Cancer Research 三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)中的細(xì)胞亞型作為癌癥復(fù)發(fā)的預(yù)測(cè)標(biāo)志物

CancerResearch|PCF空間單細(xì)胞蛋白組發(fā)現(xiàn)三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)中關(guān)鍵細(xì)胞亞型作為癌癥復(fù)發(fā)的預(yù)測(cè)標(biāo)志物越來(lái)越多的證據(jù)表明腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞的空間組織關(guān)系可能是腫瘤進(jìn)展和治療反應(yīng)的主要決定因素。因此，繪制和分析精細(xì)的腫瘤免疫微環(huán)境結(jié)構(gòu)可能為預(yù)測(cè)癌癥預(yù)后提供新的見(jiàn)解。近期Cancerresearch雜志發(fā)表了一項(xiàng)探索性和前瞻性的臨床研究，用來(lái)評(píng)估腫瘤微環(huán)境內(nèi)的結(jié)構(gòu)是否可以預(yù)測(cè)頭頸鱗狀細(xì)胞癌（HNSCC）的術(shù)后復(fù)發(fā)。該研究使用PhenoCycler-Fusion（PCF）空間單細(xì)胞蛋白組（原CODEX）檢測(cè)了主要的免疫亞群。空間細(xì)胞鄰域分析發(fā)現(xiàn)了高頻率的由CD31highCD38high漿細(xì)胞組成的三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)（TLS）與HNSCC術(shù)后復(fù)發(fā)率降低顯著相關(guān)。通過(guò)PCF空間單細(xì)胞蛋白組技術(shù)對(duì)來(lái)自9個(gè)病人的組織全片進(jìn)行了30個(gè)抗體的檢測(cè)，這些抗體可以識(shí)別主要的淋巴細(xì)胞亞群、腫瘤細(xì)胞、血管和基質(zhì)細(xì)胞。質(zhì)控之后對(duì)79萬(wàn)多個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行了定義，總共注釋了20種細(xì)胞亞型，說(shuō)明了腫瘤微環(huán)境復(fù)雜的細(xì)胞組成?？臻g關(guān)系分析定義了11個(gè)細(xì)胞鄰域（cellularneighborhood,CN）。這些CN由不同的細(xì)胞類型組成，反映了不同細(xì)胞類型間在空間上存在復(fù)雜的互作關(guān)系。對(duì)每個(gè)CN中細(xì)胞類型進(jìn)行配對(duì)細(xì)胞-細(xì)胞互作分析（pairwisecell–cellcontacts）發(fā)現(xiàn)了有些CN中同源性互作占主導(dǎo)，有些CN中主要是異源性互作為主。異源性互作占比最多的是TLS1、TLS2和hottumor這3個(gè)CN。例如漿細(xì)胞主導(dǎo)了TLS1附近的細(xì)胞相互作用。這些細(xì)胞與其他漿細(xì)胞相互作用，還與CD90+MSC-like細(xì)胞、血管細(xì)胞以及CD4+和CD8+T細(xì)胞相互作用。對(duì)比之前的研究說(shuō)明TLS1或許關(guān)聯(lián)好的預(yù)后。而在TLS2中，M2型巨噬細(xì)胞主導(dǎo)了相互作用，這些巨噬細(xì)胞與Treg、PMN-MDSC、CD4+和CD8+T細(xì)胞相互作用，暗示了TLS2中或許與抑制抗腫瘤免疫相關(guān)。在hottumor中，大約三分之一的腫瘤細(xì)胞與淋巴細(xì)胞亞群接觸，例如中性粒細(xì)胞、CD4+和CD8+T細(xì)胞，還有M2巨噬細(xì)胞和PMN-MDSC。相比之下，在coldtumor中，大多數(shù)腫瘤細(xì)胞是同類型的互作?？傊?，這些CN對(duì)于腫瘤生長(zhǎng)和免疫逃逸或有效抗腫瘤免疫的產(chǎn)生可能具有重要的功能。