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文檔簡介
第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工
執(zhí)行生命功能、表現(xiàn)生命特征的主要物質(zhì)是蛋白質(zhì)分子。DNA貯存著決定生物特征的遺傳信息,只有通過蛋白質(zhì)才能表達(dá)出它的生命意義,直接決定蛋白質(zhì)合成及蛋白質(zhì)特征的不是RNA而是DNA,因而人們確定DNA是遺傳信息貯存者后就推測DNA是通過RNA去決定蛋白質(zhì)合成的。50年代末RNA聚合酶的發(fā)現(xiàn)開始證實了這一推測。
執(zhí)行生命功能、表現(xiàn)生命特征的主要物質(zhì)是蛋白質(zhì)分
以DNA為模板合成RNA的過程稱為轉(zhuǎn)錄(transcription)。轉(zhuǎn)錄是生物界RNA合成的主要方式,是遺傳信息即DNA向RNA傳遞過程,也是基因表達(dá)的開始(圖6-1)。轉(zhuǎn)錄也是一種酶促的核苷酸聚合過程,所需的酶叫做依賴DNA的RNA聚合酶(DDRP)。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生初級轉(zhuǎn)錄物為RNA前體,它們必須經(jīng)過加工過程變?yōu)槌墒斓腞NA,才能表現(xiàn)其生物活性。以DNA為模板合成RNA的過程稱為轉(zhuǎn)錄(tr圖6-1DNA轉(zhuǎn)錄的基本過程圖6-1DNA轉(zhuǎn)錄的基本過程第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工課件第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工課件主要內(nèi)容RNA合成的酶學(xué)基礎(chǔ)
RNA合成的基本過程
RNA轉(zhuǎn)錄后的加工與修飾主要內(nèi)容RNA合成的酶學(xué)基礎(chǔ)
真核和原核細(xì)胞內(nèi)都存在有DDRP,迄今發(fā)現(xiàn)的DDRP的有以下特點:①以DNA為模板:在DNA的兩條多苷酸鏈中只有其中一條鏈作為模板,這條鏈叫做模板鏈,又叫反義鏈。DNA雙鏈中另一條不做為模板的鏈叫做編碼鏈,又叫有意義鏈,編碼鏈的的序列與轉(zhuǎn)錄本RNA的序列相同,只是在編碼鏈上的T在轉(zhuǎn)錄本RNA為U,由于RNA的轉(zhuǎn)錄合成是以DNA的一條鏈為模板而進(jìn)行的,所以這種轉(zhuǎn)錄方式又叫做不對稱轉(zhuǎn)錄。1、RNA合成的酶學(xué)基礎(chǔ)真核和原核細(xì)胞內(nèi)都存在有DDRP,迄今發(fā)現(xiàn)的DDRP的5′……GCAGT
ACAT
GT
C……3′3′……cgtcatgtacag……5′5′……GCAGUACAU
GUC……3′N……Ala·Val·His·Val……CDNA轉(zhuǎn)錄mRNA翻譯肽DNA模板、轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA
和氨基酸序列之間的關(guān)系編碼鏈模板鏈}5′……GCAGTACATGTC……35
3
3
5
模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向53模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向②都以四種三磷酸核苷酸的底物為原料;③都遵循DNA與RNA之間的堿基配對原則,A=U,T=A,C=G,合成與模板DNA序列互補的RNA鏈;④RNA鏈的延長方向是5’→3’的連續(xù)合成;⑤需要Mg2+或Mn2+離子;⑥并不需要引物。RNA聚合酶缺乏3’→5’外切酶活性,所以沒有校正功能。②都以四種三磷酸核苷酸的底物為原料;(1)RNA聚合酶所催化的反應(yīng)(1)RNA聚合酶所催化的反應(yīng)(2)大腸桿菌RNA聚合酶(2)大腸桿菌RNA聚合酶表6-1大腸桿菌RNA聚合酶亞單位
分子量亞單位數(shù)目功能α365122決定哪此基因被轉(zhuǎn)錄
β1506181與轉(zhuǎn)錄全過程有關(guān)
β’1556131結(jié)合DNA模板
702631辨認(rèn)起始點表6-1大腸桿菌RNA聚合酶亞單位分子量亞單位數(shù)目核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)
