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文檔簡介
3個(gè)專病數(shù)據(jù)庫建設(shè)需求系統(tǒng)名稱功能模塊技術(shù)功能參數(shù)要求多模態(tài)專病數(shù)據(jù)集病種數(shù)據(jù)模型建設(shè)專業(yè)級(jí)的符合行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的多模態(tài)專病數(shù)據(jù)庫,需涵蓋肝臟專病、心血管專病、耳鼻喉專病。在全院數(shù)據(jù)庫基礎(chǔ)之外,要求每個(gè)專病庫結(jié)構(gòu)化字段數(shù)達(dá)到500+,自然語言結(jié)構(gòu)化召回率不低于95%,準(zhǔn)確率不低于95%。專病數(shù)據(jù)納排需支持根據(jù)臨床要求設(shè)計(jì)病種的定制化納排標(biāo)準(zhǔn),包括診斷、科室及患者ID標(biāo)準(zhǔn)等,納入符合各類專病的數(shù)據(jù)范圍。應(yīng)提供較完善的專病庫字段模板。專病文本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化需支持參考各類疾病指南、文獻(xiàn),并結(jié)合臨床專家經(jīng)驗(yàn)設(shè)計(jì)專病結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)模型,滿足臨床科研的數(shù)據(jù)應(yīng)用。多模態(tài)專病影像文件集成與治理1)根據(jù)多模態(tài)專病科研要求,需支持接入包括CT、X光、MR、超聲、核醫(yī)學(xué)等符合DICOM協(xié)議的多種影像模態(tài)數(shù)據(jù)。2)需支持批量獲取導(dǎo)入離線影像數(shù)據(jù);支持與醫(yī)院現(xiàn)有影像集成平臺(tái)或PACS系統(tǒng)進(jìn)行鏈接跳轉(zhuǎn);支持對接影像集成平臺(tái)或PACS系統(tǒng)獲取數(shù)據(jù)。3)需支持影像文件治理,基于采集的影像文件,通過去重、審核、文本關(guān)聯(lián)等數(shù)據(jù)處理方式進(jìn)行影像DICOM文件治理。4)需支持影像DICOM的設(shè)備信息、掃描信息、檢查信息等數(shù)據(jù)名稱標(biāo)準(zhǔn)化和值域標(biāo)準(zhǔn)化;支持對影像DICOM文件的標(biāo)準(zhǔn)TAG信息進(jìn)行提取和結(jié)構(gòu)化處理。5)需支持將影像AI結(jié)構(gòu)化處理引擎提取的高維結(jié)構(gòu)化信息與臨床文本數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)、整合,以支持影像及文本的統(tǒng)一應(yīng)用。專病數(shù)據(jù)庫設(shè)置完善需配合相關(guān)??聘鶕?jù)專病研究的需要對專病數(shù)據(jù)庫設(shè)置進(jìn)行完善。影像AI引擎構(gòu)建肝臟專病影像數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化(包括但不限于)1)需支持應(yīng)用影像AI引擎,實(shí)現(xiàn)對肝臟CT影像的智能分析。2)需支持自動(dòng)提供肝臟總體積、左右肝體積比、各肝段體積和CT值信息及所占比情況,自動(dòng)分析去除肝內(nèi)管道及病灶后體積變化情況。3)需支持自動(dòng)檢出肝臟占位性病灶,定位病灶所在的肝葉肝段,自動(dòng)提供病灶大小、體積、各期相的平均CT值等信息,并將病灶分為三類(囊性、囊實(shí)性、實(shí)性)。自動(dòng)提供病灶形態(tài)信息(類圓形、楔形、不規(guī)則型)以及病灶征象信息(壞死、出血、鈣化、假包膜)。