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文檔簡介
第七章微生物的遺傳變異和育種
遺傳
(heredity):是親子間的關(guān)系,指生物的上一代將自己的一整套遺傳基因傳遞給下一代的行為或功能,具穩(wěn)定的特性。遺傳型(genotype)又稱基因型,指某一生物個體所含有的全部基因的總和是一種內(nèi)在可能性或潛力。表型(phenotype)指生物體所具有的一切外表特征和內(nèi)在特性的總和;是具一定遺傳型的生物在一定條件下所表現(xiàn)出的具體性狀。遺傳型+環(huán)境條件——表型變異(variation):生物體在外因或內(nèi)因的作用下,遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或數(shù)量發(fā)生改變而導(dǎo)致表型改變。變異的特點(diǎn):a。群體一般為10-6~10-10;b.形狀變化的幅度大;c.變化后形成的新性狀是穩(wěn)定遺傳的。變異(variation):
生物體在外因或內(nèi)因的作用下,遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或數(shù)量發(fā)生改變而導(dǎo)致表型改變。變異的特點(diǎn):a.群體變異率一般為10-6~10-10;b.性狀變化的幅度大;c.變化后形成的新性狀是穩(wěn)定遺傳的。
飾變(modification):指不涉及遺傳物質(zhì)結(jié)構(gòu)改變而只發(fā)生在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)譯水平上的表型變化。特點(diǎn):a.幾乎整個群體中的每一個個體都發(fā)生同樣的變化;b.性狀變化的幅度小;c.因遺傳物質(zhì)不變,故飾變是不遺傳的。引起飾變的因素消失后,表型即可恢復(fù)。粘質(zhì)殺雷氏菌:<25度,靈桿菌素
微生物成為遺傳模式生物原因物種和代謝類型多樣性;個體簡單;營養(yǎng)體多為單倍體;易于大量生長繁殖;繁殖速度快;易于積累不同的中間代謝物或終產(chǎn)物;菌落形態(tài)多樣性、可見性;易于形成營養(yǎng)缺陷型;各種微生物一般都有其相應(yīng)的病毒;第一節(jié)遺傳變異的物質(zhì)基礎(chǔ)一、3個經(jīng)典轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)(一)經(jīng)典轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)F.Griffith
轉(zhuǎn)化(transformation)
Streptococcuspneumoniae動物實(shí)驗(yàn)細(xì)菌培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)S型菌的無細(xì)胞抽提液試驗(yàn)動物的轉(zhuǎn)化試驗(yàn)1928年F.Griffith肺炎鏈球菌使小鼠患敗血癥死亡S型菌株---菌株形成莢膜、菌落表面光滑、莢膜多糖有毒致病R型菌株---菌株不形成莢膜、菌落表面粗糙、不致病體外培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)
熱死S菌——不生長
活R菌—長出R菌
熱死S菌+活R菌—長出大量R菌和少量S菌
活R菌+S菌無細(xì)胞抽提液
——長出大量R菌和少量S菌
1944年
O.T.Avery活R菌+①加S菌DNA②加S菌DNA及DNA酶以外的酶③加S菌的DNA和DNA酶④加S菌的RNA⑤加S菌的蛋白質(zhì)⑥加S菌的莢膜多糖長出S菌只長R菌只有S型細(xì)菌的DNA才能將S.pneumoniae的R型轉(zhuǎn)化為S型。且DNA純度越高,轉(zhuǎn)化效率也越高。說明S型菌株轉(zhuǎn)移給R型菌株的,是遺傳因子。轉(zhuǎn)化概念:(二)噬菌體感染試驗(yàn)1952年A.D.Hershey,M.Chase證實(shí)了DNA是噬菌體的遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)。32P,
35S10分鐘后用搗碎器使空殼脫離吸附離心沉淀細(xì)胞進(jìn)一步培養(yǎng)后,可產(chǎn)生大量完整的子代噬菌體(二)噬菌體感染實(shí)驗(yàn)含32P-DNA的一組:放射性85%在沉淀中(三)植物病毒的重建實(shí)驗(yàn)H.Fraenkel-Conrat(1956)煙草花葉病毒(tobaccomosaicvirus,TMV)充分證明了,在RNA病毒中,遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)是RNA。植物病毒的重建實(shí)驗(yàn)二、遺傳物質(zhì)在微生物細(xì)胞內(nèi)存在的部位和方式(一)核酸存在的七個水平1.細(xì)胞水平:存在于細(xì)胞核或核質(zhì)體,單核或多核2.細(xì)胞核水平:原核與真核生物的細(xì)胞核結(jié)構(gòu)不同,核外DNA
核染色體組、核外染色體包括:細(xì)胞質(zhì)基因、卡巴顆粒、質(zhì)粒3.染色體水平:倍性(真核)和染色體數(shù)
