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PCR技術(shù)與電泳相關(guān)問題練習(xí)一、選擇題1.大引物PCR定點(diǎn)突變常用來研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)改變導(dǎo)致的功能變化。單核苷酸的定點(diǎn)誘變僅需進(jìn)行兩輪PCR即可獲得,第一輪加誘變引物和側(cè)翼引物,第一輪產(chǎn)物作為第二輪PCR擴(kuò)增的大引物,過程如圖所示。下列敘述正確的是()A.第一輪PCR過程中復(fù)性所用的溫度與第二輪PCR復(fù)性的溫度是一樣的B.PCR擴(kuò)增的定點(diǎn)誘變產(chǎn)物通常需要連接到載體分子上才能表達(dá)出相應(yīng)的性狀,該定點(diǎn)誘變產(chǎn)物需具備啟動(dòng)子、終止子等結(jié)構(gòu)才能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯C.第二輪PCR所用的引物是第一輪PCR的產(chǎn)物DNA的兩條鏈D.將某功能蛋白的第17位Cys(UGU)改造成Ser(UCU),屬于蛋白質(zhì)工程2.惡性高熱是一種潛在致命性單基因遺傳病,患者一般無癥狀,但當(dāng)接觸麻醉劑后,會(huì)誘發(fā)患者出現(xiàn)高熱等癥狀,死亡率極高。某家庭的母親和女兒皆患有惡性高熱,母親因該病去世,女兒經(jīng)及時(shí)搶救而康復(fù)??蒲腥藛T對(duì)該家庭成員進(jìn)行了基因檢測(cè)??刂圃撔誀畹哪骋换蚩稍谙拗泼傅淖饔孟虑懈畛蓛蓷l不同長(zhǎng)度的DNA片段,用凝膠電泳法分離后可顯示出不同的帶譜如圖所示(控制該性狀的基因?yàn)橥耆@性,且不位于X、Y染色體的同源區(qū)段)。下列說法錯(cuò)誤的是()A.該遺傳病屬于常染色體顯性遺傳病B.結(jié)合3、4可推斷2號(hào)不患病的概率是100%C.該致病基因是由正?;驂A基的替換形成的D.4號(hào)與無麻醉劑接觸史的女子結(jié)婚,后代能出現(xiàn)的基因型最多有3種3.某研究小組利用轉(zhuǎn)基因技術(shù),將綠色熒光蛋白基因(GFP)整合到野生型小鼠Gata3基因一端,如圖甲所示。實(shí)驗(yàn)得到能正常表達(dá)兩種蛋白質(zhì)的雜合子雌雄小鼠各1只,交配以期獲得Gata3-GFP基因純合子小鼠。為了鑒定交配獲得的4只新生小鼠的基因型,設(shè)計(jì)了引物1和引物2用于PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖乙所示。下列敘述正確的是()A.Gata3基因的啟動(dòng)子無法控制GFP基因的表達(dá)B.翻譯時(shí)先合成Gata3蛋白,再合成GFP蛋白C.2號(hào)條帶的小鼠是野生型,4號(hào)條帶的小鼠是Gata3-GFP基因純合子D.若用引物1和引物3進(jìn)行PCR,能更好地區(qū)分雜合子和純合子4.如圖所示,在一段未知序列的突變體DNA片段中,插入了已知序列的T-DNA,要想對(duì)T-DNA兩側(cè)的未知序列進(jìn)行測(cè)序,下列做法正確的是()A.用引物①和引物④直接進(jìn)行PCR擴(kuò)增之后再測(cè)序B.用引物②和引物③直接進(jìn)行PCR擴(kuò)增之后再測(cè)序C.用DNA連接酶連接成環(huán)狀后,再用引物①④PCR擴(kuò)增后測(cè)序D.用DNA連接酶連接成環(huán)狀后,再用引物②③PCR擴(kuò)增后測(cè)序5.