4)需支持對肝囊腫、肝膿腫、局灶性結(jié)節(jié)樣增生、肝血管瘤、肝細(xì)胞癌、膽管細(xì)胞癌、肝轉(zhuǎn)移瘤等疾病的輔助鑒別,提供惡性風(fēng)險(xiǎn)值前2的病灶鑒別結(jié)果與對應(yīng)置信度。自動(dòng)生成各期相病灶密度分布圖,并提供影像組學(xué)特征信息,包括:CT最大值、最小值、平均值、CT值方差、CT值峰度、CT值偏度、最大層位置及面積、表面積、3D長徑、緊湊度、球形度、熵、能量等。5)需支持自動(dòng)分析脂肪肝含量,提供肝脾衰減比,自動(dòng)進(jìn)行肝硬化風(fēng)險(xiǎn)評估,提供尾狀葉-右葉比值、肝體積、肝平均密度、脾臟大小、門脈直徑參數(shù)。心臟專病影像數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化(包括但不限于)1)需支持應(yīng)用影像AI引擎,實(shí)現(xiàn)對心臟CTA影像的智能分析。2)需支持自動(dòng)分析冠脈優(yōu)勢型(左優(yōu)勢型、右優(yōu)勢型或均衡型),自動(dòng)檢出可疑斑塊,進(jìn)行可疑斑塊分類(鈣化、非鈣化、混合)以及狹窄類型分類(局限性、節(jié)段性、彌漫性),自動(dòng)給出管腔狹窄程度分級(jí)信息,包括未見狹窄、輕微狹窄、輕度狹窄、中度狹窄、重度狹窄、完全閉塞,并提供每個(gè)分段最狹窄處的狹窄率信息。3)需支持對心臟血管周圍組織的定量分析,包括血管周圍脂肪衰減指數(shù)(FAI)、血管壁外設(shè)置半徑區(qū)域內(nèi)脂肪體素總體積(FV)、體積血管周圍表征指數(shù)(VPCI)、血管壁內(nèi)所有纖維斑塊體素總體積的占比(FPI)、血管周圍水衰減指數(shù)平均值(PVWI)、血管壁內(nèi)所有鈣化體素總體積的占比(CI)。耳鼻喉專病影像數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化(包括但不限于)1)需支持應(yīng)用影像AI引擎,實(shí)現(xiàn)對耳部、咽喉部及鼻腔鼻竇的CT影像的智能分析。2)耳部影像需支持自動(dòng)提供包括外耳道、聽小骨、迷路、耳蝸、面神經(jīng)等結(jié)構(gòu)的高分辨率、層厚1-2mm的薄層掃描和CT值信息,同時(shí)支持包括多層重組(MPR)、曲面重組(CPR)、最大密度投影(MIP)、容積再現(xiàn)(VR)等CT圖像后處理技術(shù),需支持自動(dòng)鑒別慢性中耳炎、中耳膽脂瘤及耳部良惡性腫瘤;3)喉部CT需提供影像組學(xué)特征信息,包括:CT最大值、最小值、平均值、CT值方差、CT值峰度、CT值偏度、最大層位置及面積等,同時(shí)提供喉腔結(jié)構(gòu)的多平面重組、三維重建及仿真內(nèi)鏡技術(shù),基于上述技術(shù)支持對喉部惡性腫瘤的病變部位、范圍、向周圍侵犯情況及頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況進(jìn)行自動(dòng)分析判斷;4)鼻腔鼻竇CT需提供冠狀位圖像及軸位圖像,同時(shí)提供骨算法及軟組織算法兩種圖像重建方式,提供對鼻腔鼻竇的復(fù)雜的解剖結(jié)構(gòu)及周邊重要組織結(jié)構(gòu)如翼腭窩、顳下窩、顱底、眼眶等的高分辨率影像學(xué)信息,需支持自動(dòng)檢出鼻腔鼻竇良惡性病灶,自動(dòng)提供病灶大小、體積、各期相的平均CT值等信息。多模態(tài)數(shù)據(jù)檢索影像DICOM信息搜索1)需支持影像DICOM的設(shè)備信息、掃描信息、檢查信息、影像AI特征結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)等數(shù)據(jù)名稱標(biāo)準(zhǔn)化和值域標(biāo)準(zhǔn)化。