人類基因組單核苷酸多態(tài)性和單體型的分析及應(yīng)用

人類基因組單核苷酸多態(tài)性和單體型的分析及應(yīng)用一、本文概述《人類基因組單核苷酸多態(tài)性和單體型的分析及應(yīng)用》一文旨在對人類基因組中的單核苷酸多態(tài)性（SNP）和單體型（Haplotype）進(jìn)行深入的分析和探討，并闡述其在醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、遺傳學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用價值。單核苷酸多態(tài)性是指人類基因組中單個核苷酸的變異，這種變異在人群中具有較高的頻率，是基因組多樣性的重要來源。而單體型則是由多個相鄰的SNPs組成的遺傳單元，反映了染色體上遺傳變異的連鎖情況。本文首先將對SNP和單體型的基本概念、產(chǎn)生原因及其在基因組中的分布情況進(jìn)行簡要介紹。隨后，我們將深入探討SNP和單體型分析方法的發(fā)展歷程、基本原理以及最新技術(shù)進(jìn)展，包括高通量測序技術(shù)、生物信息學(xué)分析方法等。在此基礎(chǔ)上，我們將重點討論SNP和單體型在疾病關(guān)聯(lián)研究、藥物基因組學(xué)、個性化醫(yī)療、人類起源和進(jìn)化研究等領(lǐng)域的應(yīng)用，并展望其未來的發(fā)展前景。通過本文的闡述，我們期望能夠為讀者提供一個全面、深入的了解人類基因組單核苷酸多態(tài)性和單體型的分析及應(yīng)用的知識平臺，為推動相關(guān)領(lǐng)域的研究和發(fā)展提供參考和借鑒。二、單核苷酸多態(tài)性（SNP）的分析單核苷酸多態(tài)性（SNP，SingleNucleotidePolymorphism）是人類基因組中最為普遍的一種遺傳變異形式，它指的是在人群中單個核苷酸的變異，包括單個堿基的轉(zhuǎn)換、顛換、插入和缺失等。SNP在人類基因組中的分布廣泛且穩(wěn)定，因此成為了遺傳學(xué)和基因組學(xué)研究的重要標(biāo)記。SNP的分析主要依賴于高通量測序技術(shù)和生物信息學(xué)方法。通過大規(guī)模的基因組測序，我們可以獲得海量的SNP數(shù)據(jù)。隨后，利用生物信息學(xué)工具和算法，可以對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選、分類和注釋，從而確定SNP在基因組中的具體位置、頻率以及可能的功能影響。在SNP分析中，我們還需要關(guān)注其連鎖不平衡（LinkageDisequilibrium,LD）情況。連鎖不平衡是指不同位點上的等位基因在人群中的非隨機組合，它是理解基因組結(jié)構(gòu)、基因定位和復(fù)雜疾病遺傳機制的關(guān)鍵。通過計算SNP之間的LD程度，我們可以推測它們是否可能位于同一個基因或調(diào)控區(qū)域內(nèi)，從而進(jìn)一步揭示基因組的功能和復(fù)雜性。隨著SNP數(shù)據(jù)的不斷積累，我們還可以進(jìn)行基于SNP的關(guān)聯(lián)研究（Genome-wideAssociationStudies,GWAS）。GWAS可以幫助我們鑒定與特定表型（如疾病易感性、藥物反應(yīng)等）相關(guān)的基因變異，從而為疾病的預(yù)防和治療提供新的策略和方法。單核苷酸多態(tài)性的分析對于理解人類基因組的結(jié)構(gòu)和功能、揭示疾病的遺傳機制以及開發(fā)新的診療手段具有重要意義。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步和數(shù)據(jù)的不斷積累，我們相信SNP分析將在未來的基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中發(fā)揮更加重要的作用。三、單體型的分析單體型（Haplotype）是指在一個特定染色體區(qū)域內(nèi)，一組緊密連鎖的單核苷酸多態(tài)性（SNP）的特定組合。單體型的分析在遺傳學(xué)、生物醫(yī)學(xué)以及藥物研發(fā)等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用價值。單體型的分析有助于深入理解人類基因組的變異模式。