重疊延伸PCR技術(shù)是采用具有互補(bǔ)末端的引物,使PCR產(chǎn)物形成重疊鏈,從而在隨后的擴(kuò)增反應(yīng)中通過重疊鏈的延伸,獲得想要的目的基因。某科研團(tuán)隊(duì)運(yùn)用重疊延伸PCR技術(shù)在水蛭素基因的特定位點(diǎn)引入特定突變,以實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)突變,原理如圖。下列說法錯(cuò)誤的是()注:引起凸起處代表與模板鏈不能互補(bǔ)的突變位點(diǎn)。A.過程②需要含Mg2+的緩沖液、DNA模板、引物、4種脫氧核苷酸、耐高溫的DNA聚合酶等B.若引物1、引物2組成的反應(yīng)系統(tǒng)和引物3、引物4組成的反應(yīng)系統(tǒng)中均進(jìn)行一次DNA分子的復(fù)制后,一共會(huì)產(chǎn)生2種DNA分子C.經(jīng)過程④獲得的雜交DNA有2種,其中只有一種可以經(jīng)過程⑤獲得目的基因D.過程⑤使用耐高溫的DNA聚合酶延伸,不需要引物二、非選擇題6.人體內(nèi)的t-PA蛋白能高效降解血栓,是心梗和腦血栓的急救藥,但大劑量使用會(huì)誘發(fā)顱內(nèi)出血。如果將t-PA蛋白第84位的半胱氨酸換成絲氨酸,能顯著降低出血副作用。先對(duì)天然的t-PA基因進(jìn)行序列改造,然后在大腸桿菌中表達(dá)改造后的基因,可得到性能優(yōu)異的改良t-PA蛋白。如圖是通過重疊延伸PCR獲取t-PA改良基因和利用質(zhì)粒pCLYⅡ構(gòu)建含t-PA改良基因的重組質(zhì)粒示意圖(圖中重疊延伸PCR過程中,引物a、b用來擴(kuò)增含有突變位點(diǎn)及其上游序列的DNA片段,引物c、d用來擴(kuò)增含突變位點(diǎn)及其下游序列的DNA片段)。請(qǐng)回答:(1)已知t-PA蛋白第84位是半胱氨酸,相應(yīng)的基因模板鏈(圖中t-PA基因的上鏈)上的堿基序列是ACA,絲氨酸的密碼子是UCU。重疊延伸PCR,示意圖中的點(diǎn)表示突變部位的堿基,引物b中該部位的堿基是____________,引物c該部位的堿基是________。PCR中需要引物的原因是_______________________。(2)重疊延伸PCR中,PCR1和PCR2分別進(jìn)行,產(chǎn)物混合后再進(jìn)行PCR3。PCR1和PCR2需要分別進(jìn)行的原因是_______________________________。7.種子大小是作物重要的產(chǎn)量性狀。研究者對(duì)野生型擬南芥(2n=10)進(jìn)行誘變篩選到一株種子增大的突變體。通過遺傳分析和測(cè)序,發(fā)現(xiàn)野生型DAI基因發(fā)生一個(gè)堿基G到A的替換,突變后的基因?yàn)殡[性基因,據(jù)此推測(cè)突變體的表型與其有關(guān),開展相關(guān)實(shí)驗(yàn)?;卮鹣铝袉栴}:(1)擬采用農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法將野生型DAI基因轉(zhuǎn)入突變體植株,若突變體表型確由該突變?cè)斐?,則轉(zhuǎn)基因植株的種子大小應(yīng)與________植株的種子大小相近。(2)用PCR反應(yīng)擴(kuò)增DAI基因,用限制性內(nèi)切核酸酶對(duì)PCR產(chǎn)物和________進(jìn)行切割,用DNA連接酶將兩者連接。為確保插入的DAI基因可以正常表達(dá),其上下游序列需具備__________________________。