實體瘤分子殘留病灶檢測共識

【摘要】分子殘留病灶(molecularresidualdisease,MRD)也稱微小殘留分子殘留病灶(molecularresidualdisease,MRD)也稱微小殘留病灶(minimalresidualdisease)或可測量殘留病灶(measurableresidualdiseasRD狀態(tài)與實體瘤患者的復(fù)發(fā)風(fēng)險具有相關(guān)性，可用于實體瘤患者的預(yù)后評估和用人群，檢測技術(shù)方法、策略及時機(jī)選擇等問共識采用的推薦級別見表1。表1本共識采用的推薦級別及代表意義推薦級別代表意義2A類基于低級別臨床研究證據(jù)，專家意見高度一致；或基于高級別證據(jù)，專家意見基本一致2B類基于低級別臨床研究證據(jù)，專家意見基本一致MRD的概念起源于血液系統(tǒng)惡性腫瘤，最開始定義為白血病誘導(dǎo)化療完全緩解或者骨髓移植治療后，在體內(nèi)殘留少量白血病細(xì)胞的情況，即微小殘留病灶，用于預(yù)測復(fù)發(fā)風(fēng)險和指導(dǎo)后續(xù)治療。由于仍有10%~40%的初診白血病患者接受誘導(dǎo)治療后無法達(dá)到完全緩解，后續(xù)有學(xué)者提出用可測量殘留病灶的概念，意指初診或難治、復(fù)發(fā)狀態(tài)的白血病患者接受治療后，無論是否獲得完全緩解，體內(nèi)仍殘存白血病細(xì)胞的狀態(tài)。相對而言，微小殘留病灶是目前更為廣泛使用的概念，指血液系統(tǒng)腫瘤(白血病/淋巴瘤/骨髓瘤等)治療后疾病緩解狀態(tài)下，通過高靈敏度的檢測手段，如流式細(xì)胞術(shù)、定量聚合酶鏈反應(yīng)(polymerasechainreaction,PCR)、下一代測序(next-generationsequencing,NGS)等，從骨髓或外周血樣本中檢測出極微量的腫瘤細(xì)胞或腫瘤來源分子的情況[1-3]。MRD狀態(tài)已成為血液腫瘤療效評價標(biāo)準(zhǔn)之一，與患者疾病復(fù)發(fā)、預(yù)后分層顯著相關(guān)[1,在實體瘤中，MRD通常指分子殘留病灶，即通過循環(huán)腫瘤DNA(circulatingtumorDNA,ctDNA)等腫瘤來源的分子異常，發(fā)現(xiàn)影像學(xué)(包括正電子發(fā)射計進(jìn)展可能(2A類)。區(qū)分I~IV期(可切除肝轉(zhuǎn)移)結(jié)直腸癌患者術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險[5-7]。2022年《新蓋激素受體陽性、HER2陽性、三陰性等乳腺癌各個亞型[18-22]的研究一致策中的應(yīng)用價值[22]。此外，MRD檢測在肝癌[23-25]、胰腺癌[26-28]、食管癌[29]、胃~100%,陰性預(yù)測值范圍為80%~97%,在臨床應(yīng)用于預(yù)后分層以及治療決策時，應(yīng)結(jié)合傳統(tǒng)臨床病理因素等綜合判斷[31-32]。具有預(yù)后分層作用，臨床價值較明確(2A類);在胰腺癌、肝癌、食管癌、胃結(jié)直腸癌[5-7]、肺癌[9-15]、乳腺癌[17-22]等患者群體中，檢測術(shù)藥物的敏感性，中位無進(jìn)展生存時間為18.4個月[16]。此外，其他類型的晚-37]。目前，基于ctDNA的MRD檢測主要關(guān)注單核苷酸變異(singlenucleo上比單獨使用任一指標(biāo)更具優(yōu)勢[38]。GuardantRevealTM在檢測ctDNA突變MRD檢測[40]。盡管以上方法顯示了多組學(xué)整合在提高M(jìn)RD檢測性能方面的潛挑戰(zhàn)。因此，當(dāng)前實體瘤MRD的檢測內(nèi)容主要聚焦于ctDNA突變(表2)。表2實體瘤分子殘留病灶檢測方法及策略多重PCR和NGS多重PCR和NGS多重PCR和NGS多重PCR和NGS是，324基因panel否是，1021基因panel是，1021基因panel是，139基因panel是，769基因panel否突變(含拷貝數(shù)變異)法(2A類)。