染色體數(shù)、染色體倍數(shù)4.核酸水平核酸種類:DNA或RNA核酸結(jié)構(gòu):單鏈或雙鏈;環(huán)形或線形或超螺旋狀DNA長度:bp,kb在原核中在染色體水平、存在部分二倍體DNA或RNA,復(fù)合或裸露,雙鏈或單鏈
DNA的三種存在形式
5.基因水平:具自主復(fù)制能力的遺傳功能單位,長度與信息量,轉(zhuǎn)錄——翻譯
操縱子、調(diào)節(jié)基因、結(jié)構(gòu)基因、阻遏物、啟動基因、內(nèi)含子(intron)、外顯子(exon)6.密碼子水平:信息單位,起始和終止,三聯(lián)體密碼子7.核苷酸水平:突變或交換單位,四種堿基
(二)原核生物的質(zhì)粒1、定義和特點(diǎn)游離于原核生物核基因組以外,具有獨(dú)立復(fù)制能力的小型共價(jià)閉合環(huán)狀的dsDNA分子,即cccDNA(circularcovalentlyclosedDNA)。超螺旋、1.5-300kb、分子量106-108,1%核基因組大小。賦予細(xì)菌特殊功能:接合、產(chǎn)毒、抗藥、固氮、產(chǎn)特殊酶、降解環(huán)境毒物。是獨(dú)立的復(fù)制子(replicon)嚴(yán)密型復(fù)制控制(stringentreplicationcontrol):復(fù)制與核染色體的復(fù)制同步,1-2個。松弛型復(fù)制控制(relaxedreplicationcontrol):復(fù)制與核染色體的復(fù)制不同步,10-15個。質(zhì)粒消除(curing):含質(zhì)粒細(xì)胞在正常培養(yǎng)基上受外界因素刺激(UV、高溫、藥物等),其復(fù)制受抑,核復(fù)制繼續(xù)進(jìn)行,子代細(xì)胞質(zhì)粒消失。整合(integration):質(zhì)粒(或溫和噬菌體、病毒、轉(zhuǎn)化因子)等小型非染色體DNA插入核基因組等大型DNA分子中的現(xiàn)象。附加體(episome):某些質(zhì)粒具有與核染色體發(fā)生整合與脫離的功能,如F質(zhì)粒。2、質(zhì)粒在基因工程中的應(yīng)用優(yōu)點(diǎn):體積小,便于DNA的分離和操作。呈環(huán)狀,化學(xué)分離過程中能保持性能穩(wěn)定。有不受核基因組控制的獨(dú)立復(fù)制起始點(diǎn)??截悢?shù)多,使外源DNA可很快擴(kuò)增。存在抗藥性基因??寺≥d體(cloningvector),能完成外源DNA片斷復(fù)制的DNA分子,如:pBR322質(zhì)粒3、E.coli的pBR322質(zhì)粒優(yōu)點(diǎn):1.體積小,4361bp2.在E.coli中穩(wěn)定維持高拷貝數(shù)(20~30個/細(xì)胞)3.用氯霉素抑制其宿主蛋白質(zhì)合成,每細(xì)胞可增加到1000-3000個質(zhì)粒4.分離極容易5.可插入較多的外源DNA(<10KB)6.結(jié)構(gòu)完全清楚,可任意選擇酶切位點(diǎn)7.有兩個選擇性抗藥標(biāo)記8.可方便的通過轉(zhuǎn)化作用導(dǎo)入宿主細(xì)胞4、質(zhì)粒的分離與鑒定過程:細(xì)胞裂解、去除pro和RNA、使染色體DNA與質(zhì)粒DNA分離電鏡、瓊脂糖電泳、聚丙烯酰胺電泳鑒定;凝膠電泳譜限制性酶切圖譜密度梯度離心法5、質(zhì)粒的種類(1)F質(zhì)粒(Fplasmid)F因子、致育因子、性因子(sexfactor)轉(zhuǎn)座因子(transposableelements)
E.coli等細(xì)菌的決定性別并有轉(zhuǎn)移能力的質(zhì)粒;100kb,cccDNA,含有與質(zhì)粒復(fù)制和轉(zhuǎn)移有關(guān)的許多基因;(2)R質(zhì)粒(Rplasmid,resistranceplasmid)R質(zhì)粒由兩個相連的DNA片段組成:抗性轉(zhuǎn)移因子(resistancetransferfactor,RTF):含調(diào)節(jié)DNA復(fù)制和拷貝數(shù)的基因及轉(zhuǎn)移基因,具轉(zhuǎn)移功能;抗性決定因子(r-determinant):大小不定,無轉(zhuǎn)移功能,含各種抗性基因。R質(zhì)粒Copy:1-2,或幾十個,嚴(yán)謹(jǐn)或松弛型復(fù)制控制:經(jīng)氯霉素處理后,拷貝數(shù)達(dá)2000-3000個,傳染病大敵,(3)Col質(zhì)粒(colicinplasmid,colplasmid)又稱大腸桿菌素質(zhì)粒細(xì)菌素(bacteriocin):許多細(xì)菌能產(chǎn)生抑制或殺死近緣細(xì)菌或同種不同株的代謝產(chǎn)物,并是由質(zhì)粒編碼的蛋白,沒有抗生素的殺菌譜廣。大腸桿菌素:由Ecoli某些菌株產(chǎn)生的細(xì)菌素,具有通過抑制復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)譯或能量代謝而專一殺死它種腸道菌或同種其它菌株的能力,由大腸桿菌素質(zhì)粒編碼。大腸桿菌素分類:以ColE1為代表,分子量小,無接合作用,松弛型控制,多拷貝;以ColIb為代表,分子量大,接合轉(zhuǎn)移功能,嚴(yán)緊型控制,1~2拷貝。(4)Ti質(zhì)粒(tumorinducingplasmid)誘癌質(zhì)?;蚬诎`質(zhì)粒:是一種200kb的環(huán)狀質(zhì)粒,可從一些雙子葉植物的受傷根部侵入根部細(xì)胞,在其中溶解,釋放Ti質(zhì)粒;質(zhì)粒包括毒性區(qū)、接合專一區(qū)、復(fù)制起始區(qū)和T-DNA區(qū)。其上的T-DNA與植物細(xì)胞的核基因組整合,合成正常植株所沒有的冠癭堿類,破壞激素調(diào)控系統(tǒng),使其轉(zhuǎn)為癌細(xì)胞。廣泛用于植物基因工程,承擔(dān)80%的植物轉(zhuǎn)基因任務(wù)。(5)Ri質(zhì)粒(rootinducingplasmid)