RNA聚合酶核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzymRNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合亞基組成:a2bb'ws=a2bb'w+s
全酶核心酶
RNA聚合酶的組成
a亞基——
解開前方的DNA雙螺旋、恢復(fù)后面的DNA雙螺旋b亞基——
催化磷酸二酯鍵的形成b'亞基——
與DNA的非模板鏈結(jié)合
亞基組成:a2bb'ws=a2bb'w+s
RNA聚核心酶:解開前方的DNA雙螺旋、RNA鏈的延伸、恢復(fù)后面的DNA雙螺旋s亞基:識別DNA上轉(zhuǎn)錄的起始部位,從而引導(dǎo)全酶結(jié)合上去此外,每個RNA聚合酶還含有2個Zn離子。核心酶:解開前方的DNA雙螺旋、RNA鏈的延伸、恢復(fù)后面的D(3)真核生物RNA聚合酶(3)真核生物RNA聚合酶表6-2真核生物的RNA聚合酶種類分布合成的RNA類型對α-鵝膏蕈堿的敏感性Ⅰ核仁rRNA不敏感Ⅱ核質(zhì)hnRNA低濃度敏感Ⅲ核質(zhì)tRNA,5SRNA高濃度敏感Mt線粒體線粒體RNAs不敏感表6-2真核生物的RNA聚合酶種類分布合成的RN真核生物RNA聚合酶的共同特征3種聚合酶都由2個大亞基,12個以上的小亞基組成;在3種聚合酶之間,最大2個亞基,至少5個小亞基的基因編碼區(qū)具有同源性;4-7種小亞基為各種RNA聚合酶特有;都具有原核RNA聚合酶核心
2’同源的亞基;最大亞基與’相似,次最大亞基與相似;真核生物RNA聚合酶的共同特征3種聚合酶都由2個大亞基,12RNA聚合酶的羧基末端結(jié)構(gòu)域(CTD)
RNA聚合酶II最大亞基的羧基端,存在著一種6個氨基酸的重復(fù)序列:Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser,在哺乳類中重復(fù)52次,在酵母中重復(fù)26次,稱為CTD。轉(zhuǎn)錄起始時:Ser、Thr的羥基非磷酸化,易與DNA結(jié)合;轉(zhuǎn)錄延伸時,磷酸化,松弛與DNA的結(jié)合。RNA聚合酶的羧基末端結(jié)構(gòu)域(CTD)RNA2、轉(zhuǎn)錄的基本過程(圖6-2)(1)RNA合成的識別
(2)RNA合成的起始與延伸過程
(3)RNA合成的終止階段2、轉(zhuǎn)錄的基本過程(圖6-2)(1)RNA合成的識別圖6-2轉(zhuǎn)錄的主要過程圖6-2轉(zhuǎn)錄的主要過程
原核生物:Pribnow框和Sextama框(圖6-3)真核生物:TATA框和CAAT框(圖6-4)(1)轉(zhuǎn)錄的識別–啟動子原核生物:Pribnow框和Sextama框(圖6-3)圖6-3原核生物啟動子的結(jié)構(gòu)示意圖圖6-3原核生物啟動子的結(jié)構(gòu)示意圖轉(zhuǎn)錄起點是指與新生RNA鏈第一個核苷酸相對應(yīng)DNA鏈上的堿基,研究證實通常為一個嘌呤。常把起點前面,即5'末端的序列稱為上游(upstream),而把其后面即3’末端的序列稱為下游(downstream)。在描述堿基的位置時,一般用數(shù)字表示,起點為+1,下游方向依次為+2、+3……,上游方向依次為-1、-2、-3……。轉(zhuǎn)錄起點是指與新生RNA鏈第一個核苷酸相對應(yīng)DNA鏈上的堿基Pribnow框:-10區(qū),保守序列為TATAAT。Pribnow框是RNA聚合酶的牢固結(jié)合位點,簡稱結(jié)合位點。細(xì)菌中常見兩種啟動子突變:啟動子上升突變,提高轉(zhuǎn)錄活性;啟動子下降突變,降低轉(zhuǎn)錄水平。
σ的存在保證原核生物RNA聚合酶只能與啟動子區(qū)而不是其它區(qū)域形成穩(wěn)定的二元復(fù)合物。Pribnow框:-10區(qū),保守序列為Sextama框:-35區(qū),保守序列為TTGACA。Sextama框是RNA聚合酶中σ
的識別位點,也是RNA聚合酶的初始結(jié)合位點。Pribnow框與Sextama框之間的堿基序列并不重要,但兩個序列之間的距離十分重要;天然啟動子這段距離多為15~20bp,距離的大小可能是決定啟動子強(qiáng)度的因素之一。實驗表明:兩個序列之間的距離為17bp時,轉(zhuǎn)錄效率最高。Sextama框:-35區(qū),保守序列為T圖6-4真核生物的啟動子序列圖6-4真核生物的啟動子序列(2)轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個問題:RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域。DNA雙鏈解開,使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板。(2)轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個問題:4.-10區(qū)DNA雙鏈解開12~17bp,形成開放的二元啟動子復(fù)合物(模板-酶)。
