LightCycler480熒光定量PCR儀操作規(guī)程_第1頁
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文檔簡介

LightCycler480熒光定量PCR儀操作規(guī)程

1.開機前請注意確保室溫在15-32℃,每次反應(yīng)最后一步都建議做降溫,降至37度維持

10秒(請不要更改默認(rèn)的升降溫速率),維持至少30秒。

2.為保持實驗穩(wěn)定,在系統(tǒng)運行過程中,尤其是HRM熔解曲線信號采集時請不要在連接

儀器的計算機上進(jìn)行其他操作或同時打開超過10個實驗文件進(jìn)行分析;HRM的實驗采集

數(shù)據(jù)點每。C不要超過25個,溫度區(qū)間不要超過22℃。

3.請選用與羅氏原裝耗材高度一致的96孔板或8聯(lián)管(lOOul白色/透明矮管),在操作過

程中,切忌戴有粉末的乳膠手套或裸手接觸光學(xué)透性封板膜或8聯(lián)管蓋。

4.先開電腦和儀器,編輯程序后,再配制反應(yīng)液,不能使用預(yù)混ROX參比染料的

SYBRmix試劑,加樣封膜完畢后在板式離心機中1500xg(3000rpm)離心兩分鐘,排

除氣泡。

5.打開儀器后方的電源開關(guān),儀器自動進(jìn)行自檢,儀器正面兩盞燈呈桔黃色閃爍。打開

電腦,進(jìn)入系統(tǒng),雙擊LightCycler480軟件圖標(biāo),輸入軟件用戶名admin,密碼

MasterOlo如需安裝軟件則切換到LCinstall賬號,密碼Aal23456。儀器自檢完畢左邊

的燈變綠,右邊的燈仍為桔黃色。這時按擊燈右邊雙箭頭的開關(guān),儀器的載板器會自動

伸出,將準(zhǔn)備好的反應(yīng)板放入載板器中(反應(yīng)板的缺角在右下角)。再按一下帶雙箭頭

的開關(guān),儀器的載板器會自動縮入儀器內(nèi),此時儀器能自動檢測到反應(yīng)板,原來呈桔黃

色的燈會變綠,軟件中StartRun按鈕也同時變?yōu)榧せ顮顟B(tài)(儀器不能空機運行,也不能

只放適配器)。

6.設(shè)定完實驗程序并編輯完樣本后(樣本信息可以在實驗完成后編輯),點擊軟件中

StartRun按鈕,保存實驗文件到數(shù)據(jù)庫指定文件夾中后運行實驗。點擊EndProgram

將進(jìn)入下一個程序可以正常分析,點擊AbortRun將終止實驗而且數(shù)據(jù)不能分析。

7.軟件界面上出現(xiàn)RunComplete….標(biāo)識時?,說明實驗運行完畢,按儀器正面灰色按

鈕,使載板器伸出,取下反應(yīng)板,再按按鈕,使載板器縮回,關(guān)閉LightCycler480儀器

后方的電源開關(guān),在電腦上分析實驗數(shù)據(jù)。

8.分析完實驗數(shù)據(jù)后保存結(jié)果,打印報告,并關(guān)閉電腦及總電源,拷貝數(shù)據(jù)時建議用光

盤或格式化的U盤,實驗人員在離開PCR擴增區(qū)時帶走用完的反應(yīng)板。

維護SOP

LightCycler480是一臺免維護的儀器。做任何維護工作前,須確認(rèn)主機電源已被關(guān)閉。

預(yù)防性維護:

1.檢查LightCycler480主機兩側(cè)與背后空間,確保無任何阻礙空氣流通的物品,包

括書本、紙張或窗簾等;

2.若主機表面和桌面有灰塵,用不起毛的軟布蘸少量清水擦拭干凈。

清潔性維護:

若有需要,可用性質(zhì)溫和的商品化清潔劑或70%的乙醇溶液對LightCycler48()主機表

面、熱循環(huán)96孔模塊和熱蓋進(jìn)行清潔。

清潔96孔熱循環(huán)模塊:

L用移液器移取125m70-75%乙醇溶液或異丙醇至所有孔內(nèi);