由于單體型反映了多個SNP之間的連鎖不平衡關(guān)系，通過對其進(jìn)行分析，可以揭示基因組的復(fù)雜結(jié)構(gòu)，進(jìn)一步理解人類遺傳多樣性的來源和演化歷程。單體型的分析在疾病關(guān)聯(lián)研究中發(fā)揮著重要作用。許多復(fù)雜疾病的發(fā)生與多個基因的變異有關(guān)，這些變異往往以單體型的形式存在。通過對單體型的分析，可以確定與疾病風(fēng)險相關(guān)的特定單體型，從而更準(zhǔn)確地評估個體的疾病易感性。單體型的分析還有助于藥物研發(fā)和個性化醫(yī)療。不同單體型對藥物的反應(yīng)可能存在差異，通過對特定藥物反應(yīng)相關(guān)的單體型進(jìn)行分析，可以為藥物研發(fā)和個性化醫(yī)療提供重要依據(jù)。例如，某些藥物可能對某些單體型的人群更為有效，而對其他單體型的人群則可能效果不佳。在進(jìn)行單體型的分析時，常用的方法包括基于統(tǒng)計學(xué)的關(guān)聯(lián)分析和基于測序數(shù)據(jù)的單體型推斷。關(guān)聯(lián)分析通過比較病例組和對照組中單體型的分布頻率，尋找與疾病風(fēng)險相關(guān)的單體型。而單體型推斷則利用測序數(shù)據(jù)，通過算法對單體型進(jìn)行重建和推斷，以揭示基因組中單體型的結(jié)構(gòu)和變異。單體型的分析在遺傳學(xué)、生物醫(yī)學(xué)以及藥物研發(fā)等領(lǐng)域具有重要意義。通過對單體型的深入研究，我們可以更好地理解人類基因組的變異模式，揭示疾病發(fā)生的遺傳機制，為藥物研發(fā)和個性化醫(yī)療提供有力支持。四、SNP與單體型的聯(lián)合分析及應(yīng)用單核苷酸多態(tài)性（SNP）和單體型（Haplotype）的分析在遺傳學(xué)和生物信息學(xué)領(lǐng)域中扮演著至關(guān)重要的角色。聯(lián)合分析SNP與單體型不僅有助于更深入地理解人類基因組的復(fù)雜性和多樣性，而且為疾病關(guān)聯(lián)研究、藥物研發(fā)和個性化醫(yī)療等領(lǐng)域提供了強大的工具。聯(lián)合分析的方法：隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展，現(xiàn)在可以對數(shù)以百萬計的SNP進(jìn)行快速而準(zhǔn)確的檢測。這使得我們能夠在大規(guī)模樣本中分析SNP和單體型的聯(lián)合效應(yīng)。常用的聯(lián)合分析方法包括連鎖不平衡分析、單體型區(qū)塊分析以及基于統(tǒng)計模型的關(guān)聯(lián)分析等。這些方法的應(yīng)用，使得我們能夠更準(zhǔn)確地識別與疾病或表型相關(guān)的遺傳變異。在疾病關(guān)聯(lián)研究中的應(yīng)用：SNP與單體型的聯(lián)合分析在疾病關(guān)聯(lián)研究中具有廣泛應(yīng)用。通過分析特定疾病與特定SNP或單體型的關(guān)聯(lián)，科學(xué)家能夠更精確地確定疾病的遺傳基礎(chǔ)。例如，在某些復(fù)雜疾病如癌癥、心血管疾病和精神疾病中，聯(lián)合分析已經(jīng)成功識別了多個與疾病風(fēng)險相關(guān)的遺傳變異。在藥物研發(fā)中的應(yīng)用：SNP與單體型的聯(lián)合分析也為藥物研發(fā)提供了有力支持。通過分析不同個體的遺傳變異，科學(xué)家可以預(yù)測個體對藥物的反應(yīng)差異，從而優(yōu)化藥物設(shè)計和個性化治療方案。這有助于減少藥物副作用，提高治療效果。在個性化醫(yī)療中的應(yīng)用：隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和個性化醫(yī)療的興起，SNP與單體型的聯(lián)合分析在指導(dǎo)個體化治療策略的制定中發(fā)揮著越來越重要的作用。通過分析個體的遺傳信息，醫(yī)生可以為患者制定更加精準(zhǔn)的治療方案，從而提高治療效果和生活質(zhì)量。SNP與單體型的聯(lián)合分析在遺傳學(xué)、生物信息學(xué)以及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中具有廣泛的應(yīng)用前景。