其侵入植物根部細(xì)胞后,將Ri質(zhì)粒(250kb)中的一段T-DNA整合到宿主根部細(xì)胞的核基因組中,使之發(fā)生轉(zhuǎn)化,從而這段T-DNA就在宿主細(xì)胞中穩(wěn)定遺傳。Ri轉(zhuǎn)化的根部不形成瘤,僅生成可再生新植株的毛狀根。如毛狀根離體培養(yǎng),能合成次生代謝物??勺鳛橥庠椿虻牧己幂d體。
(6)Mega質(zhì)粒(megaplasmid)
巨大質(zhì)粒,存在于根瘤菌上,含有一系列與共生固氮相關(guān)的基因,分子量比一般質(zhì)粒大幾十倍。(7)降解性質(zhì)粒存在于假單胞菌屬,可編碼降解一系列復(fù)雜有機(jī)物的酶,在污水處理、環(huán)境保護(hù)方面發(fā)揮作用;CAM(樟腦)質(zhì)粒、OCT(辛烷)質(zhì)粒、XYL(二甲苯)質(zhì)粒等;人工構(gòu)建具有多種降解質(zhì)粒的菌株——超級菌。第二節(jié)基因突變和誘變育種一、基因突變突變:指生物體細(xì)胞內(nèi)遺傳物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)或數(shù)量突然發(fā)生可遺傳的變化,可自發(fā)或誘導(dǎo)產(chǎn)生,導(dǎo)致表型發(fā)生可遺傳的變化。
狹義突變:基因突變—點(diǎn)突變廣義突變:基因突變和染色體畸變突變的幾率:10-6---10-9
野生菌株
------突變-------突變株(一)基因突變類型(表型分類)
選擇性突變
非選擇型突變營養(yǎng)缺陷型(株)抗性突變型(株)條件致死突變(株)形態(tài)突變型(株)抗原突變型(株)產(chǎn)量突變型(株)營養(yǎng)缺陷型(auxotroph)抗性突變型(resistantmutant)條件致死突變型(conditionallethalmutant)Ts突變株即溫度敏感突變株(temperraturesensitivemutant,Tsmutant)形態(tài)突變性(morphologicalmutant)抗原突變株(antigenicmutant)產(chǎn)量突變株(metabolitequantitativemutant)正變株(plus-mutant)、副變株(minus-mutant)1、營養(yǎng)缺陷型——因突變而喪失合成某種物質(zhì)的能力,因此必須在培養(yǎng)基中添加某種生長因子、堿基或氨基酸才能生長的突變類型。2、抗性突變型——因突變而產(chǎn)生了對某種化學(xué)藥物或致死物理因子的抗性的突變株。篩選
3、條件致死突變型——突變后在某種條件下可正常生長繁殖,而在另一條件下卻無法生長繁殖的突變型Ts菌株,原因:突變使某些蛋白的結(jié)構(gòu)和功能發(fā)生改變,以致會在某特定溫度下具有功能,在另一溫度下無功能。4、形態(tài)突變型——由突變引起的個體或菌落形態(tài)變異,一般屬非選擇突變,如:鞭毛、莢膜、孢子、顏色、菌落、噬菌斑5、抗原突變型——因突變而引起的抗原結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,cell壁缺陷變異、莢膜、鞭毛成分變異;6、產(chǎn)量突變型——突變引起代謝產(chǎn)物產(chǎn)量上高于原始菌株者,稱正突變,反之為負(fù)變株。(二)突變率(mutationrate)每一細(xì)胞在每一世代中發(fā)生某一性狀突變的幾率。突變率為10–8是指該細(xì)胞在一億次細(xì)胞分裂中,會發(fā)生一次突變。突變率也可以用每一單位群體在每一世代中產(chǎn)生突變株(mutant,即突變型)的數(shù)目來表示。突變率=突變細(xì)胞數(shù)/分裂前群體細(xì)胞數(shù)
(三)基因突變的特點(diǎn)
以細(xì)菌的抗藥性為例。1、自發(fā)性:突變可以在沒有人為誘變因素處理下自發(fā)地產(chǎn)生。2、不對應(yīng)性:突變的性狀與突變原因之間無直接的對應(yīng)關(guān)系。3、稀有性:突變率低且穩(wěn)定,10-6-10-9
(三)基因突變的特點(diǎn)
4、獨(dú)立性:各種突變獨(dú)立發(fā)生,不會互相影響。某一基因發(fā)生突變不會影響其它基因的突變率。5、可誘發(fā)性:誘變劑可提高突變率。6、穩(wěn)定性:變異性狀穩(wěn)定可遺傳。7、可逆性:從原始的野生型基因到變異株的突變稱為正向突變,從突變株回到野生型的過程則稱為回復(fù)突變,(四)基因突變自發(fā)性和不對應(yīng)性的實(shí)驗(yàn)證明兩種觀點(diǎn):1、突變是通過生物對某特定環(huán)境的適應(yīng)產(chǎn)生的,環(huán)境是突變的誘因??剐孕誀钆c環(huán)境因素相對應(yīng)——馴養(yǎng)論2、抗性突變是自發(fā)產(chǎn)生的,即使誘變,其產(chǎn)生的性狀與誘變因素間是不對應(yīng)的,僅是一種用于篩選的條件。
