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文檔簡介
1、第二章 DNA與遺傳信息傳遞,DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),堿基 - 核苷 - 核苷酸,堿基 / DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),三聯(lián)密碼子(Triplet Condon),DNA半保留復制,分子雜交,DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)與轉(zhuǎn)錄因子,DNA序列的類型,基因 (Gene ) vs. 非基因 (Non-gene )序列 編碼 (Coding) vs.非編碼 (Non-coding)序列 單一 (Unique) vs.重復 (Repetitive) 序列,基因 vs. 非基因序列,基因序列 基因組中決定蛋白質(zhì)的DNA序列 ATG至終止密碼 可讀框 (ORF, open reading frame) 非基因序列 基因組中除基因以外
2、的全部DNA序列 基因間(Intergenic) DNA序列,編碼 vs. 非編碼序列,編碼序列 編碼RNA和蛋白質(zhì)的DNA序列 基因中的外顯子(exon)序列 非編碼序列 基因中的內(nèi)含子(intron)序列+基因間序列,單一 vs. 重復序列,單一序列 在基因組中只出現(xiàn)過一次的DNA序列 50,多數(shù)為基因序列 重復序列 在基因組中重復出現(xiàn)的DNA序列 輕度:210個拷貝; 中度:10數(shù)百個拷貝,常為非編碼序列; 高度:數(shù)百數(shù)百萬個拷貝,tRNA、rRNA等。,重復序列,串聯(lián)重復序列(tandem repetitive sequence) 不同數(shù)目的核苷酸重復拷貝串聯(lián)在一起的高度重復序列。 2
3、200bp,主要為衛(wèi)星DNA。 分散重復序列(interspersed repetitive sequence) 分布于基因組內(nèi)散在的重復序列,一般為中等重復序列。,衛(wèi)星DNA:在氯化銫密度梯度離心時,因為DNA中GC和AT含量的差異,在形成主帶之外還形成小的衛(wèi)星帶,這種帶的DNA中GC含量少于主帶,構(gòu)成著絲粒、端粒和Y染色體長臂的染色質(zhì)區(qū)。 小衛(wèi)星DNA (minisatellite DNA): 625個核苷酸單元重復組成。 微衛(wèi)星DNA (microsatellite DNA): 26個核苷酸單元重復組成。 短串聯(lián)重復序列(STR, short tandem repeat) 作為遺傳標記,
4、具有多態(tài)性,與疾病有關。,衛(wèi)星(satellite)DNA,衛(wèi)星(satellite)DNA,分散重復序列,短分散核酸元件 (SINE) 500 bp, 10萬拷貝; 如:Alu序列。 長分散核酸元件 (LINE) 50007000bp, 102104拷貝; 如: Kpn I家族; 構(gòu)成轉(zhuǎn)座元件。,斷裂基因(split gene)結(jié)構(gòu),基因是具有功能的DNA序列片段。 外顯子是基因內(nèi)的編碼序列,內(nèi)含子是基因內(nèi)的非編碼序列,側(cè)翼序列是基因兩側(cè)非編碼區(qū)。 GT-AG法則:每個內(nèi)含子的5端兩個核苷酸都是GT,3端兩個核苷酸都是AG,這種連接方式稱為GT-AG法則,是基因表達時剪接的共同機制。 基因家
5、族 (gene family):基因組中來源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關且常成簇存在的一組基因。 假基因(pseudogene):具有部分基因結(jié)構(gòu),但在進化中由于突變而不能活性表達產(chǎn)生蛋白。,外顯子/內(nèi)含子,GT-AG法則,基因家族/基因簇,珠蛋白基因家族和假基因,基因表達,mRNA加工過程,加帽 (capping),剪接 (splice),加尾 (polyadenylation),轉(zhuǎn)錄調(diào)控,順式作用元件(cis-acting element) 是基因(DNA)的一部分, 直接作用。 反式作用因子(trans-acting factor) 即轉(zhuǎn)錄因子(transcriptional factor)
6、,是一類蛋白質(zhì),通過與靶序列結(jié)合或 基因表達。,順式作用元件,啟動子 (promoter) 常位于轉(zhuǎn)錄起始點上游100200bp內(nèi),是RNA聚合酶結(jié)合部位,并相互作用啟動基因的轉(zhuǎn)錄。 TATA box 2530bp,轉(zhuǎn)錄起始點準確定位; CAAT box 7580bp,定量高效轉(zhuǎn)錄; GC box 結(jié)合Sp1激活轉(zhuǎn)錄。 增強子 (enhancer) 包括啟動子上下游的一段DNA序列,能增強基因轉(zhuǎn)錄,其作用不受距離和序列方向的影響。 終止子 (terminator) 由一段回文結(jié)構(gòu)和特定的5-AATAAA-3序列組成,是轉(zhuǎn)錄終止和加尾信號。,順式作用元件,轉(zhuǎn)錄因子,Ap-1,NF-kB,基因突變
7、:DNA水平遺傳物質(zhì)的變化,自然界自發(fā) 或 實驗室誘發(fā),生物進化 遺傳病/常見病,基因突變 (mutation),點突變 (point mutation): 單個堿基置換。 轉(zhuǎn)換/顛換 (1) 同義突變:不改變氨基或蛋白功能; (2) 錯義突變:改變氨基酸和蛋白功能; (3) 無義突變:突變成終止密碼子,產(chǎn)生截短蛋白。 移碼突變 (frameshift mutation): 堿基的插入或缺失 下游密碼子組成框改變。 動態(tài)突變 (dynamic mutation): 三核苷酸重復拷貝數(shù)。,同義突變 (same sense mutation),野生型: AGT CAG CAG CAG TTT TT
8、A CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gln Phe Leu Arg Asn Pro 突變型: AGT CAG CAG CAG TTT TTG CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gln Phe Leu Arg Asn Pro,錯義突變 (missense mutation),野生型: AGT CAG CAG CAG TTT TTA CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gln Phe Leu Arg Asn Pro 突變型: AGT CAG CAG CAG TTT TCA CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gl
9、n Phe Ser Arg Asn Pro,無義突變 (nonsense mutation),野生型: AGT CAG CAG CAG TTT TTA CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gln Phe Leu Arg Asn Pro 突變型: AGT CAG CAG CAG TTT TGA CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gln Phe 終止,移碼突變 (frame shift mutation),野生型: AGT CAG CAG CAG TTT TTA CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gln Phe Leu Arg Asn
10、 Pro 突變型: AGT CAG CAG CAG TTT TAC GTA ACC CGT DNA Met Gln Gln Gln Phe Tyr Val Thr Arg,動態(tài)突變 (dynamic mutation),野生型: AGT CAG CAG CAG TTT TTA CGT AAC CCG DNA Met Gln Gln Gln Phe Leu Arg Asn Pro 突變型: AGT CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG DNA Met Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln 動態(tài)突變:鄰近基因或位于基因序列中的三核苷酸重復拷貝數(shù),在一代代傳遞過程中發(fā)生明顯的增加。 可遺傳,多引起神經(jīng)系統(tǒng)疾病,如脆性X
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