![p21p27基因多態(tài)性對(duì)食管癌的發(fā)生及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響_第1頁(yè)](http://file4.renrendoc.com/view7/M02/35/3C/wKhkGWbFKX2AJIpnAAJn4f-NBKk258.jpg)
![p21p27基因多態(tài)性對(duì)食管癌的發(fā)生及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響_第2頁(yè)](http://file4.renrendoc.com/view7/M02/35/3C/wKhkGWbFKX2AJIpnAAJn4f-NBKk2582.jpg)
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1/1p21,p27基因多態(tài)性對(duì)食管癌的發(fā)生及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響p21,p27基因多態(tài)性對(duì)食管癌的發(fā)生及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響作者:
馬玉泉楊曉光劉暉李保慶劉俊峰【摘要】目的:
探討p21基因外顯子3非翻譯區(qū)(UTR)第20堿基對(duì)的核苷酸多態(tài)性(SNPs)以及p27基因第109密碼子的SNP對(duì)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)發(fā)生及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響.方法:
采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)片段長(zhǎng)度分析和PCR限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)方法檢測(cè)p21基因外顯子的3UTR第20堿基對(duì)SNP以及p27基因第109密碼子SNP位點(diǎn)的基因型.結(jié)果:
p21和p27的基因型分布在ESCC組及對(duì)照組中均符合HardyWeinberg平衡(Pgt;0.05),在ESCC組和對(duì)照組中,ESCC患者p21基因3UTR和p27基因第109密碼子的多態(tài)性基因型和等位基因型分布與對(duì)照組無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異.吸煙狀況分層分析發(fā)現(xiàn),吸煙患者p21的TT基因型頻率(26.0%)顯著高于健康吸煙組(12.0%)(2=8.60,P=0.014).與CC基因型相比,攜帶TT基因型可顯著增加吸煙者的ESCC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn).經(jīng)性別和年齡校正的比值比(OR)及其95%的可信區(qū)間(CI)分別為3.36(95%,CI=1.45~7.75),而在非吸煙的患者和健康個(gè)體中,p21基因型及等位基因型頻率差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;p27基因型及等位基因型頻率在吸煙及非吸煙患者和健康個(gè)體中差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移分層分析結(jié)果表明,有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組的p21的TT基因型頻率(26.4%)顯著高于無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組(15.3%)(2=6.128,P=0.013).與常見(jiàn)單體型C/C相比,攜帶TT基因型與TT+T/C基因型可明顯增加ESCC患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn),其性別、年齡校正的OR值及其95%的CI分別為3.11(95%,CI=1.28~7.52)和1.98(95%,CI=1.03~3.80),而p27基因多態(tài)性在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組和無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,p27基因多態(tài)性與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)性無(wú)關(guān).結(jié)論:p21基因3UTR和p27基因第109密碼子的多態(tài)性基因型和等位基因型不單獨(dú)影響ESCC的發(fā)生和發(fā)展;p213UTR的TT等位基因可能增加吸煙人群ESCC易感性,并可能增加淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)性.【關(guān)鍵詞】食管鱗狀細(xì)胞癌;p21基因;p27基因;多態(tài)性;易感性;淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移0引言p21和p27基因是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)性激酶抑制劑(cyclindependentkinaseinhibitors,CDKI)家族中的重要成員[1],其多態(tài)性與一些惡性腫瘤如肺癌、乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌、前列腺癌的易感性有關(guān)[2-4],但其與食管癌易感性的相關(guān)研究在還鮮見(jiàn)報(bào)道.我們采用基于醫(yī)院病例對(duì)照研究方法,觀(guān)察p21,p27基因型與食管癌發(fā)病及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)系,以探討p21基因外顯子3非翻譯區(qū)(untranslatedregion,UTR)第20堿基對(duì)的核苷酸多態(tài)性(singlenucleolidepolymorphisms,SNPs)以及p27基因第109密碼子的SNP對(duì)食管鱗狀細(xì)胞癌(esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)發(fā)生及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響.1對(duì)象和方法1.1對(duì)象選擇2003/2005河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院行胃鏡檢查或住院手術(shù)治療的ESCC患者202例作為病例組,其中185例有相關(guān)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移.