Luria等的變量試驗(yàn)(fluctuationtest)
變量試驗(yàn)又稱波動試驗(yàn)、彷徨試驗(yàn)。1943年,S.E.Luria和M.Delbrück根據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)原理,設(shè)計(jì)的實(shí)驗(yàn)。材料:大腸桿菌、大腸桿菌的T1噬菌體(烈性噬菌體)觀察統(tǒng)計(jì)抗噬菌體的抗性菌株數(shù)量
試驗(yàn)說明:Ecoli抗噬菌體性狀的產(chǎn)生并非由所抗的環(huán)境因素(T1phage)誘導(dǎo)出來的,而是在它接觸T1前,在某次cell分裂過程中自發(fā)產(chǎn)生,自發(fā)突變越早抗性菌落出現(xiàn)越多,T1只起辨別作用。2、Newcombe的涂布試驗(yàn)1949年,Newcombe,Nature發(fā)表原理與變量試驗(yàn)相同,方法更為簡便,且可計(jì)算突變率。初始接種量:5×104個/皿培養(yǎng)5小時(shí),繁殖了12.3代,每個微菌落約含5100個細(xì)菌這時(shí),每個平皿上的細(xì)胞數(shù)為:5100×5×104≈2.6×108個/皿在6個平板上,比接種時(shí)增加的細(xì)胞數(shù)為:
6×(2.6×108
5×104)=15.6×108在未涂布的平板上共發(fā)現(xiàn)28個突變,故突變率=28/15.6×108=1.8×10
8
結(jié)果:在涂布一組共長出抗T1菌落353個,未涂布一組為28個菌落,證明,抗性突變發(fā)生在接觸T1之前。3、Lederberg影印平板培養(yǎng)法1952年,J.Lederberg夫婦的論文《平板影印培養(yǎng)法和細(xì)菌突變株的間接選擇》,更好地證明了微生物的抗藥性是在未接觸藥物前自發(fā)地產(chǎn)生的,這一突變與相應(yīng)藥物環(huán)境毫不相干。E.coliK12,鏈霉素敏感菌株
在根本未接觸過任何一點(diǎn)鏈霉素的情況下,就可以篩選到大量抗鏈霉素的突變株,充分說明了突變是自發(fā)產(chǎn)生的,鏈霉素只是起到了一種檢出作用。平板影印培養(yǎng)不僅在微生物遺傳理論的研究中有重要應(yīng)用,而且在育種實(shí)踐和其它研究中均有應(yīng)用。(五)基因突變劑的機(jī)制自發(fā)突變:生物體在無人工干預(yù)下自然發(fā)生的低頻率突變。誘發(fā)突變:通過人為方法,利用物理、化學(xué)或生物因素顯著提高基因自發(fā)突變頻率的手段。1、
染色體數(shù)目的變化
n----2n-----3n-----4n整倍變化
n----n+1、n-1,2n---2n+1、2n-1、2n-2非整倍變化
原核生物只有一條染色體,但可成為部分二倍體。
2、
染色體結(jié)構(gòu)的變化
染色體結(jié)構(gòu)的變化也稱為染色體畸變,包括:缺失、重復(fù)、倒位、易位、轉(zhuǎn)座。一般認(rèn)為這是由于染色體單體發(fā)生斷裂后,錯誤性愈合而造成的。
可造成隱性基因的表達(dá)、顯性基因的拷貝數(shù)增多、某一性狀的缺失、基因間連鎖程度的變化、不同染色體基因的連鎖等變化。重復(fù)、缺失、倒位、易位3、基因突變(點(diǎn)突變)的誘變機(jī)制誘變劑(mutagen):凡能提高突變率的任何理化因子,均稱為誘變劑誘變劑的種類很多(1)堿基置換(substitution)一對堿基被另一對堿基所置換。轉(zhuǎn)換(transition),即DNA鏈中的一個嘌呤被另一個嘌呤或是一個嘧啶被另一個嘧啶所置換;顛換(transversion),即一個嘌呤被一個嘧啶,或是一個嘧啶被一個嘌呤所置換。
堿基置換后會出現(xiàn)下列幾種情況(1)錯義突變
一種氨基酸變成另一種氨基酸;(2)
無義突變
氨基酸的堿基置換后變成終止密碼UAG(琥珀突變)UAA(赫石突變)UGA(乳石突變)等終止密碼子;堿基置換后會出現(xiàn)下列幾種情況(3)
同義突變,堿基發(fā)生了置換,但由于遺傳密碼子的簡并性,氨基酸不變。如密碼子GCU置換成GCC后,它們都是丙氨酸的密碼子;(4)
沉默突變
,
堿基置換造成多肽鏈中一個氨基酸的改變,但該氨基酸對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能沒有多大的影響,并沒引起細(xì)胞表型變化。
A直接引起置換的誘變劑一類可直接與核酸的堿基發(fā)生化學(xué)反應(yīng)的誘變劑,不論在機(jī)體內(nèi)或是在離體條件下均有作用例如
:亞硝酸、羥胺和各種烷化劑作用:它們可與一個或幾個核苷酸發(fā)生化學(xué)反應(yīng),從而引起DNA復(fù)制時(shí)堿基配對的轉(zhuǎn)換,并進(jìn)一步使微生物發(fā)生變異。能引起顛換的誘變劑很少,只是部分烷化劑才有。*亞硝酸
HNO2
胞嘧啶(C)
尿嘧啶(U)
HNO2
腺嘌呤(A)
次黃嘌呤(H)
HNO2
鳥嘌呤(G)
黃嘌呤(X)①腺嘌呤氧化脫氨后形成烯醇式次黃嘌呤(He)
②
He通過互變異構(gòu)效應(yīng)形成酮式次黃嘌呤(HK)
③DNA復(fù)制時(shí),HK與胞嘧啶(C)配對④
DNA第二次復(fù)制時(shí),C與G正常配對,實(shí)現(xiàn)了轉(zhuǎn)換A:TG:C。
