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文檔簡(jiǎn)介
1、,組織dna提取,tissue dna extraction,實(shí)驗(yàn)?zāi)康氖菍W(xué)習(xí)從生物組織中提取dna,為研究dna的理化性質(zhì)和結(jié)構(gòu)功能打下基礎(chǔ)。dna提取的一般原則:確保一核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性。2其他生物大分子(如蛋白質(zhì)、多糖、脂肪分子)的污染必須最小化。3核酸樣品中不應(yīng)有抑制酶的有機(jī)溶劑和高濃度金屬離子。其他核酸分子,例如4 rna,也應(yīng)該盡量去除。、濃度情感,(a值為1時(shí)50g/ml雙鏈dna,40g/ml單鏈dna或rna,20g/ml單鏈寡聚核苷酸),各種堿的紫外線吸收光譜,2)適用于熒光分光光度法低濃度核酸溶液的定量分析。(1-5ng),eb和dna的結(jié)合,從500l全血中提取的基因組
2、dna電泳,從動(dòng)物組織中提取基因組dna,確認(rèn)純度,紫外線分光光度法:如果260nm和a260低于值,就可以知道制劑中仍有蛋白質(zhì)成分。高于此值表示存在rna剩馀量。純r(jià)na a260和a280的比率必須為2.0。a260/a280比是純度檢查的重要指標(biāo)。完整性確認(rèn)(integrity identification),凝膠電泳法:基因組dna電泳,在電場(chǎng)中游泳緩慢,分解發(fā)生的話,電泳也可能發(fā)生脫發(fā)現(xiàn)象??俽na電泳觀察每個(gè)帶的含量,告訴我們是否有rna降解。如果額外的槽有帶狀,則可能是dna污染。核酸的儲(chǔ)存dna保存,1)短期保存:4或-20保存在te(tris和edta)緩沖液中。te緩沖液的
3、ph與dna儲(chǔ)存有關(guān),ph為8可以減少dna脫氨反應(yīng),ph低于7.0時(shí)dna容易變性。2)長(zhǎng)期存儲(chǔ):te緩沖液中-存儲(chǔ)70年;在dna溶液中添加一滴氯仿可以有效地防止細(xì)菌和核酸的污染。每個(gè)組織的ml分解液組織菌機(jī),勻漿2.0ml均質(zhì),等體積苯酚-氯仿,搖勻5min,2,500rpm 10min,水?dāng)z取量,等體積氯仿-異丙醇,搖勻5min,2,500rpm如果a260nm/a280nm等于1.6,則表明有蛋白質(zhì)或苯酚污染,應(yīng)進(jìn)一步純化。定量,dna濃度(g/ml)=a260nm 50稀釋倍數(shù)1/光光*1od值等于50g/ml dsdna、40g/ml ssdna或rna,2og/ml升高核苷酸。
4、濃度計(jì)算,1 .分解液: 10 mmol/l ph 8.0 tris-hcl 1 mmol/l edta 0.1mol/l nacl 1% sds er聚合細(xì)胞中核蛋白降解;蛋白質(zhì)和復(fù)合物的形成,2 .酚-氯仿(phenol-chloroform):酚:強(qiáng)蛋白質(zhì)變性劑氯仿:蛋白質(zhì)變性劑,不與水互溶,可與酚相互溶解,拿走剩下的酚。,為什么苯酚要嚴(yán)重飽和才能用于dna分離?苯酚在空氣中經(jīng)常氧化,形成自由基,可直接用于dna分離,磷酸二酯鍵斷裂,dna分解。要氧化苯酚,必須在高溫下再蒸,去除氧化物,用tris-hcl飽和苯酚中性調(diào)節(jié)。3 .氯仿-異丙醇:降低分子表面張力,減少萃取過(guò)程中泡沫的生成,異
5、丙醇幫助分相,保持離心后的上層水、中間層改性蛋白質(zhì)、下層有機(jī)溶劑穩(wěn)定。4。冰無(wú)水乙醇(absolute ethonal)和70%乙醇(70% ethonal):無(wú)水乙醇奪走dna周圍的水分子,使dna失去水分,容易聚合??梢匀コ龤埩粑锏穆确?。70%乙醇洗滌去除殘留的鹽離子,鹽離子的存在不容易溶解,抑制酶反應(yīng)。5 .te緩沖(te buffer):10 mmol/l ph 8.0 tris-hcl 1 mmol/l edta緩沖不會(huì)對(duì)tris-hcl產(chǎn)生金屬離子干擾,從而使edta穩(wěn)定dna的激活。6.20%十二烷基磺酸鈉(sds):抑制dnase活性,7.10mg/ml蛋白酶k(protase
6、 k):蛋白質(zhì)分解,細(xì)胞膜破壞8.10mg/mlrna酶(rnase)dna釋放不完全。離心力的小方面分離不完全。dna降解的原因樣本不新鮮。采集物質(zhì)在舊樣品本身有大量dna酶提取dna的生物活性的原因嗎?提取的基因組dna鹽濃度過(guò)高的基因組dna中乙醇沒(méi)有清除的純基因組dna中,可能有其他抑制因素提取基因組dna,有時(shí)因?yàn)樘砑诱崽堑脑蛱砑佣嗵潜Wo(hù)dna長(zhǎng)度,注意事項(xiàng),1。處死動(dòng)物后,要取出使用的器官,盡快放入液氮中,以免dnase引起dna分解。在純化過(guò)程中,應(yīng)加入核酸酶抑制劑(eg.edta),防止dna自身分解。2.組織要盡量磨細(xì)。顆粒太大,細(xì)胞不能完全分解,隨后dna會(huì)嚴(yán)重分解。3 .真核細(xì)胞dna分子量很大,機(jī)械張力容易引起dna分子
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