2.RNA聚合酶全酶(
2)與模板-35序列結(jié)合,形成閉合的二元閉合啟動子復(fù)合物。
轉(zhuǎn)錄起始過程1.
因子辨認(rèn)轉(zhuǎn)錄起始點(-35區(qū)的TTGACA序列)3.RNA聚合酶向-10區(qū)轉(zhuǎn)移,并與之牢固結(jié)合。4.-10區(qū)DNA雙鏈解開12~17bp,形成開放的二2.RNApol(
2
)-DNA-pppGpN-OH3
轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:5
-pppG-OH+NTP
5
-pppGpN-OH3
+ppi5.在RNA聚合酶β亞基催化下形成第一個磷酸二酯鍵,形成三元復(fù)合物(模板-酶-RNA)。6.當(dāng)三元復(fù)合物中RNA長6~9個核苷酸時,因子從全酶解離下來,進(jìn)入延長階段。RNA聚合酶有兩個核苷酸結(jié)合位點:一個是起始核苷酸位點;一個是延長核苷酸位點。一般只有嘌呤核苷酸填充了起始位點,才能形成第一個磷酸二酯鍵。RNApol(2)-DNA-pppGpNRNA合成的第一個核苷酸總有GTP或ATP,以GTP常見,此時
因子從全酶解離下來,靠核心酶在DNA鏈上向下游滑動,而脫落的
因子與另一個核心酶結(jié)合成全酶反復(fù)利用。
RNA合成的第一個核苷酸總有GTP或ATP,以
真核生物轉(zhuǎn)錄起始十分復(fù)雜,往往需要多種蛋白因子的協(xié)助,已經(jīng)知道,在所有的細(xì)胞中有一類叫做轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)分子,它們與RNA聚合酶Ⅱ形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物,共同參與轉(zhuǎn)錄起始的過程。真核生物轉(zhuǎn)錄起始十分復(fù)雜,往往需要多種蛋白因子的協(xié)助,
真核生物基因中,有專門為蛋白質(zhì)編碼的基因,這些基因由RNA聚合酶Ⅱ負(fù)責(zé)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄起始關(guān)鍵性作用。根據(jù)這些轉(zhuǎn)錄因子的作用特點可大致分為以下二類:真核生物基因中,有專門為蛋白質(zhì)編碼的基因,這些基因由R
第一類為普遍轉(zhuǎn)錄因子:它們與RNA聚合酶Ⅱ共同組成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物,轉(zhuǎn)錄才能在正確的位置上開始。普遍轉(zhuǎn)錄因子是由多種蛋白質(zhì)分子組成的,其中包括特異結(jié)合在TATA盒上的蛋白質(zhì),叫做TATA盒結(jié)合蛋白,還有形成一組復(fù)合物叫做轉(zhuǎn)錄因子ⅡD。TFⅡD再與RNA聚合酶Ⅱ結(jié)合完成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成(圖6-5)。第一類為普遍轉(zhuǎn)錄因子:它們與RNA聚合酶Ⅱ共同組成轉(zhuǎn)圖6-5轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的模式圖圖6-5轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的模式圖
第二類轉(zhuǎn)錄因子為組織細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄因子或者叫可誘導(dǎo)性轉(zhuǎn)錄因子:這類TF是在特異的組織細(xì)胞或是受到一些類固醇激素,生長因子或其它刺激后,開始表達(dá)某些特異蛋白質(zhì)分子時才需要的一類轉(zhuǎn)錄因子。
