
雜合子突變表型隱性突變株正常未突變株基因組文庫(kù)I基因組文庫(kù)II轉(zhuǎn)座子探針帶轉(zhuǎn)座子DNA片段完整目的基因亞克隆探針本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第41頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
④利用RFLP圖譜,找出與所要克隆基因緊密連鎖的分子標(biāo)記,用染色體步行法找到所要克隆的基因。
AB已知基因未知基因步行探針間隔100Kb本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第42頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
⑥核DNA減法克隆。利用缺失突變體與同源親本1~2DNA片段的差異克隆目的基因。
⑤如果該基因受某種因素誘導(dǎo)表達(dá),可用mRNA差異顯示法找到所要克隆的基因。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第43頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
克隆到基因與cDNA后,測(cè)序,對(duì)比基因全序列與cDNA序列,了解基因結(jié)構(gòu):如轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),內(nèi)含子數(shù)量、位置及長(zhǎng)度,終止密碼與加尾信號(hào)的位置等。通過(guò)對(duì)比研究,表明植物基因結(jié)構(gòu)與其它真核基因結(jié)構(gòu)相似,主要由4個(gè)結(jié)構(gòu)區(qū)域組成。
5’上游區(qū)、5’非翻譯區(qū)、編碼區(qū)、3’非翻譯區(qū)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第44頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分5’上游區(qū)5’非翻譯區(qū)編碼區(qū)3’非翻譯區(qū)高等植物基因結(jié)構(gòu)增強(qiáng)子啟動(dòng)子CAATTATACapATG信號(hào)肽內(nèi)含子AATAAA外顯子1外顯子2多聚腺苷酸終止序列+1本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第45頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
3.15’上游區(qū):
轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)5’端上游一段很長(zhǎng)的區(qū)域,包含啟動(dòng)子在內(nèi)的與基因表達(dá)起始和表達(dá)調(diào)控有關(guān)的許多元件。
NNNNNNCTCATCANNN+1+78該區(qū)域結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是:①基因啟動(dòng)區(qū)序列中,在轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)附近有一一致序列(consensussequence):CTCATCA,其中的一個(gè)A為轉(zhuǎn)錄起始核苷酸,此A編為+1,轉(zhuǎn)錄本中為正數(shù),此A的上游用負(fù)數(shù)表示。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第46頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
在–75附近處常有GC(T/C)CAATCT一致序列,簡(jiǎn)稱(chēng)CAATbox,確定RNA聚合酶結(jié)合部位,具有增強(qiáng)基因轉(zhuǎn)錄的作用。
②在上游–327有一段TCACTATATAG一致順序:簡(jiǎn)稱(chēng):TATAbox。
該序列是RNA聚合酶II準(zhǔn)確起始轉(zhuǎn)錄所必需的。增強(qiáng)子啟動(dòng)子CAATTATACapATG信號(hào)肽內(nèi)含子AATAAA外顯子1外顯子2多聚腺苷酸終止序列本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第47頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
③在5’遠(yuǎn)上游區(qū),存在對(duì)基因表達(dá)有增強(qiáng)或抑制作用、決定基因表達(dá)特定時(shí)空順序以及對(duì)激素和外界脅迫起應(yīng)答作用的序列——順式作用元件(cis-actingelement)
轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)到CAATbox附近這一區(qū)段稱(chēng)為啟動(dòng)子。
GCbox:–110附近的GGGCGG保守序列,確定RNA聚合酶結(jié)合部位。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第48頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
3.25’非翻譯區(qū):5’非翻譯區(qū)增強(qiáng)子啟動(dòng)子CAATTATACapATG信號(hào)肽內(nèi)含子AATAAA外顯子1外顯子2多聚腺苷酸終止序列
轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)到翻譯起始密碼子之間的序列。該序列5’端是前體mRNA加帽位點(diǎn)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第49頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