2.15分鐘后,使用移液器對孔內(nèi)溶液進(jìn)行多次吹洗;

3.移除孔內(nèi)的液體,并使96孔模塊孔內(nèi)自然風(fēng)干;注意操作時不要讓清洗液腐蝕熱循環(huán)

模塊的涂層。

售后服務(wù):

故障報修或?qū)浖氖褂霉δ芑蛘呦嚓P(guān)參數(shù)設(shè)置有任何問題,請座機致電800-820-

8864或者手機400-820-8864o

LightCycler480Software1.5軟件操作(中文版)

第一部分基本界面及圖標(biāo)

Overview界面

Exit:關(guān)閉LC480軟件

Logoff:從目前使用的數(shù)據(jù)庫中退出并可登陸其他的數(shù)據(jù)庫

@Overview:點擊該圖標(biāo)進(jìn)入"Overview”界面

Navigator:點擊該圖標(biāo)進(jìn)入“Navigator”界面,可進(jìn)行數(shù)據(jù)的導(dǎo)入導(dǎo)出等操作,

1161Save:點擊該圖標(biāo)進(jìn)行保存

⑧Export:導(dǎo)出當(dāng)前打開的文件

Close:關(guān)閉當(dāng)前打開的文件

/Print:打印當(dāng)前打開的窗口

Tools:打開“Took”界面,可進(jìn)行密碼修改,建立和編輯用戶,系統(tǒng)設(shè)置,查看數(shù)

@據(jù)庫狀態(tài)、儀器狀態(tài)、濾光片組合等操作

Help:查看軟件版本,操作說明書等

二、NewExperiment界面

■LightCyclcr?480Softrarcrelease1.5.0

InstrumentVirtualLightCycler48096SystemI/NotConnectedDatabase:MyComputer(Traceable)

Window:|NevzExperiment3User:SystemAdmin

RunProtocolDataRunNotes

Fxperi-

ment

DetectionFormat|SYBRGreenI/HIJCcustomize^BlockSizePlateID|ReactionVolume|203ffBl

ColorCompID|LotNo|TestID|

.ProgramsS

.ProgramNameAnalysisMode

0⑥Program?

0

ReportX?

TemperatureTargets

⑥TargetfQAcquisitionModeHold(hh:mm:ss)RampRate「Acquisitions(perSecTargetStepSizefStepDelay

CMCQ(cyc?e^?

一[95:Nor-2?00:00:01:q.4::o:0"IJ"

3⑧

@

0

1

Experi-

mentRunModule:編輯、運行或查看PCR程序及查看PCR實時數(shù)據(jù)

Subset

EditorSubsetEditor:點擊該模塊后可進(jìn)行子集的編輯

ile

SampleEditor:點擊后進(jìn)行樣品信息的編輯

AnalysisModule:點擊進(jìn)行結(jié)果分析或查看已保存的分析結(jié)果

K6bou

ReportModule:選擇需要的內(nèi)容以報告的形式給出結(jié)果

SummaryModule:查看實驗的總體概況,包括實驗名稱,所用的程序,檢測模

式,濾光片組合等。概況的內(nèi)容由系統(tǒng)自動生成

三、Navigator界面

?LightCycler?480Softwarerelense1.5.0

Instrument:VinualLightCycier48096SystemI/NotConnectedDatabase:MyComputer(Traceable)

(RQCQ

Window:|Navigator□User:SystemAdmin

ExpenmerttnemeDemoAbsQuonlwithSYBRGieiA

NavigatorQuery

Createdcn2007-10188:38:15

-工JRootC<e<Xodby.SystemAdamn?l

*_?JAdhirutrabonLa?tnxxiitedon:200813115:34:43

LastmodifBdbySystemAdmin

?_Jhp

SoitwareveuonHTC13

-_|RocheReviaonhgtotyccmpJeteNo

三_|Expaments

|OemoAbsQuantwth$YBRGroen”RsSlattedat2005-6-911:24:49andcomplelet

G)DanoDualCokxHydrdyz訟PiobesInrtiumecinsmePilot-510

ImliumetiIDHTC_510

循DemoEndt>oniGenotypngPCR-Rcad

Oprr.iloiDemo

QDemoEndpantGenotypingPost-ReadNotesDetectionFWIMI:SYBRGieenI

公DemoGeneScamrgAbsoluteQuantificationwith*tand<wddilutionsn

QDemoMeltCurveGenotypngMcllmgCutveAnalysistodutmguixhspecificpt<

口DeonReiQuantDudCcioi

Progsam?