2)需支持影像DICOM信息、影像AI特征結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)與臨床結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)、原文數(shù)據(jù)進(jìn)行邏輯組合篩選。圖文搜索結(jié)果展現(xiàn)1)搜索結(jié)果列表頁需支持展示影像視圖,展示信息包括患者的疾病信息、關(guān)鍵疾病信息以及對應(yīng)的歷次影像檢查信息,其中影像檢查信息支持展示影像縮略圖、檢查號(hào)等。2)用戶通過點(diǎn)擊搜索結(jié)果列表頁指定的影像檢查信息,可直接跳轉(zhuǎn)定位至該患者全景內(nèi)的該次影像檢查記錄。條件搜索1)需支持選用結(jié)構(gòu)化條件以及原文條件。支持從預(yù)設(shè)的結(jié)構(gòu)化選項(xiàng)中選擇條件進(jìn)行精準(zhǔn)檢索或者模糊檢索;支持對病歷原文使用關(guān)鍵詞進(jìn)行搜索,用于模糊匹配特定信息。2)需支持用戶將常用的檢索字段設(shè)置為“常用字段”。這些字段會(huì)再檢索字段選擇窗口進(jìn)行置頂,便于用戶快速訪問,從而提升使用效率和操作便捷性。3)需支持以條件樹形式進(jìn)行多級(jí)組合條件可視化篩選,組合條件之間支持“and\or”多層邏輯關(guān)系的嵌套組合。4)需支持篩選條件在“納入、排除”選項(xiàng)之間靈活切換。5)需支持根據(jù)搜索記過實(shí)時(shí)計(jì)算命中的患者數(shù),用戶可即刻感知搜索效果,根據(jù)需要及時(shí)調(diào)整篩選條件。事件-時(shí)間檢索1)需支持與條件篩選結(jié)合,進(jìn)行“事件-時(shí)間”式篩選。2)需支持設(shè)置包括末次、每次、第一次至第十次,精確定義前、后時(shí)間范圍。3)需支持靈活配置時(shí)間范圍內(nèi)多個(gè)限定條件及其之間的關(guān)系。4)需支持定義事件在時(shí)間范圍內(nèi)發(fā)生的次數(shù)。患者號(hào)精確搜索需支持使用患者號(hào)、就診號(hào)、住院號(hào)、門診號(hào)、病案號(hào)進(jìn)行批量精確搜索。靈感發(fā)現(xiàn)主題管理1)需支持新增、修改、復(fù)制、刪除靈感發(fā)現(xiàn)主題。2)需支持以指標(biāo)搜索和勾選方式,便捷設(shè)靈感發(fā)現(xiàn)的數(shù)據(jù)模塊,并可自定義設(shè)置指標(biāo)的值域。3)需支持根據(jù)選擇的數(shù)據(jù)指標(biāo)生成?;鶊D,以可視化的方式查看各指標(biāo)的數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)情況。搜索管理1)需支持桑基圖數(shù)據(jù)指標(biāo)一鍵自動(dòng)轉(zhuǎn)化為條件樹搜索內(nèi)容,便捷篩選符合條件的患者數(shù)據(jù)。2)需支持桑基圖數(shù)據(jù)指標(biāo)分級(jí)轉(zhuǎn)化條件樹搜索內(nèi)容?;仡櫺匀巳宏?duì)列科研項(xiàng)目研究隊(duì)列管理1)需支持以條件篩選和患者ID的搜索方式篩選符合入組的患者,并將搜索出的患者作為隊(duì)列保存進(jìn)項(xiàng)目。2)需支持查看和調(diào)整隊(duì)列對應(yīng)的篩選條件,根據(jù)修改的后篩選結(jié)果更新研究數(shù)據(jù),并提供增了更新和覆蓋更新兩種模式。研究變量設(shè)置與管理1)需支持創(chuàng)建和管理多個(gè)變量組。用戶可以從預(yù)設(shè)的結(jié)構(gòu)化選項(xiàng)中選擇變量作為變量組下的研究變量,并允許自定義變量組名稱。