3.3編碼區(qū):
起始密碼到終止密碼之間的序列。有時(shí)專(zhuān)指外顯子(extron)部分。
①多數(shù)植物基因轉(zhuǎn)錄本5’有一個(gè)起始密碼AUG,少數(shù)植物5’有4個(gè)AUG,但真正起始密碼是第四個(gè)。
翻譯起點(diǎn)的共有序列:植物:C(G)AANNATGG動(dòng)物:A(G)----NNATGG
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第50頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分轉(zhuǎn)錄的基本原則——堿基互補(bǔ):A=TG=CA=U本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第51頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
也稱(chēng)“GT-AG法則”
③編碼區(qū)中常有數(shù)目不等的內(nèi)含子(intron)。外顯子與內(nèi)含子交界處共有序列是:外顯子···AG
GTAAGT
···內(nèi)含子···
TCNAG
G···外顯子
②外顯子中4種堿基比例:
單子葉植物:AT含量43%;雙子葉植物:AT含量54%;CapATG信號(hào)肽內(nèi)含子AATAAA外顯子1外顯子2多聚腺苷酸AGGTAAGTNCAGG本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第52頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
內(nèi)含子共有4種,具有核酶性質(zhì):
I類(lèi)內(nèi)含子:主要存在于rRNA和質(zhì)體tRNA基因中,中間部分高度保守;II類(lèi)內(nèi)含子:主要存在于線粒體和質(zhì)體mRNA基因中,拼接點(diǎn)的序列高度保守;III類(lèi)內(nèi)含子:主要存在于核mRNA基因中;IV類(lèi)內(nèi)含子:存在于核tRNA基因中;本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第53頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
3.43’非翻譯區(qū):3’末端有轉(zhuǎn)錄本mRNA的加尾信號(hào):AATAAAA98A86T98A98A95A96
終止密碼后的序列,也有一些調(diào)控序列,對(duì)mRNA的穩(wěn)定性和翻譯效率起調(diào)節(jié)作用。
3種終止密碼使用的頻率為:
單子葉植物:TGA46%,TAA28%,TAG26%雙子葉植物:TAA46%,TGA36%,TAG18%本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第54頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分前導(dǎo)區(qū)編碼區(qū)尾部區(qū)DNA+1起始密碼終止密碼信號(hào)肽序列加尾信號(hào)mRNA5’端帽子結(jié)構(gòu)m7G5’PPP5’NP3’端polyA尾巴20~200base真核細(xì)胞mRNA的結(jié)構(gòu)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第55頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
4植物基因的表達(dá)調(diào)控
真核基因表達(dá)調(diào)控的顯著特征是:
能在特定時(shí)間、特定空間的細(xì)胞中激活特定基因,從而實(shí)現(xiàn)“預(yù)定”的、有序的、不可逆的分化、發(fā)育過(guò)程;
并使生物的組織、器官在一定的環(huán)境條件范圍內(nèi)保持正常功能。
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第56頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分大腸桿菌乳糖操縱子結(jié)構(gòu)
根據(jù)調(diào)控的性質(zhì)可分:
①瞬間調(diào)控——可逆調(diào)控。相當(dāng)于原核細(xì)胞對(duì)環(huán)境條件變化做出的反應(yīng)。包括某種底物或激素水平升降時(shí),對(duì)細(xì)胞周期不同階段中酶活性和濃度的調(diào)節(jié)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第57頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
②生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控——不可逆調(diào)控。真核基因調(diào)控的精髓部分,基因按“預(yù)定”的時(shí)、空順序表達(dá),從而實(shí)現(xiàn)生長(zhǎng)、分化、發(fā)育的全過(guò)程。
在植物的生命周期中,基因表達(dá)具有時(shí)空專(zhuān)一性(生長(zhǎng)發(fā)育進(jìn)程專(zhuān)一性和細(xì)胞、組織、器官特異性),同時(shí)受環(huán)境因素的影響。持家基因(管家基因);時(shí)、空專(zhuān)一性表達(dá)基因;環(huán)境因素誘導(dǎo)表達(dá)基因;本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第58頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分持家基因表達(dá)水平受環(huán)境因素影響較小,在個(gè)體各個(gè)生長(zhǎng)階段幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小,因此常存在于生物細(xì)胞核的常染色質(zhì)中。