烷化劑(alkylatingagent)帶有一個或多個活性烷基,誘變作用是其與DNA中的堿基或磷酸作用。常見的烷化劑有硫酸二乙酯(EDS)甲基磺酸乙酯(EMS)、N-甲基-N’-硝基-N-亞硝基胍(NTG)、亞硝基甲基脲(NMU)、氮芥、乙烯亞胺和環(huán)氧乙酸等。
羥胺(HA)
能專一地與胞嘧啶作用。修飾后的N-4-羥基胞嘧啶只能與腺嘌呤配對,引起C:G
T:A堿基轉(zhuǎn)換,羥胺引起的轉(zhuǎn)換是單向的,即無法引起T:A
C:G的堿基轉(zhuǎn)換。B間接引起置換的誘變劑這類誘變劑主要是一些堿基類似物
這些化合物有5-溴尿嘧啶(5-BU),5-氟尿嘧啶(5-FU)、8-氮鳥嘌呤(8-NG)和2-氨基嘌呤(2-AP)等。它們與正常堿基的結(jié)構(gòu)類似,在DNA復(fù)制時(shí),它們可以被錯誤地?fù)饺隓NA,引起誘變效應(yīng),所以說它們引起堿基置換的作用是間接的。
5-溴尿嘧啶(5-BU)為例酮式的5-BU結(jié)構(gòu)與胸腺嘧啶相似,烯醇式5-BU結(jié)構(gòu)與胞嘧啶相似
當(dāng)把某一微生物在含5-BU的培養(yǎng)液中培養(yǎng),DNA復(fù)制時(shí),它可取代T。5-BU以酮式狀態(tài)存在于DNA中,因而與A配對。5-BU很容易進(jìn)行酮式與烯醇式結(jié)構(gòu)的互變異構(gòu),當(dāng)DNA復(fù)制時(shí),烯醇式5-BU不與A而與G配對,從而造成A:T
G:C的轉(zhuǎn)換,
(2)移碼突變(frame-shiftmutation)移碼突變是指由一種誘變劑引起DNA分子中的一個或少數(shù)幾個核苷酸的插入或缺失,從而使該部位后面的全部遺傳密碼發(fā)生轉(zhuǎn)錄和翻譯錯誤的一類突變。移碼突變誘變劑
吖啶類染料(原黃素、吖啶黃、吖啶橙等)一系列稱為ICR類的化合物(因美國的腫瘤研究所合成而得名),都是移碼突變的有效誘變劑
吖啶類化合物的誘變機(jī)制與嘌呤-嘧啶堿基對的結(jié)構(gòu)十分相似,故能嵌入兩個相鄰的DNA堿基對之間,造成雙螺旋的部分解開(0.34nm--變成0.68nm),從而在DNA復(fù)制過程中,會使鏈中增添或缺失一個堿基,結(jié)果引起移碼突變。
轉(zhuǎn)座因子(transposableelement)
轉(zhuǎn)座(transposition)
轉(zhuǎn)座因子:插入序列、轉(zhuǎn)座子、又稱可移動基因或跳躍基因插入序列
IS轉(zhuǎn)座子
Tn轉(zhuǎn)座頻率:10-5—10-7
轉(zhuǎn)座子特點(diǎn)復(fù)制新拷貝非同源重組轉(zhuǎn)移兩端有末端重復(fù)序列,正向重復(fù)、反向重復(fù)轉(zhuǎn)座酶基因轉(zhuǎn)座酶轉(zhuǎn)座的過程轉(zhuǎn)座酶識別受體DNA分子把序列,切割成兩單鏈;連接缺口由DNA多聚酶1補(bǔ)齊,DNA連接酶連接;4、自發(fā)突變的機(jī)理大多數(shù)自發(fā)突變本質(zhì)上是誘發(fā)的,它不是人為的,而是自然環(huán)境或細(xì)胞內(nèi)環(huán)境誘發(fā)的。誘因包括:細(xì)胞外因素細(xì)胞內(nèi)因素DNA分子內(nèi)部因素
(1)細(xì)胞外的誘發(fā)因素
自然環(huán)境或人工條件下的物理和化學(xué)因素宇宙間的短波輻射、宇宙射線和紫外線等,多因素低劑量長期輻射的綜合效應(yīng)。自然環(huán)境中存在低劑量的金屬離子、高分子化合物、生物堿藥物、染料等都能成為引起生物突變的化學(xué)因素。
(2)細(xì)胞內(nèi)的誘發(fā)因素
細(xì)胞的代謝活動產(chǎn)生一些誘變物質(zhì),如過氧化氫、咖啡堿和重氮絲氨酸等,它們是引起自發(fā)突變的內(nèi)源誘變劑。許多微生物的陳舊培養(yǎng)物中易出現(xiàn)自發(fā)突變株,可能就是這類原因。
(3)
DNA分子內(nèi)部因素
DNA分子中的堿基存在著互變異構(gòu)效應(yīng)。
A、T、G、C四種堿基,存在酮基結(jié)構(gòu)(T,G)或氨基結(jié)構(gòu)(A,C),酮式與烯醇式存在互變異構(gòu);氨基式與亞氨基式存在互變異構(gòu)狀態(tài);環(huán)出效應(yīng)在DNA的復(fù)制過程中,如果其中某一單鏈上偶然產(chǎn)生一個小環(huán),則會因其上的基因越過復(fù)制而發(fā)生遺傳缺失。(六)紫外線對DNA的損傷及其修復(fù)嘧啶對紫外線更敏感性。嘧啶的光化產(chǎn)物主要是二聚體和水合物。1、光復(fù)活作用(photoreactivation)經(jīng)紫外線照射后的微生物立即暴露于可見光下時(shí),可明顯降低其死亡率的現(xiàn)象,稱為光復(fù)活作用。
對照:8×106個/mlE.coliU.V.100個/ml試驗(yàn):8×106個/mlE.coliU.V.360~490nm2×106個/mlE.coli
可見光,30分
光復(fù)活作用過程經(jīng)紫外線照射后形成的帶有胸腺嘧啶二聚體的DNA分子,在黑暗下會被一種光激活酶即光裂合酶(photolyase)結(jié)合,當(dāng)形成的復(fù)合物暴露在可見光(300~500nm)下時(shí),此酶會因獲得光能而發(fā)生解離,從而使二聚體重新分解成單體。光激活酶從復(fù)合物中釋放出來。每一E.coli細(xì)胞中約含有25個光激活酶分子。光復(fù)活作用禁忌