2)需支持設(shè)置研究變量的降維規(guī)則,如首次、第二次至第十次、末次、最近一次等。根據(jù)這些規(guī)則和設(shè)定的基線時(shí)間,系統(tǒng)將自動(dòng)從數(shù)據(jù)庫中抽取并填充數(shù)據(jù),并展示其填充率。3)需支持用戶自定義添加指標(biāo),可設(shè)置指標(biāo)的默認(rèn)規(guī)則,比如默認(rèn)值、備選值等。4)需支持研究指標(biāo)可視化點(diǎn)選拖拽排序,保存后指標(biāo)排序規(guī)則即可更新在數(shù)據(jù)列表中。數(shù)據(jù)修改與導(dǎo)入1)需支持在數(shù)據(jù)列表的可視化界面上進(jìn)行編輯,用戶可以修改或補(bǔ)錄患者數(shù)據(jù),確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和完整性。2)需支持按照系統(tǒng)模板批量導(dǎo)入線下數(shù)據(jù)至數(shù)據(jù)列表,兼容文件格式為Excel。系統(tǒng)將自動(dòng)進(jìn)行文件校驗(yàn),確保數(shù)據(jù)格式的準(zhǔn)確性。按統(tǒng)計(jì)模式導(dǎo)出需支持將用戶設(shè)置的研究變量抽取出的數(shù)據(jù)以一個(gè)患者一行的格式進(jìn)行導(dǎo)出。導(dǎo)出的數(shù)據(jù)與線上患者列表數(shù)據(jù)保持一致,確保所見即所得。此外,導(dǎo)出格式兼容SPSS等統(tǒng)計(jì)分析軟件的要求,滿足數(shù)據(jù)分析和處理的需求。按表單模式導(dǎo)出需支持按患者、就診、檢查等數(shù)據(jù)維度進(jìn)行表單導(dǎo)出。用戶可以選擇人口學(xué)信息、入院記錄、檢驗(yàn)報(bào)告等進(jìn)行全模塊導(dǎo)出或者選擇模塊下的具體字段進(jìn)行導(dǎo)出,可實(shí)現(xiàn)導(dǎo)出效果的在線預(yù)覽,導(dǎo)出結(jié)果以excel文件按照模塊區(qū)分形式進(jìn)行下載到本地。數(shù)據(jù)導(dǎo)出管理1)需支持?jǐn)?shù)據(jù)導(dǎo)出申請與審批,根據(jù)用戶的數(shù)據(jù)權(quán)限,普通科研用戶導(dǎo)出數(shù)據(jù)時(shí)需經(jīng)過線上審批,保證數(shù)據(jù)使用安全性,導(dǎo)出數(shù)據(jù)可進(jìn)行多次下載。2)需支持對患者編號(hào)、門診號(hào)、住院號(hào)、檢查號(hào)等編號(hào)進(jìn)行脫敏導(dǎo)出。前瞻性科研項(xiàng)目項(xiàng)目設(shè)置1)需支持對前瞻性項(xiàng)目的項(xiàng)目名稱、收集患者數(shù)量以及研究時(shí)長等進(jìn)行靈活設(shè)置。2)需支持上傳項(xiàng)目相關(guān)附件以便維護(hù)管理。3)對于多中心模式,需支持根據(jù)項(xiàng)目研究流程靈活切換數(shù)據(jù)審核機(jī)制,支持簡單審核或多角色審核;
①在簡單審核模式下,項(xiàng)目角色包括錄入員以及審核員,在錄入員完成錄入提交后由審核員審核確認(rèn);
②在多角色審核模式下,項(xiàng)目角色包括數(shù)據(jù)錄入員、數(shù)據(jù)審核員、數(shù)據(jù)管理員以及研究員,由數(shù)據(jù)錄入員錄入數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)審核員與數(shù)據(jù)管理員雙重審核后,再由研究員確認(rèn)進(jìn)行電子簽字。成員管理1)需支持添加多個(gè)醫(yī)療機(jī)構(gòu)實(shí)現(xiàn)機(jī)構(gòu)分類管理。