選擇同期在河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院行健康查體人員及河北省血站的無(wú)腫瘤及遺傳病史健康獻(xiàn)血者265例,作為對(duì)照組.以上人員來(lái)自石家莊市或相鄰市、縣,均為漢族,無(wú)血緣關(guān)系.信息由2名專(zhuān)業(yè)人員詢(xún)問(wèn)并記錄.病例組患者的年齡、性別、吸煙狀態(tài)、家族史、病理類(lèi)型及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況來(lái)自住院病歷.以往或目前日吸煙5支以上并持續(xù)2a以上者被定義為吸煙個(gè)體;家族中有1名以上一級(jí)親屬和/或2名以上二級(jí)親屬患者屬患食管癌、賁門(mén)癌或胃癌者被定義為上消化道腫瘤(uppergastrointestinalcancers,UGIC)家族史陽(yáng)性.1.2方法抽取外周靜脈血5mL,經(jīng)枸櫞酸鈉抗凝,于4℃冰箱保存,并于采血后1wk內(nèi)提取外周血白細(xì)胞DNA.p21,p27基因型檢測(cè)采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)片斷長(zhǎng)度分析和PCR限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restrictionfragmentlengthpolymorphismanalysis,RFLP)PCRRFLP方法進(jìn)行.p21SNP擴(kuò)增引物5GAATTTGCCGTTGGGTCAAG3(上游引物)和5AGGAGAACACGGGATGAGGAG3(下游引物).3UTR發(fā)生一個(gè)CT的替代,從而產(chǎn)生一個(gè)PstⅠ限制性酶切位點(diǎn),T等位基因存在該識(shí)別位點(diǎn).p27SNP擴(kuò)增引物為5TGCAGACCCGGGAGAAAG3(上游引物)和5CCGCTAACCCCGTCTGG3(下游引物),第109密碼子發(fā)生一個(gè)TG的替代,從而產(chǎn)生一個(gè)BlgⅠ限制性酶切位點(diǎn),G等位基因存在該識(shí)別位點(diǎn).PCR反應(yīng)體系均為25L,其中模板DNA100ng,10PCR緩沖液2.5L,TaqDNA聚合酶(北京博大泰克生物基因技術(shù)有限責(zé)任公司)2.5U,MgCl21.5mmol/L,dNTPs0.2mmol/L,上、下游引物各0.2mol/L.p21PCR反應(yīng)條件為:
94℃預(yù)變性5min,94℃30s,64.8℃30s,72℃60s,共35個(gè)循環(huán)后,72℃延伸5min.p27PCR反應(yīng)條件為:
94℃預(yù)變性5min,94℃30s,58℃30s,72℃60s,共35個(gè)循環(huán)后,72℃延伸5min.取8LPCR產(chǎn)物進(jìn)行限制性?xún)?nèi)切酶消化,經(jīng)30g/L瓊脂糖凝膠電泳分析基因型.對(duì)p21,p27基因的PCR產(chǎn)物,分別經(jīng)限制性?xún)?nèi)切酶PstI和BlgI37℃過(guò)夜消化.每一批PCR反應(yīng)均以蒸餾水替代DNA作為陰性對(duì)照.100g/LDNA標(biāo)本進(jìn)行二次分型以證實(shí)分型方法的可靠性.統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:
采用SPSS12.0軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,基因型頻率觀(guān)察值和預(yù)期值采用HardyWeinberg平衡檢驗(yàn),病例組與對(duì)照組的基因型和等位基因型分布比較均采用2檢驗(yàn).以非條件Logistic回歸法計(jì)算經(jīng)性別和年齡校正的比值比(oddsratio,OR)及其95%的可信區(qū)間(confidenceinterval,CI).Plt;0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.2結(jié)果2.1患者一般特征ESCC組與對(duì)照組間的性別、年齡構(gòu)成比差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.吸煙者比例ESCC組與對(duì)照組相比差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=0.01,P=0.98).ESCC患者中UGIG家族史陽(yáng)性者比例(26.2%)顯著高于對(duì)照組(4.1%)(2=20.49,P=0.000).經(jīng)性別和年齡校正的OR值及其95%的CI為8.475(95%,CI=2.85~25).有臨床資料185例ESCC患者中,有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移87例,無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移98例,沒(méi)有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的病例.PCRRFLP檢測(cè)結(jié)果顯示,ESCC組與對(duì)照組p21,p27基因的多態(tài)性基因型與原始結(jié)果100%吻合.2.2p21,p27基因SNPs分布p21基因T/T基因型產(chǎn)物為133和735bp2個(gè)片段;C/C基因型產(chǎn)物為133,256和479bp3個(gè)片段;C/T基因型產(chǎn)物為133,256,479和735bp4個(gè)片段(圖1).p27基因T/T基因型產(chǎn)物為76和378bp2個(gè)片段;G/G基因型產(chǎn)物為76,113和265bp3個(gè)片段;T/C基因型產(chǎn)物為76,113,265和378bp4個(gè)片段(圖2).p21的T,C等位基因頻率和T/T,C/T,C/C基因型頻率在ESCC組和對(duì)照組之間差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Pgt;0.05,表1).