(3)轉(zhuǎn)化后,T-DNA(其內(nèi)部基因在減數(shù)分裂時(shí)不發(fā)生交換)可在基因組單一位點(diǎn)插入也可以同時(shí)插入多個(gè)位點(diǎn)。在插入片段均遵循基因分離及自由組合定律的前提下,選出單一位點(diǎn)插入的植株,并進(jìn)一步獲得目的基因穩(wěn)定遺傳的植株(如圖),用于后續(xù)驗(yàn)證突變基因與表型的關(guān)系。①農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化T0代植株并自交,將T1代種子播種在選擇培養(yǎng)基上,能夠萌發(fā)并生長(zhǎng)的陽(yáng)性個(gè)體即表示其基因組中插入了_______________________________。②T1代陽(yáng)性植株自交所得的T2代種子按單株收種并播種于選擇培養(yǎng)基,選擇陽(yáng)性率約________%的培養(yǎng)基中幼苗繼續(xù)培養(yǎng)。③將②中選出的T2代陽(yáng)性植株________(填“自交”“與野生型雜交”或“與突變體雜交”)所得的T3代種子按單株收種并播種于選擇培養(yǎng)基,陽(yáng)性率達(dá)到________%的培養(yǎng)基中的幼苗即為目標(biāo)轉(zhuǎn)基因植株。為便于在后續(xù)研究中檢測(cè)該突變,研究者利用PCR擴(kuò)增野生型和突變型基因片段,再使用限制性內(nèi)切核酸酶X切割產(chǎn)物,通過核酸電泳即可進(jìn)行突變檢測(cè),相關(guān)信息見下,在電泳圖中將酶切結(jié)果對(duì)應(yīng)位置的條帶涂黑。8.科研人員構(gòu)建了可表達(dá)J-V5融合蛋白的重組質(zhì)粒并進(jìn)行了檢測(cè),該質(zhì)粒的部分結(jié)構(gòu)如圖甲所示,其中V5編碼序列表達(dá)標(biāo)簽短肽V5。(1)與圖甲中啟動(dòng)子結(jié)合的酶是________。除圖甲中標(biāo)出的結(jié)構(gòu)外,作為載體,質(zhì)粒還需具備的結(jié)構(gòu)有______________________________(答出2個(gè)結(jié)構(gòu)即可)。(2)構(gòu)建重組質(zhì)粒后,為了確定J基因連接到質(zhì)粒中且插入方向正確,需進(jìn)行PCR檢測(cè),若僅用一對(duì)引物,應(yīng)選擇圖甲中的引物________。已知J基因轉(zhuǎn)錄的模板鏈位于b鏈,由此可知引物F1與圖甲中J基因的________(填“a鏈”或“b鏈”)相應(yīng)部分的序列相同。(3)重組質(zhì)粒在受體細(xì)胞內(nèi)正確表達(dá)后,用抗J蛋白抗體和抗V5抗體分別檢測(cè)相應(yīng)蛋白是否表達(dá)以及表達(dá)水平,結(jié)果如圖乙所示。其中,出現(xiàn)條帶1證明細(xì)胞內(nèi)表達(dá)了____________,條帶2所檢出的蛋白________(填“是”或“不是”)由重組質(zhì)粒上的J基因表達(dá)的。9.基因定點(diǎn)突變是指按照特定的要求,使基因的特定序列發(fā)生插入、刪除、置換、重排等變異。下圖甲是一種PCR介導(dǎo)的基因定點(diǎn)突變示意圖,圖乙是研究人員利用基因M1構(gòu)建基因表達(dá)載體的過程。請(qǐng)回答下列問題:(1)進(jìn)行基因定點(diǎn)突變的PCR反應(yīng)體系中,除加入引物和模板DNA外,一般還需要加入________________________;圖甲所示的基因定點(diǎn)突變技術(shù)需要________次PCR;獲得產(chǎn)物A需要的引物是____________。