持家基因(house-keepinggenes):又稱(chēng)管家基因,是指所有細(xì)胞中均要表達(dá)的一類(lèi)基因,其產(chǎn)物是對(duì)維持細(xì)胞基本生命活動(dòng)所必需的。持家基因是一類(lèi)始終保持著低水平甲基化并且一直處于活性轉(zhuǎn)錄狀態(tài)的基因。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第59頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
持家基因的表達(dá)只受啟動(dòng)序列或啟動(dòng)子與RNA聚合酶相互作用的影響,而不受其他機(jī)制調(diào)節(jié)。在組成型啟動(dòng)子調(diào)控下,不同組織器官和發(fā)育階段的基因表達(dá)沒(méi)有明顯差異。目前使用最廣泛的組成型啟動(dòng)子是花椰菜花葉病毒(CaMV)35S啟動(dòng)子、來(lái)自根癌農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒T-DNA區(qū)域的冠癭堿合成酶基因啟動(dòng)子(Nos、Ocs啟動(dòng)子),后者雖來(lái)自細(xì)菌,但具有植物啟動(dòng)子的特性。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第60頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
由于組成型啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的基因在各組織中均有一定程度表達(dá),應(yīng)用中存在一定問(wèn)題。如外源基因在整株植物中表達(dá),產(chǎn)生大量異源蛋白或代謝產(chǎn)物在植物體內(nèi)積累,打破植物原有代謝平衡,有些產(chǎn)物對(duì)植物并非必需甚至有毒,因而阻礙了植物的正常生長(zhǎng),甚至導(dǎo)致死亡。另外,重復(fù)使用同一種啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)兩個(gè)或兩個(gè)以上的外源基因可能引起基因沉默或共抑制現(xiàn)象。因此,人們尋找更為有效的組織、器官特異性啟動(dòng)子代替組成型啟動(dòng)子,以更好地調(diào)控植物基因表達(dá)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第61頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分時(shí)、空專(zhuān)一性表達(dá)基因:
這類(lèi)基因的表達(dá)往往只限于生長(zhǎng)發(fā)育的特定時(shí)期,以及某些特定的器官組織中,并表現(xiàn)出生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)節(jié)特性?;蚪M織特異性表達(dá)通常是以組織細(xì)胞的結(jié)構(gòu)和化學(xué)、物理信號(hào)為基礎(chǔ),通過(guò)組織特異性啟動(dòng)子活動(dòng)實(shí)現(xiàn)的。組織特異性啟動(dòng)子能使目的基因的表達(dá)產(chǎn)物在一定器官或組織積累,執(zhí)行特定的功能,同時(shí)避免了植物營(yíng)養(yǎng)的不必要浪費(fèi)。作為植物基因工程最有前景的調(diào)控元件,組織特異性啟動(dòng)子成為近年研究的熱點(diǎn)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第62頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分環(huán)境因素誘導(dǎo)表達(dá)基因:在長(zhǎng)期適應(yīng)和進(jìn)化過(guò)程中,植物形成了感知環(huán)境并能做出適應(yīng)性反應(yīng)的特性。主要是通過(guò)啟動(dòng)不同基因的表達(dá)可在一定范圍內(nèi)適應(yīng)光、溫、水等環(huán)境的變化。環(huán)境因素誘導(dǎo)表達(dá)基因是在某些特定的物理或化學(xué)信號(hào)的刺激下,通過(guò)誘導(dǎo)型啟動(dòng)子活動(dòng)實(shí)現(xiàn)的。天然誘導(dǎo)型啟動(dòng)子包括光、溫度、激素應(yīng)答啟動(dòng)子等。目前已經(jīng)分離了光誘導(dǎo)表達(dá)基因啟動(dòng)子、熱誘導(dǎo)表達(dá)基因啟動(dòng)子、創(chuàng)傷誘導(dǎo)表達(dá)基因啟動(dòng)子、真菌誘導(dǎo)表達(dá)基因啟動(dòng)子和共生細(xì)菌誘導(dǎo)表達(dá)基因啟動(dòng)子等。
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第63頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分確定某種基因在何種組織專(zhuān)一表達(dá)的方法:
①以基因編碼區(qū)中一段序列為探針,從不同組織或器官中提取總mRNA,進(jìn)行Northern雜交。