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步和方法的不斷完善，我們有望在未來更深入地理解人類基因組的復(fù)雜性和多樣性，為疾病的預(yù)防和治療提供更加精準(zhǔn)和有效的策略。五、結(jié)論與展望隨著人類基因組計劃的完成，單核苷酸多態(tài)性（SNP）和單體型（Haplotype）的研究已成為遺傳學(xué)、生物醫(yī)學(xué)和藥物研發(fā)等領(lǐng)域的重要方向。本文通過綜合分析人類基因組中的單核苷酸多態(tài)性和單體型，詳細(xì)探討了它們的產(chǎn)生機制、分析方法及其在疾病關(guān)聯(lián)研究、藥物研發(fā)和個性化醫(yī)療等領(lǐng)域的應(yīng)用。結(jié)論部分，我們總結(jié)了當(dāng)前SNP和Haplotype分析的主要技術(shù)和方法，包括高通量測序技術(shù)、基因分型技術(shù)、統(tǒng)計分析和生物信息學(xué)方法等。這些技術(shù)的應(yīng)用，極大地推動了我們對人類基因組復(fù)雜性的理解，也為疾病預(yù)測、診斷和治療提供了新的視角和工具。同時，我們也看到了SNP和Haplotype在個性化醫(yī)療中的巨大潛力，它們能夠為個體提供精確的醫(yī)療方案和用藥指導(dǎo)，從而提高治療效果和生活質(zhì)量。然而，盡管我們在SNP和Haplotype的研究和應(yīng)用上取得了顯著的進(jìn)展，但仍面臨許多挑戰(zhàn)和未解決的問題。例如，SNP和Haplotype的功能性解釋仍是一個難題，我們需要更深入地理解它們與疾病之間的關(guān)聯(lián)機制。由于人類基因組的復(fù)雜性和多樣性，如何準(zhǔn)確、高效地分析和解讀大量的基因組數(shù)據(jù)也是一個亟待解決的問題。展望未來，我們期待在以下幾個方面取得突破：隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步，我們將能夠更快速、更準(zhǔn)確地獲取和分析基因組數(shù)據(jù)，從而更深入地理解SNP和Haplotype的功能和作用。我們需要發(fā)展新的統(tǒng)計和分析方法，以應(yīng)對基因組數(shù)據(jù)的復(fù)雜性和多樣性。我們期待將SNP和Haplotype的研究應(yīng)用于更多的領(lǐng)域，如精準(zhǔn)醫(yī)療、藥物研發(fā)、生物進(jìn)化等，從而為人類健康和生物科學(xué)的發(fā)展做出更大的貢獻(xiàn)。單核苷酸多態(tài)性和單體型的研究是基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的重要課題，它們?yōu)槲覀兝斫馊祟惢蚪M的復(fù)雜性、探索疾病的遺傳基礎(chǔ)和開發(fā)個性化醫(yī)療方案提供了有力的工具。盡管仍有許多挑戰(zhàn)需要我們?nèi)ッ鎸徒鉀Q，但隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步和研究的深入，我們有理由相信，未來我們將在這一領(lǐng)域取得更大的突破和進(jìn)展。參考資料：隨著生物技術(shù)的飛速發(fā)展，人類基因組中單核苷酸多態(tài)性的檢測技術(shù)已經(jīng)成為基因組學(xué)領(lǐng)域的重要研究內(nèi)容。單核苷酸多態(tài)性，或稱SNP，是指在基因組中，一個核苷酸位點上存在兩個或多個替代的堿基，這些堿基在人群中的頻率通常大于1%。SNP在人類基因組中廣泛存在，并且與許多遺傳性疾病和表型特征密切相關(guān)。因此，開發(fā)高效、準(zhǔn)確的SNP檢測技術(shù)對于遺傳學(xué)研究和醫(yī)學(xué)應(yīng)用具有重要意義。目前，用于檢測SNP的主要技術(shù)包括基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）的方法、基于微陣列的方法、新一代測序技術(shù)等。基于PCR的方法是最早用于SNP檢測的技術(shù)之一。通過設(shè)計針對待檢測SNP的特異性引物，PCR可以擴增包含SNP的DNA片段，然后通過電泳或熒光檢測確定擴增產(chǎn)物中的SNP類型。該方法具有操作簡便、成本低廉的優(yōu)點，但靈敏度和準(zhǔn)確性相對較低。