2)需支持設(shè)置成員所屬中心機(jī)構(gòu),并根據(jù)數(shù)據(jù)審核模式設(shè)置包含系統(tǒng)管理員、數(shù)據(jù)審核員、數(shù)據(jù)錄入員、數(shù)據(jù)管理員、研究員等角色。3)對于多中心項(xiàng)目,需支持根據(jù)患者數(shù)據(jù)所屬中心進(jìn)行數(shù)據(jù)權(quán)限區(qū)分,例如A醫(yī)院的成員僅可瀏覽屬于A醫(yī)院的數(shù)據(jù)。CRF表單配置1)需支持自定義創(chuàng)建CRF表單,可靈活配置表單目錄以及表單名稱。并支持引用已有表單模板、復(fù)制已有表單結(jié)構(gòu),實(shí)現(xiàn)表單的快速創(chuàng)建。2)需支持CRF表單模版管理,支持用戶自定義表單保存為模板。3)需支持多種題目類型,包括單選題、多選題、填空題、日期題、文件題、矩陣題、自增題等。其中選擇類型題目可自定義設(shè)置選項(xiàng)、取值、必填項(xiàng)、默認(rèn)值、展示樣式等內(nèi)容,文本類型題目可支持小數(shù)、整數(shù)、短文本、長文本、單位、必填、默認(rèn)值等內(nèi)容限制;文件題支持圖片、音頻、視頻、word、excel、ppt、txt、pdf、zip、dicom等文件格式。4)需支持臨床數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)字典,可應(yīng)用字典所支持的數(shù)據(jù)字段快速完成表單配置,字典包括患者基本信息、病案首頁、入院記錄、病理記錄、手術(shù)記錄、病程記錄、出院記錄等模塊。5)需支持設(shè)置題目之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系,例如可實(shí)現(xiàn)當(dāng)性別取女的時(shí)候出現(xiàn)有無月經(jīng)史的字段。6)需支持以可視化拖拽的方式創(chuàng)建表單題目,支持題目間位置拖動(dòng)調(diào)整、題目控件復(fù)制、題目刪除等交互操作。7)需支持表單預(yù)覽,通過預(yù)覽功能可隨時(shí)查看表單配置效果。項(xiàng)目訪視配置需支持訪視內(nèi)容自定義配置,包括訪視名稱、訪視類型、訪視表單等,其中訪式類型支持自由訪視和一般訪視,可根據(jù)訪視需求靈活選擇。隨訪日程配置對于隨訪項(xiàng)目,訪視類型支持隨訪訪視。需支持等距隨訪與自定義隨訪兩種訪視計(jì)劃,從而靈活設(shè)定隨訪頻次。項(xiàng)目概覽需支持項(xiàng)目進(jìn)度看板,以數(shù)據(jù)可視化的方式查看入組患者情況、數(shù)據(jù)錄入情況等?;颊呒{排需支持將搜索出的患者入組到項(xiàng)目中,支持查看和調(diào)整隊(duì)列對應(yīng)的篩選條件。用戶可根據(jù)患者數(shù)據(jù)情況進(jìn)一步審核患者是否入組。患者列表對于已經(jīng)入組的患者需支持查看對應(yīng)患者數(shù)據(jù)列表。支持新增、刪除入組患者數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)錄入需支持進(jìn)行數(shù)據(jù)錄入,支持增加、刪除訪視,可自定義訪視名稱、選擇訪視菜單、添加訪視內(nèi)容。對于錄入的數(shù)據(jù)支持保存與提交。數(shù)據(jù)預(yù)填充需支持部分人口學(xué)信息模塊的研究指標(biāo)實(shí)現(xiàn)自動(dòng)預(yù)填寫,包括患者姓名、性別、出生日期、民族、職業(yè)等內(nèi)容,從而提升數(shù)據(jù)錄入效率。數(shù)據(jù)留痕需支持?jǐn)?shù)據(jù)留痕,包括字段修改留痕、字段質(zhì)疑痕跡、字段狀態(tài)留痕,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)錄入全程追蹤。