QDemoRdQuartMonoCola

I:Preincubation1CJFCteJt)None

傘DemoTmCaftngwithHybProbeProbes2'Amplification45cycle㈤Quanl

IMacro*?.MeltingCmve1cj.cle(.|Meltir

4Cooling1eyeleft)None

IPreferencesE]

?+-._jSpecialDaUBlocklype384wells

*_JTemplate?

-_|SystemAdmnDetectionCarnal:

?_UExper?nenlxNameSYBRGreen

IrtograbontmemodeManual

IMacro?01

:+!_|PreferencesFrtetcombrahons:

?_JSpecialDataAcirveName

圖_JTemplatesYetSYBRGieen(483533)

Analysemodiiec

1AbtQuanl/2ndDerivativeMax(oftype"Abt(

GeHedcc20079-2614.52:45

CrMtedSysteMAdmin

Results

I黑:霜]|Imp?!盵[Export[〔BatchImport](BatchExp

NewNewFolderOpenRenameDelete

(1)Navigator:保存的實驗數(shù)據(jù)和模板

L溫港]Problemreporting:儀器出現(xiàn)故障時生成一^t*問題報告

I]Import:導(dǎo)入一個文件

[志。"]Export:導(dǎo)出一個文件

Ji"。"〕BatchImport:導(dǎo)入一批數(shù)據(jù)

I?…。"IBatchExport:導(dǎo)出一批數(shù)據(jù)

「嬴】New:新建一個實驗或文件夾

NewFolder:新建一個文件夾

則」Open:打開一個文件

Rename:重命名

Delete:刪除選中的目標(biāo)

'Copy:拷貝選中的目標(biāo)

(2)Queny:設(shè)定條件進(jìn)行數(shù)據(jù)搜索和篩選

Note:所有上述圖標(biāo)在深藍(lán)色時為激活狀態(tài),灰色時為滅活狀態(tài)也就是不可用狀態(tài)。

各圖標(biāo)的功能在不同狀態(tài)下以顏色來區(qū)分是否具備。

軟件操作

一.打開軟件

打開電腦,Windows操作系統(tǒng)的用戶名為operator,密碼為LC480(區(qū)分大小

寫)。電腦操作系統(tǒng)啟動完畢,檢查電腦右下角是否有令圖標(biāo)。如果沒有,點擊桌面

“Exor4forXDMS_R”快捷方式文件。然后右鍵點擊它圖標(biāo),左鍵點擊“Show”,如最后一

句話顯示“Exor4serverisrunning”表示數(shù)據(jù)庫加載成功。如果顯示“Exor4failedtostart”則

表示數(shù)據(jù)庫沒有加載上,關(guān)閉該窗口,右鍵點擊e圖標(biāo),選“Shutdown",退出數(shù)據(jù)庫,

重新雙擊桌面“Exor4forXDMS_T”文件,加載數(shù)據(jù)庫。

然后點擊桌面“LightCycler480Software”快捷方式文件,運行該軟件。

輸入用戶名和密碼。用戶名默認(rèn)為admin(管理者權(quán)限),密碼為LightCycler480(區(qū)分

大小寫),如用戶已經(jīng)建立新用戶名,則可以按照新用戶名登錄。

二.用戶管理

為了實驗結(jié)果的有效管理,可以建立不同級別的用戶。如:標(biāo)準(zhǔn)用戶(Standard

User)、專業(yè)用戶(ExpertUser)、管理者(LocalAdministrator)。一般實驗室建議建

立專業(yè)用戶(ExpertUser)用戶名,然后以該用戶名登錄軟件進(jìn)行實驗操作。

建立新用戶操作:打開LightCycler480操作軟件,點擊右側(cè)[割按鈕打開“Tools”工

具欄,選擇“UserAccess/UsersandGroups”選項。在右邊窗口中點擊“NewUser”鍵,在右

邊“Entertheuser'sfullname”一欄中填寫用戶的全名,在“Enterthenametheuserwantsto

loginas”一欄填寫用戶登錄名,在“Entertheuser'spassword”一欄中輸入密碼(密碼須含

有6個以上字母,1個以上數(shù)字,其中有至少一個字母大寫),在“Confirmthepassword”

