PubMed檢索完全攻略

PubMed檢索完全攻略免疫細(xì)胞研究bioworld微信號(hào)antibody-king新朋友點(diǎn)圖片上方藍(lán)字免疫細(xì)胞研究bioworld關(guān)注，統(tǒng)計(jì)你探索生命科學(xué)的軌跡，分享科研旅途中的點(diǎn)點(diǎn)滴滴。第一章進(jìn)入PubMed魔法學(xué)校--PubMed概述有位退休的老專家不止一次的向我感慨：'你們現(xiàn)在真是幸福，我們那時(shí)候要查一篇有關(guān)的文獻(xiàn)，要到圖書館一本一本目錄去檢索。特別是做某些別人不太做的課題時(shí)，要收集幾篇有用的文獻(xiàn)，竟要花上3，4個(gè)月時(shí)間，而你們現(xiàn)在……。'趁他打頓的時(shí)候，我告訴他，'快的話，可能只要3秒鐘'。從他兩個(gè)厚厚的酒瓶底背面露出一絲羨慕的眼神。我能夠想見他當(dāng)時(shí)在一大堆期刊中埋頭查閱的情形，但對(duì)于現(xiàn)在的醫(yī)學(xué)工作者來說，我已經(jīng)無法想像，如果我們失去PubMed，世界將會(huì)如何。盡管在因特網(wǎng)上，類似于PubMed的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。尚有非常重要的一點(diǎn)，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的,PubMed是免費(fèi)向公眾開放的。無論何時(shí)何地，你只要在瀏覽器地址欄中輸入：。俗話說，喝水不忘掘井人。PubMed是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)所屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)，位于美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院（NIH）的平臺(tái)上。有不少西方人有在飯前祈禱感恩的習(xí)慣，不懂得我們與否也有必要每次使用PubMed前都感謝NCBI呢？PubMed覆蓋了全世界70多個(gè)國(guó)家4300多個(gè)重要生物醫(yī)學(xué)期刊的摘要和部分全文。其覆蓋的時(shí)間段也非常長(zhǎng)，早的能夠追溯到20世紀(jì)60年代，普通而言，這已經(jīng)足夠早了，極少有人會(huì)需要查閱在此之前的文獻(xiàn)。固然，碩士物醫(yī)學(xué)史的工作者可能是個(gè)例外。而最新的文獻(xiàn)幾乎就在此時(shí)此刻。與PubMed掛鉤的出版商會(huì)自動(dòng)向PubMed提供最新的文獻(xiàn)摘要，而往往在這個(gè)時(shí)候文獻(xiàn)還沒有正式出版。因此盡管生物醫(yī)學(xué)的文章從被期刊接受到出版往往要好幾個(gè)月的時(shí)間，但借助于PubMed，我們?nèi)耘f能夠隨時(shí)掌握最新的動(dòng)向，從而大大有助于自己的臨床和研究工作。尚有些出版商通過PubMed提供文獻(xiàn)的全文，有時(shí)甚至是免費(fèi)的，這樣，我們就能夠在PubMed上真正享有'坐擁書城'的感覺了（有關(guān)如何獲取全文將在后來的章節(jié)中詳述）。進(jìn)入PubMed的主界面后，首先映入我們眼簾的就是頁(yè)面上方的檢索框和功效鍵（以下圖）。這是PubMed的核心部分。大部分工作，我們只要運(yùn)用這'一框五鍵'（檢索框，Limit鍵,Preview/Index鍵,History鍵，Clipboard鍵和Details鍵）即可完畢。在主界面的左側(cè)框（如左圖），有：·JournalBrowser期刊瀏覽·MeShBrowser能夠用它來分層流覽MeSH表·SingleCitationMatcher輸入期刊的信息能夠找到某單篇的文獻(xiàn)或整個(gè)期刊的內(nèi)容?！atchCitutionMatcher用一種特定的形式輸入期刊的信息一次搜索多篇文獻(xiàn)?！linicalQueries這一部分為臨床醫(yī)生設(shè)立，通過過濾的方式將搜索的文獻(xiàn)固定在4個(gè)范疇：治療、診療、病原學(xué)與預(yù)后。