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hiv基因組及其編碼蛋白hiv基因組及其編碼蛋白第1頁(yè)基因組蛋白質(zhì)決定hiv基因組及其編碼蛋白第2頁(yè)HIV基因組結(jié)構(gòu)1HIV編碼蛋白質(zhì)及其主要功效2HIV膜蛋白主要功效區(qū)3hiv基因組及其編碼蛋白第3頁(yè)HIV基因組結(jié)構(gòu)
美國(guó)北卡羅來(lái)納大學(xué)研究人員利用一個(gè)新成像技術(shù),首次破譯出了完整艾滋病病毒(HIV)基因組結(jié)構(gòu)。由此,為科學(xué)家更深入地研究HIV提供了可能,也為新型抗艾滋病藥品研發(fā)指明了方向。該研究結(jié)果登載于年8月6日出版《自然》雜志上。1、HIV基因組結(jié)構(gòu)破譯hiv基因組及其編碼蛋白第4頁(yè)蘭の幽蝶
基因組為兩條相同RNA單鏈,每條單鏈含有9749核酸,每條RNA鏈長(zhǎng)約9.7kb,兩條鏈5’端借氫鍵形成二聚體。與其它逆轉(zhuǎn)錄病毒相同,HIV基因結(jié)構(gòu)從5’端到3’端依次為5’LTR-gag-pro-pol-env-3’LTR。5’端有帽狀結(jié)構(gòu)m7G5ppp5GmpNp,3’端有polyA序列。2、HIV基因組詳細(xì)結(jié)構(gòu)gap:結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)pro:蛋白編碼區(qū)Pol:具各種酶活性蛋白編碼區(qū)env:外膜蛋白hiv基因組及其編碼蛋白第5頁(yè)基因組tat基因rev基因nef基因gag基因pol基因env基因調(diào)整基因結(jié)構(gòu)基因基因組由結(jié)構(gòu)基因和調(diào)整基因等組成。hiv基因組及其編碼蛋白第6頁(yè)hiv基因組及其編碼蛋白第7頁(yè)還有4個(gè)基因:
(1)vif基因(病毒感染因子)、在一些細(xì)胞因子協(xié)同下,促進(jìn)HIV在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制。
(2)vpr基因(R蛋白)、能使HIV在巨噬細(xì)胞中增殖。
(3)vpu基因(u蛋白)、促進(jìn)HIV-1從細(xì)胞膜上釋放,僅在HIV-l中。
(4)vpx基因(X蛋白)、是HIV-2在淋巴細(xì)胞和巨噬細(xì)胞增殖進(jìn)所必需,能促進(jìn)
病毒粒子形成,僅存在于HIV-2中。
hiv基因組及其編碼蛋白第8頁(yè)
另外,為了最大程度地使用有限基因,HIV-I基因編碼區(qū)有很多重合,尤其是在其基因組3’末端。個(gè)別基因(tat,rev)沒(méi)有單獨(dú)編
碼區(qū),見(jiàn)圖:hiv基因組及其編碼蛋白第9頁(yè)hiv基因組及其編碼蛋白第10頁(yè)
hiv基因組及其編碼蛋白第11頁(yè)
HIV含有獨(dú)特病毒顆粒結(jié)構(gòu),其關(guān)鍵為棒狀(或截頭圓錐狀),它結(jié)構(gòu)蛋白主要由4組基因編碼。gag基因編碼病毒關(guān)鍵蛋白,翻譯時(shí)先形成一個(gè)分子量大約是55kD前體蛋日(p55),然后在HIV蛋白酶作用下裂解成p17、p24、p15三個(gè)蛋白質(zhì)。p24和p17分別參加組成HIV顆粒內(nèi)殼和內(nèi)膜,p15深入裂解成與病毒RNA結(jié)合核殼蛋白p9和p7。pol基因編碼病毒復(fù)制所需酶類,其中p66蛋白為逆轉(zhuǎn)錄酶,p32蛋白則為整合酶(integrase,INT)。