第二類轉(zhuǎn)錄因子為組織細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄因子或者叫可誘導(dǎo)性RNA鏈的延長靠核心酶的催化,在起始復(fù)合物上第一個GTP的核糖3’-OH上與DNA模板能配對的第二個三磷酸核苷酸起反應(yīng)形成磷酸二酯鍵。聚合進(jìn)去的核苷酸又有核糖3’-OH游離,這樣就可按模板DNA的指引,一個接一個地延長下去。因此RNA鏈的合成方向也是5’-3’。由于DNA鏈與合成的RNA鏈具有反平行關(guān)系,所以RNA聚合酶是沿著DNA鏈3’-5’方向移動。(3)轉(zhuǎn)錄的延伸RNA鏈的延長靠核心酶的催化,在起始復(fù)合物上第
整個轉(zhuǎn)錄過程是由同一個RNA聚合酶來完成的一個連續(xù)不斷的反應(yīng),轉(zhuǎn)錄本RNA生成后,暫時與DNA模板鏈形成DNA·RNA雜交體,長度約為12個堿基對,形成一個轉(zhuǎn)錄泡(圖6-6)。轉(zhuǎn)錄速度大約是每秒鐘30-50個核苷酸,但并不是以恒定速度進(jìn)行的。整個轉(zhuǎn)錄過程是由同一個RNA聚合酶來完成的一個連續(xù)不圖6-6轉(zhuǎn)錄的延伸過程圖6-6轉(zhuǎn)錄的延伸過程1.
亞基脫落,RNA聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;2.在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長。3.堿基配對原則:A-U,T-A,G-C4.延長中的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物也叫轉(zhuǎn)錄泡。隨著RNA
聚合酶前移,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA不斷移出轉(zhuǎn)錄泡,已轉(zhuǎn)錄完畢的DNA雙鏈又重新復(fù)合而不再打開。5.原核生物的轉(zhuǎn)錄和翻譯偶聯(lián)進(jìn)行。(NMP)n
+
NTP
(NMP)n+1
+PPi原核生物RNA轉(zhuǎn)錄的延長過程1.亞基脫落,RNA聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿圖6-7原核生物轉(zhuǎn)錄過程中的羽毛狀現(xiàn)象5
3
DNA核糖體RNARNA聚合酶圖6-7原核生物轉(zhuǎn)錄過程中的羽毛狀現(xiàn)象53DNA核糖依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止非依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(4)轉(zhuǎn)錄的終止和新生RNA鏈的釋放指RNA聚合酶在DNA模板上停頓下來不再前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來。分類依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(4)轉(zhuǎn)錄的終止和新生RNA鏈的釋放指R依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(圖6-8)1969年,Roberts發(fā)現(xiàn)了能控制轉(zhuǎn)錄終止的蛋白質(zhì),即ρ因子。它由相同的6個亞基組成六聚體,分子量200kD。ρ因子具有NTP酶活性和解螺旋酶活性,是促使轉(zhuǎn)錄三元復(fù)合物解離的根本原因。ρ因子的NTP酶活性依賴于單鏈RNA的結(jié)構(gòu)。ρ因子依賴性終止子含有一個反向重復(fù)序列,使RNA末端形成一個發(fā)夾結(jié)構(gòu),導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄延宕,ρ因子得以發(fā)揮作用,終止轉(zhuǎn)錄。依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(圖6-8)1969年,Roberts圖6-8圖6-8非依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(圖6-9)DNA模板接近轉(zhuǎn)錄終止的區(qū)域內(nèi),有較密集的A-T配對區(qū)或G-C配對區(qū),且G-C配對為回文結(jié)構(gòu)。
轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA的3′-末端有若干個連續(xù)的U。連續(xù)U區(qū)的5′-端前方堿基形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)或發(fā)夾結(jié)構(gòu)。這種二級結(jié)構(gòu)是阻止轉(zhuǎn)錄繼續(xù)向下游推進(jìn)的關(guān)鍵。非依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(圖6-9)DNA模板接近轉(zhuǎn)錄終止的轉(zhuǎn)錄方向3′3′5′TCGGGCGAGCCCGCCGCCCGAGCGGGCTAAAAAATTTTTT3′3′5′5′DNA模板鏈編碼鏈AAAAAAUUUUUU5′CGCCCGAGCGGGCU5′TTTTTTDNA模板鏈編碼鏈轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物3′圖6-9不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止轉(zhuǎn)錄方向3′3′5′TCGGGCGCGCCCGAAAAAAA莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機(jī)理
使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;密集A-U配對使轉(zhuǎn)錄復(fù)合物趨于解離,釋放RNA。5′pppG53
35RNA-pol莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機(jī)理使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;5′原核生物與真核生物轉(zhuǎn)錄的區(qū)別
原核生物真核生物RNApol一種高度分工起始轉(zhuǎn)錄因子沒有需要(各不同)延長核小體影響沒有有啟動子以外序列沒有有且復(fù)雜轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物多順反子單順反子場所轉(zhuǎn)錄與翻譯偶聯(lián)不偶聯(lián)轉(zhuǎn)錄終止兩種終止子不明確原核生物與真核生物轉(zhuǎn)錄的區(qū)別轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的相似之處:⑴都是酶促的核苷酸聚合過程;⑵都以DNA為模板;⑶都需依賴DNA的聚合酶;⑷聚合過程都是核苷酸之間生成磷酸二酯鍵;⑸都從5′至3′方向延伸成新鏈多聚核苷酸;⑹都遵從堿基配對規(guī)律——
但轉(zhuǎn)錄忠實性要低于DNA復(fù)制。⑺轉(zhuǎn)錄與復(fù)制都受到嚴(yán)格的調(diào)控
轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的異同點轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的相似之處:轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的異同點轉(zhuǎn)錄和復(fù)制的區(qū)別引物有無高度進(jìn)行性中途不停止可一段一段進(jìn)行A-U,T-A,G-CA-T,G-C配對mRNA,tRNA,rRNA子代雙鏈DNA(半保留復(fù)制)產(chǎn)物RNA聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶酶NTPdNTP原料模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對稱轉(zhuǎn)錄)兩股鏈均復(fù)制模板轉(zhuǎn)錄復(fù)制A-U,T-A,G-CA-T,G-C配對mRNA,tRNA,rRNA子代雙鏈DNA(半保留復(fù)制)產(chǎn)物RNA聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶酶NTPdNTP原料模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對稱轉(zhuǎn)錄)兩股鏈均復(fù)制模板轉(zhuǎn)錄復(fù)制轉(zhuǎn)錄和復(fù)制的區(qū)別引物3、轉(zhuǎn)錄后加工過程及其機(jī)制mRNA的前體加工
rRNA的前體加工
tRNA的前體加工
RNA的剪接和RNA催化活性
