?？茖２∨R床研究數(shù)據(jù)庫共性技術平臺需求

專科專病臨床研究數(shù)據(jù)庫共性技術平臺需求一、技術要求1.1技術要求系統(tǒng)建議采用B/S架構(gòu)，純WEB版產(chǎn)品界面，無需安裝插件，無需下載客戶端；支持與醫(yī)院信息系統(tǒng)數(shù)據(jù)的批量定時同步；支持物理服務器和虛擬服務器部署方案；系統(tǒng)支持結(jié)構(gòu)化統(tǒng)計，如標準術語數(shù)量、標準術語類別；1.2性能要求產(chǎn)品穩(wěn)定性要求：系統(tǒng)24小時不宕機；服務器的平均無故障運行時間不少于一年(該故障定義為：導致客戶無法進行正常操作、存在一個或多個功能無法實現(xiàn))；數(shù)據(jù)檢索時間：病歷查詢，平均響應時間小于3秒；多維度查詢，病歷記錄總數(shù)據(jù)達200萬以上，查詢平均響應時間小于3秒；系統(tǒng)性能應滿足用戶的要求，穩(wěn)定、可靠、實用。人機界面友好，輸出、輸入方便，圖表生成美觀，檢索、查詢簡單快捷。二、功能要求2.1科研數(shù)據(jù)采集2.1.1采集方式支持批量數(shù)據(jù)采集完成對數(shù)據(jù)的采集工作。支持參照已定義的數(shù)據(jù)采集規(guī)范標準，完成批量數(shù)據(jù)采集工作；支持批量數(shù)據(jù)接收服務：通過批量數(shù)據(jù)接收服務在中心端完成數(shù)據(jù)緩存；支持數(shù)據(jù)預處理：將數(shù)據(jù)按批存儲在采集工具里并逐行進行數(shù)據(jù)清洗。支持數(shù)據(jù)分發(fā)服務：將預處理完成的增量數(shù)據(jù)導入科研數(shù)據(jù)中心。2.1.2采集范圍支持以患者為單位，整合患者特征中醫(yī)數(shù)據(jù)、病種中醫(yī)數(shù)據(jù)、治療方案與費用中醫(yī)數(shù)據(jù)等形成中醫(yī)數(shù)據(jù)中心；支持存儲患者就診全過程中醫(yī)數(shù)據(jù)；支持存儲基于中醫(yī)數(shù)據(jù)標準治理后的結(jié)構(gòu)化中醫(yī)數(shù)據(jù)；支持存儲基于中醫(yī)數(shù)據(jù)標準構(gòu)建的符合臨床研究維度的中醫(yī)數(shù)據(jù)表；2.1.3數(shù)據(jù)內(nèi)容支持以患者為單位，整合患者特征數(shù)據(jù)、病種數(shù)據(jù)、治療方案與費用數(shù)據(jù)等形成數(shù)據(jù)中心；支持存儲患者就診全過程數(shù)據(jù)；支持存儲基于數(shù)據(jù)標準治理后的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)；支持存儲基于數(shù)據(jù)標準構(gòu)建的符合臨床研究維度的數(shù)據(jù)表；支持存儲通過eCRF科研表單、隨訪管理系統(tǒng)采集的數(shù)據(jù)；支持外部數(shù)據(jù)的整合；支持對多種臨床數(shù)據(jù)的采集，包括但不限于患者基本信息、臨床診療病史信息、臨床診療病史信息、首次病程記錄、日常病程記錄、檢驗記錄表、檢驗明細表、入院登記信息、出院登記信息、住院費用發(fā)生明細表等；2.2科研數(shù)據(jù)中心RDR構(gòu)建中醫(yī)科研數(shù)據(jù)中心，采集和存儲全院各個業(yè)務系統(tǒng)科研相關中醫(yī)數(shù)據(jù)，為臨床研究者最大化提供臨床中醫(yī)數(shù)據(jù)資源。為了保證科研項目的信息完整，除了患者診療信息，系統(tǒng)應支持對患者的隨訪信息、科研樣本信息和科研項目信息進行收集。