吸煙狀況分層分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),p21的T/T基因型頻率ESCC吸煙組(26.0%)顯著高于健康吸煙組(12.0%)(2=8.60,P=0.014).經(jīng)性別和年齡校正的OR值及其95%的CI為3.36(95%,CI=1.45~7.75),而在非吸煙的患者和健康個(gè)體中,p21基因型及等位基因型頻率差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.p27等位基因型及基因型SNPs分布在ESCC組和對(duì)照組之間均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異.吸煙狀況分層分析p27等位基因型及基因型SNPs分布在ESCC組和對(duì)照組之間均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(表2).2.3p21,p27基因SNPs分布與ESCC淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)系有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組p21的T/T基因型頻率(26.4%)顯著高于無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組(15.3%)(2=6.128,P=0.013).經(jīng)性別、年齡校正的OR值及其95%的CI為3.11(95%,CI=1.28~7.52).淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀況分層分析結(jié)果顯示,p27等位基因型及基因型SNPs分布在ESCC組與對(duì)照組之間差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(表3).表1p21,p27基因SNPs分布表2p21,p27基因SNPs分布與吸煙的分層分析表3p21,p27基因SNPs與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)系3討論p21和p27基因能誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻滯,被認(rèn)為是腫瘤抑制基因,其多態(tài)性及蛋白表達(dá)與多種腫瘤的易感性及預(yù)后有關(guān)[5-6].本研究結(jié)果顯示,病例總體分析并未發(fā)現(xiàn)p21基因3UTR第20堿基對(duì)的多態(tài)性與ESCC的易感性相關(guān).然而,對(duì)吸煙狀況的分層分析發(fā)現(xiàn),與CC基因型相比,攜帶TT基因型可使吸煙人群ESCC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加3倍.而在非吸煙的患者和健康個(gè)體中,p21的基因型及等位基因型頻率均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,這說(shuō)明TT基因型可增加吸煙者患ESCC的風(fēng)險(xiǎn),表明TT基因型的過(guò)量表達(dá)可能與吸煙所誘導(dǎo)的代謝改變相互作用,從而影響ESCC的易感性.周?chē)?rùn)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是影響UGIC患者預(yù)后和生存率的重要因素.因此,找到分子生物學(xué)指標(biāo)來(lái)預(yù)測(cè)腫瘤浸潤(rùn)和轉(zhuǎn)移,從而制定個(gè)體化的治療方案具有重要價(jià)值.通過(guò)對(duì)ESCC患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況分層后發(fā)現(xiàn)與CC基因型相比,攜帶TT基因型可使ESCC患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的危險(xiǎn)性增高3倍,攜帶TT+T/C基因型可使ESCC患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的危險(xiǎn)性增高近2倍,這表明攜帶TT或TT+T/C基因型的ESCC患者更容易發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,提示攜帶該基因型的ESCC患者在臨床治療時(shí)應(yīng)盡可能進(jìn)行淋巴結(jié)清掃,并進(jìn)行相應(yīng)的術(shù)后綜合治療,以減少淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶的殘留.綜上所述,p27基因V109G多態(tài)性與食管癌的易感性無(wú)相關(guān)關(guān)系,經(jīng)吸煙狀況、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移分層分析也未顯示出差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.p27基因在腫瘤細(xì)胞中很少有突變和甲基化[7],且其功能的改變是轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),因此對(duì)于其基因多態(tài)性與腫瘤易感性的相關(guān)性研究的價(jià)值可能會(huì)減少.【參考文獻(xiàn)】[1]GomesCC,DrummondSN,GuimaraesAL,etal.p21/WAF1andcyclinD1variantsandoralsquamouscellcarcinoma[J].JOralPatholMed,2008,37(3):151-156.[2]IzawaH,YamamotoH,DamdinsurenB,etal.Effectsofp21cip1/waf1overexpressionongrowth,apoptosisanddifferentiationinhumancoloncarcinomacells[J].IntJOncol,2005,27(1):69-76.[3]LiG,SturgisEM,WangLE,etal.AssociationbetweentheV109Gpolymorphismofthep27geneandtheriskandprogressionoforalsquamouscellcarcinoma[J].ClinCancerRes,2004,10(12):3996
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