RNA編輯3、轉(zhuǎn)錄后加工過程及其機(jī)制mRNA的前體加工⑴真核細(xì)胞每種轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物都是各種RNA的前身,即無活性,亦無功能。⑵真核初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物必須在胞核內(nèi)經(jīng)過適當(dāng)加工,使之變成具有活性的成熟RNA后,由胞核運至胞質(zhì)才能執(zhí)行翻譯功能。⑶真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄作用和翻譯作用無論在空間上還是時間上都是彼此分開進(jìn)行的。⑷原核細(xì)胞mRNA不需加工,tRNA和rRNA加工。真核細(xì)胞與原核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的區(qū)別:⑴真核細(xì)胞每種轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物都是各種RNA的前身,真核細(xì)胞與原核3.1mRNA的前體加工5
端形成帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppNp—)
3
端加上多聚腺苷酸尾巴(polyAtail)
中部剪接除去內(nèi)含子
鏈內(nèi)部核苷酸的甲基化hnRNA轉(zhuǎn)變成mRNA的加工過程包括:3.1mRNA的前體加工5端形成帽子結(jié)構(gòu)(m7Gpp⑴修飾的化學(xué)反應(yīng):⑵5′-端的修飾在核內(nèi)完成,且先于中段剪切。⑶5′帽子分Cap0、Cap1、Cap2。5′-端加上帽子結(jié)構(gòu)(mGpppNp—)5′pppN…磷酸酶ppi5′pN…pppGpi5′GpppN…甲基化酶+CH3m7GpppN…⑴修飾的化學(xué)反應(yīng):⑵5′-端的修飾在核內(nèi)完成,且先于中段帽子0結(jié)構(gòu)帽子0結(jié)構(gòu)圖5-9帽子p161圖5-9帽子p161mRNA帽子的生理功能:⑶促進(jìn)某些RNA的合成。⑴帽子結(jié)構(gòu)參與翻譯起始,帽0結(jié)構(gòu)是核糖體識別
mRNA所必需的;核糖體上有帽結(jié)合蛋白。⑵帽子結(jié)構(gòu)增加mRNA的穩(wěn)定性,保護(hù)mRNA防止其受5′核酸外切酶的降解。mRNA帽子的生理功能:⑶促進(jìn)某些RNA的合成。⑴3′-端加上多聚腺苷酸尾巴(polyA)⑴polyA的出現(xiàn)不依賴DNA模板。⑵加尾信號:3′-末端出現(xiàn)AAUAAA及下游的
GU豐富區(qū)。在兩序列之間由特異的核酸內(nèi)切酶切除多余的核苷酸,然后加上polyA。
尾部修飾和轉(zhuǎn)錄終止同時進(jìn)行。⑶3′-端修飾也在核內(nèi)完成,并先于mRNA中段的剪接。⑷polyA的有無及長短是維持mRNA作為翻譯模板的活性,以及增加mRNA本身穩(wěn)定性的因素。3′-端加上多聚腺苷酸尾巴(polyA)⑴polyA的第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工課件mRNA3′-端的多聚腺苷酸化可被冬蟲夏草素
(3′-脫氧胸苷)所阻止;
即冬蟲夏草素是多聚腺苷酸化的特異抑制劑。
mRNA的甲基化
真核生物mRNA分子中有許多甲基化的堿基,主要是:N6-甲基腺嘌呤(m6A)。mRNA3′-端的多聚腺苷酸化可被冬蟲夏草素mRNA的甲基化3.2rRNA前體的加工原核細(xì)胞與真核細(xì)胞的rRNA前體都需加工:大腸桿菌共有7個轉(zhuǎn)錄單位,每個轉(zhuǎn)錄單位由16SrRNA、23SrRNA、5SrRNA及一個或幾個tRNA基因組成。3.2rRNA前體的加工原核細(xì)胞與真核細(xì)胞的rRNA前體都圖5-10p163大腸桿菌rRNA前體加工過程圖5-10p163大腸桿菌rRNA前體加工過程真核細(xì)胞rRNA基因為串聯(lián)重復(fù)序列:由18SrRNA、28SrRNA、5.8SrRNA基因組成一個轉(zhuǎn)錄單位,彼此被間隔區(qū)分開。每個重復(fù)單位之間的間隔DNA序列不轉(zhuǎn)錄,稱為非轉(zhuǎn)錄間隔序列。真核生物5SrRNA基因也是成簇排列的,中間隔以不被轉(zhuǎn)錄的區(qū)域,它由RNApolⅢ轉(zhuǎn)錄,加工成熟后構(gòu)成核糖體大亞基。