由于一般的微生物中都存在著光復(fù)活作用,所以進(jìn)行紫外線誘變育種時(shí),只能在紅光下照射及處理照射后的菌液。2、暗修復(fù)作用(darkrepair)又稱切除修復(fù)(excisionrepair)。是活細(xì)胞內(nèi)一種用于修復(fù)被紫外線等誘變劑(包括烷化劑、X射線和γ射線等)損傷后的DNA的機(jī)制。這種修復(fù)作用與光無關(guān)。有四種酶參與①內(nèi)切核酸酶:切開
②外切核酸酶:擴(kuò)大③DNA聚合酶:復(fù)制④通過連接酶:連接
完成了修復(fù)作用。
3、紫外誘變方法:設(shè)備:紫外燈、磁力攪拌器、暗室等,紫外燈:波長為253.7nm,功率是15W處理時(shí)的照射距離:20cm—30cm樣品:要直接暴露在紫外燈下,厚度不能超過3mm照射時(shí),要用磁力攪拌器攪拌。處理劑量:常用照射時(shí)間或死亡率作為相對劑量生產(chǎn)上經(jīng)常采用的劑量:死亡率為70%——80%左右二、突變與育種(一)自發(fā)突變與育種1、生產(chǎn)中育種10-6突變率
-----尋找正向突變菌株2、定向培育優(yōu)良菌種牛型結(jié)核桿菌------13年----230代----卡介苗(減毒活菌疫苗)(二)誘變育種
誘變
+篩選誘變是隨機(jī)的;篩選是定向的目前發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)菌株都是經(jīng)過突變改造過的。1、誘變育種的基本規(guī)律2、誘變育種中的幾個原則
誘變劑的選擇
1)誘變劑作用的普遍性:選擇那些在其它菌種選育中誘變效果好的誘變劑。如:UV、亞硝基胍(NTG)、快中子等。
2)誘變劑的特異性:憑經(jīng)驗(yàn)。
如,四環(huán)素族抗生素用亞硝酸、羥胺,
青霉素用氮芥、乙烯亞胺、亞硝基胍.3)菌株的差異:(即使是同一菌)
A:遺傳性不穩(wěn)定的菌株------用緩和誘變劑
B:遺傳性穩(wěn)定的菌株---------首用強(qiáng),后用緩。
4)考慮誘變機(jī)制:UV——嘧啶,
亞硝酸
——嘌呤,因此復(fù)合使用為好。
3、出發(fā)菌株的選擇
出發(fā)菌株—用來育種處理的起始菌株
◆出發(fā)菌株應(yīng)具備
①對誘變劑的敏感性高;
②具有特定生產(chǎn)性狀的能力或潛力;
◆出發(fā)菌株的來源
①自然界直接分離到的野生型菌株:
②歷經(jīng)生產(chǎn)考驗(yàn)的菌株:
③已經(jīng)歷多次育種處理的菌株:4、誘變劑劑量的選擇用50—85%的殺菌劑量,此時(shí)正突變率高,特別是出發(fā)菌株已是高產(chǎn)菌株。
5、三類突變株的篩選產(chǎn)量突變株篩選
抗藥性突變株的篩選(梯度平板法)
營養(yǎng)缺陷型(auxotroph)的篩選
1)產(chǎn)量突變株篩選瓊脂塊培養(yǎng)法(春日霉素)
孢子懸液------誘變----適當(dāng)培養(yǎng)(表型遲延)——涂布平板----打孔取菌落-----瓊脂塊培養(yǎng)----4-5天,測定瓊脂塊所含的抗生素的抑菌圈----獲效價(jià)高菌
2)抗藥性突變株的篩選(梯度平板法)
3)營養(yǎng)缺陷型(auxotroph)的篩選三類遺傳型:營養(yǎng)缺陷型突變株:必須在培養(yǎng)基內(nèi)加入相應(yīng)有機(jī)養(yǎng)分野生型菌株:自然界分離到的任何微生物,在其發(fā)生營養(yǎng)缺陷突變前的原始菌株,為該微生物的野生型。原養(yǎng)型菌株:指營養(yǎng)缺陷型突變菌株回復(fù)突變或重組后產(chǎn)生的菌株,與野生型的表型相同。
三類培養(yǎng)基:基本培養(yǎng)基(MM)[-]:凡是能滿足野生型菌株?duì)I養(yǎng)要求的最低成分的合成培養(yǎng)基。完全培養(yǎng)基(CM)[+]:滿足一切營養(yǎng)缺陷型菌株生長的天然或半合成培養(yǎng)基。
補(bǔ)充培養(yǎng)基(SM)[x]:在MM中有針對性地加入一或幾種營養(yǎng)成分以滿足相應(yīng)營養(yǎng)缺陷型菌株生長的合成培養(yǎng)基。檢出缺陷型方法逐個檢出法影印檢出法夾層培養(yǎng)法限量補(bǔ)給法a.逐個檢出法
b.影印檢出法
c.夾層培養(yǎng)法
d.限量補(bǔ)給法
在含少量的(0.01%)蛋白胨的MM上培養(yǎng),缺陷型饑餓,大菌落為野生型,小菌落的為缺陷型。
6、鑒定缺陷型生長譜法組合營養(yǎng)物法組合補(bǔ)充培養(yǎng)基法
1)生長譜法
斜面菌種-----生理鹽水洗下細(xì)胞------洗滌-----涂布(105個/皿)
紙片1:氨基酸混合液;紙片2:維生素混合液;紙片3:核酸水解液;紙片4:酵母水解液
2)Amestest:對化學(xué)誘變劑做檢測
原理:his-在基本培養(yǎng)基上不長;而發(fā)生回復(fù)突變則長。
菌種:鼠傷寒沙門氏菌his-
第三節(jié)基因重組原核生物的基因重組凡把兩個不同性狀個體內(nèi)的遺傳基因轉(zhuǎn)移到一起,經(jīng)過遺傳分子間的重新組合,形成新遺傳型個體的方式,稱為基因重組(generecombination)或遺傳重組。作用:重組可使生物體在未發(fā)生突變的情況下,也能產(chǎn)生新遺傳型的個體。
一、原核微生物的基因重組特點(diǎn):片段性:僅一小段DNA參與重組單向性:共體