2.2.1數(shù)據(jù)存儲支持結(jié)構(gòu)及非結(jié)構(gòu)等多樣化的數(shù)據(jù)存儲方式，支持結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)、文本類數(shù)據(jù)存儲；支持快速構(gòu)建不同主題的數(shù)據(jù)庫；2.2.2科研指標管理支持對數(shù)據(jù)集進行分類和管理；支持對數(shù)據(jù)集隨時進行補充和調(diào)整、修改、刪除等設置；支持從全量指標和?？浦笜藘蓚€層次提供多病種?？浦笜思诸惞芾?，包括但不限于技術指標和業(yè)務指標；支持提供指標目錄，可以快速實現(xiàn)對所有應于臨床數(shù)據(jù)中心的指標字段的維護；支持對多種數(shù)據(jù)項的多樣化設置及管理，豐富科研指標體系和指標維度；支持將業(yè)務指標按照研究標準轉(zhuǎn)化為研究指標；支持根據(jù)不同需求和研究方向不同選取不同的指標集；支持科研數(shù)據(jù)值域和臨床數(shù)據(jù)值域的代碼映射和轉(zhuǎn)化功能；2.2.3數(shù)據(jù)建模支持以臨床科研通用數(shù)據(jù)模型（commondatamodel,CDM）管理、存儲科研樣本數(shù)據(jù)；支持使用CDM模型的指標目錄維護所有對應于臨床數(shù)據(jù)中心的醫(yī)療事件模型的字段；支持對CDM模型進行擴充；支持以CDM模型為基礎對臨床科研模型進行全局、專科、隊列模型分層；支持支持對通用中醫(yī)數(shù)據(jù)模型等多種中醫(yī)數(shù)據(jù)模型的管理；支持中醫(yī)基于專病庫權(quán)限控制、數(shù)據(jù)去隱私化等設置，保證數(shù)據(jù)安全；能夠?qū)Σ煌瑱?quán)限用戶進行權(quán)限配置，不同科室的用戶可以查看特定專病庫的數(shù)據(jù)；2.2.4第三方數(shù)據(jù)接入管理支持開放接口以便未來為不同的研究課題、項目和其他數(shù)據(jù)分析提供數(shù)據(jù)；2.2.5權(quán)限安全管理支持角色管理，包括角色的創(chuàng)建，角色權(quán)限設置等功能；支持設置角色權(quán)限的增加、刪除和修改管理，可以對不同用戶、不同角色配置不同的功能權(quán)限和專病庫開放權(quán)限。2.3數(shù)據(jù)治理系統(tǒng)2.3.1后結(jié)構(gòu)化處理支持自定義待結(jié)構(gòu)化的實體以及實體所屬業(yè)務分類；支持提供可視化的實體管理功能，允許對接來自于病歷非結(jié)構(gòu)化文本，并提供默認主動式的實體提取工具從文本中匹配指標數(shù)據(jù)；支持識別文本中的癥狀、影像所見、患者結(jié)局等術語、日期、數(shù)字等實體，并通過識別實體關系來判別文本中實體的關聯(lián)；在對相關實體和實體關系識別和處理之后，支持通過映射將相同、相似的實體和實體關系映射到所有文本中，以便對同類型的文本進行自動處理；支持在線自定義否定語義、排除語義；支持后結(jié)構(gòu)化處理模型的在線調(diào)試，支持通過輸入調(diào)試樣本文本實時反饋后結(jié)構(gòu)化結(jié)果；支持提供后結(jié)構(gòu)化結(jié)果的驗證功能，可以針對驗證結(jié)果逐步完善語義處理模型準確率；支持基于專病庫樣本為驗證范圍的過濾功能，能夠針對性的進行校驗；支持在校驗功能中對語義處理的溯源，并以明顯標識并指示實體在源文本中的上下文位置；支持人工驗證功能對后結(jié)構(gòu)化處理結(jié)果，支持對結(jié)果進行正誤判定；支持模型的二次驗證功能，對模型調(diào)整后的后結(jié)構(gòu)化處理結(jié)果進行多次評判；2.3.2術語庫支持參照國內(nèi)、國際臨床術語標準，構(gòu)建基于標準的術語體系；支持以目錄樹的形式展示術語庫體系，并按術語所屬業(yè)務領域進行劃分；支持基于