一欄中重新輸入一次密碼,加以確認(rèn),在“Selecttheuser'srole”一欄中選擇用戶級別,然

后點擊右下方“Close”按鈕加以確認(rèn)。

在國I“Tools”工具欄中的“SystemSettings”界面中可以設(shè)置各用戶級的權(quán)限,以及

密碼的時效。

新建檢測通道:在底卜Tools”工具欄中的“DetectionFormats”界面中,點擊“New”,

命名檢測通道名稱,根據(jù)實際檢測的熒光探針在界面右上角的filtercombination

selection,勾選每個探針?biāo)鶎?yīng)的激發(fā)光波長(Excitation)和檢測波長(Emission);在

右下角的list中Name欄目編輯每個通道對應(yīng)的探針名稱,并將每個探針的QuantFactor

設(shè)置為10,Maxintegrationtime改為2即可。

三.儀器自檢

每次開機時,儀器會自動進(jìn)行初始化自檢程序。自檢通過,儀器左側(cè)指示燈變綠。

如放置了樣本,儀器右側(cè)指示燈變綠。在自檢時,不能放置反應(yīng)板,否則自檢無法通

過,如果儀器有配置八連管適配器,則應(yīng)注意該適配器日常不用時不能放入儀器中。

四.建立實驗程序

打開LightCycler480操作軟件,成功登錄后點擊■一一二一瓶____J按鈕,進(jìn)

入NewExperiment/RunProtocol程序設(shè)置界面。在“DetectionFormat”一欄中選擇所使用

的熒光檢測技術(shù),可選擇各類探針和染料,如常見的SYBRGreenl染料、MonoColor

HydrolysisProbe單色TaqMan水解探針、MultiColorHydrolysisProbe多色TaqMan水解

-Setup------------------------------------------------------------------------------

探針DetectionFormat[MultiColorHydrolysisProbt▼[

在進(jìn)行多色熒光PCR實驗時,須點擊回E遺按鈕選擇用戶所采用的熒光檢測通道,

點擊確認(rèn)。

DetectionFormats

Dele島onFormatMultiColorHydrolysisProbe

-IntegrationTimeMode------------------------------------

t*Dynamic「Manual

o⑧

在ReactionVolume忸過一欄中填寫反應(yīng)體積。

在“Programs”界面中設(shè)置實驗程序:在“ProgramName”下方命名程序,“Cycles”一欄

內(nèi)填寫該程序的循環(huán)數(shù),在“AnalysisMode”一欄選擇該程序的分析模式。定量分析選擇

“Quantification”,溶解曲線分析選擇“MeltingCurves”,顏色補償實驗選擇“Color

Compensation”。

而后在“TemperatureTargets”界面內(nèi)設(shè)置所指定程序的內(nèi)容,在“Target(℃)”處填寫目

標(biāo)溫度,“AcquisitionMode”處選擇信號采集方式,“HokT一欄填寫該溫度所持續(xù)的時

間,“RampRate(℃/s)”處填寫升降溫速率。如一個程序有多個步驟,則在Temperature

Targets界面的左側(cè)處點擊⑥,增加步驟;也可點擊上下箭頭£)(3調(diào)整各步驟的先后

順序。如一個實驗中有多個程序,也可在“Programs”界面左側(cè)點L[十I,增加程序,也可

點擊上下箭頭調(diào)整各程序的先后順序。

實驗程度設(shè)置完成后,在下方“Overview”界面內(nèi)會自動生成溫度隨時間變化的溫控

曲線,以及估計的運行時間,綠色點表示采集熒光信號的溫度和時間點,可以依照該圖

檢查一下程度設(shè)置是否正確。

|crIlghtCvder2480So內(nèi)二

Instrument:VirtualLightCycler48096SystemI■'NotConnectedDatabase:MyComputer(Research)