[42],這可能影響MRD檢測的靈敏度[33];同時，高深度測序數(shù)據(jù)量大、成推薦意見6:實體瘤MRD檢測按照是否進(jìn)行個性化探針設(shè)計分為群體定制和但每位患者可用的追蹤突變數(shù)量相對少；個性化定制每位患者追蹤的突變數(shù)量相對多，具有更高靈敏度。未來的臨床實踐中，可綜合評估后選擇群體定制、個性化定制或二者結(jié)合的方式(2B類)。和tumor-agnostic/naive分析。Tumor-informed分析通常參考患者原發(fā)或轉(zhuǎn)移灶腫瘤組織中檢測到的突變信息(腫瘤組織基線突變檢測),在腫瘤組織不RD分析[15]。群體定制和個性化定制都可以采用tumor-informed分析策略 d分析和tumor-agnostic/naive分析(n=151)進(jìn)一步證實了這一點[13]。度，優(yōu)先考慮采用tumor-informedvigor010中[44],對基于WES個性化定制的SignateraTM和基于大panel個選擇(2B類)。=162)能更精準(zhǔn)地預(yù)測復(fù)發(fā)風(fēng)險(風(fēng)險比分別為5.31和16.4)[13]。針對非的時間窗通常為根治性治療后4個月內(nèi)[12,14],而對于根治性放化療后進(jìn)行行MRD檢測[14]。在結(jié)直腸癌領(lǐng)域，研究表明術(shù)后4周內(nèi)游離DNA(cell-fr大[48]。因此，建議對術(shù)后4周內(nèi)MRD檢測結(jié)果為陰性的患瘤類型和臨床需求靈活調(diào)整。另外，多項針對肺癌[9-15]、腸癌[5-8]、cfDNA輸入量(包含來自腫瘤細(xì)胞的ctDNA以及來自正常細(xì)胞的cfDNA)、測序因此，群體定制panel測序深度一般在30000×以上[52]。個性化定制panel追蹤突變數(shù)量超過50個之后很難進(jìn)一步提升分析靈敏度[52]。因此在設(shè)計檢含有2條源自腫瘤的DNA分子[9,54]。在無影像學(xué)可見腫瘤的狀態(tài)下，患者限20mL計算，10mL血漿理論上含有10000~30000個單倍體基因組當(dāng)量(human01%~0.1%范圍內(nèi)[6,9]。這些患者M(jìn)RD檢出時間較臨床復(fù)發(fā)提前264d,而平取、文庫制備、上機(jī)測序)和“干實驗”(即生物信息學(xué)分析流程);分析后的的準(zhǔn)確性，從而提供可靠、具有臨床指導(dǎo)意義的MRD檢測推薦意見12:MRD檢測的質(zhì)控需包含NGS檢測常規(guī)質(zhì)控內(nèi)容，質(zhì)控中需重推薦意見13:實體瘤MRD檢測報告應(yīng)包含以下內(nèi)容：(1)受檢者的基本信息。(2)樣本信息。(3)實驗室信息。(4)檢測內(nèi)容：包括檢測范圍、檢測的患者，應(yīng)盡可能綜合展示歷次檢測結(jié)果便于臨床參考。(6)質(zhì)控結(jié)果：樣本質(zhì)量、核酸質(zhì)量、文庫質(zhì)量、測序質(zhì)量、測序深度等(2B類)。實體瘤MRD的預(yù)后分層價值已經(jīng)有較為充分的證據(jù)，臨床研究將進(jìn)一步明確實體瘤MRD檢測的臨床價值[30-31]。對于基于ctDNAment:roleofminimalresidualdiseaseinmultiplemyeloma[J].Blood,2015,125(20):3059-3068.DOI:10.1182/blood-2014-11-568907.[2]SchuurhuisGJ,HeuserM,FreemanS,etal.MinimaNetMRDWorkingParty[J].Blood,2018,131(12):1275-1291.DOI:10.1182/blood-2017-09-801498.asticleukemia:aMeta-analysis[J].JAMADOI:10.1001/jamaoncol.2017.0580.ngGroupconsensus 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