受體,單方向轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)移機(jī)制多樣性:轉(zhuǎn)化、
轉(zhuǎn)導(dǎo)、
接合、
原生質(zhì)體融合(一)轉(zhuǎn)化(transformation)概念:受體菌直接吸收來自供體菌的游離DNA片段,并把它整合到自己的基因組中,而獲得部分新的遺傳性狀的基因轉(zhuǎn)移過程,稱為轉(zhuǎn)化。轉(zhuǎn)化后的的受體菌稱為轉(zhuǎn)化子(transformant)來自供體菌的DNA片段稱為轉(zhuǎn)化因子1、轉(zhuǎn)化發(fā)生的條件(1)兩個菌株間的親緣關(guān)系密切(2)受體細(xì)胞要處于感受態(tài).(3)供體DNA片段(轉(zhuǎn)化因子)大小適宜,分子量一般為1×106
D
左右,15個基因(4)單鏈供體DNA進(jìn)入受體菌,發(fā)生同源重組;(在受體菌表面,一條鏈被水解)(5)DNA復(fù)制,受體細(xì)胞分裂,帶有新性狀的個體為轉(zhuǎn)化子2、感受態(tài)感受態(tài):受體細(xì)胞能從環(huán)境吸取外源DNA片段并實(shí)現(xiàn)其轉(zhuǎn)化的一種生理狀態(tài)用CaCl2處理大腸桿菌,可以增加大腸桿菌細(xì)胞壁的透性,當(dāng)轉(zhuǎn)化因子結(jié)合在受體細(xì)胞的接合點(diǎn)上時(shí),DNA中的一個鏈可被受體細(xì)胞膜上核酸酶分解,另一個鏈進(jìn)入受體細(xì)胞,通過整合作用與受體細(xì)胞的DNA進(jìn)行g(shù)ene重組。在具有感受態(tài)的微生物中,感受態(tài)細(xì)胞所占比例和維持時(shí)間不同。3、轉(zhuǎn)化因子是離體的DNA片段,長15kb,可攜帶15個基因;有些菌種只吸收dsDNA形式的轉(zhuǎn)化因子,入胞后降解成ssDNA發(fā)生整合;有些菌種只吸收的ssDNA;能發(fā)生轉(zhuǎn)化的最低DNA濃度極低。4、轉(zhuǎn)化過程S.pneumoniae抗鏈霉素基因標(biāo)記為例供體菌(strR)的dsDNA片段與感受態(tài)受體菌(strS)細(xì)胞表面的膜連DNA結(jié)合蛋白結(jié)合,其中一條鏈被核酸酶水解,另一條鏈進(jìn)入細(xì)胞ssDNA片段與細(xì)胞內(nèi)特異蛋白結(jié)合,使其與受體菌核染色體上的同源區(qū)段配對、重組染色體組復(fù)制、細(xì)胞分裂,遺傳性狀分離。
5、轉(zhuǎn)染把噬菌體或其它病毒的DNA(或RNA)抽提出來,讓它去感染感受態(tài)的宿主細(xì)胞,并進(jìn)而產(chǎn)生正常的噬菌體或病毒的后代,這種現(xiàn)象稱為轉(zhuǎn)染(transfection)。
(二)轉(zhuǎn)導(dǎo)(Transduction)概念:借助缺陷噬菌體為媒介,把供體細(xì)胞中DNA片段攜帶到受體細(xì)胞中,從而使后者獲得前者部分遺傳性狀的現(xiàn)象,稱轉(zhuǎn)導(dǎo)。獲得新遺傳性狀的受體細(xì)胞稱為轉(zhuǎn)導(dǎo)子(transductant)。轉(zhuǎn)導(dǎo)過程不需要細(xì)胞接觸,而是以噬菌體為載體。轉(zhuǎn)導(dǎo)主要分為:
完全普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)
流產(chǎn)普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)
低頻局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)局限轉(zhuǎn)導(dǎo)
高頻局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)1、
普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)(Generalizedtransduction)
由完全缺陷型噬菌體對供體菌染色體上任何DNA片段進(jìn)行“誤包”,當(dāng)它去感染受體菌時(shí),將其遺傳性狀傳遞給受體菌,使后者獲得這部分遺傳性狀的現(xiàn)象稱為普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)。分類:完全普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)、流產(chǎn)普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)
(1)完全普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)鼠傷寒沙門氏菌為例:供體菌:野生型受體菌:各種營養(yǎng)缺陷型完全缺陷型噬菌體:P22(只含有核染色體),感染復(fù)數(shù)(M.O.I.)<1,不會發(fā)生溶源化,外源DNA片段可與受體細(xì)胞染色體同源區(qū)段配對、雙交換、整合、獲得普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)子。特點(diǎn):供體的任何基因都有可能進(jìn)入受體細(xì)胞完全普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)外來DNA片段通過雙交換而形成轉(zhuǎn)導(dǎo)子