基于微陣列的方法利用基因芯片技術(shù)，將大量探針固定在芯片上，通過與待測DNA的雜交，實現(xiàn)對SNP的檢測。該方法能夠高通量地檢測大量SNP，但需要制備高特異性、高密度的探針陣列，成本較高。新一代測序技術(shù)，如高通量測序和單分子測序，為SNP檢測提供了新的手段。這些技術(shù)能夠直接對整個基因組進(jìn)行測序，從而在全基因組范圍內(nèi)檢測SNP。新一代測序技術(shù)具有高分辨率、高靈敏度、高通量等優(yōu)點，但設(shè)備成本高昂，數(shù)據(jù)分析復(fù)雜。除了上述技術(shù)外，研究人員還開發(fā)了一些結(jié)合不同方法的策略，以提高SNP檢測的靈敏度和特異性。例如，多重等位基因特異性連接酶擴增（MALDI-TOF）技術(shù)結(jié)合了PCR和質(zhì)譜分析的原理，用于大規(guī)模SNP篩查。該方法具有高靈敏度、高分辨率和高通量的特點，且易于自動化。除了上述技術(shù)外，研究人員還利用納米孔測序和光學(xué)捕捉等技術(shù)進(jìn)行SNP檢測。納米孔測序利用電導(dǎo)變化檢測經(jīng)過納米孔的DNA分子，通過分析電導(dǎo)變化模式確定DNA序列中的SNP。該方法具有實時、快速、便攜等優(yōu)點，但易受到噪聲和序列長度的影響。光學(xué)捕捉技術(shù)利用光學(xué)探針與待測DNA的結(jié)合，通過熒光信號或表面增強拉曼散射等光學(xué)手段實現(xiàn)對SNP的檢測。該方法具有高靈敏度、高特異性等優(yōu)點，但探針設(shè)計和制備較為復(fù)雜。人類基因組中單核苷酸多態(tài)性的檢測技術(shù)多種多樣，各有優(yōu)缺點。在實際應(yīng)用中，應(yīng)根據(jù)具體需求選擇適合的方法。未來，隨著技術(shù)的不斷發(fā)展與創(chuàng)新，我們相信會有更加高效、準(zhǔn)確、便捷的SNP檢測方法問世，為遺傳學(xué)研究和醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供更多可能性。隨著生物技術(shù)的不斷進(jìn)步，人類基因組研究已經(jīng)成為了生命科學(xué)領(lǐng)域的熱點。在人類基因組研究中，單核苷酸多態(tài)性（SNP）和單體型分析具有重要的意義。單核苷酸多態(tài)性是指基因組中單個核苷酸位點的變異，這種變異在人群中具有一定的頻率。單體型是指一組緊密關(guān)聯(lián)的SNP位點，這些位點在人群中以一定的頻率出現(xiàn)，并可以用來標(biāo)記基因組中的某種表型或遺傳特征。本文將介紹單核苷酸多態(tài)性和單體型的概念、分析方法及其應(yīng)用前景。單核苷酸多態(tài)性（SNP）是指基因組中單個核苷酸位點上的變異。這種變異通常只涉及一個堿基的替換，但也可以是插入或缺失。SNP是遺傳多態(tài)性的重要組成部分，其分布廣泛，幾乎在每個人的基因組中都有分布。SNP可以通過限制性酶切、測序等方法進(jìn)行檢測。單體型是指一組緊密關(guān)聯(lián)的SNP位點，這些位點在人群中以一定的頻率出現(xiàn)，并且可以用來標(biāo)記基因組中的某種表型或遺傳特征。單體型分析可以幫助人們更好地理解基因組的遺傳結(jié)構(gòu)和功能，并且可以應(yīng)用于疾病關(guān)聯(lián)分析、藥物反應(yīng)等領(lǐng)域。樣本選擇：選擇具有代表性的樣本群體，以獲得準(zhǔn)確的SNP和單體型頻率。DNA提取：從樣本中提取高質(zhì)量的DNA，以保證后續(xù)實驗的準(zhǔn)確性。SNP分型：利用高通量測序技術(shù)或基因芯片等方法對樣本進(jìn)行SNP分型。單體型構(gòu)建：根據(jù)SNP分型結(jié)果，利用計算機算法找出單體型并計算其頻率。數(shù)據(jù)分析：對單核苷酸多態(tài)性和單體型數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析，以揭示其與疾病或其他遺傳特征的關(guān)聯(lián)。通過對單核苷酸多態(tài)性和單體型數(shù)據(jù)的分析，我們可以得到以下實驗結(jié)果：單核苷酸多態(tài)性和單體型頻率：我們可以獲得每個SNP和單體型的頻率，以及它們在人群中的分布特征。