(2)研究人員對(duì)PCR的中間產(chǎn)物A、B進(jìn)行純化后,利用圖中相關(guān)酶對(duì)基因M和產(chǎn)物A、B進(jìn)行充分酶切后得到不同的片段,長(zhǎng)度(kb)如下表,則圖中基因敲除片段的長(zhǎng)度為________,基因M1的長(zhǎng)度為________。項(xiàng)目基因MAB長(zhǎng)度3.24、2.8、0.15、0.132.8、0.093.24、0.05(3)通過圖甲過程獲得的基因M1仍需要大量擴(kuò)增,此時(shí)選擇的引物是________,為了與圖乙中的Ti質(zhì)粒相連,還需要分別在它們的__________端引入限制酶________的識(shí)別序列。(4)構(gòu)建基因表達(dá)載體時(shí),M1基因必需插入Ti質(zhì)粒的________中,原因是_______________________________________________________。答案:1.D為了使兩輪PCR在同一支試管中進(jìn)行,引物設(shè)計(jì)時(shí)應(yīng)考慮不同的復(fù)性溫度,第二輪PCR的復(fù)性溫度應(yīng)該比第一輪高,A錯(cuò)誤;若要使得目的基因可以表達(dá)出蛋白質(zhì),則載體上需要具備啟動(dòng)子和終止子等結(jié)構(gòu)才能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯,B錯(cuò)誤;除第一輪產(chǎn)物作為第二輪PCR擴(kuò)增的大引物外,第二輪PCR仍需加入的引物是另一種側(cè)翼引物,以便進(jìn)行另一條鏈的延伸,C錯(cuò)誤;將某功能蛋白的第17位Cys(UGU)改造成Ser(UCU),屬于蛋白質(zhì)工程,D正確。2.B據(jù)題意可知,該家庭女兒患惡性高熱,兒子相關(guān)致病基因檢測(cè)結(jié)果與女兒相同,因此兒子也患惡性高熱;父親只有500bp和800bp的片段,女兒和兒子既含1300bp片段,也含500bp和800bp的片段,說明女兒和兒子都是既含致病基因,又含正常基因,若是該致病基因在X染色體上,且不位于X、Y染色體的同源區(qū)段,兒子就不會(huì)同時(shí)含有致病基因和正?;?,因此判斷該病為常染色體顯性遺傳病,A正確;根據(jù)題意,“控制該性狀的某一基因可在限制酶的作用下切割成兩條不同長(zhǎng)度的DNA片段”,若是致病基因被切割成兩條不同長(zhǎng)度的DNA片段,父親有可能是患者,B錯(cuò)誤;據(jù)題圖可知,某限制酶作用于相應(yīng)基因后,正常基因和致病基因的總長(zhǎng)度不變(都是1300bp),因此推測(cè)該致病基因由正?;驂A基的替換形成,C正確;由分析可知,該病為常染色體顯性遺傳病,4號(hào)是雜合子,用A/a表示相關(guān)基因,4號(hào)與無麻醉劑接觸史的女子(基因型為AA、Aa或aa)結(jié)婚,當(dāng)該女子的基因型為Aa時(shí),后代出現(xiàn)的基因型最多,有AA、Aa、aa,3種,D正確。