(2)流產(chǎn)普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)(abortivetransduction)概念:經(jīng)轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體為媒介獲得的供體菌DNA片段的受體菌,如果這段外源DNA在其內(nèi)不交換、整合和復(fù)制,也不迅速消失,而僅表現(xiàn)為穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)譯和形狀表達(dá),稱流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)。特點(diǎn):受體菌只能將這段外源DNA分配到一個子細(xì)胞中,另一個細(xì)胞僅能獲得外源基因經(jīng)轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)譯而形成的少量酶,有輕微表型變化。流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)的示意圖
流產(chǎn)普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)特征:形成微型菌落轉(zhuǎn)導(dǎo)的兩種結(jié)局2、局限轉(zhuǎn)導(dǎo)
Restrictedtransduction概念:是指通過部分缺陷的溫和噬菌體把供體菌的少數(shù)特定基因攜帶到受體菌中,在受體菌中整合、重組,并獲得表達(dá)的轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象。
(2)局限轉(zhuǎn)導(dǎo)
Restrictedtransduction條件:
供體菌----大腸桿菌K12(λ)溶源菌(野生型)
受體菌-----營養(yǎng)缺陷型(Bio-,gal-)
部分缺陷溫和性噬菌體----λd局限轉(zhuǎn)導(dǎo)特點(diǎn):只傳遞供體菌的少數(shù)特定基因,一般為噬菌體整合位點(diǎn)兩側(cè)的基因;該特定基因由部分缺陷的溫和噬菌體攜帶;缺陷噬菌體脫離宿主核染色體時(shí)發(fā)生低頻率誤切;局限噬菌體的產(chǎn)生是由于UV等因素對溶源菌的誘導(dǎo)引起裂解而產(chǎn)生的。正常
噬菌體和轉(zhuǎn)導(dǎo)半乳糖(gal)的缺陷型噬菌體(
dg)的形成過程
低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)發(fā)生誤切頻率10–4~10–6因此
形成轉(zhuǎn)導(dǎo)子的頻率低條件:感染復(fù)數(shù)m.o.i<1(1)低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)通過一般溶源菌釋放的噬菌體所進(jìn)行的轉(zhuǎn)導(dǎo),因其只能形成極少數(shù)誤切——(10-4~10-6)轉(zhuǎn)導(dǎo)子,稱低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)。Gal:發(fā)酵半乳糖基因;Bio:合成生物素基因;部分缺陷噬菌體感染宿主并整合在宿主核基因組上時(shí),可形成一個獲得了供體菌的gal或bio基因的局限轉(zhuǎn)導(dǎo)子。(2)高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)雙重溶源菌:當(dāng)以gal-
E.coli作受體菌,溶源菌的裂解物以高感染復(fù)數(shù)(M.O.I.>1)進(jìn)行感染時(shí),凡感染部分缺陷噬菌體的細(xì)胞同時(shí)感染正常噬菌體,二者同時(shí)整合在一個受體菌的核染色體組上,這樣的受體菌稱為雙重溶源菌。高頻轉(zhuǎn)導(dǎo):在局限轉(zhuǎn)導(dǎo)中,若對雙重溶源菌進(jìn)行誘導(dǎo),就會產(chǎn)生50%的局限轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體的高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)裂解物(HFTlysate),用這種裂解物去轉(zhuǎn)導(dǎo)受體菌,就可獲得50%的轉(zhuǎn)導(dǎo)子,稱高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)。高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)條件:當(dāng)感染復(fù)數(shù)m.o.I>1受體菌變?yōu)樾纬呻p溶源菌
E.coliK12(
/
dgal),E.coliK12(
dgal)
表示帶有供體菌gal基因的
缺陷噬菌體。
①轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體(
dgal)50%+②輔助噬菌體(
)50%再次侵
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