DNA中糖苷鍵堿基側(cè)二共價(jià)鍵的喇曼特性分析

./(南京師范大學(xué)生物系南京.凳鍵調(diào)小牛胸腺脫氧棱糖核酸,墨堂堂水合層,嘌呤.p,~JD芋j..L11.1小牛胸腺DNA為BRL產(chǎn)品.以pH值為7.0的重蒸餾水配成5DNA水溶液構(gòu)象.直接用固體DNA纖維測(cè)定纖維態(tài)DNA構(gòu)象.1.2喇曼測(cè)試條件喇曼散射測(cè)試在HRD2型雙單色儀(JobinYvon公司產(chǎn))上進(jìn)行,由286控ITla1.3相對(duì)強(qiáng)度變化率校正值(PV)PED~RIV—PED~(RI2一22.1DNADNA譜中具807cm的骨架非對(duì)稱(chēng)伸縮振動(dòng)模和表征脫氧桉糖構(gòu)象為c3,內(nèi)式的特性模.據(jù)此鑒定纖維DNA中重要為A型構(gòu)象.5DNA水溶液喇曼譜中骨架非對(duì)稱(chēng)伸縮振動(dòng)模移至835cm'中圖1小牛胸隙DNA2,2嘌崎堿基中N9C4與N9C8兩個(gè)喇曼譜數(shù)據(jù)相比較可見(jiàn),一種重要的現(xiàn)象是在纖維態(tài)A型DNA向水溶液B型A16分析測(cè)試第l5卷第4期啶堿基的Nlc2與N1C6卻沒(méi)有明顯的差別.這與文獻(xiàn)報(bào)道有關(guān)在DNA文所指出的堿基中兩個(gè)共價(jià)鍵喇曼模分析的報(bào)道.根據(jù)文獻(xiàn)]o1]列出有關(guān)喇曼峰的歸屬指認(rèn)見(jiàn)表l.由表1可見(jiàn)在DNAl539em兩峰處產(chǎn)生強(qiáng)烈的喇曼減色,相對(duì)強(qiáng)度變化率分別達(dá)48.3和衰l對(duì)強(qiáng)度變fA一礬.c8(19)+N.cB(1G—TNlCZ(14)+N1C6(9)TN1C2(38)C—N1CZ(38)+N1C6(34)C——O.298+0.085—————————*大.從730與1482Cnl兩峰看RIV值相近.但N9C8成分在兩峰中PED值不同,求得的v值就有明顯差別,可知在730cnl峰中N9C8增色更強(qiáng)(見(jiàn)表2).同理分析730與勢(shì)能分布(PED~N9(34與N9C8特性差別和DNAn?曲鹋盼虬昭??牡站啪)OBm?第15卷第4期(1996)分子產(chǎn)生配體反映的原子涉及嘌呤的N3和N7兩個(gè)與N9C4和N9C8DNA水合反映時(shí),N3原子參加水橋形成的數(shù)量要多于N9C8側(cè)的N7.這可從與和增色且增幅更大,C4N3與N9C4同樣同為減色但減幅為低(PV值分別是和一與喇曼增色體現(xiàn)相一致的是,瞟呤堿基N3與N7的原子電荷(單位為kT/e)增為一0.717和一0.702.強(qiáng)于N7的一0.599和一O.575.C4正電荷(+0.695和于C8(+0.488和+0.428),上述事實(shí)表明N9C4DNA使位于雙螺旋小溝側(cè)的N3原子與配基分子反映的活性不同于大溝側(cè)的N73BeaevidesIM,WangAH-938BenevidesJM.WangAH—J,MarelGA.Nuc1.AcidsRes..1984.12(14)l5913lIoundmi】(收藕日期歡迎向各地郵局訂閱刊號(hào)12—~51-析化學(xué))(ISSN0253—3820,CO