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動物肝臟中DNA的提取南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院生化實驗報告 動物肝臟中DNA的提取一實驗?zāi)康膶W(xué)習(xí)和掌握用濃鹽法從動物組織中提取DNA的原理和技術(shù)了解分離提取DNA的一般原理二實驗原理一、核酸提取的主要步驟:破碎細胞:研磨、組織勻漿、超聲波、凍融;一硫氰酸胍、堿裂解;酶解(溶菌酶)除去與核酸結(jié)合的蛋白質(zhì)以及多糖、脂類等生物大分子:酚/氯仿抽提、蛋白質(zhì)變性(SDS、異硫氰酸胍等)、蛋白酶處理、高鹽洗滌除去其他不需要的核酸分子沉淀核酸,去除鹽類,有機溶劑等雜質(zhì)二提取DNA的注意事項避免過酸、過堿及高溫加入DNA酶抑制劑:檸檬酸、氰化物、碑酸鹽、EDTA、SDS、苯酚等蛋白變性劑反映不宜過于劇烈,以防機械張力使核酸鏈破壞。加入RNA降解酶除RNA三、DNA的主要來源動物組織及器官:脾、肝、胸腺、魚類精子等。植物:種子的胚芽等微生物:細菌、酵母菌等核酸和蛋白質(zhì)在生物體中以核蛋白的形式存在,其中DNA主要存在于細胞核中,RNA主要存在于核仁及細胞質(zhì)中。生物體組織細胞中的脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),大部分與蛋白質(zhì)結(jié)合,以核蛋白——脫氧核糖核蛋白(DNP)和核糖核蛋白(RNP)的形式存在,這兩種復(fù)合物在不同的電解質(zhì)溶液中的溶解度有較大差異。在低濃度的NaCl溶液中,DNP的溶解度隨NaCl濃度的增加而逐漸降低,當(dāng)NaCl濃度達到0.14mol/L時,DNP的溶解度約為純水中溶解度的1%(幾乎不溶);但當(dāng)NaCl濃度繼續(xù)升高時,DNP的溶解度又逐漸增大,當(dāng)NaCl濃度增至0.5mol/L時,DNP的溶解度約等于純水中的溶解度,當(dāng)NaCl濃度繼續(xù)增至1.0mol/L時,DNP的溶解度約為純水中溶解度的2倍(溶解度很大)。而RNP則不一樣,它在濃NaCl溶液和稀NaCl溶液中的溶解度都很大。因此,可以利用不同濃度的NaCl溶液將DNP和RNP分別抽提出來。在低濃度的NaCl溶液中,DNP的溶解度隨NaCl濃度的增加而逐漸降低,當(dāng)NaCl濃度達到0.14mol/L時,DNP的溶解度約為純水中溶解度的1%(幾乎不溶);但當(dāng)NaCl濃度繼續(xù)升高時,DNP的溶解度又逐漸增大,當(dāng)NaCl濃度增至0.5mol/L時,DNP的溶解度約等于純水中的溶解度,當(dāng)NaCl濃度繼續(xù)增至1.0mol/L時,DNP的溶解度約為純水中溶解度的2倍(溶解度很大)。而RNP則不一樣,它在濃NaCl溶液和稀NaCl溶液中的溶解度都很大。因此,可以利用不同濃度的NaCl溶液將DNP和RNP分別抽提出來。將抽提得到的DNP用十二烷基硫酸鈉(SDS)處理,DNA即與蛋白質(zhì)分開,可用氯仿-異丙醇將蛋白質(zhì)沉淀除去,而DNA溶于溶液中,加入適量的乙醇,DNA即析出,進一步脫水干燥,即得白色纖維狀的DNA粗制品。為了防止DNA(或RNA)酶解,提取時加入乙二胺四乙酸(EDTA)。大部分多糖在用乙醇或異丙醇分級沉淀時即可除去。DNA中的2-脫氧核糖在酸性環(huán)境中與二苯胺試劑一起加熱產(chǎn)生藍色反應(yīng)。制備過程應(yīng)在低溫下(4度)進行,防止過酸,過堿及其他引起核降解的因素。必要時加入酶抑制劑(檸檬酸、EDTA等可以抑制DNA酶活性,SDS或苯酚等蛋白質(zhì)變性劑可以使核酸降解酶破壞)動植物的DNA核蛋白能溶于水及高濃度的鹽溶液,但在0.14mol/l的鹽溶液中溶解度很低,而RNA核蛋白則溶于0.14mol/l鹽溶液,可利用不同濃度的氯化鈉溶液,將脫氧核糖核蛋白和核糖核蛋白從樣品中分別抽提出來。在核酸分子中,由于磷酸基的存在,使其酸性占優(yōu)勢,DNA或RNA都能溶于水中,而不溶于有機溶劑。用絡(luò)合劑EDTA抑制核酸水解酶的活力,同時用去污劑SDS把蛋白質(zhì)和DNA分開,再用氯仿-異丙醇作為蛋白質(zhì)的變性劑沉淀蛋白質(zhì)最后用乙醇把DNA沉淀出來。三實驗器材搗碎機離心機手術(shù)剪離心管刻度吸管燒杯(100ml,250ml)玻棒新鮮動物肝臟石英比色皿量筒(10ml,100ml)容量瓶(50ml)四實驗試劑1、 0.1mol/LNaCl-0.05mol/L檸檬酸鈉溶液(pH6.8)。2、 0.015mol/LNaCl-0.0015mol/L檸檬酸三鈉溶液:氯化鈉0.828克及檸檬酸三鈉0.341克溶于蒸餾水,稀釋至1000ml。3、 95%乙醇(A.R.)。4、 NaCl固體(A.R.)。5、 5%SDS溶液:5gSDS溶于100ml水中。6、 氯仿(A.R.)。7、 V(氯仿):V(異戊醇)混合液20:1五實驗操作

)粗提稱取豬肝8g于100ml的小燒杯中,用剪刀剪碎,加入2倍重的0.1mol/LNaCl-0.05mol/L檸檬酸鈉緩沖液(16ml),高速勻漿。.將勻漿液(~25ml)轉(zhuǎn)移到100ml離心管中,在4000r/min下離心10min,棄去上清液。沉淀中繼續(xù)加入25ml緩沖液,攪拌均勻后于4000r/min離心20min,取沉淀。2)分離DNP、除蛋白.將上述沉淀轉(zhuǎn)移至250ml燒杯中,加入40ml0.1mol/LNaCl-0.05mol/L檸檬酸鈉緩沖液、21ml氯仿/異戊醇、4ml5%SDS,用保鮮膜封口,振搖30min。.緩慢加入3.6gNaCl(事先在研缽中研成粉末)使體系終濃度為1mol/L。將混合液轉(zhuǎn)移至離心管中于3500r/min離心20min,取上清水相(用滴管吸取并量體積)?!揖誓髮印袡C和場一本格(含DNA—我臼凝殷層—有機和場一本格(含DNA仍鹽)3)沉淀DNA.在水相中加入等體積95%乙醇,邊加邊用玻璃棒朝一個方向慢慢攪動直至溶液澄清,將DNA凝膠纏繞在玻璃棒上,用濾紙吸去多余的乙醇,得DNA粗品。【注】用玻棒纏繞DNA有困難時,亦可緩慢搖動燒杯以助于DNA聚集。6.將DNA粗品用5mmol/LNaOH溶解并定容至50ml,作為待測樣品。六注意事項1、 勻漿(破碎細胞)要充分,需剪成小塊。2、 固體

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