關鍵字配置、以分詞匹配算法對數(shù)據(jù)進行術語歸一化處理；支持術語的的在線校驗功能；支持對術語歸一化后結(jié)果校驗，支持通過篩選具體術語查看匹配情況2.3.3數(shù)據(jù)脫敏支持后臺隱藏患者的個人信息，包括患者姓名、身份證號、住址、手機號等敏感數(shù)據(jù)；支持在需要定位到具體患者時，可以在申請通過后，用患者就診號或者EMPI號來定位具體患者；2.4專病庫管理系統(tǒng)在科研數(shù)據(jù)中心的基礎上構(gòu)建面向不同研究方向的專病數(shù)據(jù)庫支持集成不同病種的患者樣本，并以專病庫的形式收集、預覽、共享專病樣本數(shù)據(jù)；支持專病庫指標按業(yè)務域分組查看功能；支持用戶在權(quán)限許可情況下對系統(tǒng)內(nèi)用戶的專病庫構(gòu)建情況進行概覽，支持以可視化的方式展示專病庫數(shù)據(jù)的分布、來源、臨床特征等數(shù)據(jù)；支持對專病庫名稱、所屬?？?、項目標簽進行說明及設置；支持專病庫使用權(quán)限控制，管理專病庫所屬用戶；對各用戶角色的權(quán)限在系統(tǒng)功能進行統(tǒng)一配置管理；支持設置專病數(shù)據(jù)庫的納排條件，實現(xiàn)符合條件的患者定期收錄進專病庫；支持全文及精確入組規(guī)則設置功能，將符合條件的患者加入專病數(shù)據(jù)庫；支持按照病人信息、臨床信息等維度在設置納排規(guī)則時同步規(guī)則預覽，并實時統(tǒng)計樣本數(shù)量；支持以二維表形式預覽符合入組條件的患者明細數(shù)據(jù)；支持專病視圖預覽，支持通過餅狀圖、柱狀圖、散點圖、箱圖、詞云、折線圖等形式對數(shù)據(jù)進行圖形化展示；2.5科研隊列管理支持根據(jù)專病庫定義科研隊列，各隊列按專病進行分組，并提供通過切換專病庫查看不同專病研究隊列；提供對隊列的管理功能，包括增加修改和刪除；支持隊列定義功能：能添加隊列，通過動態(tài)調(diào)整數(shù)據(jù)集中指標項目的方式，進行隊列人群的定義，可以通過與或非邏輯任意添加入組規(guī)則；支持快捷入組條件設定和復雜入組條件相結(jié)合的方式收集入組患者；支持對入組規(guī)則歷史追溯的功能，支持通過點擊歷史入組條件進行樣本查詢；支持以可視化方式查看隊列數(shù)據(jù)質(zhì)量，對隊列中的指標缺失度比率以柱狀圖的形態(tài)進行展示，按缺失度由低向高排序，并將完全為空或非缺失的指標以明細方式分組顯示；支持使用直方圖、餅圖、環(huán)形圖、折線圖等形式查看隊列指標集中的值域分布；支持動態(tài)定義、添加、刪除值域分布視圖中的指標項目，可對待顯示的可視化指標進行組合展示；支持動態(tài)切換可視化值域視圖中的直方圖和環(huán)形圖表現(xiàn)形式；支持按隊列定義此隊列下的指標集，可以對指標集進行增刪改查等操作；支持自定義隊列指標集中的指標名稱；支持在已建指標集列表上顯示當前數(shù)據(jù)量、指標提取狀態(tài)等；支持按實際研究需要將隊列指標集進行分組，并支持自定義分組名稱；支持以拖拽的方式增添隊列指標集，支持拖拽方式對指標集分組進行排序；支持從隊列中重復拾取不同名稱的指標項目，支持重復設置指標集分組；支持細粒度定義隊列中的指標對應樣本數(shù)據(jù)提取方式，提取規(guī)則包括但不僅限于設置最大值、最小值、平均值等；支持細粒度定義隊列中指標集的事件來源，并可手工修改原隊列指標的對應事件項目；支持將調(diào)整規(guī)則后的隊列指標集特征數(shù)據(jù)多次生成，支持選擇不同特征指標進行數(shù)據(jù)導出；支持指標集導出前對數(shù)據(jù)集進行全量預覽；支持克隆已有的隊列指標集，并自動對復制的指標集重命名；支持隊列指標集中指標的統(tǒng)計類型設置，包括但可不僅限于連續(xù)變量、二分類變量、離