單核苷酸多態(tài)性和單體型分布特征：通過分析單核苷酸多態(tài)性和單體型的分布特征，我們可以了解它們在不同人群亞群中的差異，例如不同種族、不同地理區(qū)域等。單核苷酸多態(tài)性和單體型與疾病關(guān)聯(lián)：通過將單核苷酸多態(tài)性和單體型數(shù)據(jù)與疾病數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，我們可以發(fā)現(xiàn)某些SNP或單體型與特定疾病的關(guān)聯(lián)，為疾病預(yù)防和治療提供新的思路。單核苷酸多態(tài)性和單體型分析在許多領(lǐng)域都具有廣泛的應(yīng)用前景。例如：疾病預(yù)測和預(yù)防：通過揭示SNP或單體型與疾病之間的關(guān)聯(lián)，我們可以預(yù)測個體患某種疾病的風(fēng)險，從而有針對性地進(jìn)行預(yù)防措施。藥物反應(yīng)：了解SNP或單體型與藥物代謝、療效等方面的關(guān)聯(lián)，可以幫助我們預(yù)測個體對某種藥物的反應(yīng)，優(yōu)化治療方案。個性化醫(yī)療：結(jié)合個體的SNP和單體型數(shù)據(jù)，可以為個體提供個性化的診療方案和藥物選擇。生物進(jìn)化研究：了解不同物種間的SNP和單體型差異，有助于我們理解生物的進(jìn)化歷程和適應(yīng)環(huán)境的能力。單核苷酸多態(tài)性和單體型分析在人類基因組研究中具有重要的意義和應(yīng)用價值。未來研究可以進(jìn)一步拓展其應(yīng)用領(lǐng)域，如跨種族、跨地理區(qū)域的數(shù)據(jù)比較，以及結(jié)合其他遺傳和環(huán)境因素進(jìn)行綜合分析等。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步，我們需要不斷優(yōu)化分析方法，提高數(shù)據(jù)質(zhì)量，以更好地揭示基因組奧秘，造福人類健康和生活。單核苷酸多態(tài)性（SNP，SingleNucleotidePolymorphism）是基因組中最常見的一種遺傳變異形式，表現(xiàn)為基因組中單個核苷酸的變異或變化。這種變化可以是轉(zhuǎn)換（例如，從腺苷酸到胸腺嘧啶），顛換（例如，從腺苷酸到鳥嘌呤），或者是微缺失或插入。它們在人類基因組中的頻率非常高，每千個堿基中就有一個SNP。這種高頻率和普遍性使得SNP成為生物醫(yī)學(xué)研究中的重要遺傳標(biāo)記，用于疾病預(yù)測、藥物反應(yīng)、個性化醫(yī)療等眾多領(lǐng)域。聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）-限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）分析：這種方法涉及使用特定引物進(jìn)行PCR擴增，然后使用限制性酶對產(chǎn)物進(jìn)行消化，產(chǎn)生特定長度的片段。這些片段的長度可以通過凝膠電泳進(jìn)行分離和可視化，從而識別基因型。序列特異性引物（SSP）和序列特異性擴增（SSA）：這些技術(shù)都是基于PCR的，使用特定的引物來識別和擴增含有SNP的DNA片段。SSP采用預(yù)先設(shè)計的引物，而SSA則采用一個通用引物和一組特定的探針。微陣列芯片：這些芯片可以同時檢測數(shù)以千計的SNP。通過將基因組DNA與固定在芯片上的特異性探針進(jìn)行雜交，可以識別出各種SNP。高分辨率溶解曲線（HRM）分析：這種技術(shù)通過高分辨率熔解曲線分析儀來檢測DNA的熔解溫度變化。由于不同基因型的熔解溫度不同，因此可以通過此技術(shù)來識別SNP。質(zhì)譜測序（MS）：這是一種檢測基因序列的技術(shù)，可以同時檢測多個SNP位點。MS技術(shù)可以檢測到非常小的分子量差異，從而精確地確定SNP的存在。近年來，隨著新一代測序技術(shù)的發(fā)展，研究人員已經(jīng)開始使用全基因組測序（WGS）和外顯子組測序（WES）來檢測SNP和其他類型的遺傳變異。這些方法不僅可以檢測已知的SNP，還可以發(fā)現(xiàn)新的SNP和其他類型的遺傳變異。研究人員還在開發(fā)更高效的多重PCR方法，例如多重AS-PCR和多重側(cè)流免疫分析等，以便同時檢測多個SNP位點。同時，基于微流控芯片的技術(shù)也在快速發(fā)展，可以將PCR和其他基因分析步驟集成到一個微小的芯片上，大大提高了分析的效率和準(zhǔn)確性。