不同生物的rRNA前體大小不同:哺乳動物為45S;果蠅38S;酵母37S;四膜蟲35S真核細(xì)胞rRNA基因為串聯(lián)重復(fù)序列:每個重復(fù)單位之間的間18S5.8S28S18S-rRNA5.8S和28S-rRNA內(nèi)含子45S轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物剪接終產(chǎn)物rDNA基因間隔哺乳動物細(xì)胞rRNA前體加工過程18S5.8S28S18S-rRNA5.8S和28S-rRNtRNA前體RNApolⅢTGGCNNAGTGCGGTTCGANNCCDNA3.3tRNA前體的加工原核與真核tRNA基因大多成簇存在tRNA前體RNApolⅢTGGCNNAGTGCGGTTtRNA前體的加工包括:⑴剪切內(nèi)含子⑵核酸外切酶修剪3′末端,逐個切去附加序列;⑶加上CCA-OH的3′末端,完成柄部結(jié)構(gòu)。⑷堿基修飾tRNA的加工酶系包括:tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶、RNaseP、RNaseD、RNaseⅢ等。tRNA前體的加工包括:tRNA的加工酶系包括:Ⅰ型:有-CCA序列基因,原核生物絕大部分;Ⅱ型:沒有-CCA序列基因,為真核生物。tRNA基因有兩種:原核生物與真核生物都有tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶,負(fù)責(zé)給Ⅱ型tRNA加上-CCA3′-OH末端,或修復(fù)發(fā)生損傷的Ⅰ型tRNA3′-OH末端。Ⅰ型:有-CCA序列基因,原核生物絕大部分;tRNA基RNaseP、
RNaseDRNaseⅢ連接酶剪切內(nèi)含子:屬于酶促反應(yīng),需要酶及ATPATPADPRNaseP、RNaseDRNaseⅢ連接酶剪切內(nèi)含子:tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶加上CCA-OH的3′末端,完成柄部結(jié)構(gòu)。tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶加上CCA-OH的3′末端,堿基修飾(2)還原反應(yīng)如:UDHU
(3)核苷內(nèi)的轉(zhuǎn)位反應(yīng)如:Uψ(4)脫氨反應(yīng)如:A
I
如:AAm(1)甲基化(1)(1)(3)(2)(4)堿基修飾(2)還原反應(yīng)如:UDHU(3)核苷內(nèi)的3.4RNA的剪接真核不連續(xù)基因的初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中,外顯子與內(nèi)含子交替出現(xiàn);轉(zhuǎn)錄后把內(nèi)含子切除而把外顯子連接起來產(chǎn)生成熟RNA分子的過程,叫RNA剪接
(RNAsplicing)。內(nèi)含子5′端與3′端都存在保守序列,分別稱為5′剪接點(GU)和3′剪接點(AG)。3.4RNA的剪接真核不連續(xù)基因的初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中,外顯子rRNA的自我剪接
四膜蟲rRNA剪接由鳥苷酸發(fā)動第一次親核攻擊,經(jīng)過兩次連續(xù)的轉(zhuǎn)酯反應(yīng),將兩個外顯子連接起來,釋放出線形內(nèi)含子序列。
釋放出的線形內(nèi)含子序列再經(jīng)過兩次連續(xù)的轉(zhuǎn)酯反應(yīng),釋放出15核苷酸和4核苷酸的兩個小片段,最終形成穩(wěn)定的線形產(chǎn)物L(fēng)-19。(linearminus19interveningsequence)L-19是四膜蟲35SrRNA剪接的最終產(chǎn)物,仍具有酶的活性和特征。rRNA的自我剪接四膜蟲rRpG-OH(ppG-OH,pppG-OH)U-OHGpUpGpA第一次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)第二次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)UpAGpU外顯子1內(nèi)含子外顯子2G-OHUpUpGpA剪接過程的二次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)pG-OHU-OHGpUpGpA第一次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)第二次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工課件RNA的催化功能L-19具有酶的主要特征:專一性強(qiáng),加快反應(yīng)速度,反應(yīng)前后酶分子保持不變,這種由