Northern雜交技術(shù)用于檢測(cè)特異性mRNA的存在。mRNA樣品經(jīng)電泳分離后,轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,與DNA探針進(jìn)行雜交,即可檢測(cè)特異性mRNA分子在樣品中存在與否,量的多少。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第64頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
限制性酶切
電泳
同位素探針雜交
放射自顯影
轉(zhuǎn)膜mRNA
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第65頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分mRNA電泳DNAprobe
轉(zhuǎn)膜
Northern雜交技術(shù)廣泛用于研究特異性mRNA分子在細(xì)胞處于不同條件下發(fā)生量和質(zhì)的變化,或不同組織器官中基因表達(dá)的差異。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第66頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
②Northern原位雜交
指在細(xì)胞、組織切片上直接進(jìn)行分子雜交,通過(guò)檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)特異mRNA的存在與否來(lái)了解哪些細(xì)胞中有特異基因的表達(dá)。
整個(gè)過(guò)程包括材料的預(yù)處理、細(xì)胞固定、細(xì)胞的DNase酶解(降解DNA,減少非特異性雜交)雜交、檢出。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第67頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
③將待測(cè)基因的啟動(dòng)子序列與一報(bào)告基因的編碼區(qū)及3’端終止區(qū)連接,建成融合基因,經(jīng)轉(zhuǎn)化植物細(xì)胞得到再生植株后,檢測(cè)報(bào)告基因在何種組織與細(xì)胞中表達(dá)。常用的報(bào)告基因有:GUS基因、Nos、Ocs基因等。葡萄糖苷酸酶;X-Glucuionicacid(5-bromo-4-chloro-3-indoyl—glucuronicacid)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第68頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分GFP蕎麥細(xì)胞色素的可溶區(qū)段(紅色)本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第69頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
④用基因編碼的蛋白質(zhì)制備出抗體,對(duì)植物不同組織切片進(jìn)行免疫原位雜交。(
Western蛋白質(zhì)雜交技術(shù))本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第70頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分4.1器官、組織專(zhuān)一性表達(dá)的基因②HRGP基因:
編碼富含羥脯氨酸糖蛋白(Hydroxyproline-richglycoproteinHRGP),主要在莖柵狀細(xì)胞、表皮細(xì)胞中表達(dá)。①rbcS基因:
編碼Rubisco小亞基,在葉肉細(xì)胞、保衛(wèi)細(xì)胞、中脈與綠色組織細(xì)胞中表達(dá)。
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第71頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
③P2基因:編碼一種參與花粉管萌發(fā)生長(zhǎng)的蛋白質(zhì),只在雄蕊成熟花粉與花粉管中表達(dá)。
④PAL2基因:編碼PAL,參與花色素形成,只在花瓣中表達(dá)。
⑤Gy4基因:
編碼大豆貯藏蛋白,只在胚乳組織中表達(dá)。
⑥
Amyl基因:
編碼-淀粉酶,種子萌發(fā)時(shí),在糊粉層表達(dá)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第72頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分4.2受環(huán)境影響而表達(dá)的基因①HSP基因:
編碼80~90、65~75、15~30kD幾種熱激蛋白。熱脅迫時(shí),HSF單體在核內(nèi)組裝成三聚體,與DNA的HSE(熱激元件)結(jié)合,刺激HSP-mRNA轉(zhuǎn)錄,翻譯成HSP。HSP參與生物體內(nèi)新生肽的運(yùn)輸、折疊、組裝、定位以及變性蛋白的復(fù)性和降解。
HSP功能:維持變性蛋白質(zhì)的可溶性,使變性蛋白重新折疊成有活性的構(gòu)象,提高蛋白質(zhì)(酶)熱穩(wěn)定性。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第73頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分熱激因子(HSF)循環(huán)激發(fā)熱激蛋白(HSP)mRNA的合成本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第74頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分雙子葉:20單子葉:11低溫誘導(dǎo)基因低溫超量表達(dá)基因;不包括低量、瞬時(shí)表達(dá)基因。同工蛋白(isoform)抗凍蛋白(antifreezeproteinAFP)類(lèi)脂轉(zhuǎn)移蛋白(lipidtransferproteinLTP)胚胎發(fā)育晚期豐富蛋白(LEA)②低溫誘導(dǎo)基因:
植物經(jīng)低溫誘導(dǎo)能使某些特定的基因活化,表達(dá)合成一組新蛋白(Coldacclimationprotein)。
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第75頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
低溫誘導(dǎo)基因品種基因編碼蛋白其他逆境擬南芥
cor
6.6AFP干旱,ABAcor
78NK干旱
cor47D-11LEA干旱,ABAlti
30D-11LEA干旱,ABA油菜
rab18D-11LEA干旱,ABA
Bn115NK
Bn
28AFP大麥
blt4LTP干旱,ABA
blt63EF-laNK
HVA1D-7LEAABA小麥cor39D-11LEA干旱,ABAWcor410D-11LEA干旱,ABA本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第76頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
擬南芥中的冷調(diào)節(jié)蛋白COR6.6、油菜的BN28蛋白與魚(yú)類(lèi)抗凍蛋白有同源性,體外實(shí)驗(yàn)表明冷調(diào)節(jié)蛋白能減少凍融過(guò)程對(duì)類(lèi)囊體膜傷害。擬南芥葉綠體的CORl5蛋白在體外能有效地防止乳酸脫氫酶因冰凍而失活,其效率較蔗糖高出106倍,較其它蛋白高102倍~103倍。
抗凍蛋白(AFP):
一種能降低細(xì)胞間隙體液冰點(diǎn)的糖蛋白。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第77頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
③水分逆境誘導(dǎo)的基因:
水分脅迫會(huì)誘導(dǎo)一些特定的基因表達(dá),合成新蛋白質(zhì)——水分脅迫蛋白(waterstressprotein)。這類(lèi)蛋白質(zhì)多數(shù)是高度親水的,能增強(qiáng)原生質(zhì)的水合度,起到抗脫水的作用。
水分脅迫蛋白的功能可能還包括對(duì)膜結(jié)構(gòu)的保護(hù)、恢復(fù)一些蛋白質(zhì)的活性和形成特定的水、離子通道(如水孔蛋白),改變或調(diào)節(jié)液泡和細(xì)胞質(zhì)中的ψs等。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第78頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
⑤病菌感染誘導(dǎo)的基因:
病原物侵染能刺激植物致病相關(guān)基因表達(dá),合成與正常組織不同的新蛋白,稱(chēng)為“病程相關(guān)蛋白”(PR)。幾丁質(zhì)酶基因、葡聚糖酶基因、PAL基因、CHS基因等。
④創(chuàng)傷誘導(dǎo)的基因:
植物受傷后一些基因往往被誘導(dǎo)表達(dá),如土豆中的蛋白酶抑制劑II基因,其表達(dá)產(chǎn)物抑制多種微生物和昆蟲(chóng)蛋白酶活性。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第79頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分4.3植物基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理
(1)調(diào)控的特點(diǎn)(方式):染色質(zhì)水平的調(diào)控;以正調(diào)節(jié)為主,具有多個(gè)調(diào)控序列;調(diào)控區(qū)很大,遠(yuǎn)離啟動(dòng)子幾百至上千個(gè)bp;存在多種轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控機(jī)制;具有細(xì)胞特異性或組織特異性表達(dá);本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第80頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第81頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分(2)順式作用元件與基因表達(dá)調(diào)控
植物基因的調(diào)控主要在轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行,受特定順式作用元件(cis-actingelement)和反式作用因子(trans-actingfactor)影響。
基因轉(zhuǎn)錄所需的順式作用元件主要是:?jiǎn)?dòng)子(promoter)和增強(qiáng)子(enhancer);本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第82頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分啟動(dòng)子:
核心啟動(dòng)子(corepromoter):
是決定轉(zhuǎn)錄起始位置的關(guān)鍵序列,也是普通轉(zhuǎn)錄因子TFⅡD的結(jié)合位點(diǎn)。①TATAbox:位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游25~
30bp。②起始子(initiator,Inr):是與轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)重疊的短的較保守序列.
