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1、,原核生物與真核生物 基因表達(dá)方面的主要差異,122210101436熊雪薇,基因表達(dá): 基因表達(dá)(gene expression)是指細(xì)胞在生命過(guò) 程中,把儲(chǔ)存在DNA順序中遺傳信息經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄和翻譯,轉(zhuǎn)變成具有生物活性的蛋白質(zhì)分子。,原核生物 真核生物,原料: 模板: 酶: 其他因子:,NTP (ATP UTP CTP GTP) DNA RNA-聚合酶 RNA-聚合酶 I II III 轉(zhuǎn)錄因子,原核生物的基因由于沒有外顯子和內(nèi)含子,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的信使RNA不需要剪切、拼接等加工過(guò)程。而真核生物有內(nèi)含子、外顯子,因此轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的RNA需要加工修飾!,?,轉(zhuǎn)錄:,模板:,原核生物RNA-聚合酶,真核生
2、物RNA-聚合酶,酶:,原核生物每一轉(zhuǎn)錄區(qū)段可視為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,稱為操縱子(operon)。操縱子包括若干個(gè)結(jié)構(gòu)基因及其上游(upstream)的調(diào)控序列。,原核生物上游調(diào)控序列:中的啟動(dòng)子是RNA聚合酶結(jié)合模板DNA的部位,也是控制轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵部位。 轉(zhuǎn)錄起始區(qū):A-T配對(duì)比較多,A-T多是有利于解鏈的 -10區(qū)的“一致性序列”為TATAAT -35區(qū)最大一致性序列是TTGACA,(啟動(dòng)子),真核生物轉(zhuǎn)錄起始前的上游區(qū)段調(diào)控序列: 不同物種、不同細(xì)胞或不同的基因,轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游可以有不同的DNA序列,但這些序列都可統(tǒng)稱為順式作用元件(cis-acting element)。 順式作用元件包括啟
3、動(dòng)子、啟動(dòng)子上游元件(upstream promoter elements) 等近端調(diào)控元件和增強(qiáng)子(enhancer)等遠(yuǎn)隔序列。 起始點(diǎn)上游多數(shù)有共同的TATA序列,稱為Hognest盒或TATA盒(TATA box)。通常認(rèn)為這就是啟動(dòng)子的核心序列。TATA盒雖然沒有原核的-10區(qū)、-35區(qū)那么典型,沒有原核那樣的相對(duì)較高較精確的豐度、區(qū)段;除TATA盒;還有一些叫“盒”或不叫的調(diào)控序列。 啟動(dòng)子上游元件是位于TATA盒上游的DNA序列,多在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)約-40-100nt的位置,比較常見的是GC盒和CAAT盒。,轉(zhuǎn)錄起始:,原核生物:RNA聚合酶和DNA的特殊序列啟動(dòng)子(promoter
4、)結(jié)合后,就能啟動(dòng)RNA合成。 RNA聚合酶全酶( 2 )與模板結(jié)合,形成閉合轉(zhuǎn)錄復(fù)合體。 DNA雙鏈局部解開,形成開放轉(zhuǎn)錄復(fù)合體。 在RNA聚合酶作用下發(fā)生第一次聚合反應(yīng),形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。,真核生物:轉(zhuǎn)錄起始需要啟動(dòng)子 、RNA聚合酶和轉(zhuǎn)錄因子的參與。 少數(shù)幾個(gè)反式作用因子的搭配啟動(dòng)特定基因的轉(zhuǎn)錄 真核生物RNA-pol不與DNA分子直接結(jié)合,而需依靠眾多的轉(zhuǎn)錄因子,形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。,真核生物RNA聚合酶-DNA-RNA復(fù)合物,轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng):,原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中有羽毛狀現(xiàn)象:,啟動(dòng)子清除,亞基脫落,RNApol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移,在核心酶作用下NTP不斷
5、聚合,RNA鏈不斷延長(zhǎng)。,原核生物在同一DNA模板上,有多個(gè)轉(zhuǎn)錄同時(shí)在進(jìn)行,轉(zhuǎn)錄尚未完成,翻譯已在進(jìn)行。 真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程與原核生物大致相似,但因有核膜相隔,沒有轉(zhuǎn)錄與翻譯同步的現(xiàn)象。,轉(zhuǎn)錄終止:,RNA聚合酶在DNA模板上停頓下來(lái)不再前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來(lái)。,原核生物的轉(zhuǎn)錄終止分類:,依賴因子的轉(zhuǎn)錄終止,非依賴因子的轉(zhuǎn)錄終止,因子: 識(shí)別富含C的RNA鏈 ATPase活性 解螺旋酶(helicase)活性,因子,真核生物的轉(zhuǎn)錄終止:在超出千百個(gè)核苷酸后停頓, 轉(zhuǎn)錄后修飾有多聚腺苷酸(poly A)尾巴結(jié)構(gòu)加進(jìn)去 。在讀碼框架下游常有一組公共序列AATAAA 及 GT