HIV編碼蛋白質(zhì)及其主要功效
1、主要蛋白質(zhì)hiv基因組及其編碼蛋白第12頁(yè)hiv基因組及其編碼蛋白第13頁(yè)
從pol和gag基因重合區(qū)內(nèi)起始一段序列為pro基因,它編碼蛋白酶p22,p22在裂解上述HIV蛋白前體形成終末成熟蛋白過(guò)程中起著主要作用。env基因先編碼出一個(gè)88kD蛋白質(zhì),經(jīng)糖基化后分子量增至160kD,這就是HIV包膜糖蛋白前體gP160。該前體蛋白在蛋白酶作用下被切割成gp120和gp41。hiv基因組及其編碼蛋白第14頁(yè)gp120暴露于病毒包膜之外稱外膜蛋白,感染細(xì)胞時(shí)可與細(xì)胞CD4受體蛋白相結(jié)合;gp41稱跨膜蛋白,是嵌入病毒包膜脂質(zhì)中個(gè)別。當(dāng)gp120與CD4受體結(jié)合后,其構(gòu)象改變?cè)斐膳cgP41分離,暴露出gp41可插入細(xì)胞膜,造成膜融合,致使病毒關(guān)鍵被導(dǎo)入細(xì)胞。HIV蛋白及其功效見(jiàn)下表。
2、蛋白質(zhì)功效hiv基因組及其編碼蛋白第15頁(yè)hiv基因組及其編碼蛋白第16頁(yè)
HIV-lgp160由845~870個(gè)氨基酸組成,在511位被蛋白酶裂解為gpl20和gp41。二者氨基端以非共價(jià)鍵其它分子作用力結(jié)合在一起。gp120有24個(gè)糖基化位點(diǎn),其糖基化是gp120與CD4受體結(jié)合所必須。經(jīng)過(guò)重配和突變?cè)囼?yàn),現(xiàn)已定位多個(gè)gpl60蛋白功效區(qū)。以HIV-1ⅢB株BH-10克隆gp160為例,其中最主要是:①刺激中和抗體產(chǎn)生功效區(qū):這些功效區(qū)包含V3區(qū)主要中和決定簇(principalneutralizingdeterminant,PND),即第301~324位環(huán)狀肽段(V3肽),以及若干個(gè)較弱決定簇,其中有兩個(gè)位于gp41肽段(616~632和724~751)。。
HIV膜蛋白主要功效區(qū)1、主要功效區(qū)hiv基因組及其編碼蛋白第17頁(yè)②T淋巴細(xì)胞決定簇:兩個(gè)輔助性T淋巴細(xì)胞(TH細(xì)胞)決定簇T2和T1分別位于105~117C1區(qū)和421~436C4區(qū);一個(gè)主要細(xì)胞毒性T細(xì)胞(CTL)決定簇位于308~322,與V3環(huán)個(gè)別重合;4個(gè)弱CTL決定簇中有3個(gè)在gp41肽段。③與CD4受體結(jié)合區(qū):該區(qū)位于423~437位(C4區(qū)),另外C3和C5區(qū)也有作用。hiv基因組及其編碼蛋白第18頁(yè)
上述各功效發(fā)揮作用還是依賴于整個(gè)分子特定空間構(gòu)象。下列圖中標(biāo)示了gp160上分別與gp120、gp41相互作用、膜融合及膜錨定等功效相關(guān)區(qū)段。2、功效區(qū)相互關(guān)系hiv基因組及其編碼蛋白第19頁(yè)SlowRoastedhiv基因組及其編碼蛋白第20頁(yè)現(xiàn)已表明,gp120與CD4相互作用主要是由gp120
C4和C3、C5與CD4
V1和V2區(qū)介導(dǎo),其結(jié)合常數(shù)為4X10-9mol/L。CCR5分子為C-C和C-X-C型趨化因子受體,
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