與基因轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)有關(guān)的一組DNA序列,位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游
100~200bp以?xún)?nèi),其功能是決定轉(zhuǎn)錄的起始位點(diǎn)和調(diào)控轉(zhuǎn)錄頻率。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第83頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分上游啟動(dòng)子元件:(UpstreamPromoterelement,UPE)位于較上游(30~
110bp),能較強(qiáng)影響轉(zhuǎn)錄起始的頻率,如CAATbox和GCbox。其中GC盒是轉(zhuǎn)錄因子SPl的結(jié)合位點(diǎn)。
組成型啟動(dòng)子(constitutivepromoter):是指在該類(lèi)啟動(dòng)子控制下,結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)大體恒定在一定水平上,在不同組織、部位表達(dá)水平?jīng)]有明顯差異?;ㄒ嘶ㄈ~病毒(CaMV)35S啟動(dòng)子;胭脂堿合成酶基因Nos啟動(dòng)子(具有植物啟動(dòng)子特性)啟動(dòng)子的分類(lèi):本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第84頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
組織特異啟動(dòng)子(tissue-specificpromoter):又稱(chēng)器官特異性啟動(dòng)子。在這類(lèi)啟動(dòng)子調(diào)控下,基因往往只在某些特定的器官或組織部位表達(dá),并表現(xiàn)出發(fā)育調(diào)節(jié)的特性。
例如煙草的花粉絨氈層細(xì)胞中特異表達(dá)基因啟動(dòng)子TA29,豌豆的豆清蛋白(leguimin)基因啟動(dòng)子可在轉(zhuǎn)化植物種子中特異性表達(dá),馬鈴薯塊莖儲(chǔ)藏蛋白(patatin)基因啟動(dòng)子在塊莖中優(yōu)勢(shì)表達(dá)。
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第85頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
根特異啟動(dòng)子:根特異表達(dá)系統(tǒng)可用于研究轉(zhuǎn)基因植物的高滲脅迫耐受、植物修復(fù)和根際分泌等問(wèn)題。
莖特異啟動(dòng)子:莖中特異表達(dá)基因的啟動(dòng)子,不僅可從分子水平了解莖的發(fā)生、分化過(guò)程,更重要的是利用這些啟動(dòng)子調(diào)節(jié)植物代謝可滿(mǎn)足人類(lèi)需求,如人們對(duì)木質(zhì)素生物合成及其調(diào)控的研究。葉特異啟動(dòng)子:花特異啟動(dòng)子:果實(shí)、種子特異性啟動(dòng)子:本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第86頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
誘導(dǎo)型啟動(dòng)子(induciblepromoter):是指在某些特定的物理或化學(xué)信號(hào)的刺激下,該種類(lèi)型的啟動(dòng)子可以大幅度地提高基因的轉(zhuǎn)錄水平。如、熱、創(chuàng)傷、真菌誘導(dǎo)表達(dá)基因啟動(dòng)子和共生細(xì)菌誘導(dǎo)表達(dá)基因啟動(dòng)子等。
天然誘導(dǎo)型啟動(dòng)子
包括光、溫度、激素應(yīng)答啟動(dòng)子等。在進(jìn)化過(guò)程中,植物通過(guò)啟動(dòng)不同基因的表達(dá)可在一定范圍內(nèi)適應(yīng)光、溫、水等環(huán)境的變化。利用這些環(huán)境應(yīng)答基因的啟動(dòng)子與抗逆基因融合,從而使轉(zhuǎn)基因植物更好地適應(yīng)逆境。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第87頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分人工構(gòu)建的誘導(dǎo)型啟動(dòng)子