6、GTGT序列,這些序列稱為轉(zhuǎn)錄終止修飾點(diǎn)。,原核生物真核生物轉(zhuǎn)錄對(duì)比:,翻譯:,mRNA是蛋白質(zhì)生物合成的直接模板: 遺傳學(xué)將編碼一個(gè)多肽的遺傳單位稱為順反子(cistron)。 原核細(xì)胞中數(shù)個(gè)結(jié)構(gòu)基因常串聯(lián)為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,轉(zhuǎn)錄生成的mRNA可編碼幾種功能相關(guān)的蛋白質(zhì),為多順反子(polycistron) 。 真核mRNA只編碼一種蛋白質(zhì),為單順反子(single cistron) 許多真核生物基因轉(zhuǎn)錄后有一個(gè)對(duì)mRNA外顯子加工的過(guò)程,使mRNA序列中出現(xiàn)移碼、錯(cuò)義、無(wú)義突變,導(dǎo)致同一前體mRNA翻譯出序列、功能不同的蛋白質(zhì)。這種基因表達(dá)的調(diào)節(jié)方式稱為mRNA編輯(mRNA editing)
7、。,核蛋白體是蛋白質(zhì)生物合成的場(chǎng)所: 核蛋白體是細(xì)胞質(zhì)和線粒體中無(wú)膜包裹的顆粒狀細(xì)胞器,具蛋白質(zhì)合成功能。 核蛋白體包括 rRNA(核糖體RNA) 和蛋白質(zhì),直徑為 20-25nm,真核細(xì)胞的核蛋白體比原核細(xì)胞的大。,蛋白質(zhì)生物合成需要酶類、蛋白質(zhì)因子:,氨基酸的活化:,氨基酸與特異的tRNA結(jié)合形成氨基酰-tRNA的過(guò)程稱為氨基酸的活化,氨基酸活化形成氨基酰-tRNA。 原核、真核生物-都有兩種Met-tRNA:,原核生物起始氨基酰-tRNA: fMet-tRNAfMet tRNAfMet與甲硫氨酸結(jié)合后,甲硫氨酸很快被甲?;癁镹-甲酰甲硫氨酸,于是形成N-甲酰甲硫氨酰-tRNA (fMet
8、-tRNAfMet)。,真核生物起始氨基酰-tRNA: Met-tRNAiMet tRNAiMet與甲硫氨酸結(jié)合后形成Met-tRNAiMet 。,參與肽鏈延長(zhǎng)的甲硫氨酰-tRNA:Met-tRNAMet,肽鏈合成起始:,原核生物: 起始tRNA是fMet-tRNA(fMet上角標(biāo)) 30s小亞基首先與mRNA模板相結(jié)合 再與fMet-tRNA(fMet上角標(biāo))結(jié)合 最后與50s大亞基結(jié)合,真核生物: 起始tRNA是 Met-tRNA(Met上角標(biāo)) 40s小亞基首先與Met-tRNA(Met上角標(biāo))相結(jié)合 再與模板mRNA結(jié)合 最后與60s大亞基結(jié)合生成起始復(fù)合物,原核生物位于AUG上游8-
9、13個(gè)核苷酸處的一個(gè)短片段(4-6個(gè)核苷酸)叫做SD序列。這段序列正好與tRNA 30S小亞基中的16s rRNA3端一部分序列互補(bǔ),因此SD序列也叫做核糖體結(jié)合序列。其中有三種IF參加起始復(fù)合物的形成。 真核生物mRNA中的帽子結(jié)構(gòu)和帽子結(jié)合蛋白復(fù)合物結(jié)合。至少有十種eIF參與起始復(fù)合物的形成。,真核生物翻譯起始,原核生物肽鏈合成的延長(zhǎng):,進(jìn)位: 氨基酰-tRNA按照mRNA模板的指令進(jìn)入并結(jié)合到核蛋白體A位 2. 成肽:轉(zhuǎn)肽酶催化,核蛋白體P位上起始氨基酰-tRNA轉(zhuǎn)移到A位,與A位上氨基酰-tRNA的-氨基結(jié)合形成肽鍵 3. 轉(zhuǎn)位轉(zhuǎn)位酶催化,核蛋白體向3-端移動(dòng)一個(gè)密碼子的距離,使mRN
10、A上下一個(gè)密碼子進(jìn)入核蛋白體A位、而占據(jù)A位的肽酰-tRNA移入P位 延長(zhǎng)因子: EF-Tu EF-Ts EF-G,真核延長(zhǎng)過(guò)程與原核基本相似 但有不同的反應(yīng)體系和延長(zhǎng)因子:eEF-1 eEF-1 eEF-2 真核細(xì)胞核蛋白體沒有E位,轉(zhuǎn)位時(shí)卸載的tRNA直接從P位脫落,肽鏈合成終止:,核蛋白體A位出現(xiàn)mRNA的終止密碼子后,多肽鏈合成停止,肽鏈從肽酰-tRNA中釋出,mRNA、核蛋白體大、小亞基等分離。,原核生物終止階段需要釋放因子RF-1、 RF-2和 RF-3參與 釋放因子功能:I 識(shí)別終止密碼子 II誘導(dǎo)轉(zhuǎn)肽酶轉(zhuǎn)變?yōu)轷ッ富钚?IIIRF-3有GTP酶活性,能介導(dǎo)RF-1、RF-2與核蛋白體的相互作用,真核生物翻譯終止過(guò)程與原核生物相似,但只有1個(gè)釋放因子 eRF,可識(shí)別所有終止密碼子,完成原核生物各類RF的功能。,蛋白質(zhì)翻譯后修飾: 真核生物中新生(未成熟)分泌蛋白的N端有
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