另一個重要的研究方向是開發(fā)用于SNP檢測的生物信息學(xué)方法。這些方法可以幫助研究人員從大量的數(shù)據(jù)中篩選出真正有意義的SNP，并預(yù)測它們可能的影響。研究人員還在開發(fā)更精確的機器學(xué)習(xí)方法，以預(yù)測新的SNP對蛋白質(zhì)功能的影響。單核苷酸多態(tài)性（SNP）是遺傳學(xué)研究中的一個重要主題，相關(guān)的檢測和分析方法在不斷發(fā)展和完善中。這些技術(shù)的進(jìn)步不僅有助于更好地理解人類的基因組結(jié)構(gòu)和功能，也為疾病預(yù)測、藥物研發(fā)和個性化醫(yī)療等提供了更準(zhǔn)確和有效的工具。單核苷酸多態(tài)性主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種，占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中廣泛存在，平均每300個堿基對中就有1個，估計其總數(shù)可達(dá)300萬個甚至更多。SNP是一種二態(tài)的標(biāo)記，由單個堿基的轉(zhuǎn)換或顛換所引起。SNP既可能在基因序列內(nèi)，也可能在基因以外的非編碼序列上。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個堿基的變異，這種變異可由單個堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起，也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個或4個等位多態(tài)性，但實際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。因此，通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C←→T，在其互補鏈上則為G←→A)，也可能是顛換(C←→A，G←→T，C←→G，A←→T)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異，具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3，其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高，可能是因為CpG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中最易發(fā)生突變的位點，其中大多數(shù)是甲基化的，可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中，任何堿基均有可能發(fā)生變異，因此SNP既有可能在基因序列內(nèi)，也有可能在基因以外的非編碼序列上。位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP(codingSNP,cSNP)比較少，因為在外顯子內(nèi)，其變異率僅及周圍序列的1/5。但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義，因此cSNP的研究更受關(guān)注。從對生物的遺傳性狀的影響上來看，cSNP又可分為2種：一種是同義cSNP(synonymouscSNP),即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質(zhì)的氨基酸序列，突變堿基與未突變堿基的含義相同；另一種是非同義cSNP(non-synonymouscSNP),指堿基序列的改變可使以其為原本翻譯的蛋白質(zhì)序列發(fā)生改變，從而影響了蛋白質(zhì)的功能。這種改變常是導(dǎo)致生物性狀改變的直接原因。cSNP中約有一半為非同義cSNP。先形成的SNP在人群中常有更高的頻率，后形成的SNP所占的比率較低。各地各民族人群中特定SNP并非一定都存在，其所占比率也不盡相同，但大約有85%應(yīng)是共通的。二是分布在基因編碼區(qū)(codingregion),稱其為cSNP，屬功能性突變。在遺傳學(xué)分析中，SNP作為一類遺傳標(biāo)記得以廣泛應(yīng)用,主要源于這幾個