<1toche>

Window:|NewExperimentUser:SystemAdmin

IExperlRunProtocolDataRunNotme

DetectionFormat(MultiColorHydrolysisPCustomBlockSizePlateID|ReactionVolume

ColorCompID|LotNo「?TestID「H

Programs

ProgramNameCyclesAnalystsMode

pre-denatureiNone

AmplificationQuant1tication

HelclngCurveBeltingCurves

BlMCoolm9(None

0

AmplificationTemperatureTargets

TargetfQAcquisitionModi:Hold(hh:mm:ss)RampRatefAcquisitions(per"SecTargetfStepSizofStepDelay

⑥qQQ(cycles)

aai-

Al

設(shè)置好的實驗程序可以保存成模板文件,下次使用同樣的實驗程序時可以調(diào)用。具

I!....Apply....iO

.Template_I

SaveAs~

體操作如下:點擊工嬴PXJ按鈕右側(cè)的下拉箭頭,選中"SaveAsTemplate”選項,系統(tǒng)

默認(rèn)將實驗程序模板文件保存在所登錄的用戶名下“Templates”目錄中,用戶可將其存放

在其下的子目錄“RunTemplates”下,填寫該程序模板文件的名稱,點擊T”按鈕即完成保

存。調(diào)用模板程序時可點擊“ApplyTemplate”按鈕,從目錄樹中選定所要調(diào)用的模板,點

擊按鈕確認(rèn)。

五.樣本設(shè)置

1、樣本亞組編輯:LightCycler480軟件擁有一個獨特的樣本編輯管理功能——亞

組編輯(SubsetEditor),即將反應(yīng)板上所有的樣本根據(jù)用戶需要分成亞組,對亞組進(jìn)行

獨立地分析定量。具體操作如下:

在“NewExperiment”界面中,點擊左側(cè)的?巡J按鈕,進(jìn)入Subset設(shè)置界面,點擊⑥

按鈕新建亞組,并給其命名。點擊國按鈕可復(fù)制所選定的亞組,點擊叵司按鈕可更改

所選定亞組的名稱,點擊“Delete”按鈕可刪除所選定的亞組。設(shè)置亞組:在Subsets界面

中選定要設(shè)置的亞組名,在右邊反應(yīng)板孔位處選定該亞組所包含的孔位,使所選定的孔

位中都出現(xiàn)深藍(lán)色凹陷的序,點擊下方的?"3按鈕加以確認(rèn)。

InctrumeotVirtualLightCycier4809&SystemI>'No<ConnedodDatabase:MyComputer(Research)

Window:|N?wExp?dmn?TMsecSyMemAdmin

H

S

IS3I

設(shè)置亞組可以在一塊反應(yīng)板上實現(xiàn)多個檢測項目的實驗,前提是這些檢測項目的實

驗運行程序都一致(這在使用T叫Man水解探針時比較容易實現(xiàn)),由于各檢測項目均

有各自的質(zhì)控對照,因而,設(shè)定亞組可以單獨對各檢測項目進(jìn)行分析。

2.樣本屬性編輯

點擊NewExperiment界面左側(cè)^司按鈕設(shè)置樣本信息。在“Workflow”一欄在選擇實

驗方案:AbsQuant:絕對定量或定性分析;ReiQuant:相對定量;Scanning:基因掃

描;ColorComp:顏色補償;Tm:熔解溫度檢測;MeltGeno:熔解曲線法基因分型;

EndptGeno:終點法基因分型。

-Step1:SelectWorkflow-------------------------------------------------------------

「AbsQuant「ReiQuant「Scanning「ColorComp

CTm('MeltGenoCEndptGeno

在SelectSainples/Subset選項中選定待編輯的樣本亞組:

-Step2:SelectSamples----------------

Subset:|HBVsamples二]

在界面右方編輯各樣本的名稱屬性等:

Pos:樣本在96孔板或384孔板上的位置;ReplOf:重復(fù)樣本設(shè)置;

SampleName:樣本名稱;QuantificationSampleType:定量樣本類型;Concentration:濃

度;TargetName:檢測類型。

-SelectFilterCombinations-------------AbsQuant-

Units[

F483-533廠558-610

PosColorReplOfSampleQuantificationConce

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