隨訪日歷對于隨訪項(xiàng)目需支持根據(jù)患者入組時(shí)間自動(dòng)生成隨訪日程,并以日歷形式提供每日的隨訪工作安排,方便隨訪人員快速開展隨訪數(shù)據(jù)錄入工作。數(shù)據(jù)導(dǎo)出需支持?jǐn)?shù)據(jù)導(dǎo)出,可按照數(shù)據(jù)表單模塊自定義選擇需要導(dǎo)出的數(shù)據(jù)范圍,需支持以excel格式導(dǎo)出CRF表單數(shù)據(jù)。多模態(tài)數(shù)據(jù)科研數(shù)據(jù)標(biāo)注1)能夠進(jìn)行圖像數(shù)據(jù)線上和線下標(biāo)注,方便科研人員靈活處理標(biāo)注數(shù)據(jù)。2)需支持圖像數(shù)據(jù)自動(dòng)標(biāo)注、自動(dòng)選框標(biāo)注、點(diǎn)狀標(biāo)注、插值標(biāo)注功能、擴(kuò)展標(biāo)注功能,滿足各類標(biāo)注應(yīng)用場景。3)AI輔助標(biāo)注,需支持應(yīng)用AI算法實(shí)現(xiàn)對圖像病灶的自動(dòng)標(biāo)注,提高標(biāo)注效率。4)需具備通用醫(yī)療大模型的能力,支持采用通用醫(yī)療分割模型進(jìn)行交互式分割,支持點(diǎn)選、框選等模式,支持病灶分割、器官分割。5)需具備支持病理數(shù)據(jù)標(biāo)注的能力,包括細(xì)胞病理、組織病理、免疫組化中的上皮細(xì)胞、淋巴細(xì)胞、精母細(xì)胞、癌細(xì)胞分割等。6)需支持影像特征自動(dòng)提取,需支持超過2600種影像特征的批量計(jì)算及導(dǎo)出。機(jī)器學(xué)習(xí)1)需支持以可視化的操作方法進(jìn)行各類參數(shù)配置,包括配置因變量、配置組學(xué)特征濾波變換、配置組學(xué)特征類型、配置模型驗(yàn)證方法、特征清洗等能力。2)需支持LogisticRegression、SVM、LinearSVC、DecisionTree、RandomForest、AdaBoost、GradientBoosting、XGBoost、BernoulliNB、GaussianNB、KNearestNeighbors、LinearDiscriminantAnalysis、SGD、MultilayerPerceptron等14種及以上機(jī)器學(xué)習(xí)模型。3)需支持模型調(diào)參、全局超參搜索等能力。4)需支持自動(dòng)生成ROC曲線、PR曲線、決策曲線、校準(zhǔn)曲線、諾模圖等,方便實(shí)驗(yàn)結(jié)果可視化分析。5)需支持算法模型的外部驗(yàn)證,生成相關(guān)模型效果評價(jià)結(jié)果。深度學(xué)習(xí)1)需具備深度學(xué)習(xí)算法模型的能力,滿足深度學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)分析,支持整圖分類、病灶分類、病灶檢測、病灶分割四種深度學(xué)習(xí)場景。2、需支持多種數(shù)據(jù)增強(qiáng)方式,包括鏡像(Mirroring)、彈性變換(ElasticDeformations)、旋轉(zhuǎn)(Rotations)、縮放(Scaling)、重采樣(Resampling)、亮度(Brightness)、對比度(Contrast)、伽馬變換(Gamma)、高斯噪聲(GaussianNoise)、隨機(jī)裁剪(RandomCrop)、中央裁剪(CenterCrop)等12種及以上數(shù)據(jù)增強(qiáng)方式。3、需支持算法分類模型,包括Resnet、AlexNet、DenseNet、SqueezeNet、ResNext、Xceptio
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