目前研究最多的是化學(xué)誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng)。一個(gè)理想的化學(xué)誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng)應(yīng)具備以下特點(diǎn):(1)外源基因在植物體自身不表達(dá)或低水平表達(dá),當(dāng)添加誘導(dǎo)物后,高效誘導(dǎo)基因表達(dá);(2)誘導(dǎo)物需要有較強(qiáng)的專(zhuān)一性;(3)誘導(dǎo)物可快速啟動(dòng)基因表達(dá)的“開(kāi)”與“關(guān)”;而且誘導(dǎo)物對(duì)植物無(wú)毒或低毒。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第88頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分①增強(qiáng)效應(yīng)十分明顯;可使基因轉(zhuǎn)錄頻率增加10~100倍,有的可達(dá)上千倍;
②增強(qiáng)效應(yīng)與其位置和取向無(wú)關(guān);
增強(qiáng)子提高同一條DNA鏈上基因轉(zhuǎn)錄效率,可以遠(yuǎn)距離起作用,而且在基因的上游或下游都能起作用。增強(qiáng)子的作用與其序列的正反方向無(wú)關(guān),將增強(qiáng)子方向倒置依然能起作用。
增強(qiáng)子(enhancer):
能顯著提高基因轉(zhuǎn)錄效率的一類(lèi)順式調(diào)控元件(其核心序列常為8~12bp),其作用特點(diǎn):
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第89頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
③增強(qiáng)子沒(méi)有基因?qū)R恍裕?/p>
增強(qiáng)子要有啟動(dòng)子才能發(fā)揮作用,沒(méi)有啟動(dòng)子存在,增強(qiáng)子不能表現(xiàn)活性。但增強(qiáng)子對(duì)啟動(dòng)子沒(méi)有嚴(yán)格的專(zhuān)一性,同一增強(qiáng)子可以影響不同類(lèi)型啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄。
當(dāng)增強(qiáng)子移位時(shí),能提高新位置周?chē)虻霓D(zhuǎn)錄。使某些癌基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)增強(qiáng),可能是腫瘤發(fā)生的因素之一。
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第90頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第91頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分
④增強(qiáng)效應(yīng)有組織和細(xì)胞專(zhuān)一性;
增強(qiáng)子必須與特定的蛋白質(zhì)因子結(jié)合后才能發(fā)揮增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的作用。增強(qiáng)子一般具有組織或細(xì)胞特異性,許多增強(qiáng)子只在某些細(xì)胞或組織中表現(xiàn)活性,是由這些細(xì)胞或組織中具有特異性蛋白質(zhì)因子所決定的。
⑤許多增強(qiáng)子還受外部信號(hào)的調(diào)控;
如熱激蛋白基因的表達(dá)。金屬硫蛋白基因上游增強(qiáng)子能對(duì)環(huán)境中的鋅濃度做出反應(yīng)。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第92頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分應(yīng)答元件(responsiveelements)
真核細(xì)胞中對(duì)某些特定的環(huán)境作出應(yīng)答的基因,常具有相同的順式元件—應(yīng)答元件。RNAPolⅡ的誘導(dǎo)型轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合部位。沉寂子(silencer):負(fù)調(diào)控元件——是能抑制基因表達(dá)的序列,使基因沉默。本文檔共110頁(yè);當(dāng)前第93頁(yè);編輯于星期二\23點(diǎn)12分(3)反式作用因子與基因調(diào)控反式作用因子(trans-actingfactor)
是通過(guò)識(shí)別和結(jié)合順式調(diào)控元件的核心序列而調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的一組蛋白質(zhì)。反式作用因子對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控可正(激活)可負(fù)(阻遏)。
所有
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