臨床相關(guān)性分析表明了細(xì)胞鄰域TLS1在腫瘤未復(fù)發(fā)的患者中更為常見(jiàn)，高頻率的TLS1與不復(fù)發(fā)顯著相關(guān)，并且可預(yù)測(cè)無(wú)復(fù)發(fā)生存期。同樣，組織漿細(xì)胞的占比與無(wú)復(fù)發(fā)相關(guān)，并預(yù)測(cè)無(wú)復(fù)發(fā)生存期。蛋白定量分析發(fā)現(xiàn)了TLS1中漿細(xì)胞表達(dá)更高的CD38和CD31，外部TCGA數(shù)據(jù)也表明了更高的CD38和CD31轉(zhuǎn)錄水平與更好的疾病生存率顯著相關(guān)?？偠灾@項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了PCF空間單細(xì)胞蛋白組在免疫監(jiān)測(cè)中的作用，揭示了HNSCC患者腫瘤微環(huán)境的異常復(fù)雜性，再次說(shuō)明了腫瘤微環(huán)境的空間組織結(jié)構(gòu)對(duì)于細(xì)胞功能和預(yù)后至關(guān)重要性，并發(fā)現(xiàn)了TLS1和CD31highCD38high漿細(xì)胞是腫瘤復(fù)發(fā)的重要預(yù)測(cè)因子。PCF空間單細(xì)胞蛋白組學(xué)介紹PCF采用oligo偶聯(lián)抗體檢測(cè)技術(shù)結(jié)合自動(dòng)化高分辨熒光顯微鏡，可實(shí)現(xiàn)超多靶標(biāo)的空間定位及單細(xì)胞分辨率下的細(xì)胞表型分析。所有抗體先一次性與組織切片結(jié)合，再啟動(dòng)抗體和熒光探針的“雜交—成像—?jiǎng)冸x”三步循環(huán)，每次循環(huán)后通過(guò)熒光顯微鏡收集檢測(cè)抗體的熒光信號(hào)。PCF空間單細(xì)胞蛋白組學(xué)優(yōu)勢(shì)華盈生物PhenoCycler-Fusion單細(xì)胞原位空間蛋白組學(xué)技術(shù)資格證書(shū)華盈生物是美國(guó)AkoyaBioscience公司的PhenoCycler-Fusion空間單細(xì)胞蛋白組學(xué)技術(shù)認(rèn)證服務(wù)商，已經(jīng)被納入了該技術(shù)的全球CRO服務(wù)提供者體系。借助全球領(lǐng)先的PhenoCycler-Fusion空間單細(xì)胞蛋白組學(xué)技術(shù)平臺(tái)的建立，華盈生物將為中國(guó)客戶提供更具精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)特色的服務(wù)與合作，推動(dòng)中國(guó)團(tuán)隊(duì)在空間生物學(xué)領(lǐng)域的研究水平，加快構(gòu)建符合中國(guó)人群的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)模式。即刻加入“STAMP郵戳”計(jì)劃華盈生物推出腫瘤微環(huán)境空間蛋白組解剖分析項(xiàng)目”STAMP郵戳”計(jì)劃(SpatialTumorAnatomyofMicroenvironmentProteome),常備15-plex、25-plex、35-plex三款組合性panel,與國(guó)內(nèi)腫瘤研究領(lǐng)域的科學(xué)家共同推進(jìn)腫瘤空間生物學(xué)研究。相關(guān)文獻(xiàn)WeedDT,ZilioS,McGeeC,MarnissiB,SargiZ,FranzmannE,ThomasG,LeibowitzJ,NicolliE,ArnoldD,BicciatoS,SerafiniP.TheTumorImmuneMicroenvironmentArchitectureCorrelateswithRiskofRecurrenceinHeadandNeckSquamousCellCarcinoma.CancerRes.2023;83(23):3886-3900.相關(guān)閱讀血液腫瘤進(jìn)展｜免疫細(xì)胞空間關(guān)系是細(xì)胞治療應(yīng)答的關(guān)鍵決定因素CancerCell|PCF空間單細(xì)胞蛋白組鑒定三陰乳腺癌不同的治療反應(yīng)軌跡PCF空間單