·OldPubMed(使用舊式的PubMed查詢方式)3)RelatedResources·OrderDocuments能夠使顧客在本地得到文獻(xiàn)的全文，但這是要收費(fèi)的，至于如何免費(fèi)獲得文獻(xiàn)全文，我將在背面的有關(guān)章節(jié)中詳述?！ratefulMed是對(duì)另一種NLM基于網(wǎng)絡(luò)的查詢系統(tǒng)的鏈接。GratefulMed也提供MEDLINE的接入，并且尚有某些其它的數(shù)據(jù)庫(kù)如AIDSLINE、HISTLINE等等。·ConsumerHealth提供與MEDLINEplus的鏈接，MEDLINEplus是與消費(fèi)者健康信息有關(guān)的國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)?！linicalAlerts此部分的目的是加緊NIH資助的臨床研究成果的公布。運(yùn)用左側(cè)框的這些服務(wù)，我們不僅能夠進(jìn)行功效更加強(qiáng)大的檢索，并且還能得到不少非常有用的服務(wù)。這些都將在后續(xù)章節(jié)中介紹。總體而言，PubMed的界面相稱簡(jiǎn)潔清晰，幾乎是傻瓜式的。然而傻瓜式的界面并不意味著傻瓜式的操作。我看到諸多人用了幾年的PubMed，還是只懂得在檢索框里輸入一種核心字，然后按一下'Go'按鈕這樣一種單一原始的檢索方式。即使有二分之一左右的狀況，這樣的操作就足以得到令人滿意的信息，但對(duì)于另二分之一狀況，就沒有那么幸運(yùn)了，要么你真正所需的信息湮沒在大量紛繁蕪雜的'無用'信息中，要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。令人費(fèi)解的是，諸多醫(yī)務(wù)工作者寧可在每次檢索時(shí)都花上成倍的時(shí)間，卻不肯花上幾個(gè)小時(shí)的時(shí)間去認(rèn)真研究一下PubMed。'君欲善其事，必先利其器'，PubMed就仿佛一把功效強(qiáng)大的槍，你決不能僅僅滿足于懂得扣動(dòng)扳機(jī)就能夠發(fā)射子彈，更重要的是，你要懂得如何運(yùn)用準(zhǔn)星瞄準(zhǔn)，如何把這把槍的功效發(fā)揮到及至。在后來的章節(jié)中，我們將逐步進(jìn)一步地理解PubMed，相信通過這些章節(jié)的學(xué)習(xí)，我們能夠真正純熟掌握PubMed，從而使自己的工作事半功倍。第二章PUBMED簡(jiǎn)樸檢索技巧一．在這一章里，我們將對(duì)如何應(yīng)用PUBMED這一得力助手檢索文獻(xiàn)，作以簡(jiǎn)樸介紹。1．當(dāng)你打開瀏覽器，在地址欄內(nèi)鍵入://.gov/后，就進(jìn)入了PUBMED檢索系統(tǒng)主頁(yè),能夠見到以下的頁(yè)面。2．在靠近頁(yè)面上部的地方，首先映入我們眼簾的，即是供我們輸入所需查詢內(nèi)容的檢索框。在檢索框中輸入查詢?cè)~，然后單擊'go'按鈕或按回車鍵，PubMed將會(huì)自動(dòng)開始檢索，并將檢索到的有關(guān)條目顯示在屏幕上。在檢索框前面，你還能夠選定所要檢索內(nèi)容的數(shù)據(jù)庫(kù)范疇，除NCBI的數(shù)據(jù)庫(kù)以外，可供選擇的尚有：PROTEIN,STRUCTURE,POPSET等等。說到這里，諸多人可能覺得只需傻瓜式的輸入幾個(gè)字符然后回車一敲便可萬(wàn)事大吉，其實(shí)否則。每個(gè)人搜索效率的高低往往存在很大差別。在這里提供下列建議僅供讀者參考：明確你索要檢索的核心概念及詞語(yǔ)，即核心字；考慮到核心字的類似說法，即有可能出現(xiàn)的同義詞；通過限定DATES,STUDYGROUP等，精煉你的檢索范疇；多向有經(jīng)驗(yàn)的人討教，由于不同的專業(yè)背景以及個(gè)人的差別，都有可能形成不同的辦法和技巧。3．通過布爾（BOOLEAN）運(yùn)算來提高你的效率最慣用的三種布爾運(yùn)算即是AND,OR,和NOT。AND提供的運(yùn)算方式即不管所輸入的兩個(gè)核心詞語(yǔ)所出現(xiàn)的位置在哪，只要他們都出現(xiàn)在索引文章的某一處，就將其列出。而OR則是將出現(xiàn)最少一種核心詞的文章列出，這種運(yùn)算在想將相似主題的文章羅列在一起時(shí)，十分有效。NOT運(yùn)算能夠在你的檢索范疇內(nèi)將某些不需要的部分除去。