3.B由圖甲可知,Gata3基因與GFP基因共用一個(gè)啟動(dòng)子,且由題干可知兩基因能正常表達(dá)出相關(guān)蛋白質(zhì),A錯(cuò)誤;由于啟動(dòng)子在左側(cè),基因在右側(cè),轉(zhuǎn)錄基因時(shí),先轉(zhuǎn)錄Gata3基因,再轉(zhuǎn)錄GFP基因,由于轉(zhuǎn)錄和翻譯的方向均是沿mRNA的5′→3′,因此翻譯時(shí)先合成Gata3蛋白,再合成GFP蛋白,B正確;由圖乙可知,大片段包含GFP基因編碼區(qū)片段,小片段不包含GFP基因編碼區(qū)片段,則2號(hào)小鼠是Gata3-GFP基因純合子,4號(hào)小鼠是野生型,C錯(cuò)誤;若用引物1和引物3進(jìn)行PCR,雜合子和Gata3-GFP基因純合子均能擴(kuò)出條帶,僅有Gata3基因時(shí)無法擴(kuò)出條帶,不利于區(qū)分雜合子和純合子,D錯(cuò)誤。4.C直接選用引物①、④組合進(jìn)行PCR,引物選擇方向相反,無法完成擴(kuò)增,A錯(cuò)誤;用引物②和引物③可實(shí)現(xiàn)對(duì)已知的T-DNA序列進(jìn)行擴(kuò)增,但達(dá)不到預(yù)期目的,B、D錯(cuò)誤;用DNA連接酶連接成環(huán)狀后,用引物①④PCR擴(kuò)增后測(cè)序,恰好可擴(kuò)增出T-DNA兩側(cè)的未知序列,C正確。5.B過程②為PCR反應(yīng),需要在添加了Mg2+的緩沖液中才能進(jìn)行,需要提供DNA模板、分別與兩條模板鏈結(jié)合的引物、4種脫氧核苷酸和耐高溫的DNA聚合酶等,A正確;兩個(gè)反應(yīng)系統(tǒng)中各自形成兩種DNA分子,但由于引物1和引物4形成兩個(gè)與原DNA相同的DNA分子,所以含有引物1和4的DNA屬于同一種DNA,故總共形成3種DNA分子,B錯(cuò)誤;過程④獲得的雜交DNA有2種,一種3′端為單鏈,一種5′端為單鏈,5′端為單鏈的雜交DNA為所需DNA,C正確;過程⑤是延伸過程,該過程使用耐高溫的DNA聚合酶進(jìn)行催化,不需要引物,D正確。6.(1)GCDNA聚合酶只能將單個(gè)脫氧核苷酸連接到雙鏈DNA片段的引物鏈上(或DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,而只能從3′端延伸DNA鏈)(2)引物b和引物c遵循堿基互補(bǔ)配對(duì),會(huì)使引物失效解析(1)已知t-PA蛋白第84位是半胱氨酸,相應(yīng)的基因模板鏈上的堿基序列是ACA,半胱氨酸的密碼子為UGU,而絲氨酸的密碼子是UCU,由此可知,若要將t-PA蛋白第84位的半胱氨酸換成絲氨酸,則t-PA基因上鏈第84位發(fā)生的堿基替換為C→G,題圖中顯示引物b與t-PA改良基因的下鏈互補(bǔ),故其中相應(yīng)部位的堿基與上鏈相同,即該部位的堿基是G,引物c與t-PA改良基因的上鏈互補(bǔ),故其中相應(yīng)部位的堿基與下鏈相同,即該部位的堿基是C。由于DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,而只能從3′端延伸DNA鏈,因此PCR中需要加入合適的引物來完成子鏈的延伸。(2)題圖信息顯示,引物b和引物c遵循堿基互補(bǔ)配對(duì),因此,如果PCR1和PCR2同時(shí)進(jìn)行,會(huì)使引物失效,無法達(dá)到預(yù)期目的。7.(1)野生型(2)Ti質(zhì)粒啟動(dòng)子和終止子(3)①DAI基因和卡那霉素抗性基因②75③自交100解析(1)根據(jù)題干信息可知,突變后的基因?yàn)殡[性基因,則野生型DAI基因?yàn)轱@性基因,因此采用農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法將野生型DAI基因轉(zhuǎn)入突變體植株,若突變體表型確由該突變?cè)斐?,則轉(zhuǎn)基因植株的種子大小應(yīng)與野生型植株的種子大小相近。