散變量、有序多分類變量等；支持對隊列指標集樣本數(shù)據(jù)的假設檢驗，包括但可不僅限于正態(tài)性檢驗、離群點檢驗、總體參數(shù)比較、比例檢驗等；支持對隊列指標集樣本數(shù)據(jù)的統(tǒng)計描述，包括但可不僅限于頻率分布、疑似異常值分布、一般性統(tǒng)計等描述；支持對隊列指標集樣本數(shù)據(jù)的缺失值填補，包括但可不僅限于補零、均值、中位數(shù)、眾數(shù)、臨近值、固定值等；支持通過可視化圖表展示各指標集在空缺值填補后的表現(xiàn)；支持隊列組內(nèi)及隊列組件樣本特征數(shù)據(jù)對比功能，并在線生成基線特征提取報告；2.6大數(shù)據(jù)檢索平臺系統(tǒng)提供一套靈活強大的數(shù)據(jù)查詢篩選工具，提供多維度、多病種符合專病模型的檢索功能，可以對所有維度數(shù)據(jù)進行靈活地組合需要查詢篩選的數(shù)據(jù)項及條件，能夠從病歷、診斷、用藥醫(yī)囑、檢驗、檢查報告、體征等結(jié)構(gòu)化及非結(jié)構(gòu)化文本中提取檢索點位，個性化定制專病檢索模型。支持通過入選和排除等集合運算實現(xiàn)研究人群的精確篩選，實現(xiàn)自動發(fā)現(xiàn)滿足條件的新病人并自動入組，實時精準從海量病歷中定位研究人群。支持通過輸入任意診療關鍵字進行全文檢索；支持檢索時即時提示聯(lián)想詞條供快捷選擇輸入；支持指定檢索詞條所屬具體診療業(yè)務過程；支持通過輸入邏輯符組織各結(jié)構(gòu)化指標的關系；支持通過目錄樹的方式選擇診療過程中產(chǎn)生的各數(shù)據(jù)指標；支持通過and/or/分組的方式進行檢索指標的邏輯組合；支持對日期、數(shù)值等不同數(shù)據(jù)類型的指標進行包含、不等于等關系設置；支持對日期、數(shù)值等不同數(shù)據(jù)類型的指標值進行差異化錄入；支持對性別、診斷、檢驗等指標進行語義化輸入；支持以病歷模式、病人模式、表格模式進行檢索檢索展示；支持默認使用“并且”的方式理解指標關系；支持將全文檢索輸入的條件理解并轉(zhuǎn)化為高級檢索邏輯關系的過程；支持全文檢索過程中對輸入指標進行遞進式聯(lián)想；支持檢索結(jié)果表格根據(jù)檢索指標進行動態(tài)拓展；支持高級檢索過程的值域控件跟隨指標類型動態(tài)變化；支持對檢索條件的分組后邏輯進行排除，進行反向條件檢索；支持對需納入人群的檢索條件進行記錄、調(diào)出、管理；支持對檢索結(jié)果一鍵導出為excel格式；支持動態(tài)監(jiān)測檢索結(jié)果指標項目，并自行轉(zhuǎn)化為表格結(jié)果列以及導出項目；支持對導出項目進行手工調(diào)整；支持默認通過基礎信息、檢驗、用藥及診斷幾個大的維度觀察數(shù)據(jù)分布；支持通過餅狀圖、柱狀圖、散點圖、箱圖、詞云、折線圖等形式對數(shù)據(jù)進行圖形化展示；支持基于術語庫歸一化治理之后的同義詞檢索；支持檢索平臺全局檢索詞條的實時統(tǒng)計；支持對檢索平臺訪問量的在線實時統(tǒng)計；支持對結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)和非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的檢索；支持根據(jù)操作者權(quán)限對檢索結(jié)果的結(jié)果項目進行控制；支持對檢索歷史進行實時記錄，并通過檢索歷史進行回溯；支持對檢索條件模板進行收藏，并可以對收藏進行增刪管理；項目實施要求（1）實施時間：自合同簽訂之日起3個月內(nèi)完成開發(fā)、安裝、調(diào)試并交付使用；（2）實施地點：招標人指定地點。（3）投標方需提供項目詳盡的實施方案和實施進度表。（4）投標人應在系統(tǒng)實施方案