但是在使用的時(shí)候要特別注意，會(huì)有可能將某些你所需要的文章遺漏。例如當(dāng)你的檢索詞為L(zhǎng)EADPOISONINGNOTCHILDREN時(shí)，除了會(huì)刪除掉那些僅討論小朋友的文章，同時(shí)也會(huì)刪去那些同時(shí)討論小朋友及其它年紀(jì)組的文章。4．PUBMED檢索類型普通我們所要查詢的單詞類型大致能夠分為：詞語(yǔ)（主題）檢索這時(shí)我們?cè)赑ubMed主頁(yè)的檢索框中鍵入的是英文單詞或短語(yǔ)（大寫或小寫均可）。然后回車或點(diǎn)擊'Go'，PubMed即使用其詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換功效進(jìn)行檢索，并將檢索成果直接顯示在主頁(yè)下方。例如：鍵入'vitaminccommoncold'后回車或點(diǎn)擊'Go'，PubMed開始檢索并將檢索成果顯示出來。著者檢索當(dāng)我們所要查詢的是著作者時(shí)，在檢索框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫，格式為：'著者姓空格名字首字母縮寫'，例如smithja，然后回車或點(diǎn)擊Go，系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)到著者字段去檢索，并顯示檢索成果?？麢z索在檢索框中鍵入刊名全稱或MEDLINE形式的簡(jiǎn)稱、ISSN號(hào)，例如：molecularbiologyofthecell,或molbiolcell,或1059-1524，然后回車或點(diǎn)擊Go,系統(tǒng)將在刊名字段檢索，并顯示檢索成果。日期或日期范疇檢索能夠在檢索框中鍵入日期或日期范疇，然后回車或點(diǎn)擊Go，系統(tǒng)會(huì)按日期段檢索，并將符合條件的統(tǒng)計(jì)予以顯示。日期的錄入格式為YYYY/MM/DD；如：1999/09/08也能夠不錄月份和日子，如：或1999/12。檢索期刊子集（輯）檢索的格式為：檢索詞ANDjsubseta,如：neoplasmANDjsubseta。可供檢索的期刊子庫(kù)有3種：AbridgedIndexMedicus(有120種重要核心期刊)、Dental和Nursing。分別使用jsubseta,jsubsetd,jsubsetn進(jìn)行限定。檢索帶文摘的統(tǒng)計(jì)檢索的格式為：檢索詞ANDhasabstract,如：livercancerANDhasabstract。要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE統(tǒng)計(jì)中沒有文摘。布爾邏輯檢索PubMed系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索，只要在檢索框中鍵入布爾邏輯運(yùn)算符（AND，OR或NOT）。具體使用時(shí)要注意的問題，詳見上第3點(diǎn)所述。5．如何解決檢索成果當(dāng)你點(diǎn)擊GO或回車后，PubMed將會(huì)自動(dòng)運(yùn)行檢索命令，在屏幕的下方顯示出符合檢索規(guī)定的項(xiàng)目，并且在查詢框內(nèi)保存原檢索詞。此時(shí)要注意的是符合檢索規(guī)定的項(xiàng)目是以SUMMARY（簡(jiǎn)要格式）顯示出來的，就是列出作者，文章題目，以及文章來源的某些信息。在DISPLAY鍵后還能夠選擇別的顯示格式，點(diǎn)擊DISPLAY鍵后，系統(tǒng)按所選格式全部檢索成果。如果只需要顯示其中一部分統(tǒng)計(jì)，則需點(diǎn)擊該統(tǒng)計(jì)左邊的查詢框，使標(biāo)記后，再點(diǎn)擊Display鍵；如果只需顯示一條統(tǒng)計(jì)，則可直接點(diǎn)擊該統(tǒng)計(jì)中的作者姓名超鏈接，系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)顯示該統(tǒng)計(jì)的文摘格式。尚有一點(diǎn)，系統(tǒng)所設(shè)定的默認(rèn)值為每頁(yè)顯示20條選項(xiàng)，這點(diǎn)能夠在SHOW后的下拉菜單處選擇。如果選