(2)利用PCR技術(shù)擴(kuò)增DAI基因后,應(yīng)該用同種限制性內(nèi)切核酸酶對(duì)DAI基因和作為載體的Ti質(zhì)粒進(jìn)行切割,再用DNA連接酶將兩者連接。在基因表達(dá)載體中,啟動(dòng)子位于目的基因的首端,終止子位于目的基因的尾端,因此為確保插入的DAI基因可以正常表達(dá),其上下游序列需具備啟動(dòng)子和終止子。(3)①根據(jù)題干信息和圖形分析,將T0代植株的花序浸沒于農(nóng)桿菌(T-DNA上含有DAI基因和卡那霉素抗性基因)菌液進(jìn)行轉(zhuǎn)化,再將獲得的T1代種子播種在選擇培養(yǎng)基(含有卡那霉素)上,若在選擇培養(yǎng)基上有能夠萌發(fā)并生長(zhǎng)的陽(yáng)性個(gè)體,則說明含有卡那霉素抗性基因,即表示其基因組中插入DAI基因和卡那霉素抗性基因。②T1代陽(yáng)性植株都含有DAI基因,由于T-DNA(其內(nèi)部基因在減數(shù)分裂時(shí)不發(fā)生交換)可在基因組單一位點(diǎn)插入也可以同時(shí)插入多個(gè)位點(diǎn),所以不確定是單一位點(diǎn)插入還是多位點(diǎn)插入。根據(jù)題意,選出單一位點(diǎn)插入的植株,相當(dāng)于一對(duì)等位基因的雜合子,其自交后代應(yīng)該出現(xiàn)3∶1的性狀分離比,因此應(yīng)該選擇陽(yáng)性率約75%的培養(yǎng)基中幼苗繼續(xù)培養(yǎng)。③將②中選出的T2代陽(yáng)性植株自交,再將得到的T3代種子按單株收種并播種于選擇培養(yǎng)基上,若某培養(yǎng)基上全部為具有卡那霉素抗性的植株即為需要選擇的植株,即陽(yáng)性率達(dá)到100%的培養(yǎng)基中的幼苗即為目標(biāo)轉(zhuǎn)基因植株。根據(jù)圖形分析,野生型和突變型基因片段的長(zhǎng)度都是150bp,野生型的基因沒有限制酶X的切割位點(diǎn),而突變型的基因有限制酶X的切割位點(diǎn),結(jié)合圖中的數(shù)據(jù)分析可知電泳圖中,野生型只有150bp,突變型有50bp和100bp,如圖:]8.(1)RNA聚合酶復(fù)制原點(diǎn)、標(biāo)記基因、限制酶切割位點(diǎn)(2)F1和R2或者F2和R1a鏈(3)J-V5融合蛋白不是解析(1)與圖甲中啟動(dòng)子結(jié)合的酶是RNA聚合酶。圖甲中有啟動(dòng)子和終止子等,作為載體,質(zhì)粒還需具備的結(jié)構(gòu)有限制酶切割位點(diǎn)、標(biāo)記基因、復(fù)制原點(diǎn)等。(2)據(jù)圖甲可知,引物F2與R1或F1與R2結(jié)合部位均包含J基因的堿基序列,因此推測(cè)為了確定J基因連接到質(zhì)粒中且插入方向正確,進(jìn)行PCR檢測(cè)時(shí),若僅用一對(duì)引物,應(yīng)選擇圖甲中的引物F2和R1或F1與R2。b是模板鏈,而根據(jù)圖上啟動(dòng)子和終止子的位置可知轉(zhuǎn)錄方向是圖上從左向右,對(duì)應(yīng)的模板鏈方向應(yīng)該是3′→5′,非模板鏈(也就是a鏈)是5′→3′,圖中F1是前引物,在左側(cè),所以其配對(duì)的單鏈?zhǔn)?′→5′的b鏈,故其序列應(yīng)該與a鏈相應(yīng)部分的序列相同。(3)據(jù)圖乙可知,只有抗V5抗體時(shí),出現(xiàn)條帶1,抗V5抗
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