RNA構(gòu)成的酶稱之為核酶。
核酶首先是美國Colorado大學(xué)Cech在研究四膜蟲rRNA剪接機(jī)制時發(fā)現(xiàn)的。他一方面證明了四膜蟲rRNA的剪接機(jī)制;另一方面證明了L-19分子的催化活性。
繼而在1983年,耶魯大學(xué)SidneyAltamn
發(fā)現(xiàn)了第二個核酶,參與tRNA前體加工的
RNaseP。1992年,加州大學(xué)的HarryNoller
又證明了核糖體大亞基rRNA的催化活性。RNA的催化功能L-19具有酶的主要特征四膜蟲rRNA內(nèi)含子的二級結(jié)構(gòu)四膜蟲rRNA的剪接采用自我剪接方式5′-端核苷酸序列四膜蟲rRNA內(nèi)含子的二級結(jié)構(gòu)四膜蟲rRNA的剪接采用自我剪核酶研究的意義核酶的發(fā)現(xiàn),對中心法則作了重要補充;核酶的發(fā)現(xiàn)是對傳統(tǒng)酶學(xué)的挑戰(zhàn);利用核酶的結(jié)構(gòu)設(shè)計合成人工核酶。核酶研究的意義核酶的發(fā)現(xiàn),對中心法則作了重要補充;人工設(shè)計的核酶粗線表示合成的核酸分子細(xì)線表示天然的核酸分子X表示一致性序列箭頭表示切斷點人工設(shè)計的核酶粗線表示合成的核酸分子tRNA的剪接tRNA分子的內(nèi)含子首先由核酸內(nèi)切酶(RNaseⅢ)剪去。最后由RNA連接酶完成連接。tRNA的剪接tRNA分子的內(nèi)含子首mRNA的自我剪接——除去hnRNA中的內(nèi)含子,將外顯子連接。snRNP與hnRNA結(jié)合成為剪接體,進(jìn)行剪接;參與mRNA剪切的snRNP包括U1、U2
、U4
、U5
、U6
內(nèi)含子上有3個保守性序列——剪接位點:
①
5′端起始序列GU;
②
3′端AG;③距3′端18~40個核苷酸處有一個“分支點”,一定含A﹡,由A﹡發(fā)動第一次轉(zhuǎn)酯反應(yīng)。剪接過程是兩次轉(zhuǎn)脂反應(yīng)。與Ⅱ類內(nèi)含子相似。mRNA的自我剪接——除去hnRNA中的內(nèi)含子,將外顯子連第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工課件第六講RNA的生物合成與轉(zhuǎn)錄后加工課件順式和反式剪接
內(nèi)含子剪接一般都是發(fā)生在同一基因內(nèi),切除內(nèi)含子,相鄰的外顯子彼此連接,這種剪接稱為順式剪接(cis-splicing)。
反式剪接(trans-splicing)則是指發(fā)生在不同基因之間的外顯子的剪接。
反式剪接發(fā)現(xiàn)于幾種錐蟲和線蟲中。都是在
mRNA5′端存在前導(dǎo)序列,稱剪接前導(dǎo)RNA
(splicingleaderRNA,slRNA)。
slRNA的反式剪接表現(xiàn)了核內(nèi)剪接系統(tǒng)的進(jìn)化。順式和反式剪接內(nèi)含子剪接一
概念:RNA編輯是指在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA前體的編碼區(qū)內(nèi)發(fā)生核苷酸插入、丟失或轉(zhuǎn)換等現(xiàn)象。3.5RNA編輯(mRNAediting)
近年發(fā)現(xiàn)某些mRNA前體的核苷酸序列需加以改編,才能變成正確的有翻譯活性的模板。
mRNA的這種編輯作用廣泛存在于原生動物及植物細(xì)胞的線粒體。概念:RNA編輯是指在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA前3.5RNA編人類apoB基因mRNA(14500個核苷酸)肝臟apoB100(分子量為500000)腸道細(xì)胞apoB48(分子量為240000)mRNA編輯C→UCAA→UAA6666位
哺乳動物載脂蛋白-B基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物即存在mRNA編輯作用。人類apoB基因mRNA(14500個核苷酸)肝臟腸道細(xì)RNA編輯的生物學(xué)意義:
校正作用;調(diào)控翻譯;如Apo-B基因在腸道的表達(dá)。擴(kuò)充遺傳信息:按照基因信息傳遞的理論,這種mRNA的編輯作用無疑是對傳統(tǒng)分子生物學(xué)原理的挑戰(zhàn)。RNA編輯的四種類型:①簡單編輯:單堿基的轉(zhuǎn)變;②插入編輯:插入單個核苷酸;③
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